logo

Genes within 1Mb (chr6:133268445:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.63e-01 0.0331 0.11 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0621 0.116 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 1.63e-01 0.061 0.0436 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 6.29e-01 0.0398 0.0823 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0377 0.0497 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 6.22e-01 0.0517 0.105 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 9.54e-02 0.136 0.0811 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 1.52e-01 0.121 0.0845 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 3.29e-01 0.0718 0.0733 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.43e-01 0.0384 0.0499 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00787 0.101 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 4.88e-01 0.0553 0.0796 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0413 0.0831 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0969 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00379 0.0332 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0998 0.1 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.57e-01 0.0554 0.125 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 8.60e-01 0.0137 0.0775 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 7.02e-01 0.0369 0.0961 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0883 0.104 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 5.67e-01 0.0636 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 2.41e-01 -0.073 0.062 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 2.42e-01 -0.115 0.0982 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 165317 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0582 0.0896 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.27e-01 0.0304 0.0869 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.60e-01 0.0178 0.0582 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.0996 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 7.41e-01 0.0355 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 5.36e-01 -0.047 0.0758 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0525 0.0453 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0968 0.0897 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 5.49e-02 0.18 0.0932 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0446 0.0869 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.91e-01 -0.114 0.108 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.15e-01 -0.0704 0.0445 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 1.92e-01 -0.143 0.11 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.21e-01 0.00862 0.0865 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 1.29e-01 0.159 0.104 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0364 0.0414 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0255 0.114 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 2.52e-01 -0.144 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 6.29e-01 0.0557 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 1.85e-01 -0.143 0.107 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 1.77e-01 0.155 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.28e-01 0.0489 0.0615 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 2.39e-01 0.127 0.107 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00728 0.123 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 1.23e-01 0.166 0.107 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.52e-01 0.0656 0.0704 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 3.36e-01 0.102 0.106 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 7.36e-01 -0.022 0.065 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0263 0.117 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0998 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 3.36e-01 0.105 0.109 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 1.83e-01 0.114 0.0851 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0531 0.0537 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 4.66e-01 0.082 0.112 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 3.14e-01 -0.111 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0193 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.08e-01 0.0541 0.053 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.28e-01 -0.124 0.103 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000612 0.0587 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0458 0.113 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.09e-01 0.0595 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 1.54e-01 -0.161 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00307 0.0617 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.21e-01 0.138 0.113 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.41e-01 0.0462 0.0599 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 6.15e-01 0.0576 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 5.82e-02 0.219 0.115 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 8.11e-02 0.2 0.114 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 4.01e-01 0.0975 0.116 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.23e-01 0.0827 0.0533 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 3.77e-01 0.0955 0.108 0.157 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.80e-01 0.0386 0.0935 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.36e-01 0.0882 0.0915 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.63e-01 0.095 0.0847 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.04e-01 0.0895 0.0548 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.41e-01 0.00792 0.106 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 4.70e-01 0.0731 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 2.07e-01 0.128 0.101 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0907 0.1 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00917 0.052 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.51e-01 0.00748 0.12 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0259 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0957 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 8.27e-01 0.0243 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 3.37e-01 0.0437 0.0455 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 7.84e-01 -0.031 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 5.19e-01 0.0657 0.102 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0513 0.0951 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.22e-01 -0.132 0.108 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 7.77e-01 0.0164 0.0578 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00148 0.112 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 9.37e-01 0.00864 0.109 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.84e-01 0.0319 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0529 0.1 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000356 0.0574 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.80e-01 0.00284 0.115 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 9.06e-01 -0.015 0.126 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0551 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.48e-01 -0.134 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 3.15e-01 0.0569 0.0565 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 7.53e-01 0.0391 0.124 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 2.01e-01 0.142 0.11 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.79e-01 0.034 0.121 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 8.88e-01 0.0169 0.12 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.66e-01 0.0472 0.0646 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 2.52e-01 -0.14 0.122 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0122 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 8.62e-01 0.0192 0.11 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.10e-02 0.189 0.111 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0234 0.0552 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.96e-01 0.000605 0.116 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0889 0.123 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.08e-01 0.0589 0.115 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 1.14e-01 0.184 0.116 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0508 0.0647 0.16 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 4.72e-02 0.199 0.0999 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0392 0.0923 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.86e-02 -0.19 0.115 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0318 0.0458 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.09e-01 -0.045 0.12 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0284 0.11 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000263 0.111 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.22e-01 -0.0799 0.0514 0.167 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 8.86e-02 0.176 0.103 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.1 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.22e-01 -0.138 0.112 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0749 0.0609 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 1.48e-01 0.207 0.142 0.159 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 7.27e-01 -0.043 0.123 0.159 PB L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.90e-01 0.00132 0.102 0.159 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 5.92e-01 0.0671 0.125 0.159 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0864 0.0706 0.159 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0897 0.133 0.159 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 8.97e-01 0.0149 0.116 0.161 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 2.50e-01 0.119 0.103 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 6.51e-01 0.0501 0.111 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0116 0.0419 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 3.11e-01 0.11 0.108 0.161 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 1.52e-01 0.171 0.119 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.28e-01 0.11 0.112 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 7.08e-01 0.0355 0.0946 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0354 0.0418 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.60e-01 0.00594 0.118 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.56e-01 0.0571 0.128 0.159 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0523 0.1 0.159 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 6.52e-02 0.184 0.0989 0.159 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0638 0.117 0.159 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0484 0.114 0.159 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0759 0.0562 0.159 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 3.05e-01 0.115 0.112 0.159 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 165317 sc-eQTL 1.21e-01 -0.139 0.0888 0.159 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.80e-01 0.0417 0.101 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0277 0.0764 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0933 0.108 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0493 0.109 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.80e-01 0.0022 0.0872 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0382 0.0483 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0695 0.0932 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 2.00e-01 -0.145 0.113 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0431 0.0818 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0896 0.102 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 2.35e-01 0.132 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0667 0.0726 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0801 0.0521 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0698 0.0968 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.33e-02 -0.269 0.144 0.161 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 4.86e-01 0.0874 0.125 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 3.11e-01 -0.14 0.138 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.62e-01 0.0737 0.0525 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 5.06e-01 -0.091 0.136 0.161 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0438 0.117 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.24e-01 0.11 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 7.06e-01 0.0426 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 8.21e-02 0.193 0.111 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 2.40e-01 0.133 0.113 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00295 0.0493 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 6.21e-01 0.0579 0.117 0.161 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00961 0.0791 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 9.13e-01 0.0123 0.112 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0822 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0307 0.107 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0634 0.0532 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0562 0.0943 0.161 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 3.24e-01 -0.138 0.14 0.158 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0268 0.0932 0.158 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 9.88e-01 0.00138 0.0939 0.158 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 4.24e-01 0.0764 0.0954 0.158 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 4.56e-01 0.0848 0.114 0.158 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.86e-01 -0.103 0.0779 0.158 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 7.35e-03 -0.308 0.113 0.158 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 165317 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0808 0.111 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.60e-01 0.0365 0.119 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 1.96e-01 0.15 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.11e-01 0.0665 0.0655 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 4.59e-01 0.0768 0.104 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0194 0.0591 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 6.97e-01 0.0424 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0376 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 866970 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0832 0.121 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 3.27e-01 0.0489 0.0498 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.91e-01 0.00105 0.0969 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 7.76e-01 0.0167 0.0586 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00123 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0133 0.0907 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 9.52e-01 0.00378 0.0631 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.103 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 5.04e-01 0.0717 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000656 0.0709 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0674 0.0484 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0498 0.0864 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0415 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 7.86e-01 0.0208 0.0765 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 533680 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0472 0.113 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 554390 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0523 0.112 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 8.92e-01 0.0143 0.105 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0317 0.0446 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 sc-eQTL 1.55e-01 -0.154 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -683725 sc-eQTL 2.49e-02 0.206 0.0914 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 755247 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0628 0.0868 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 504986 sc-eQTL 1.25e-01 -0.169 0.109 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 453876 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0726 0.0446 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 554390 pQTL 0.0276 0.0972 0.0441 0.0 0.0 0.19
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 eQTL 0.00227 -0.0837 0.0274 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 866970 2.74e-07 1.25e-07 4.08e-08 1.86e-07 9.01e-08 1e-07 1.53e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.62e-07 8.55e-08 1.47e-07 6.56e-08 6.02e-08 7.53e-08 3.93e-08 1.26e-07 5.36e-08 4.04e-08 1.13e-07 1.28e-07 1.44e-07 3.49e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.09e-07 1.03e-07 9.7e-08 4.09e-08 3.56e-08 8.44e-08 7.66e-08 3.62e-08 5.08e-08 9.3e-08 6.59e-08 3.37e-08 5e-08 1.35e-07 5.08e-08 1.61e-08 5.19e-08 1.99e-08 1.19e-07 3.81e-09 4.81e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 455106 7.74e-07 4e-07 1.03e-07 3.48e-07 1.05e-07 1.64e-07 5.13e-07 9.69e-08 3.66e-07 2.16e-07 4.88e-07 3.11e-07 6.98e-07 1.07e-07 1.57e-07 2.08e-07 2.11e-07 3.44e-07 1.5e-07 1.17e-07 1.89e-07 3.15e-07 3.11e-07 1.21e-07 6.59e-07 2.42e-07 2.24e-07 2.18e-07 2.78e-07 4.3e-07 2.55e-07 8.48e-08 5.68e-08 1.16e-07 2.7e-07 7.56e-08 1.03e-07 7.98e-08 6.29e-08 7.39e-08 8.68e-08 4.35e-07 1.7e-08 1.74e-08 1.1e-07 1.37e-08 7.25e-08 3.2e-09 5.52e-08