logo

Genes within 1Mb (chr6:133262735:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.15e-01 0.0129 0.12 0.139 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0778 0.127 0.139 B L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.31e-01 0.0722 0.0476 0.139 B L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 9.45e-01 0.00621 0.0901 0.139 B L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0485 0.0543 0.139 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 1.48e-01 0.166 0.114 0.139 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.90e-01 0.0946 0.0891 0.139 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.60e-02 0.17 0.0922 0.139 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.91e-01 0.0691 0.0803 0.139 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 4.11e-01 0.045 0.0546 0.139 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.17e-01 0.0899 0.11 0.139 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 5.82e-01 0.048 0.0869 0.139 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0141 0.0908 0.139 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0765 0.106 0.139 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 8.74e-01 -0.00575 0.0362 0.139 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00872 0.11 0.139 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.54e-01 0.155 0.136 0.14 DC L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 9.28e-01 0.00764 0.0845 0.14 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 9.10e-01 0.0119 0.105 0.14 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0893 0.113 0.14 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 1.74e-01 0.164 0.12 0.14 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0703 0.0677 0.14 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 2.35e-01 -0.127 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 159607 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0314 0.0977 0.14 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 6.85e-01 0.0384 0.0946 0.139 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.16e-01 0.0318 0.0633 0.139 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 2.00e-01 -0.139 0.108 0.139 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 8.45e-01 0.0229 0.117 0.139 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 7.28e-01 0.0288 0.0825 0.139 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0405 0.0494 0.139 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0604 0.0977 0.139 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 1.91e-01 0.134 0.102 0.139 NK L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.83e-01 -0.014 0.0944 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0735 0.117 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0589 0.0485 0.139 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.53e-01 -0.137 0.12 0.139 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 7.55e-01 0.0295 0.0946 0.139 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 1.00e-01 0.188 0.114 0.139 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0408 0.0453 0.139 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 8.36e-01 0.0257 0.124 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0766 0.139 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 5.95e-01 0.0676 0.127 0.138 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.49e-01 -0.112 0.119 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 2.51e-01 0.145 0.126 0.138 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 5.80e-01 0.0376 0.0678 0.138 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 2.75e-01 0.13 0.118 0.138 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 8.03e-01 0.0334 0.134 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 2.92e-01 0.124 0.117 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.21e-01 0.0762 0.0766 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 4.96e-01 0.0789 0.116 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0327 0.0708 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.56e-01 0.0752 0.128 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.81e-02 -0.211 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 3.40e-01 0.113 0.118 0.14 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.96e-01 0.12 0.0923 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0214 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0448 0.0583 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 2.36e-01 0.144 0.121 0.14 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0928 0.121 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 8.35e-01 0.0278 0.133 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.38e-01 0.0556 0.0579 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 9.28e-02 -0.189 0.112 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 8.38e-01 0.0131 0.0642 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 6.23e-01 0.0609 0.124 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 8.59e-01 0.0225 0.126 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 1.32e-01 -0.186 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 5.06e-01 0.0446 0.0671 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.18e-01 0.123 0.123 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.17e-01 0.0653 0.0651 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.81e-01 0.0877 0.124 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.91e-02 0.278 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.68e-01 0.175 0.126 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 2.30e-01 0.154 0.128 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 1.22e-01 0.0914 0.0588 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.08e-01 0.0789 0.119 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0275 0.103 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.98e-01 0.129 0.1 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.87e-01 0.0806 0.093 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 1.26e-01 0.0923 0.0601 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.05e-01 0.0969 0.116 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 4.78e-01 0.0785 0.111 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.24e-01 0.171 0.111 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.37e-01 0.0226 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0152 0.057 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.66e-01 0.0961 0.132 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 8.63e-01 0.0218 0.126 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.81e-01 -0.052 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.54e-01 0.0224 0.122 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.00e-01 0.0638 0.0496 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.72e-01 0.07 0.124 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.16e-01 0.0118 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0819 0.104 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.65e-01 -0.107 0.118 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 4.34e-01 0.0495 0.0632 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.66e-01 0.0704 0.122 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 8.18e-01 0.0277 0.12 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 5.40e-01 0.0785 0.128 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0263 0.11 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00145 0.0631 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 6.65e-01 0.0548 0.127 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 6.96e-01 0.0546 0.139 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0603 0.129 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.91e-01 -0.11 0.128 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.58e-01 0.0705 0.0622 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.21e-01 0.11 0.137 0.132 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 1.43e-01 0.178 0.121 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.84e-01 0.0194 0.133 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 6.72e-01 0.056 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 1.53e-01 0.101 0.0706 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.51e-01 -0.101 0.134 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.44e-01 0.00886 0.127 0.139 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.35e-01 0.0251 0.12 0.139 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 7.79e-02 0.216 0.122 0.139 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0278 0.0602 0.139 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 7.55e-01 0.0394 0.126 0.139 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0118 0.135 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 4.41e-01 0.0962 0.125 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 6.10e-02 0.237 0.126 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0212 0.0706 0.138 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.03e-01 0.14 0.109 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0144 0.101 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 1.72e-01 -0.172 0.125 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0161 0.0499 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 3.93e-01 -0.112 0.131 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 8.29e-01 -0.026 0.12 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0175 0.121 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0488 0.0563 0.144 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.10e-01 0.141 0.112 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000134 0.109 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.76e-01 -0.109 0.122 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0401 0.0665 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.97e-01 0.154 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0608 0.126 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0959 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 7.03e-01 0.0492 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 7.78e-02 -0.128 0.072 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 3.52e-01 -0.127 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 8.46e-01 0.0246 0.126 0.139 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.15e-01 0.177 0.112 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 6.79e-01 0.0501 0.121 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00484 0.0458 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 2.81e-01 0.128 0.118 0.139 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.28e-01 0.158 0.131 0.139 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.43e-01 0.181 0.123 0.139 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 9.19e-01 0.0105 0.104 0.139 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0544 0.0459 0.139 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.86e-01 0.0708 0.13 0.139 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 2.19e-01 0.173 0.141 0.134 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 5.46e-01 -0.067 0.111 0.134 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 4.77e-02 0.217 0.109 0.134 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 6.99e-01 -0.05 0.129 0.134 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.48e-01 0.0243 0.126 0.134 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0557 0.0621 0.134 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.20e-01 0.0794 0.123 0.134 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 159607 sc-eQTL 2.56e-01 -0.112 0.0982 0.134 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 3.85e-01 0.0961 0.11 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0224 0.0839 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 2.59e-01 -0.134 0.118 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0886 0.119 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.61e-01 0.0875 0.0955 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0324 0.0531 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0297 0.102 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 1.68e-01 -0.172 0.124 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0278 0.0899 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0797 0.112 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 2.39e-01 0.144 0.122 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00782 0.0799 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0726 0.0573 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 8.29e-01 -0.023 0.106 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 1.95e-01 -0.212 0.163 0.13 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.97e-01 0.119 0.141 0.13 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 2.61e-01 -0.175 0.155 0.13 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 9.92e-02 0.0976 0.0588 0.13 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 3.14e-01 -0.155 0.153 0.13 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 3.09e-01 -0.131 0.128 0.136 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.48e-01 0.115 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 9.74e-01 0.00408 0.124 0.136 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 4.03e-02 0.251 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 8.57e-02 0.214 0.124 0.136 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 6.70e-01 0.0232 0.0543 0.136 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0992 0.132 0.136 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 7.77e-01 0.0366 0.129 0.138 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00666 0.0874 0.138 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00107 0.123 0.138 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0792 0.122 0.138 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 7.56e-01 0.0366 0.118 0.138 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0827 0.0587 0.138 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 3.10e-01 -0.106 0.104 0.138 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 5.17e-01 -0.104 0.16 0.13 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 3.15e-01 -0.107 0.107 0.13 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0311 0.108 0.13 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 5.74e-01 0.0617 0.109 0.13 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.01e-01 0.135 0.13 0.13 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 1.14e-01 -0.142 0.0891 0.13 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 8.18e-02 -0.231 0.132 0.13 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 159607 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0993 0.127 0.13 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 7.10e-01 0.0484 0.13 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 2.88e-01 0.134 0.126 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 2.17e-01 0.0883 0.0712 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 6.54e-01 0.0508 0.113 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0215 0.0644 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 2.43e-01 0.138 0.118 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0609 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 861260 sc-eQTL 6.30e-01 -0.064 0.133 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 1.91e-01 0.0711 0.0542 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0482 0.106 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 5.70e-01 0.0363 0.0639 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 5.67e-01 0.0691 0.121 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 9.27e-01 0.00909 0.0991 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 7.75e-01 0.0198 0.0689 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 2.17e-01 -0.139 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 6.37e-01 0.0554 0.117 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 3.74e-01 0.0689 0.0773 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.75e-01 -0.058 0.053 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00966 0.0945 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0915 0.127 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.82e-01 0.0343 0.0836 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 527970 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0921 0.123 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 548680 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0436 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 4.19e-01 0.0931 0.115 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0193 0.0488 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 sc-eQTL 1.60e-01 -0.166 0.118 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -689435 sc-eQTL 1.41e-01 0.148 0.1 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 749537 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0368 0.0944 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 499276 sc-eQTL 2.29e-01 -0.144 0.119 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 448166 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0608 0.0486 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 eQTL 0.039 -0.059 0.0285 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 861260 2.67e-07 1.11e-07 3.54e-08 1.82e-07 8.83e-08 9.87e-08 1.42e-07 5.33e-08 1.4e-07 4.4e-08 1.56e-07 7.75e-08 1.41e-07 6.38e-08 5.53e-08 7.26e-08 3.88e-08 1.14e-07 5.21e-08 4.21e-08 1.04e-07 1.27e-07 1.32e-07 4.05e-08 1.33e-07 1.19e-07 1.11e-07 9.15e-08 1.03e-07 1.11e-07 9.73e-08 3.94e-08 3.26e-08 8.49e-08 8.98e-08 3.96e-08 5.06e-08 9.68e-08 7.52e-08 3e-08 4.41e-08 1.31e-07 4.19e-08 1.49e-08 5.59e-08 1.68e-08 1.26e-07 3.99e-09 4.73e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 449396 4.68e-07 1.92e-07 6.57e-08 2.49e-07 1.08e-07 1.08e-07 3.25e-07 6.2e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.18e-07 1.48e-07 3.95e-07 8.54e-08 6.6e-08 1.01e-07 5.57e-08 2.33e-07 7.11e-08 7.83e-08 1.27e-07 1.9e-07 2e-07 4.81e-08 2.99e-07 1.56e-07 1.33e-07 1.42e-07 1.48e-07 1.85e-07 1.39e-07 4.43e-08 4.74e-08 9.61e-08 8.75e-08 3.94e-08 5.96e-08 7.92e-08 5.8e-08 6.67e-08 4.72e-08 2.41e-07 3.13e-08 2e-08 5.49e-08 6.53e-09 7.83e-08 2.2e-09 4.72e-08