logo

Genes within 1Mb (chr6:133257889:CTATT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.119 0.143 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0462 0.125 0.143 B L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 1.67e-01 0.0653 0.0471 0.143 B L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.75e-01 0.0028 0.0889 0.143 B L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0395 0.0537 0.143 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 1.27e-01 0.173 0.112 0.143 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.87e-01 0.0941 0.0881 0.143 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.09e-02 0.16 0.0912 0.143 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 5.39e-01 0.049 0.0795 0.143 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.82e-01 0.0473 0.054 0.143 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.94e-01 0.0933 0.109 0.143 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 6.18e-01 0.0429 0.0859 0.143 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0432 0.0897 0.143 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0722 0.105 0.143 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00459 0.0358 0.143 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0142 0.108 0.143 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.47e-01 0.156 0.134 0.144 DC L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 9.08e-01 0.0097 0.0836 0.144 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 7.51e-01 0.0329 0.104 0.144 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0646 0.112 0.144 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.144 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.40e-01 -0.064 0.067 0.144 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 2.74e-01 -0.116 0.106 0.144 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 154761 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0197 0.0967 0.144 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 6.73e-01 0.0396 0.0937 0.143 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.13e-01 0.0318 0.0627 0.143 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 3.37e-01 -0.103 0.107 0.143 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 7.79e-01 0.0325 0.116 0.143 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.04e-01 0.00992 0.0818 0.143 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0293 0.049 0.143 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0382 0.0969 0.143 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.36e-01 0.12 0.101 0.144 NK L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0169 0.0935 0.144 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0846 0.116 0.144 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0596 0.048 0.144 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.96e-01 -0.124 0.119 0.143 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 7.94e-01 0.0245 0.0937 0.143 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 8.12e-02 0.197 0.113 0.143 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0426 0.0448 0.143 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 7.60e-01 0.0376 0.123 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 5.04e-01 0.0839 0.125 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.05e-01 -0.149 0.117 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 3.46e-01 0.118 0.125 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.98e-01 0.0456 0.0671 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 1.97e-01 0.151 0.117 0.143 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 9.09e-01 0.0151 0.132 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 3.32e-01 0.0738 0.0759 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.65e-01 0.0837 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0191 0.0701 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 6.59e-01 0.0558 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.64e-01 -0.177 0.126 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.11e-01 0.115 0.0915 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0167 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0423 0.0578 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.119 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 6.58e-01 0.0582 0.131 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 3.49e-01 0.0538 0.0573 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 1.37e-01 -0.166 0.111 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.18e-01 0.023 0.0634 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 5.41e-01 0.0749 0.122 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 8.44e-01 0.0247 0.125 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 1.77e-01 -0.164 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.80e-01 0.0274 0.0664 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 3.76e-01 0.108 0.122 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.89e-01 0.0683 0.0644 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.65e-01 0.111 0.123 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.76e-02 0.298 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 1.16e-01 0.197 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 2.87e-01 0.135 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 1.30e-01 0.0884 0.0581 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.74e-01 0.0845 0.118 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0361 0.101 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.0989 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.78e-01 0.0653 0.0919 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 1.23e-01 0.0919 0.0594 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.05e-01 0.0958 0.115 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 4.23e-01 0.0878 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 1.74e-01 0.15 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00611 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0168 0.0563 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.20e-01 0.105 0.13 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 8.61e-01 0.022 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0637 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.20e-01 0.0121 0.12 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.09e-01 0.0619 0.0491 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 7.42e-01 0.0404 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 8.73e-01 0.0176 0.11 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 3.80e-01 -0.103 0.117 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.63e-01 0.046 0.0625 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 5.76e-01 0.0679 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 8.79e-01 0.018 0.119 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.23e-01 0.0621 0.126 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0391 0.109 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 9.89e-01 0.000892 0.0624 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 7.33e-01 0.0427 0.125 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 6.58e-01 0.0613 0.138 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.128 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0862 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.65e-01 0.0689 0.0617 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.07e-01 0.112 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.76e-01 0.163 0.12 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 9.60e-01 0.00655 0.132 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 6.66e-01 0.0566 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 1.45e-01 0.102 0.07 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.10e-01 -0.11 0.133 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 9.02e-01 0.0155 0.125 0.143 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.119 0.143 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.06e-02 0.204 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0303 0.0595 0.143 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 7.80e-01 0.0349 0.125 0.143 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0517 0.133 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 3.69e-01 0.111 0.123 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 1.10e-01 0.2 0.125 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0187 0.0699 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.50e-01 0.157 0.108 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0183 0.0997 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 1.59e-01 -0.175 0.124 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0145 0.0495 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 4.06e-01 -0.108 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0294 0.118 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0275 0.12 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.31e-01 -0.044 0.0557 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.82e-01 0.12 0.111 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00205 0.108 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 3.67e-01 -0.11 0.121 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0405 0.0659 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.97e-01 0.154 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0608 0.126 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0959 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 7.03e-01 0.0492 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.78e-02 -0.128 0.072 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.52e-01 -0.127 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 9.28e-01 0.0113 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 6.35e-01 0.057 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0084 0.0454 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 2.39e-01 0.138 0.117 0.143 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.03e-01 0.165 0.129 0.143 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.143 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0077 0.103 0.143 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0432 0.0454 0.143 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 5.47e-01 0.0774 0.128 0.143 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 2.24e-01 0.169 0.139 0.139 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 4.93e-01 -0.075 0.109 0.139 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 4.04e-02 0.222 0.107 0.139 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 8.45e-01 -0.025 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.124 0.139 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0531 0.0613 0.139 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.139 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 154761 sc-eQTL 2.94e-01 -0.102 0.097 0.139 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 4.91e-01 0.0753 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0171 0.0829 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0924 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0722 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.50e-01 0.0714 0.0944 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.03e-01 -0.02 0.0525 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0237 0.101 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.72e-01 -0.168 0.123 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0306 0.089 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0651 0.111 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0334 0.0791 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0635 0.0568 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 9.72e-01 0.00364 0.105 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.88e-01 -0.213 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 3.71e-01 0.124 0.139 0.136 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 3.15e-01 -0.155 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 1.09e-01 0.0937 0.0581 0.136 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.58e-01 -0.139 0.151 0.136 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0893 0.128 0.14 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.76e-01 0.133 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 7.35e-01 0.0417 0.123 0.14 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 4.84e-02 0.239 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 1.09e-01 0.198 0.123 0.14 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 7.04e-01 0.0205 0.0538 0.14 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0747 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 7.60e-01 0.0392 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0118 0.0865 0.143 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 8.31e-01 0.0261 0.122 0.143 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 5.87e-01 -0.066 0.121 0.143 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 8.81e-01 0.0175 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 1.65e-01 -0.081 0.0582 0.143 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.143 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0916 0.158 0.136 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0432 0.105 0.136 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0216 0.106 0.136 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 4.42e-01 0.0828 0.107 0.136 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.136 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.0878 0.136 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.56e-02 -0.26 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 154761 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0551 0.125 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 7.56e-01 0.0399 0.128 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 2.23e-01 0.152 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.50e-01 0.0813 0.0704 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 6.77e-01 0.0466 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0118 0.0637 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 2.48e-01 0.135 0.116 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0603 0.119 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 856414 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0335 0.131 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 2.26e-01 0.0651 0.0536 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0459 0.104 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 4.77e-01 0.045 0.0631 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 4.38e-01 0.0926 0.119 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 9.67e-01 -0.004 0.0979 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 7.82e-01 0.0189 0.0681 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 5.69e-01 0.066 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 5.27e-01 0.0485 0.0765 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0468 0.0524 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 9.13e-01 0.0102 0.0934 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0699 0.126 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.35e-01 0.0394 0.0829 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 523124 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0417 0.122 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 543834 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0344 0.121 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 4.76e-01 0.0813 0.114 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 6.79e-01 -0.02 0.0484 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 sc-eQTL 2.25e-01 -0.143 0.117 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -694281 sc-eQTL 1.57e-01 0.141 0.0991 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 744691 sc-eQTL 6.62e-01 -0.041 0.0935 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 494430 sc-eQTL 2.23e-01 -0.144 0.118 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 443320 sc-eQTL 2.14e-01 -0.06 0.0481 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 eQTL 0.0435 -0.0576 0.0285 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 856414 2.67e-07 1.83e-07 6.04e-08 2.07e-07 8.83e-08 9.3e-08 1.53e-07 5.24e-08 1.4e-07 4.24e-08 1.56e-07 7.88e-08 1.41e-07 7.37e-08 5.4e-08 7.5e-08 3.87e-08 1.14e-07 5.21e-08 3.29e-08 1.05e-07 1.3e-07 1.26e-07 4.99e-08 1.31e-07 1.15e-07 1.12e-07 8.7e-08 9.88e-08 1.12e-07 9.92e-08 3.19e-08 2.75e-08 8.21e-08 3.57e-08 3.93e-08 4.85e-08 8.28e-08 8.3e-08 3.59e-08 3.46e-08 1.37e-07 4.01e-08 0.0 9.21e-08 1.74e-08 1.35e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 444550 9.39e-07 2.44e-06 2.79e-07 9.83e-07 9.61e-08 2.08e-07 8.7e-07 5.56e-08 5.88e-07 1.21e-07 1.03e-06 3.84e-07 9.97e-07 2.81e-07 3e-07 1.61e-07 7.66e-07 3.79e-07 2.25e-07 5.75e-08 1.35e-07 2.99e-07 3.77e-07 4.27e-08 6.65e-07 2.29e-07 2.22e-07 1.7e-07 2.84e-07 7.36e-07 4.65e-07 3.8e-08 2.92e-08 1.23e-07 5.69e-07 5.23e-08 4.28e-08 9.26e-08 6.3e-08 6.31e-08 4.69e-08 5.52e-07 3.31e-08 1.09e-08 4.91e-08 1.05e-08 8.81e-08 3.78e-09 4.94e-08