logo

Genes within 1Mb (chr6:133255306:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0242 0.0969 0.254 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0297 0.102 0.254 B L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.20e-01 0.0312 0.0386 0.254 B L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0547 0.0725 0.254 B L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0169 0.0439 0.254 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 2.48e-01 -0.107 0.0921 0.254 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0502 0.072 0.254 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.14e-01 0.0612 0.0748 0.254 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.69e-02 -0.154 0.064 0.254 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0576 0.0439 0.254 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00801 0.0893 0.254 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.01e-01 -0.115 0.07 0.254 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.06e-01 -0.119 0.0731 0.254 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 6.50e-01 -0.039 0.0858 0.254 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.20e-01 -0.036 0.0292 0.254 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.30e-01 0.0078 0.0887 0.254 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.18e-01 -0.168 0.107 0.261 DC L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 3.83e-01 0.0585 0.0669 0.261 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 7.67e-02 -0.147 0.0825 0.261 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 2.69e-01 0.0992 0.0895 0.261 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 5.74e-01 -0.054 0.0959 0.261 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0667 0.0536 0.261 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 5.24e-01 0.0543 0.0851 0.261 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 152178 sc-eQTL 9.67e-01 0.00317 0.0775 0.261 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 2.84e-01 0.0805 0.0749 0.254 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 2.62e-01 0.0563 0.0501 0.254 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0876 0.086 0.254 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 3.43e-02 0.195 0.0918 0.254 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.11e-02 -0.14 0.0647 0.254 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 9.10e-01 0.00441 0.0392 0.254 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 5.74e-01 0.0437 0.0775 0.254 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.00e-01 0.0865 0.0832 0.255 NK L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000919 0.0772 0.255 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 5.51e-01 0.0573 0.096 0.255 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0517 0.0396 0.255 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0802 0.0964 0.254 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 7.32e-01 0.0261 0.076 0.254 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.09e-01 -0.147 0.0913 0.254 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 8.13e-02 -0.0634 0.0362 0.254 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.17e-01 0.0104 0.0998 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 8.49e-01 0.0212 0.111 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 9.61e-01 0.00491 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 6.72e-01 0.0402 0.0949 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0937 0.101 0.26 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.01e-02 -0.125 0.0533 0.26 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.79e-01 0.0145 0.0949 0.26 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.40e-01 0.158 0.107 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 7.25e-02 -0.168 0.0933 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 2.62e-01 0.069 0.0613 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.50e-01 -0.133 0.0922 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0632 0.0566 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.05e-01 0.0252 0.102 0.255 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 7.93e-01 0.0269 0.103 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 4.42e-01 0.0728 0.0945 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.48e-01 -0.107 0.0739 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0557 0.097 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 4.05e-01 -0.039 0.0467 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00337 0.0976 0.252 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.68e-01 0.0413 0.0962 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 3.03e-01 -0.109 0.106 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 2.72e-01 0.0508 0.0461 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.48e-01 0.13 0.0894 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0576 0.051 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0968 0.0985 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.06e-01 -0.107 0.104 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 3.84e-01 0.0889 0.102 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0163 0.0556 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.17e-01 -0.16 0.101 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0794 0.0537 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 7.57e-01 -0.032 0.103 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0403 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 6.12e-01 0.0508 0.1 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.00e+00 -8.03e-06 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 8.76e-02 -0.0796 0.0464 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00193 0.0942 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 2.06e-01 -0.103 0.081 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.59e-01 0.112 0.0794 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 4.76e-02 -0.146 0.0732 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.69e-01 -0.053 0.0478 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0659 0.0922 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 2.05e-01 0.11 0.0868 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0627 0.0876 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.52e-01 -0.124 0.086 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.14e-02 -0.103 0.0443 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0226 0.104 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.01e-01 0.0849 0.101 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0573 0.101 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 2.82e-01 -0.104 0.0969 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 8.93e-02 -0.0675 0.0396 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0146 0.099 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.08e-01 -0.046 0.0894 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.28e-03 -0.237 0.082 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.78e-01 0.0838 0.0948 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.29e-01 -0.077 0.0506 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 2.20e-01 -0.121 0.0982 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0409 0.0964 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0477 0.103 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.75e-01 -0.12 0.0883 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.62e-01 -0.057 0.0506 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 6.88e-01 0.0409 0.102 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 5.75e-01 0.0616 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0955 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 4.44e-02 0.202 0.0997 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0318 0.049 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 1.15e-01 -0.169 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0322 0.0963 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 5.24e-01 0.0671 0.105 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.23e-01 0.161 0.104 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0507 0.0561 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 3.54e-01 0.0985 0.106 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0428 0.103 0.255 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.71e-01 0.0705 0.0976 0.255 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0976 0.0992 0.255 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0412 0.0488 0.255 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00929 0.102 0.255 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0739 0.108 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0294 0.1 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 9.38e-02 -0.17 0.101 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0843 0.0565 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.93e-01 0.116 0.089 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 8.70e-01 0.0134 0.0819 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 6.25e-01 0.0501 0.102 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 9.36e-02 -0.068 0.0404 0.256 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 6.83e-01 -0.045 0.11 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.74e-01 -0.136 0.0998 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.46e-01 0.147 0.101 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0138 0.0473 0.253 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.42e-01 0.0711 0.0922 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000251 0.0895 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 5.11e-01 0.0661 0.1 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0616 0.0544 0.256 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 7.30e-01 0.0434 0.125 0.256 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 1.00e-01 0.175 0.106 0.256 PB L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.22e-01 -0.138 0.0884 0.256 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 5.11e-01 0.0717 0.109 0.256 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 6.02e-01 0.0324 0.0619 0.256 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0232 0.116 0.256 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0581 0.104 0.252 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.68e-02 -0.22 0.0913 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0744 0.0992 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0236 0.0375 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.92e-02 -0.16 0.0966 0.252 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0734 0.105 0.254 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0337 0.0989 0.254 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00763 0.0832 0.254 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0359 0.0367 0.254 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 7.01e-01 -0.04 0.104 0.254 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 2.04e-01 -0.137 0.108 0.266 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 6.76e-02 0.155 0.0841 0.266 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 9.22e-03 -0.218 0.0827 0.266 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 3.14e-01 0.0998 0.0988 0.266 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0885 0.0963 0.266 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0401 0.0476 0.266 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 3.96e-02 -0.193 0.0933 0.266 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 152178 sc-eQTL 4.25e-01 0.0603 0.0753 0.266 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.20e-01 0.132 0.0847 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 7.31e-01 0.0222 0.0646 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0386 0.0913 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 3.71e-02 0.191 0.0912 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.34e-01 -0.11 0.0733 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 9.32e-01 0.0035 0.0409 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.85e-02 0.13 0.0784 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 5.28e-01 0.061 0.0964 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.51e-03 0.196 0.0684 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 9.96e-01 0.0004 0.0871 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 3.34e-02 0.2 0.0935 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.98e-02 -0.127 0.0613 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 5.14e-01 0.0291 0.0445 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 1.60e-01 -0.116 0.0821 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.14e-01 0.217 0.137 0.264 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 9.61e-01 0.00581 0.119 0.264 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0417 0.131 0.264 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0449 0.0498 0.264 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.42e-01 0.00948 0.129 0.264 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 1.44e-01 0.142 0.0972 0.258 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0136 0.0933 0.258 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 6.29e-02 -0.175 0.0934 0.258 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 9.48e-01 0.00605 0.0931 0.258 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00675 0.0946 0.258 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0183 0.0412 0.258 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00688 0.1 0.258 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0918 0.105 0.256 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00687 0.0712 0.256 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0442 0.1 0.256 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 4.90e-02 0.195 0.0987 0.256 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0037 0.0958 0.256 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.84e-01 0.0515 0.0479 0.256 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00454 0.0849 0.256 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0244 0.122 0.268 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 5.47e-01 0.0492 0.0814 0.268 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0353 0.082 0.268 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 8.48e-01 0.016 0.0835 0.268 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.14e-01 -0.157 0.0987 0.268 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0219 0.0685 0.268 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 2.94e-01 0.106 0.101 0.268 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 152178 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00921 0.097 0.268 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.99e-01 0.0861 0.102 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 1.88e-01 -0.13 0.0987 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.98e-01 0.0381 0.0561 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 1.86e-01 -0.117 0.0885 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0619 0.0504 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 8.41e-01 0.0187 0.0929 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0649 0.0973 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 853831 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0503 0.107 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 8.46e-01 0.00853 0.0439 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 7.21e-01 0.0305 0.0852 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0755 0.0513 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 1.90e-01 -0.127 0.0969 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 2.33e-01 0.0926 0.0773 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 1.04e-01 0.0877 0.0536 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0597 0.0879 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 4.80e-02 0.181 0.0909 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 2.62e-02 -0.134 0.06 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000536 0.0416 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 4.90e-01 0.0511 0.0739 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.71e-01 0.0907 0.101 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0489 0.0668 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 520541 sc-eQTL 1.73e-01 -0.134 0.098 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 541251 sc-eQTL 1.75e-01 0.132 0.0971 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 8.29e-01 0.0199 0.092 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 4.33e-01 0.0306 0.039 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 441967 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0524 0.0947 0.256 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -696864 sc-eQTL 3.91e-01 0.0709 0.0825 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 742108 sc-eQTL 9.00e-01 0.00979 0.0776 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 491847 sc-eQTL 3.71e-01 0.088 0.0981 0.256 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 440737 sc-eQTL 2.64e-01 -0.0448 0.04 0.256 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 520541 eQTL 0.0136 -0.0407 0.0165 0.0 0.0 0.263
ENSG00000112299 VNN1 541251 pQTL 0.000394 0.141 0.0396 0.0 0.0 0.262
ENSG00000112299 VNN1 541251 eQTL 0.000702 0.0831 0.0244 0.0 0.0 0.263
ENSG00000112303 VNN2 491847 pQTL 7.29e-05 -0.113 0.0285 0.0 0.0 0.262
ENSG00000112303 VNN2 491847 eQTL 0.0365 -0.0307 0.0146 0.0 0.0 0.263
ENSG00000234484 AL032821.1 502631 eQTL 0.024 0.0794 0.0351 0.0 0.0 0.263

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina