logo

Genes within 1Mb (chr6:133254229:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 9.16e-01 0.0126 0.119 0.143 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0462 0.125 0.143 B L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 1.67e-01 0.0653 0.0471 0.143 B L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.75e-01 0.0028 0.0889 0.143 B L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0395 0.0537 0.143 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 1.27e-01 0.173 0.112 0.143 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.87e-01 0.0941 0.0881 0.143 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.09e-02 0.16 0.0912 0.143 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 5.39e-01 0.049 0.0795 0.143 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.82e-01 0.0473 0.054 0.143 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.94e-01 0.0933 0.109 0.143 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 6.18e-01 0.0429 0.0859 0.143 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0432 0.0897 0.143 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0722 0.105 0.143 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00459 0.0358 0.143 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0142 0.108 0.143 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.47e-01 0.156 0.134 0.144 DC L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 9.08e-01 0.0097 0.0836 0.144 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 7.51e-01 0.0329 0.104 0.144 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0646 0.112 0.144 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.144 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.40e-01 -0.064 0.067 0.144 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 2.74e-01 -0.116 0.106 0.144 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 151101 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0197 0.0967 0.144 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 6.73e-01 0.0396 0.0937 0.143 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.13e-01 0.0318 0.0627 0.143 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 3.37e-01 -0.103 0.107 0.143 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 7.79e-01 0.0325 0.116 0.143 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.04e-01 0.00992 0.0818 0.143 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0293 0.049 0.143 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0382 0.0969 0.143 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.36e-01 0.12 0.101 0.144 NK L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0169 0.0935 0.144 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0846 0.116 0.144 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0596 0.048 0.144 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.96e-01 -0.124 0.119 0.143 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 7.94e-01 0.0245 0.0937 0.143 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 8.12e-02 0.197 0.113 0.143 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0426 0.0448 0.143 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 7.60e-01 0.0376 0.123 0.143 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 3.67e-01 -0.124 0.137 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 5.04e-01 0.0839 0.125 0.143 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.05e-01 -0.149 0.117 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 3.46e-01 0.118 0.125 0.143 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.98e-01 0.0456 0.0671 0.143 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 1.97e-01 0.151 0.117 0.143 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 9.09e-01 0.0151 0.132 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 1.91e-01 0.152 0.116 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 3.32e-01 0.0738 0.0759 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.65e-01 0.0837 0.114 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0191 0.0701 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 6.59e-01 0.0558 0.126 0.142 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.64e-01 -0.177 0.126 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 3.43e-01 0.111 0.117 0.144 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.11e-01 0.115 0.0915 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0167 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0423 0.0578 0.144 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 2.07e-01 0.152 0.12 0.144 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 3.95e-01 -0.102 0.119 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 6.58e-01 0.0582 0.131 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 3.49e-01 0.0538 0.0573 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 1.37e-01 -0.166 0.111 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.18e-01 0.023 0.0634 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 5.41e-01 0.0749 0.122 0.143 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 8.44e-01 0.0247 0.125 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 1.77e-01 -0.164 0.121 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.80e-01 0.0274 0.0664 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 3.76e-01 0.108 0.122 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.89e-01 0.0683 0.0644 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.65e-01 0.111 0.123 0.144 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.76e-02 0.298 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 1.16e-01 0.197 0.125 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 2.87e-01 0.135 0.126 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 1.30e-01 0.0884 0.0581 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.74e-01 0.0845 0.118 0.139 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0361 0.101 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 1.98e-01 0.128 0.0989 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.78e-01 0.0653 0.0919 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 1.23e-01 0.0919 0.0594 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.05e-01 0.0958 0.115 0.143 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 4.23e-01 0.0878 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 1.74e-01 0.15 0.11 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00611 0.109 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0168 0.0563 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.20e-01 0.105 0.13 0.143 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 8.61e-01 0.022 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0637 0.125 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.20e-01 0.0121 0.12 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.09e-01 0.0619 0.0491 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 7.42e-01 0.0404 0.123 0.143 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 8.73e-01 0.0176 0.11 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.81e-01 -0.111 0.103 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 3.80e-01 -0.103 0.117 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.63e-01 0.046 0.0625 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 5.76e-01 0.0679 0.121 0.143 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 8.79e-01 0.018 0.119 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.23e-01 0.0621 0.126 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0391 0.109 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 9.89e-01 0.000892 0.0624 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 7.33e-01 0.0427 0.125 0.143 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 6.58e-01 0.0613 0.138 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 4.02e-01 -0.107 0.128 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0862 0.127 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.65e-01 0.0689 0.0617 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.07e-01 0.112 0.135 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.76e-01 0.163 0.12 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 9.60e-01 0.00655 0.132 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 6.66e-01 0.0566 0.131 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 1.45e-01 0.102 0.07 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.10e-01 -0.11 0.133 0.144 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 9.02e-01 0.0155 0.125 0.143 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 9.13e-01 0.0131 0.119 0.143 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.06e-02 0.204 0.12 0.143 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0303 0.0595 0.143 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 7.80e-01 0.0349 0.125 0.143 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0517 0.133 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 3.69e-01 0.111 0.123 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 1.10e-01 0.2 0.125 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0187 0.0699 0.142 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.50e-01 0.157 0.108 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0183 0.0997 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 1.59e-01 -0.175 0.124 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0145 0.0495 0.142 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 4.06e-01 -0.108 0.13 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0294 0.118 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0275 0.12 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.31e-01 -0.044 0.0557 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.82e-01 0.12 0.111 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00205 0.108 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 3.67e-01 -0.11 0.121 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0405 0.0659 0.142 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.97e-01 0.154 0.147 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0608 0.126 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0959 0.105 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 7.03e-01 0.0492 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.78e-02 -0.128 0.072 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.52e-01 -0.127 0.136 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 9.28e-01 0.0113 0.125 0.143 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 1.39e-01 0.165 0.111 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 6.35e-01 0.057 0.12 0.143 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0084 0.0454 0.143 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 2.39e-01 0.138 0.117 0.143 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.03e-01 0.165 0.129 0.143 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.02e-01 0.156 0.122 0.143 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0077 0.103 0.143 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0432 0.0454 0.143 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 5.47e-01 0.0774 0.128 0.143 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 2.24e-01 0.169 0.139 0.139 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 4.93e-01 -0.075 0.109 0.139 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 4.04e-02 0.222 0.107 0.139 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 8.45e-01 -0.025 0.128 0.139 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 9.03e-01 0.0151 0.124 0.139 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0531 0.0613 0.139 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.77e-01 0.107 0.121 0.139 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 151101 sc-eQTL 2.94e-01 -0.102 0.097 0.139 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 4.91e-01 0.0753 0.109 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0171 0.0829 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0924 0.117 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0722 0.118 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.50e-01 0.0714 0.0944 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.03e-01 -0.02 0.0525 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0237 0.101 0.143 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.72e-01 -0.168 0.123 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0306 0.089 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0651 0.111 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 2.52e-01 0.138 0.12 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0334 0.0791 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0635 0.0568 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 9.72e-01 0.00364 0.105 0.143 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.88e-01 -0.213 0.161 0.136 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 3.71e-01 0.124 0.139 0.136 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 3.15e-01 -0.155 0.153 0.136 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 1.09e-01 0.0937 0.0581 0.136 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.58e-01 -0.139 0.151 0.136 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0893 0.128 0.14 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.76e-01 0.133 0.122 0.14 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 7.35e-01 0.0417 0.123 0.14 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 4.84e-02 0.239 0.121 0.14 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 1.09e-01 0.198 0.123 0.14 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 7.04e-01 0.0205 0.0538 0.14 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0747 0.131 0.14 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 7.60e-01 0.0392 0.128 0.143 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0118 0.0865 0.143 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 8.31e-01 0.0261 0.122 0.143 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 5.87e-01 -0.066 0.121 0.143 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 8.81e-01 0.0175 0.117 0.143 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 1.65e-01 -0.081 0.0582 0.143 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 3.09e-01 -0.105 0.103 0.143 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0916 0.158 0.136 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0432 0.105 0.136 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0216 0.106 0.136 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 4.42e-01 0.0828 0.107 0.136 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 2.68e-01 0.142 0.128 0.136 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.0878 0.136 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.56e-02 -0.26 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 151101 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0551 0.125 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 7.56e-01 0.0399 0.128 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 2.23e-01 0.152 0.124 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.50e-01 0.0813 0.0704 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 6.77e-01 0.0466 0.112 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0118 0.0637 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 2.48e-01 0.135 0.116 0.143 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0603 0.119 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 852754 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0335 0.131 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 2.26e-01 0.0651 0.0536 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0459 0.104 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 4.77e-01 0.045 0.0631 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 4.38e-01 0.0926 0.119 0.143 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 9.67e-01 -0.004 0.0979 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 7.82e-01 0.0189 0.0681 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 3.36e-01 -0.107 0.111 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 5.69e-01 0.066 0.116 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 5.27e-01 0.0485 0.0765 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0468 0.0524 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 9.13e-01 0.0102 0.0934 0.143 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0699 0.126 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.35e-01 0.0394 0.0829 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 519464 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0417 0.122 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 540174 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0344 0.121 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 4.76e-01 0.0813 0.114 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 6.79e-01 -0.02 0.0484 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 sc-eQTL 2.25e-01 -0.143 0.117 0.144 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -697941 sc-eQTL 1.57e-01 0.141 0.0991 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 741031 sc-eQTL 6.62e-01 -0.041 0.0935 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 490770 sc-eQTL 2.23e-01 -0.144 0.118 0.142 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 439660 sc-eQTL 2.14e-01 -0.06 0.0481 0.142 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 eQTL 0.0443 -0.0572 0.0284 0.0 0.0 0.174

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 852754 2.77e-07 1.7e-07 5.64e-08 2.44e-07 9.79e-08 8.45e-08 1.9e-07 5.53e-08 1.59e-07 6.4e-08 1.83e-07 9.19e-08 2.74e-07 8.13e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.18e-08 1.64e-07 7.39e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.87e-08 2.09e-07 1.22e-07 1.13e-07 1.1e-07 1.23e-07 1.06e-07 1.14e-07 2.96e-08 3.96e-08 9.58e-08 3.97e-08 3.14e-08 6.04e-08 9.36e-08 6.5e-08 7.65e-08 5.34e-08 1.62e-07 5.22e-08 1.92e-08 4.25e-08 1.87e-08 1.21e-07 4.04e-09 4.85e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 440890 1.17e-06 9.34e-07 1.5e-07 6.45e-07 1.05e-07 3.24e-07 7.25e-07 1.62e-07 8.66e-07 3.1e-07 1.26e-06 4.28e-07 1.63e-06 2.09e-07 3.35e-07 3.36e-07 5.63e-07 5.02e-07 3.95e-07 2.27e-07 2.38e-07 5.5e-07 4.4e-07 2.39e-07 1.69e-06 2.57e-07 4e-07 4.11e-07 4.88e-07 8.47e-07 4.61e-07 5.82e-08 5.47e-08 2.72e-07 3.27e-07 1.46e-07 3.62e-07 7.93e-08 8.45e-08 4.17e-08 8.42e-08 1.43e-06 2.88e-08 9e-08 1.1e-07 1.31e-08 8.01e-08 0.0 4.59e-08