logo

Genes within 1Mb (chr6:133242316:G:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0193 0.0969 0.252 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0385 0.102 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.96e-01 0.0263 0.0386 0.252 B L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0491 0.0725 0.252 B L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0154 0.0439 0.252 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 2.03e-01 -0.117 0.092 0.252 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.41e-01 -0.044 0.0719 0.252 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.01e-01 0.0629 0.0747 0.252 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 2.48e-02 -0.145 0.064 0.252 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0621 0.0438 0.252 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0373 0.0891 0.252 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0934 0.0702 0.252 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.05e-01 -0.119 0.0732 0.252 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0329 0.0859 0.252 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0385 0.0293 0.252 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00435 0.0888 0.252 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.19e-01 -0.169 0.108 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 3.83e-01 0.059 0.0675 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 7.86e-02 -0.147 0.0831 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 2.32e-01 0.108 0.0901 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0495 0.0967 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.12e-01 -0.0677 0.0541 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 5.41e-01 0.0525 0.0858 0.259 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 139188 sc-eQTL 9.28e-01 0.00711 0.0782 0.259 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.60e-01 0.0689 0.0751 0.252 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 3.47e-01 0.0473 0.0502 0.252 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0779 0.0862 0.252 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 2.48e-02 0.208 0.0919 0.252 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 4.24e-02 -0.133 0.065 0.252 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00077 0.0393 0.252 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 6.62e-01 0.034 0.0778 0.252 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.57e-01 0.0945 0.0832 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 9.57e-01 0.00415 0.0772 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 5.71e-01 0.0545 0.096 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0542 0.0396 0.253 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0966 0.252 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.29e-01 0.0165 0.0762 0.252 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.81e-01 -0.123 0.0918 0.252 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 7.30e-02 -0.0654 0.0363 0.252 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00265 0.1 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 8.17e-01 0.0256 0.111 0.258 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 9.96e-01 0.000515 0.101 0.258 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 6.76e-01 0.0397 0.0948 0.258 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0877 0.101 0.258 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.46e-02 -0.121 0.0533 0.258 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.14e-01 0.0103 0.0947 0.258 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.81e-01 0.143 0.107 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 5.87e-02 -0.178 0.0935 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 2.26e-01 0.0747 0.0615 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.24e-01 -0.143 0.0924 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0615 0.0567 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.10e-01 0.0246 0.102 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 7.44e-01 0.0336 0.103 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 4.50e-01 0.0718 0.0947 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.52e-01 -0.107 0.0741 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 5.86e-01 -0.053 0.0973 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0371 0.0468 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00941 0.0979 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 6.87e-01 0.0389 0.0964 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 3.00e-01 -0.11 0.106 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 3.13e-01 0.0467 0.0462 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.50e-01 0.13 0.0896 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0514 0.0511 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 3.08e-01 -0.101 0.0987 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0998 0.104 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 3.94e-01 0.0868 0.102 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.01e-01 -0.014 0.0555 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.48e-01 -0.147 0.101 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0774 0.0537 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0343 0.103 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0269 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 7.49e-01 0.0322 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 9.37e-01 0.00804 0.102 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 9.27e-02 -0.0787 0.0466 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0177 0.0946 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0937 0.0809 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.42e-01 0.117 0.0792 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 7.88e-02 -0.129 0.0732 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0566 0.0477 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0963 0.0918 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.40e-01 0.102 0.0868 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0645 0.0876 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.37e-01 -0.128 0.086 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.46e-02 -0.109 0.0442 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0535 0.104 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.66e-01 0.0916 0.101 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0581 0.101 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0981 0.0972 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 6.53e-02 -0.0734 0.0396 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00811 0.0993 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0386 0.0895 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.27e-03 -0.237 0.0821 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 3.55e-01 0.0879 0.0949 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0824 0.0506 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 2.26e-01 -0.119 0.0982 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0284 0.0967 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0326 0.103 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0885 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0541 0.0508 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.58e-01 0.0183 0.102 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.75e-01 0.0616 0.11 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0955 0.101 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 4.44e-02 0.202 0.0997 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0318 0.049 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 1.15e-01 -0.169 0.107 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0239 0.0967 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 5.99e-01 0.0555 0.105 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.01e-01 0.172 0.104 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0455 0.0564 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 4.01e-01 0.0897 0.107 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.55e-01 -0.061 0.103 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 6.19e-01 0.0487 0.0979 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 2.95e-01 -0.104 0.0994 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0446 0.0489 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.23e-01 -0.023 0.103 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0713 0.108 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0195 0.1 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.14e-01 -0.161 0.101 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.40e-01 -0.0839 0.0566 0.253 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.60e-01 0.126 0.0892 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 7.99e-01 0.0209 0.082 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 6.90e-01 0.0409 0.103 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 7.44e-02 -0.0724 0.0404 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0448 0.111 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.81e-01 -0.135 0.1 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.76e-01 0.138 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0114 0.0474 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.81e-01 0.0813 0.0926 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 9.61e-01 0.00436 0.0898 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 5.29e-01 0.0636 0.101 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0643 0.0546 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 8.08e-01 0.0305 0.125 0.252 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 8.91e-02 0.181 0.106 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.32e-01 -0.134 0.0884 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 5.30e-01 0.0686 0.109 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 6.24e-01 0.0304 0.0619 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0254 0.116 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0536 0.104 0.25 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 2.32e-02 -0.21 0.092 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0498 0.0998 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0283 0.0377 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 1.19e-01 -0.152 0.0972 0.25 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0707 0.105 0.252 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0223 0.0994 0.252 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 9.71e-01 0.00301 0.0836 0.252 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0342 0.0369 0.252 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0615 0.104 0.252 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.32e-01 -0.129 0.108 0.263 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 5.23e-02 0.164 0.0839 0.263 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 8.73e-03 -0.219 0.0826 0.263 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 2.91e-01 0.104 0.0987 0.263 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0898 0.0962 0.263 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0355 0.0475 0.263 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 5.52e-02 -0.18 0.0934 0.263 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 139188 sc-eQTL 5.88e-01 0.0409 0.0753 0.263 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.55e-01 0.121 0.0849 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.94e-01 0.00864 0.0647 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0379 0.0915 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 3.17e-02 0.197 0.0913 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.28e-01 -0.112 0.0734 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 9.99e-01 -2.99e-05 0.041 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 1.01e-01 0.129 0.0786 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.04e-01 0.0645 0.0965 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 7.54e-03 0.185 0.0686 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 9.63e-01 0.00402 0.0871 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 3.47e-02 0.199 0.0936 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 4.90e-02 -0.122 0.0614 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 5.84e-01 0.0244 0.0446 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 1.49e-01 -0.119 0.0822 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.14e-01 0.217 0.137 0.264 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 9.61e-01 0.00581 0.119 0.264 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0417 0.131 0.264 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0449 0.0498 0.264 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.42e-01 0.00948 0.129 0.264 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 1.44e-01 0.142 0.0972 0.258 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0136 0.0933 0.258 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 6.29e-02 -0.175 0.0934 0.258 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 9.48e-01 0.00605 0.0931 0.258 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00675 0.0946 0.258 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0183 0.0412 0.258 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00688 0.1 0.258 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.13e-01 -0.107 0.106 0.253 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0121 0.0716 0.253 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0351 0.101 0.253 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 2.84e-02 0.219 0.0991 0.253 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 9.58e-01 0.00506 0.0965 0.253 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 3.15e-01 0.0487 0.0483 0.253 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0168 0.0855 0.253 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0203 0.124 0.266 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 5.40e-01 0.0506 0.0824 0.266 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0337 0.083 0.266 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 7.41e-01 0.028 0.0845 0.266 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 9.94e-02 -0.165 0.0997 0.266 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0224 0.0692 0.266 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 2.91e-01 0.108 0.102 0.266 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 139188 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00421 0.0981 0.266 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 4.14e-01 0.0834 0.102 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 1.56e-01 -0.141 0.0987 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.98e-01 0.0382 0.0562 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 1.49e-01 -0.128 0.0885 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.20e-01 -0.062 0.0505 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 8.90e-01 0.0128 0.093 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0589 0.0976 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 840841 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0544 0.107 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 9.14e-01 0.00476 0.044 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 6.72e-01 0.0362 0.0854 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0711 0.0515 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 1.74e-01 -0.132 0.0971 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 2.69e-01 0.086 0.0775 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 1.61e-01 0.0757 0.0538 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0542 0.088 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 3.97e-02 0.188 0.091 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 3.38e-02 -0.128 0.0601 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00369 0.0417 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 5.19e-01 0.0478 0.0741 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 5.02e-01 0.0683 0.101 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0537 0.0669 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 507551 sc-eQTL 2.03e-01 -0.125 0.0982 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 528261 sc-eQTL 1.16e-01 0.153 0.0971 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 7.86e-01 0.025 0.0921 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 5.35e-01 0.0243 0.0391 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 428977 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0697 0.0948 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -709854 sc-eQTL 3.31e-01 0.0804 0.0825 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 729118 sc-eQTL 8.52e-01 0.0145 0.0777 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 478857 sc-eQTL 4.01e-01 0.0827 0.0982 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 427747 sc-eQTL 2.22e-01 -0.049 0.04 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 507551 eQTL 0.0318 -0.0359 0.0167 0.0 0.0 0.253
ENSG00000112299 VNN1 528261 pQTL 0.00119 0.13 0.0401 0.0 0.0 0.252
ENSG00000112299 VNN1 528261 eQTL 0.000383 0.0882 0.0247 0.0 0.0 0.253
ENSG00000112303 VNN2 478857 pQTL 4.13e-05 -0.118 0.0288 0.0 0.0 0.252
ENSG00000112303 VNN2 478857 eQTL 0.0311 -0.032 0.0148 0.0 0.0 0.253
ENSG00000234484 AL032821.1 489641 eQTL 0.0313 0.0768 0.0356 0.0 0.0 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 528261 1.26e-06 9.59e-07 2.7e-07 1.58e-06 3.69e-07 5.95e-07 1.61e-06 2.66e-07 1.74e-06 6.65e-07 1.73e-06 8.37e-07 3.53e-06 7.96e-07 5.56e-07 1e-06 7.93e-07 1.14e-06 5.81e-07 5.62e-07 6.24e-07 1.91e-06 1.14e-06 5.81e-07 2.25e-06 2.8e-07 9.28e-07 8.53e-07 1.11e-06 1.19e-06 7.41e-07 5.83e-07 2.76e-07 1.44e-06 5.64e-07 6.16e-07 9.66e-07 4.2e-07 1.23e-06 3.46e-07 2.08e-07 1.66e-06 4.98e-07 1.83e-07 1.69e-07 3.7e-07 2.24e-07 2.41e-07 5.49e-07