logo

Genes within 1Mb (chr6:133239488:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 8.00e-01 -0.03 0.119 0.15 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.83e-01 0.0412 0.0471 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.42e-01 0.0177 0.0888 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 6.68e-01 -0.023 0.0537 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 2.61e-01 0.127 0.113 0.15 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 3.18e-01 0.0884 0.0882 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0916 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.69e-01 0.0454 0.0796 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.03e-01 0.0558 0.054 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.21e-01 0.0307 0.0859 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0897 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0945 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.41e-01 0.00264 0.0358 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0609 0.108 0.15 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 8.76e-02 0.227 0.132 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.28e-01 0.0179 0.0826 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 4.41e-01 0.0789 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 2.19e-01 0.145 0.118 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0815 0.0661 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0964 0.105 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 136360 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0234 0.0956 0.151 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.12e-01 0.0343 0.093 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0612 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0811 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0242 0.0486 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0293 0.0961 0.15 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.83e-01 0.0552 0.1 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0444 0.0928 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0628 0.115 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.69e-01 -0.043 0.0477 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0846 0.118 0.15 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 7.48e-01 0.03 0.093 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.33e-01 0.109 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0251 0.0446 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0168 0.122 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0762 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 6.70e-01 0.0531 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 1.50e-01 -0.168 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 4.64e-01 0.0909 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 4.56e-01 0.0496 0.0664 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 2.20e-01 0.143 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 8.28e-01 0.0288 0.132 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.116 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 9.33e-01 0.00643 0.076 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.63e-01 0.00322 0.0701 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 8.59e-01 0.0224 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 6.54e-02 -0.232 0.125 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 4.08e-01 0.0965 0.116 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 1.90e-01 0.12 0.0911 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0502 0.0576 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0927 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 7.57e-01 0.0407 0.131 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 7.36e-01 0.0194 0.0573 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.40e-01 -0.106 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 5.82e-01 0.035 0.0634 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00945 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0113 0.0664 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.74e-01 0.108 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.91e-01 0.0844 0.0643 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 4.14e-02 0.255 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 2.02e-01 0.159 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 4.85e-01 0.088 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.08e-01 0.0933 0.0578 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 6.00e-01 0.0616 0.117 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0764 0.102 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0994 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.62e-01 0.0161 0.0924 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.18e-01 0.0935 0.0596 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 5.30e-01 0.0725 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 7.14e-01 0.0398 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0132 0.0564 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 5.38e-01 0.0806 0.131 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.64e-01 0.0719 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.61e-01 -0.114 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 6.56e-01 0.0534 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.62e-01 0.0685 0.0489 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00245 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0892 0.103 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 2.96e-01 -0.122 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.85e-01 0.0669 0.0624 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 9.59e-01 0.00618 0.121 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 9.56e-01 0.00656 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.65e-01 0.0548 0.126 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.99e-01 -4.42e-05 0.0625 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 7.53e-01 0.0395 0.125 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.77e-01 0.0769 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 2.64e-01 -0.142 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.50e-01 0.0886 0.0613 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 7.07e-01 0.0508 0.135 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 1.77e-01 0.162 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.75e-01 0.0207 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0832 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.34e-01 0.0834 0.0698 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.17e-01 -0.133 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.26e-01 0.044 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 7.12e-01 0.0439 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 2.13e-01 0.15 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0158 0.0595 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 9.44e-01 0.00873 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0512 0.132 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 8.49e-01 0.0132 0.0695 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0491 0.0991 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 2.27e-01 -0.15 0.124 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00283 0.0492 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.117 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 9.11e-01 0.0133 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0255 0.0553 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.05e-01 0.0423 0.112 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0491 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0722 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0276 0.0659 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 3.72e-01 0.132 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 1.59e-01 -0.176 0.124 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0981 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.87e-02 -0.149 0.0713 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 1.89e-01 -0.179 0.135 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00963 0.123 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 2.67e-01 0.122 0.11 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00541 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000255 0.0447 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.49e-01 0.108 0.115 0.152 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 1.35e-01 0.192 0.128 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 4.45e-01 0.0927 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00263 0.102 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0433 0.045 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 6.57e-01 0.0567 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 1.14e-01 0.214 0.135 0.146 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0455 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 1.58e-02 0.254 0.104 0.146 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0681 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 7.21e-01 0.0434 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0877 0.0595 0.146 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.81e-01 0.104 0.118 0.146 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 136360 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0452 0.0948 0.146 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.46e-01 0.0655 0.108 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0178 0.0823 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0821 0.116 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.64e-01 0.0542 0.0938 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0261 0.0521 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0545 0.101 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 9.50e-02 -0.204 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0179 0.0884 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0553 0.11 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 5.44e-01 0.0729 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 5.59e-01 -0.046 0.0785 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0551 0.0564 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 5.85e-01 0.0573 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 2.91e-01 -0.171 0.162 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.08e-01 0.142 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.84e-01 -0.135 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.74e-02 0.129 0.0578 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 4.15e-01 -0.124 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0513 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 3.46e-01 0.113 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00777 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 1.46e-01 0.174 0.119 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 6.14e-02 0.227 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 8.76e-01 0.00826 0.053 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 4.35e-01 -0.101 0.129 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.48e-01 0.0411 0.128 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 9.34e-01 0.00712 0.0863 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 7.43e-01 0.04 0.122 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 2.12e-01 -0.151 0.12 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 7.02e-01 0.0444 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0693 0.0581 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.149 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0806 0.161 0.141 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0662 0.107 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 9.70e-01 0.00407 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 6.43e-01 0.0509 0.11 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 2.38e-01 -0.106 0.0895 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 1.07e-01 -0.214 0.132 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 136360 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0782 0.127 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.128 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 2.24e-01 0.151 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 5.75e-01 0.0395 0.0704 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 6.59e-01 0.0492 0.111 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 8.60e-01 0.0112 0.0635 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 3.71e-01 0.104 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0749 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 838013 sc-eQTL 9.94e-01 0.00106 0.131 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.01e-01 0.0282 0.0539 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 8.93e-01 -0.014 0.105 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.40e-01 0.0605 0.0632 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 7.11e-01 0.0443 0.119 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0238 0.0971 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 8.21e-01 0.0153 0.0675 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 7.47e-01 0.0245 0.0759 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0501 0.0519 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 8.79e-01 0.0141 0.0926 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 7.74e-01 -0.036 0.125 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 6.24e-01 0.0405 0.0825 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 504723 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0772 0.121 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 525433 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 4.22e-01 0.0911 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00508 0.0481 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 sc-eQTL 1.85e-01 -0.155 0.116 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -712682 sc-eQTL 3.96e-01 0.0839 0.0987 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 726290 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0728 0.0927 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 476029 sc-eQTL 3.24e-01 -0.116 0.117 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 424919 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0472 0.0479 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 eQTL 0.0459 -0.0551 0.0276 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 838013 1.24e-06 1.39e-06 1.87e-07 1.43e-06 1.56e-07 4.12e-07 8.73e-07 1.09e-07 1.12e-06 2.43e-07 1.67e-06 6.16e-07 1.46e-06 3.41e-07 4.6e-07 6.7e-07 7.47e-07 5.16e-07 3.95e-07 4.25e-07 2.3e-07 1.24e-06 5.67e-07 3.59e-07 1.94e-06 2.33e-07 6.3e-07 2.68e-07 4.33e-07 6.73e-07 5.43e-07 6.2e-08 4.34e-08 5.82e-07 7.08e-07 6.52e-08 2.9e-07 7.98e-08 2.21e-07 3.01e-08 1.01e-07 1.26e-06 7.6e-08 5.71e-09 4.99e-08 4.48e-08 9.83e-08 2.41e-08 4.8e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 426149 1.88e-06 5.05e-06 2.46e-07 3.41e-06 4.71e-07 7.26e-07 1.9e-06 4.05e-07 2.43e-06 7.15e-07 3.62e-06 2.24e-06 3.69e-06 1.97e-06 9.02e-07 2e-06 1.55e-06 2.17e-06 6.96e-07 1.15e-06 6.18e-07 3.73e-06 1.94e-06 9.4e-07 4.27e-06 6.57e-07 1.42e-06 8.31e-07 1.75e-06 1.63e-06 2.03e-06 3.03e-07 1.75e-07 1.22e-06 2.01e-06 4.75e-07 8.34e-07 2.79e-07 1.3e-06 3.73e-07 2.82e-07 3.33e-06 6.51e-07 1.91e-07 1.69e-07 3.46e-07 2.26e-07 2.62e-07 5.4e-08