logo

Genes within 1Mb (chr6:133233803:T:TTTTG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 2.12e-01 -0.199 0.159 0.071 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0759 0.169 0.071 B L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 5.63e-01 0.0368 0.0636 0.071 B L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0653 0.12 0.071 B L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0494 0.0723 0.071 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 4.31e-02 -0.307 0.151 0.071 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.88e-01 0.0166 0.118 0.071 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0108 0.122 0.071 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.98e-02 -0.229 0.105 0.071 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0548 0.0719 0.071 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.82e-03 -0.449 0.142 0.071 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.62e-01 -0.087 0.118 0.071 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00875 0.123 0.071 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.60e-01 -0.162 0.144 0.071 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0386 0.0492 0.071 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 8.73e-03 -0.388 0.146 0.071 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 2.43e-01 -0.208 0.178 0.072 DC L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 8.82e-01 0.0165 0.111 0.072 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00148 0.137 0.072 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0232 0.148 0.072 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.87e-01 -0.137 0.158 0.072 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.05e-01 0.046 0.0888 0.072 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 4.61e-01 0.104 0.14 0.072 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 130675 sc-eQTL 4.86e-01 0.0893 0.128 0.072 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.79e-01 0.0869 0.122 0.071 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 3.38e-01 0.0786 0.0819 0.071 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0709 0.141 0.071 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 3.85e-01 -0.132 0.151 0.071 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.18e-01 -0.132 0.107 0.071 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.79e-01 0.00979 0.0641 0.071 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 4.08e-01 -0.105 0.127 0.071 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.39e-01 0.106 0.136 0.071 NK L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0721 0.126 0.071 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0528 0.157 0.071 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0357 0.0649 0.071 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0277 0.159 0.071 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 7.44e-01 0.0408 0.125 0.071 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 1.97e-01 -0.195 0.151 0.071 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00253 0.0599 0.071 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 5.88e-01 -0.089 0.164 0.071 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 6.94e-01 0.0699 0.177 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0209 0.162 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 1.25e-01 0.233 0.151 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 7.20e-02 -0.29 0.16 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.12e-01 -0.137 0.0861 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0723 0.152 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 5.11e-01 -0.117 0.178 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 1.38e-01 -0.231 0.155 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.24e-01 0.00979 0.102 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0626 0.154 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0714 0.0941 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0979 0.17 0.071 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.87e-01 0.024 0.168 0.069 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 3.03e-01 0.16 0.155 0.069 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 3.44e-01 -0.115 0.121 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 1.60e-01 -0.223 0.158 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.87e-01 -0.101 0.0763 0.069 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 2.73e-02 -0.351 0.158 0.069 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0869 0.159 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 1.66e-01 -0.241 0.174 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.00e-01 0.04 0.0762 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.35e-02 0.334 0.146 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0971 0.0841 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.88e-01 -0.214 0.162 0.071 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.86e-01 -0.224 0.169 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0134 0.165 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.70e-01 0.0384 0.09 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 4.11e-01 -0.136 0.165 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.51e-01 -0.126 0.0871 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.67e-01 -0.23 0.166 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.62e-01 0.122 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0463 0.165 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.40e-01 -0.159 0.166 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 7.50e-01 0.0245 0.077 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 4.87e-01 0.108 0.155 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0322 0.136 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 5.89e-01 0.072 0.133 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.71e-02 -0.256 0.122 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0378 0.0799 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 6.50e-03 -0.416 0.151 0.071 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.97e-01 0.0186 0.143 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0991 0.144 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.14e-01 -0.176 0.142 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.04e-01 -0.119 0.0732 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.18e-03 -0.547 0.166 0.071 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 2.10e-01 0.209 0.166 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0934 0.167 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.57e-01 -0.148 0.16 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0319 0.0658 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 3.73e-02 -0.339 0.162 0.071 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.32e-01 -0.117 0.149 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0425 0.14 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0197 0.159 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0131 0.0849 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.62e-01 -0.23 0.164 0.071 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 5.82e-01 0.0886 0.161 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.39e-01 -0.133 0.171 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0957 0.148 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.78e-01 -0.013 0.0847 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.34e-02 -0.417 0.167 0.071 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 9.53e-01 0.0107 0.183 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.50e-01 -0.0106 0.17 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 9.80e-01 0.00431 0.169 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0716 0.082 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 3.57e-02 -0.376 0.178 0.067 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 5.88e-01 0.0857 0.158 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 1.05e-01 0.279 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.02e-01 -0.115 0.171 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.19e-01 -0.046 0.0923 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.68e-01 -0.24 0.174 0.073 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0639 0.169 0.071 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 8.92e-01 0.0218 0.16 0.071 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 1.71e-01 -0.223 0.162 0.071 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.50e-01 0.0152 0.0801 0.071 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0855 0.168 0.071 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.93e-01 0.227 0.174 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 2.81e-01 -0.175 0.162 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00802 0.165 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.28e-01 -0.14 0.0913 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.01e-01 0.238 0.144 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.17e-01 -0.014 0.133 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.78e-01 0.0928 0.166 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0785 0.0659 0.071 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.77e-01 -0.132 0.185 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 3.55e-01 -0.156 0.168 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.51e-01 -0.159 0.17 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0253 0.0795 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.97e-01 0.0195 0.15 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0586 0.145 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.38e-01 -0.156 0.163 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0462 0.0884 0.071 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0164 0.199 0.078 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 2.05e-01 0.215 0.169 0.078 PB L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0721 0.142 0.078 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 9.56e-01 0.0095 0.174 0.078 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 5.38e-01 0.0607 0.0984 0.078 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 9.14e-01 0.0199 0.185 0.078 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 9.79e-01 0.00456 0.17 0.07 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.28e-01 -0.12 0.151 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0181 0.163 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.63e-01 0.0269 0.0615 0.07 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 2.92e-01 -0.168 0.159 0.07 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.54e-01 0.032 0.174 0.071 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0948 0.164 0.071 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 4.75e-01 0.0985 0.138 0.071 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0923 0.0606 0.071 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0549 0.172 0.071 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.64e-01 -0.128 0.174 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.59e-02 0.272 0.135 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 2.52e-01 -0.155 0.135 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 8.21e-01 0.0362 0.16 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.94e-02 -0.292 0.154 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 9.46e-01 0.00524 0.0768 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 4.16e-01 -0.124 0.152 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 130675 sc-eQTL 4.54e-01 0.0911 0.121 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0224 0.14 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.46e-01 0.081 0.106 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00568 0.15 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 2.72e-01 -0.166 0.151 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 1.65e-01 -0.168 0.121 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0108 0.0672 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 6.79e-01 0.0537 0.13 0.071 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 2.61e-01 0.177 0.157 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 2.43e-01 0.133 0.113 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 2.51e-01 -0.163 0.142 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 4.02e-01 -0.129 0.154 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 3.08e-01 -0.103 0.101 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0161 0.0727 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 2.84e-02 -0.294 0.133 0.071 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.56e-01 0.297 0.208 0.076 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.95e-01 -0.123 0.18 0.076 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 4.36e-01 -0.155 0.199 0.076 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 4.31e-01 0.0597 0.0757 0.076 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 3.08e-01 0.2 0.195 0.076 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.75e-01 0.213 0.157 0.073 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 4.51e-01 -0.113 0.15 0.073 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 4.51e-01 -0.115 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 8.63e-02 -0.257 0.149 0.073 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 1.67e-01 -0.211 0.152 0.073 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0883 0.0662 0.073 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0501 0.162 0.073 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0423 0.169 0.075 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00796 0.114 0.075 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 1.86e-01 -0.213 0.161 0.075 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0961 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.13e-01 -0.101 0.154 0.075 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 3.44e-01 0.0732 0.0772 0.075 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0437 0.137 0.075 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0171 0.19 0.076 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0561 0.126 0.076 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 6.51e-01 0.0576 0.127 0.076 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 9.34e-02 -0.216 0.128 0.076 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.81e-01 -0.166 0.153 0.076 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 5.22e-01 0.0679 0.106 0.076 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 9.50e-03 0.403 0.153 0.076 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 130675 sc-eQTL 7.88e-01 0.0405 0.15 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.20e-01 -0.137 0.169 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 6.93e-01 -0.065 0.165 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 8.62e-01 0.0163 0.0933 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 4.52e-02 -0.295 0.146 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0456 0.0841 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.40e-01 -0.228 0.154 0.071 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 1.90e-01 -0.209 0.159 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 832328 sc-eQTL 3.31e-01 -0.17 0.175 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 7.59e-01 0.0221 0.0719 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.70e-01 0.154 0.139 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 1.87e-01 -0.111 0.0841 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 1.20e-01 -0.247 0.158 0.071 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 5.89e-01 0.0688 0.127 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 2.64e-01 0.0987 0.0881 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0479 0.144 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 2.97e-01 -0.157 0.15 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 2.19e-01 -0.122 0.099 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 7.59e-01 -0.021 0.0681 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0657 0.121 0.071 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 6.33e-01 0.0776 0.162 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 1.95e-01 -0.139 0.107 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 499038 sc-eQTL 2.81e-01 -0.17 0.157 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 519748 sc-eQTL 1.85e-01 -0.207 0.156 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0854 0.147 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 8.78e-01 0.00963 0.0625 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 sc-eQTL 7.82e-01 -0.042 0.152 0.071 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -718367 sc-eQTL 4.27e-01 0.107 0.134 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 720605 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0599 0.126 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 470344 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0724 0.16 0.071 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 419234 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0304 0.0651 0.071 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 499038 eQTL 0.00394 -0.0864 0.0299 0.0 0.0 0.0608
ENSG00000112299 VNN1 519748 pQTL 0.00245 -0.224 0.0738 0.0 0.0 0.0592
ENSG00000112303 VNN2 470344 pQTL 1.46e-06 -0.256 0.0528 0.0 0.0 0.0592
ENSG00000112303 VNN2 470344 eQTL 0.00809 -0.0705 0.0266 0.0 0.0 0.0608
ENSG00000146409 SLC18B1 420464 eQTL 0.0482 -0.0906 0.0458 0.0 0.0 0.0608
ENSG00000234484 AL032821.1 481128 eQTL 4.85e-06 0.291 0.0633 0.0 0.0 0.0608

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina