logo

Genes within 1Mb (chr6:133221396:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 8.00e-01 -0.03 0.119 0.15 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.83e-01 0.0412 0.0471 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.42e-01 0.0177 0.0888 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 6.68e-01 -0.023 0.0537 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 2.61e-01 0.127 0.113 0.15 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 3.18e-01 0.0884 0.0882 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0916 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.69e-01 0.0454 0.0796 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.03e-01 0.0558 0.054 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.21e-01 0.0307 0.0859 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0897 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0945 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.41e-01 0.00264 0.0358 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0609 0.108 0.15 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 8.76e-02 0.227 0.132 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.28e-01 0.0179 0.0826 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 4.41e-01 0.0789 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 2.19e-01 0.145 0.118 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0815 0.0661 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0964 0.105 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 118268 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0234 0.0956 0.151 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.12e-01 0.0343 0.093 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0612 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0811 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0242 0.0486 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0293 0.0961 0.15 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.83e-01 0.0552 0.1 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0444 0.0928 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0628 0.115 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.69e-01 -0.043 0.0477 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0846 0.118 0.15 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 7.48e-01 0.03 0.093 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.33e-01 0.109 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0251 0.0446 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0168 0.122 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0762 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 6.70e-01 0.0531 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 1.50e-01 -0.168 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 4.64e-01 0.0909 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 4.56e-01 0.0496 0.0664 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 2.20e-01 0.143 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 8.28e-01 0.0288 0.132 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.116 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 9.33e-01 0.00643 0.076 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.63e-01 0.00322 0.0701 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 8.59e-01 0.0224 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 6.54e-02 -0.232 0.125 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 4.08e-01 0.0965 0.116 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 1.90e-01 0.12 0.0911 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0502 0.0576 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0927 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 7.57e-01 0.0407 0.131 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 7.36e-01 0.0194 0.0573 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.40e-01 -0.106 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 5.82e-01 0.035 0.0634 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00945 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0113 0.0664 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.74e-01 0.108 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.91e-01 0.0844 0.0643 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 4.14e-02 0.255 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 2.02e-01 0.159 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 4.85e-01 0.088 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.08e-01 0.0933 0.0578 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 6.00e-01 0.0616 0.117 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0764 0.102 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0994 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.62e-01 0.0161 0.0924 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.18e-01 0.0935 0.0596 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 5.30e-01 0.0725 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 7.14e-01 0.0398 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0132 0.0564 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 5.38e-01 0.0806 0.131 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.64e-01 0.0719 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.61e-01 -0.114 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 6.56e-01 0.0534 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.62e-01 0.0685 0.0489 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00245 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0892 0.103 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 2.96e-01 -0.122 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.85e-01 0.0669 0.0624 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 9.59e-01 0.00618 0.121 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 9.56e-01 0.00656 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.65e-01 0.0548 0.126 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.99e-01 -4.42e-05 0.0625 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 7.53e-01 0.0395 0.125 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.77e-01 0.0769 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 2.64e-01 -0.142 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.50e-01 0.0886 0.0613 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 7.07e-01 0.0508 0.135 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 1.77e-01 0.162 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.75e-01 0.0207 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0832 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.34e-01 0.0834 0.0698 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.17e-01 -0.133 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.26e-01 0.044 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 7.12e-01 0.0439 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 2.13e-01 0.15 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0158 0.0595 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 9.44e-01 0.00873 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0512 0.132 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 8.49e-01 0.0132 0.0695 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0491 0.0991 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 2.27e-01 -0.15 0.124 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00283 0.0492 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.117 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 9.11e-01 0.0133 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0255 0.0553 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.05e-01 0.0423 0.112 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0491 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0722 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0276 0.0659 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 3.72e-01 0.132 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 1.59e-01 -0.176 0.124 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0981 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.87e-02 -0.149 0.0713 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 1.89e-01 -0.179 0.135 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00963 0.123 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 2.67e-01 0.122 0.11 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00541 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000255 0.0447 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.49e-01 0.108 0.115 0.152 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 1.35e-01 0.192 0.128 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 4.45e-01 0.0927 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00263 0.102 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0433 0.045 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 6.57e-01 0.0567 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 1.14e-01 0.214 0.135 0.146 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0455 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 1.58e-02 0.254 0.104 0.146 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0681 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 7.21e-01 0.0434 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0877 0.0595 0.146 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.81e-01 0.104 0.118 0.146 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 118268 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0452 0.0948 0.146 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.46e-01 0.0655 0.108 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0178 0.0823 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0821 0.116 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.64e-01 0.0542 0.0938 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0261 0.0521 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0545 0.101 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 9.50e-02 -0.204 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0179 0.0884 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0553 0.11 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 5.44e-01 0.0729 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 5.59e-01 -0.046 0.0785 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0551 0.0564 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 5.85e-01 0.0573 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 2.91e-01 -0.171 0.162 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.08e-01 0.142 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.84e-01 -0.135 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.74e-02 0.129 0.0578 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 4.15e-01 -0.124 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0513 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 3.46e-01 0.113 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00777 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 1.46e-01 0.174 0.119 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 6.14e-02 0.227 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 8.76e-01 0.00826 0.053 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 4.35e-01 -0.101 0.129 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.48e-01 0.0411 0.128 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 9.34e-01 0.00712 0.0863 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 7.43e-01 0.04 0.122 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 2.12e-01 -0.151 0.12 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 7.02e-01 0.0444 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0693 0.0581 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.149 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0806 0.161 0.141 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0662 0.107 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 9.70e-01 0.00407 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 6.43e-01 0.0509 0.11 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 2.38e-01 -0.106 0.0895 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 1.07e-01 -0.214 0.132 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 118268 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0782 0.127 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.128 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 2.24e-01 0.151 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 5.75e-01 0.0395 0.0704 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 6.59e-01 0.0492 0.111 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 8.60e-01 0.0112 0.0635 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 3.71e-01 0.104 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0749 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 819921 sc-eQTL 9.94e-01 0.00106 0.131 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.01e-01 0.0282 0.0539 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 8.93e-01 -0.014 0.105 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.40e-01 0.0605 0.0632 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 7.11e-01 0.0443 0.119 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0238 0.0971 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 8.21e-01 0.0153 0.0675 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 7.47e-01 0.0245 0.0759 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0501 0.0519 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 8.79e-01 0.0141 0.0926 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 7.74e-01 -0.036 0.125 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 6.24e-01 0.0405 0.0825 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 486631 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0772 0.121 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 507341 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 4.22e-01 0.0911 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00508 0.0481 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 sc-eQTL 1.85e-01 -0.155 0.116 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -730774 sc-eQTL 3.96e-01 0.0839 0.0987 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 708198 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0728 0.0927 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 457937 sc-eQTL 3.24e-01 -0.116 0.117 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 406827 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0472 0.0479 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 457937 eQTL 0.189 -0.0211 0.016 0.00106 0.0 0.184
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 eQTL 0.0461 -0.0549 0.0275 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 819921 2.76e-07 1.27e-07 4.69e-08 1.81e-07 9.25e-08 9.91e-08 1.6e-07 5.37e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.54e-07 9.19e-08 1.52e-07 7.13e-08 5.91e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.33e-07 5.75e-08 4.23e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.45e-07 3.03e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.1e-08 3.96e-08 8.34e-08 7.02e-08 3.62e-08 5.04e-08 8.93e-08 6.86e-08 3.76e-08 5.34e-08 1.33e-07 5.21e-08 1.61e-08 4.25e-08 1.84e-08 1.21e-07 1.88e-09 5.01e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 408057 9.36e-07 6.04e-07 1.07e-07 3.96e-07 9.45e-08 2.24e-07 5.9e-07 1.11e-07 4.3e-07 2.37e-07 7.15e-07 4.03e-07 8.34e-07 1.49e-07 2.44e-07 2.45e-07 3.52e-07 3.95e-07 2.12e-07 1.51e-07 1.91e-07 3.8e-07 3.77e-07 1.63e-07 8.33e-07 2.4e-07 2.72e-07 2.54e-07 3.99e-07 5.67e-07 3.13e-07 6.56e-08 5.31e-08 1.36e-07 3.36e-07 7.86e-08 1.09e-07 8.04e-08 6.49e-08 3.58e-08 1.01e-07 5.52e-07 2.99e-08 1.53e-08 1.26e-07 1.22e-08 1.24e-07 1.26e-08 5.96e-08