logo

Genes within 1Mb (chr6:133220181:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 8.00e-01 -0.03 0.119 0.15 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.125 0.15 B L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.83e-01 0.0412 0.0471 0.15 B L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.42e-01 0.0177 0.0888 0.15 B L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 6.68e-01 -0.023 0.0537 0.15 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 2.61e-01 0.127 0.113 0.15 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 3.18e-01 0.0884 0.0882 0.15 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 1.68e-01 0.127 0.0916 0.15 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.69e-01 0.0454 0.0796 0.15 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.03e-01 0.0558 0.054 0.15 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 7.56e-01 0.0341 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.21e-01 0.0307 0.0859 0.15 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0252 0.0897 0.15 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0945 0.105 0.15 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.41e-01 0.00264 0.0358 0.15 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0609 0.108 0.15 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 8.76e-02 0.227 0.132 0.151 DC L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.28e-01 0.0179 0.0826 0.151 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 4.41e-01 0.0789 0.102 0.151 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.11 0.151 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 2.19e-01 0.145 0.118 0.151 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0815 0.0661 0.151 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0964 0.105 0.151 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 117053 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0234 0.0956 0.151 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.12e-01 0.0343 0.093 0.15 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.35e-01 0.0296 0.0622 0.15 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 3.24e-01 -0.105 0.107 0.15 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0612 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0151 0.0811 0.15 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0242 0.0486 0.15 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0293 0.0961 0.15 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.83e-01 0.0552 0.1 0.15 NK L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0444 0.0928 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0628 0.115 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.69e-01 -0.043 0.0477 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0846 0.118 0.15 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 7.48e-01 0.03 0.093 0.15 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.33e-01 0.109 0.112 0.15 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0251 0.0446 0.15 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0168 0.122 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0762 0.136 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 6.70e-01 0.0531 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 1.50e-01 -0.168 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 4.64e-01 0.0909 0.124 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 4.56e-01 0.0496 0.0664 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 2.20e-01 0.143 0.116 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 8.28e-01 0.0288 0.132 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 1.64e-01 0.161 0.116 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 9.33e-01 0.00643 0.076 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.45e-01 0.108 0.114 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.63e-01 0.00322 0.0701 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 8.59e-01 0.0224 0.126 0.148 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 6.54e-02 -0.232 0.125 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 4.08e-01 0.0965 0.116 0.151 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 1.90e-01 0.12 0.0911 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0858 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0502 0.0576 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 2.87e-01 0.128 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0927 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 7.57e-01 0.0407 0.131 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 7.36e-01 0.0194 0.0573 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.40e-01 -0.106 0.111 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 5.82e-01 0.035 0.0634 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00945 0.122 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 4.08e-01 -0.101 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0113 0.0664 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.74e-01 0.108 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.91e-01 0.0844 0.0643 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.13e-01 0.124 0.123 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 4.14e-02 0.255 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 2.02e-01 0.159 0.124 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 4.85e-01 0.088 0.126 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.08e-01 0.0933 0.0578 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 6.00e-01 0.0616 0.117 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0764 0.102 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0994 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.62e-01 0.0161 0.0924 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.18e-01 0.0935 0.0596 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 5.30e-01 0.0725 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 3.20e-01 0.109 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.18e-01 0.11 0.11 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 7.14e-01 0.0398 0.109 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0132 0.0564 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 5.38e-01 0.0806 0.131 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.64e-01 0.0719 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.61e-01 -0.114 0.124 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 6.56e-01 0.0534 0.12 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.62e-01 0.0685 0.0489 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00245 0.122 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 8.67e-01 0.0184 0.11 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0892 0.103 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 2.96e-01 -0.122 0.117 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.85e-01 0.0669 0.0624 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 9.59e-01 0.00618 0.121 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 9.56e-01 0.00656 0.119 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.65e-01 0.0548 0.126 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.109 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.99e-01 -4.42e-05 0.0625 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 7.53e-01 0.0395 0.125 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.77e-01 0.0769 0.137 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 2.64e-01 -0.142 0.127 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0267 0.126 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.50e-01 0.0886 0.0613 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 7.07e-01 0.0508 0.135 0.141 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 1.77e-01 0.162 0.12 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.75e-01 0.0207 0.131 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0832 0.13 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.34e-01 0.0834 0.0698 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.17e-01 -0.133 0.132 0.151 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.26e-01 0.044 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 7.12e-01 0.0439 0.119 0.149 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 2.13e-01 0.15 0.121 0.149 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0158 0.0595 0.149 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 9.44e-01 0.00873 0.125 0.149 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0512 0.132 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.123 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 1.67e-01 0.172 0.124 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 8.49e-01 0.0132 0.0695 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 2.81e-01 0.117 0.108 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0491 0.0991 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 2.27e-01 -0.15 0.124 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00283 0.0492 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 2.85e-01 -0.138 0.129 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0287 0.117 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 9.11e-01 0.0133 0.119 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0255 0.0553 0.158 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.05e-01 0.0423 0.112 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0491 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0722 0.121 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0276 0.0659 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 3.72e-01 0.132 0.147 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 1.59e-01 -0.176 0.124 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0981 0.104 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 4.27e-01 0.102 0.128 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.87e-02 -0.149 0.0713 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 1.89e-01 -0.179 0.135 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00963 0.123 0.152 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 2.67e-01 0.122 0.11 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00541 0.118 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000255 0.0447 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.49e-01 0.108 0.115 0.152 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 1.35e-01 0.192 0.128 0.15 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 4.45e-01 0.0927 0.121 0.15 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00263 0.102 0.15 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0433 0.045 0.15 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 6.57e-01 0.0567 0.127 0.15 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 1.14e-01 0.214 0.135 0.146 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0455 0.107 0.146 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 1.58e-02 0.254 0.104 0.146 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0681 0.124 0.146 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 7.21e-01 0.0434 0.121 0.146 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0877 0.0595 0.146 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.81e-01 0.104 0.118 0.146 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 117053 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0452 0.0948 0.146 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.46e-01 0.0655 0.108 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0178 0.0823 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0821 0.116 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 2.73e-01 -0.129 0.117 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.64e-01 0.0542 0.0938 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0261 0.0521 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0545 0.101 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 9.50e-02 -0.204 0.122 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0179 0.0884 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0553 0.11 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 5.44e-01 0.0729 0.12 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 5.59e-01 -0.046 0.0785 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0551 0.0564 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 5.85e-01 0.0573 0.105 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 2.91e-01 -0.171 0.162 0.142 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.08e-01 0.142 0.139 0.142 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.84e-01 -0.135 0.154 0.142 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.74e-02 0.129 0.0578 0.142 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 4.15e-01 -0.124 0.152 0.142 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0513 0.126 0.144 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 3.46e-01 0.113 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00777 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 1.46e-01 0.174 0.119 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 6.14e-02 0.227 0.121 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 8.76e-01 0.00826 0.053 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 4.35e-01 -0.101 0.129 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.48e-01 0.0411 0.128 0.149 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 9.34e-01 0.00712 0.0863 0.149 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 7.43e-01 0.04 0.122 0.149 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 2.12e-01 -0.151 0.12 0.149 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 7.02e-01 0.0444 0.116 0.149 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0693 0.0581 0.149 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 2.82e-01 -0.111 0.103 0.149 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0806 0.161 0.141 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0662 0.107 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 9.70e-01 0.00407 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 6.43e-01 0.0509 0.11 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.09e-01 0.133 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 2.38e-01 -0.106 0.0895 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 1.07e-01 -0.214 0.132 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 117053 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0782 0.127 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 9.81e-01 0.00298 0.128 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 2.24e-01 0.151 0.124 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 5.75e-01 0.0395 0.0704 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 6.59e-01 0.0492 0.111 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 8.60e-01 0.0112 0.0635 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 3.71e-01 0.104 0.116 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0749 0.12 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 818706 sc-eQTL 9.94e-01 0.00106 0.131 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.01e-01 0.0282 0.0539 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 8.93e-01 -0.014 0.105 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.40e-01 0.0605 0.0632 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 7.11e-01 0.0443 0.119 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0238 0.0971 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 8.21e-01 0.0153 0.0675 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 3.56e-01 -0.102 0.11 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0107 0.115 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 7.47e-01 0.0245 0.0759 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0501 0.0519 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 8.79e-01 0.0141 0.0926 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 7.74e-01 -0.036 0.125 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 6.24e-01 0.0405 0.0825 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 485416 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0772 0.121 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 506126 sc-eQTL 2.50e-01 -0.138 0.12 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 4.22e-01 0.0911 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00508 0.0481 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 sc-eQTL 1.85e-01 -0.155 0.116 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -731989 sc-eQTL 3.96e-01 0.0839 0.0987 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 706983 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0728 0.0927 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 456722 sc-eQTL 3.24e-01 -0.116 0.117 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 405612 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0472 0.0479 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 456722 eQTL 0.186 -0.0212 0.016 0.00105 0.0 0.184
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 eQTL 0.0445 -0.0554 0.0275 0.0 0.0 0.184

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 818706 2.8e-07 1.35e-07 5.82e-08 1.89e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.67e-07 5.75e-08 1.5e-07 6.4e-08 1.63e-07 1.11e-07 1.71e-07 7.64e-08 5.98e-08 7.74e-08 4.18e-08 1.51e-07 6.92e-08 5.04e-08 1.25e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.83e-08 1.65e-07 1.23e-07 1.12e-07 1.01e-07 1.24e-07 1.05e-07 1.08e-07 3.93e-08 3.59e-08 8.7e-08 3.52e-08 2.69e-08 5.7e-08 8.37e-08 6.76e-08 3.75e-08 5.44e-08 1.46e-07 5.39e-08 1.23e-08 2.82e-08 1.65e-08 9.96e-08 1.93e-09 4.82e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 406842 1.01e-06 6.76e-07 1.63e-07 4.31e-07 9.23e-08 2.95e-07 6.19e-07 2.07e-07 6.52e-07 3.1e-07 9.46e-07 5.08e-07 9.97e-07 1.58e-07 3.13e-07 3.4e-07 5.34e-07 4.31e-07 2.87e-07 2.27e-07 2.42e-07 5.18e-07 4.08e-07 2.95e-07 1.06e-06 2.64e-07 4.25e-07 3.24e-07 5.41e-07 7.79e-07 3.68e-07 4.06e-08 5.95e-08 2.08e-07 3.7e-07 1.85e-07 1.4e-07 1.27e-07 8.72e-08 8.22e-09 1.35e-07 6.95e-07 5.78e-08 5.64e-09 1.91e-07 3.92e-08 1.46e-07 4.47e-08 5.55e-08