logo

Genes within 1Mb (chr6:133196998:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.47e-01 0.037 0.115 0.165 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 8.08e-01 0.0294 0.121 0.165 B L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 6.99e-01 0.0177 0.0456 0.165 B L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00686 0.0858 0.165 B L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.39e-01 0.0173 0.0519 0.165 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 9.35e-02 0.183 0.108 0.165 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 1.98e-01 0.109 0.0846 0.165 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 2.30e-01 0.106 0.088 0.165 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.48e-01 0.0717 0.0763 0.165 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 2.72e-01 0.057 0.0518 0.165 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.54e-01 0.0623 0.105 0.165 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 2.77e-01 0.0898 0.0823 0.165 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00137 0.0862 0.165 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.15e-01 -0.101 0.1 0.165 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 8.25e-01 0.00759 0.0344 0.165 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 9.20e-01 0.0105 0.104 0.165 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 1.44e-02 0.311 0.126 0.167 DC L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00499 0.0793 0.167 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 5.79e-02 0.186 0.0975 0.167 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0401 0.106 0.167 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 1.79e-01 0.153 0.113 0.167 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0613 0.0636 0.167 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0612 0.101 0.167 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 93870 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0556 0.0917 0.167 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 6.35e-01 0.0423 0.0889 0.165 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.82e-01 0.0165 0.0595 0.165 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 2.45e-01 -0.119 0.102 0.165 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0402 0.11 0.165 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0553 0.0775 0.165 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00351 0.0465 0.165 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 8.21e-01 0.0208 0.0919 0.165 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.48e-01 0.0187 0.097 0.165 NK L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0271 0.0897 0.165 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0547 0.112 0.165 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0456 0.0461 0.165 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 3.11e-01 -0.115 0.113 0.165 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0291 0.0893 0.165 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 1.63e-01 0.151 0.108 0.165 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0141 0.0428 0.165 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0249 0.117 0.165 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0492 0.131 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 7.38e-01 0.04 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 1.81e-01 -0.15 0.111 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 5.46e-01 0.072 0.119 0.163 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.52e-01 0.048 0.0638 0.163 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 8.99e-02 0.189 0.111 0.163 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 6.14e-01 0.0642 0.127 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 1.25e-01 0.171 0.111 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0224 0.073 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.93e-01 0.094 0.11 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.87e-01 0.0469 0.0673 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 4.63e-01 0.0892 0.121 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.49e-02 -0.217 0.121 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 4.09e-01 0.0928 0.112 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 1.63e-01 0.123 0.0878 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.61e-01 -0.105 0.115 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 8.60e-01 0.00979 0.0556 0.166 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.14e-01 0.0757 0.116 0.166 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0278 0.115 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 5.32e-01 0.0789 0.126 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0387 0.0551 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.04e-01 -0.11 0.107 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 3.82e-01 0.0534 0.061 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.84e-01 0.0645 0.118 0.165 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.95e-01 0.0315 0.121 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0249 0.118 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0438 0.0644 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.55e-01 0.0885 0.118 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.25e-02 0.127 0.0621 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 2.22e-01 0.146 0.119 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.51e-02 0.231 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 3.37e-01 0.115 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.52e-01 0.0911 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.32e-01 0.0841 0.0556 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 7.52e-01 0.0357 0.113 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0345 0.0969 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 2.55e-01 0.108 0.0948 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 5.33e-01 0.0549 0.088 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.13e-01 0.0904 0.0568 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 4.67e-01 0.0801 0.11 0.165 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 4.81e-01 0.0738 0.105 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 3.50e-01 0.0985 0.105 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 8.38e-01 0.011 0.0539 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 6.74e-01 0.0525 0.125 0.165 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.78e-01 0.0339 0.12 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 5.77e-02 -0.227 0.119 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.49e-01 0.0873 0.115 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.99e-01 0.0608 0.0471 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 7.12e-01 0.0435 0.118 0.165 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 7.63e-01 0.0319 0.106 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0595 0.0986 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 2.25e-01 -0.136 0.112 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.21e-01 0.0483 0.0599 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 7.67e-01 0.0345 0.116 0.165 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.31e-01 0.0712 0.113 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00661 0.121 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0286 0.104 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0102 0.0598 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 6.49e-01 0.0546 0.12 0.165 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 3.66e-01 0.12 0.132 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 3.92e-01 -0.105 0.122 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0323 0.121 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.78e-01 0.0797 0.0589 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 4.25e-01 0.104 0.13 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 1.19e-01 0.178 0.114 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000165 0.125 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0776 0.124 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.15e-01 0.105 0.0665 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0743 0.126 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.42e-01 0.024 0.12 0.165 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.15e-01 0.0418 0.114 0.165 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 1.16e-01 0.182 0.115 0.165 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00173 0.0571 0.165 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 8.22e-01 0.0269 0.12 0.165 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.98e-01 0.000256 0.127 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 2.47e-01 0.136 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 2.59e-01 0.135 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.41e-01 0.0221 0.0666 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.18e-01 0.0675 0.104 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0319 0.0955 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 2.66e-01 -0.133 0.119 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00121 0.0474 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0831 0.124 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 3.70e-01 -0.101 0.112 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.33e-01 -0.039 0.114 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00567 0.0531 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0164 0.108 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 8.39e-01 0.0213 0.105 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0747 0.118 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0155 0.0639 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 3.20e-01 0.145 0.145 0.152 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 1.24e-01 -0.191 0.123 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0629 0.104 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.21e-01 0.0628 0.127 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 3.96e-02 -0.147 0.0707 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 2.87e-01 -0.144 0.134 0.152 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00118 0.119 0.167 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.89e-01 0.0284 0.106 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0212 0.114 0.167 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0042 0.0431 0.167 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 1.76e-01 0.151 0.111 0.167 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.55e-02 0.214 0.124 0.165 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 1.81e-01 0.157 0.117 0.165 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0383 0.0989 0.165 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0149 0.0438 0.165 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 2.30e-01 0.148 0.123 0.165 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.65e-02 0.247 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0912 0.102 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 3.51e-03 0.293 0.0991 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 9.83e-01 0.00262 0.119 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.76e-01 0.103 0.116 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.43e-02 -0.0957 0.0569 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 3.02e-01 0.117 0.113 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 93870 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0459 0.0908 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.44e-01 0.0073 0.104 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.38e-01 -0.061 0.0786 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 4.61e-01 -0.082 0.111 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 5.39e-01 -0.069 0.112 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.94e-01 0.0235 0.0897 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 9.87e-01 0.000809 0.0498 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 9.25e-01 0.00904 0.0961 0.165 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0875 0.117 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 8.92e-01 0.0116 0.0849 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0668 0.106 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 3.03e-01 0.119 0.115 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0754 0.0753 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0162 0.0543 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.94e-01 0.0536 0.1 0.165 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0932 0.154 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.75e-01 0.0952 0.133 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0679 0.147 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 5.18e-02 0.108 0.0553 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 1.07e-01 -0.233 0.144 0.158 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0507 0.12 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 2.47e-01 0.133 0.114 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0388 0.116 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 5.35e-01 0.0711 0.114 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 3.13e-02 0.249 0.115 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 6.27e-01 0.0246 0.0506 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0763 0.123 0.158 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 6.17e-01 0.061 0.122 0.165 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 8.85e-01 0.0119 0.0823 0.165 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 5.59e-01 0.0679 0.116 0.165 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 2.65e-01 -0.129 0.115 0.165 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 8.28e-01 0.0241 0.111 0.165 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0415 0.0556 0.165 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 2.60e-01 -0.111 0.0979 0.165 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 3.91e-01 0.129 0.151 0.161 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0817 0.1 0.161 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 8.68e-02 0.173 0.1 0.161 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 7.97e-01 0.0265 0.103 0.161 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 6.10e-01 0.0625 0.122 0.161 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0749 0.0842 0.161 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 1.01e-01 -0.204 0.124 0.161 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 93870 sc-eQTL 3.36e-01 -0.115 0.119 0.161 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 8.16e-01 0.0285 0.123 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 2.04e-01 0.151 0.119 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 6.91e-01 0.0269 0.0675 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.80e-01 0.0299 0.107 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 4.04e-01 0.0508 0.0608 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 1.86e-01 0.148 0.111 0.165 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.85e-01 -0.0022 0.116 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 795523 sc-eQTL 6.47e-01 0.0582 0.127 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0156 0.0521 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0379 0.101 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 1.23e-01 0.0944 0.0609 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 2.99e-01 0.12 0.115 0.165 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0115 0.0927 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00438 0.0645 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 3.28e-01 -0.103 0.105 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 7.89e-01 0.0293 0.11 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0216 0.0725 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0188 0.0497 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 5.98e-01 0.0467 0.0884 0.165 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0151 0.119 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 5.04e-01 0.0526 0.0786 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 462233 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0909 0.116 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 482943 sc-eQTL 1.92e-01 -0.15 0.114 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.60e-01 0.0799 0.108 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 5.65e-01 0.0264 0.0459 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 sc-eQTL 3.43e-01 -0.106 0.111 0.166 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -755172 sc-eQTL 5.36e-01 0.0592 0.0956 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 683800 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0673 0.0898 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 433539 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0952 0.114 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 382429 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0499 0.0463 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 433539 eQTL 0.161 -0.022 0.0157 0.00123 0.0 0.196
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 eQTL 0.0421 -0.0549 0.027 0.0 0.0 0.196

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 383659 6.97e-07 5.67e-07 1.05e-07 3.48e-07 1.05e-07 1.71e-07 5.01e-07 8.11e-08 3.51e-07 2.06e-07 4.74e-07 4.21e-07 6e-07 1.34e-07 1.51e-07 2.18e-07 1.62e-07 3.12e-07 2.13e-07 1.31e-07 1.6e-07 3.13e-07 3.11e-07 9.01e-08 8.09e-07 2.2e-07 2.57e-07 2.54e-07 2.76e-07 4.9e-07 2.31e-07 5.99e-08 5.55e-08 1.21e-07 3.04e-07 6.73e-08 9.9e-08 6.67e-08 5.98e-08 2.56e-08 4.78e-08 4.42e-07 1.67e-08 3.38e-08 8.59e-08 1.59e-08 8.01e-08 2.41e-08 5.16e-08