logo

Genes within 1Mb (chr6:133190477:G:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.17e-01 0.0536 0.107 0.182 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 9.69e-01 0.00437 0.113 0.182 B L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.36e-01 0.0202 0.0427 0.182 B L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 7.13e-01 0.0296 0.0802 0.182 B L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.14e-01 0.0114 0.0485 0.182 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 5.03e-01 0.0684 0.102 0.182 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.16e-02 0.148 0.0786 0.182 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.44e-01 0.0781 0.0823 0.182 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.03e-01 0.0908 0.0711 0.182 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.24e-01 0.0479 0.0484 0.182 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0281 0.0982 0.182 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.13e-01 0.0963 0.0771 0.182 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00513 0.0808 0.182 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.70e-01 -0.129 0.0939 0.182 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.32e-01 0.00683 0.0322 0.182 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0734 0.0973 0.182 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.36e-02 0.2 0.119 0.185 DC L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.94e-01 0.000568 0.0742 0.185 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 6.29e-02 0.171 0.0913 0.185 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0652 0.0993 0.185 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.92e-01 0.0731 0.106 0.185 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0701 0.0594 0.185 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0676 0.0942 0.185 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 87349 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0865 0.0857 0.185 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.85e-01 0.034 0.0836 0.182 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.18e-01 0.00576 0.0559 0.182 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 1.84e-01 -0.127 0.0956 0.182 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0285 0.103 0.182 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.69e-01 -0.1 0.0726 0.182 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0283 0.0436 0.182 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0406 0.0864 0.182 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 3.32e-01 0.0886 0.0911 0.182 NK L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0524 0.0844 0.182 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0873 0.105 0.182 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 1.80e-01 -0.0582 0.0433 0.182 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.01e-01 -0.136 0.106 0.182 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0371 0.0837 0.182 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.22e-01 0.124 0.101 0.182 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0124 0.0401 0.182 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0757 0.11 0.182 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0799 0.122 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 8.52e-01 0.0208 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 1.61e-01 -0.146 0.104 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 3.04e-01 0.114 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.87e-01 0.0514 0.0593 0.181 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 1.16e-01 0.163 0.103 0.181 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 7.54e-01 0.0374 0.119 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 7.88e-02 0.183 0.104 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0177 0.0685 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.81e-01 0.111 0.103 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 5.69e-01 0.036 0.0631 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 9.42e-01 0.00833 0.114 0.18 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.17e-01 -0.142 0.114 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 3.92e-01 0.0905 0.106 0.183 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 1.39e-01 0.122 0.0826 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0769 0.108 0.183 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00685 0.0523 0.183 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.56e-01 0.0199 0.109 0.183 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0472 0.108 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 9.75e-01 0.00369 0.118 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0263 0.0517 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0799 0.1 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 6.30e-01 0.0275 0.0571 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0477 0.11 0.182 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.71e-01 0.0645 0.114 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0407 0.111 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0643 0.0604 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.74e-01 0.121 0.111 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 9.08e-02 0.0993 0.0584 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.17e-01 0.0912 0.112 0.182 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 1.31e-01 0.169 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 2.37e-01 0.132 0.111 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 5.72e-01 0.0636 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 1.22e-01 0.0802 0.0516 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 6.09e-01 0.0536 0.105 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.99e-01 0.0351 0.0906 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.99e-01 0.075 0.0888 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 3.02e-01 0.085 0.0822 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 9.33e-02 0.0895 0.0531 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 9.94e-01 0.00074 0.103 0.182 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.20e-01 0.0631 0.0979 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.77e-01 0.0871 0.0985 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0444 0.0972 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 7.74e-01 0.0145 0.0504 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0313 0.117 0.182 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0124 0.112 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.39e-02 -0.237 0.111 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.07e-01 0.0893 0.107 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.14e-01 0.0444 0.044 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0236 0.11 0.182 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 4.43e-01 0.0761 0.0989 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0112 0.0926 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.24e-01 -0.162 0.105 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 7.12e-01 0.0208 0.0563 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0261 0.109 0.182 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.99e-01 0.0557 0.106 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0252 0.113 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0435 0.0973 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.60e-01 -0.00988 0.0558 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.86e-01 0.016 0.112 0.182 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 7.41e-01 0.0407 0.123 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0578 0.114 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0864 0.113 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 2.16e-01 0.068 0.0548 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 7.57e-01 0.0373 0.121 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 1.37e-01 0.159 0.106 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 8.22e-01 0.0263 0.117 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0962 0.116 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.78e-01 0.0551 0.0623 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 3.57e-01 -0.109 0.118 0.183 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00286 0.113 0.182 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.79e-01 0.0444 0.107 0.182 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.11e-01 0.173 0.108 0.182 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 9.86e-01 0.000929 0.0536 0.182 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00398 0.112 0.182 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0411 0.119 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 4.36e-01 0.0863 0.11 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.47e-01 0.13 0.112 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0128 0.0626 0.18 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.17e-01 0.121 0.0975 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0502 0.0895 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.68e-01 -0.154 0.112 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0193 0.0444 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0288 0.116 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0918 0.105 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0126 0.107 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0441 0.0497 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.85e-01 0.0555 0.101 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.17e-01 0.0103 0.0982 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 3.31e-01 -0.107 0.11 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0523 0.0598 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 1.65e-01 0.196 0.14 0.167 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 1.70e-01 -0.165 0.12 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 7.66e-01 0.0301 0.101 0.167 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 5.22e-01 0.079 0.123 0.167 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 1.33e-01 -0.105 0.0692 0.167 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.22e-01 -0.105 0.131 0.167 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.72e-01 0.00389 0.112 0.185 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.66e-01 0.00421 0.0996 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0173 0.107 0.185 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0078 0.0404 0.185 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 2.32e-01 0.125 0.104 0.185 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 6.36e-02 0.215 0.115 0.182 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 2.91e-01 0.116 0.109 0.182 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 9.43e-01 0.0066 0.0921 0.182 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0117 0.0407 0.182 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 5.32e-01 0.072 0.115 0.182 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.18 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0693 0.095 0.18 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 7.38e-03 0.251 0.0927 0.18 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0359 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 7.50e-01 0.0346 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.70e-02 -0.111 0.0528 0.18 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 2.44e-01 0.123 0.105 0.18 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 87349 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0867 0.0844 0.18 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0143 0.0969 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0656 0.0734 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0854 0.104 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0492 0.105 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0336 0.0839 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0189 0.0466 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0378 0.0898 0.182 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0796 0.11 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00611 0.0794 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 3.59e-01 -0.091 0.099 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 2.75e-01 0.118 0.107 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 1.47e-01 -0.102 0.0702 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0391 0.0507 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0218 0.094 0.182 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 2.33e-01 -0.168 0.14 0.182 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 5.85e-01 0.0663 0.121 0.182 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0704 0.134 0.182 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.42e-02 0.0879 0.0506 0.182 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 1.90e-01 -0.173 0.131 0.182 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0155 0.112 0.176 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 2.86e-01 0.114 0.106 0.176 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0266 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 6.08e-01 0.0546 0.106 0.176 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 8.57e-02 0.186 0.107 0.176 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 9.50e-01 0.00296 0.0471 0.176 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 3.32e-01 -0.111 0.114 0.176 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 5.02e-01 0.076 0.113 0.183 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 8.91e-01 0.0105 0.0764 0.183 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 6.46e-01 0.0496 0.108 0.183 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 2.04e-01 -0.136 0.107 0.183 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0215 0.103 0.183 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0317 0.0515 0.183 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0657 0.091 0.183 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 7.52e-01 0.043 0.136 0.184 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0593 0.0903 0.184 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 8.32e-02 0.157 0.0901 0.184 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 7.31e-01 0.0319 0.0926 0.184 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 8.20e-01 0.0251 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0773 0.0757 0.184 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 1.88e-02 -0.262 0.11 0.184 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 87349 sc-eQTL 2.33e-01 -0.128 0.107 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 8.14e-01 0.0271 0.115 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 1.78e-01 0.151 0.111 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 7.49e-01 0.0203 0.0634 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 5.46e-01 0.0606 0.1 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 5.26e-01 0.0362 0.0571 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 5.61e-01 0.061 0.105 0.182 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.14e-01 0.0117 0.108 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 789002 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00111 0.119 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0205 0.0489 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 9.53e-01 0.00559 0.0949 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 2.82e-01 0.0618 0.0573 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 7.98e-01 0.0278 0.108 0.182 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0192 0.0871 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0153 0.0606 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 2.74e-01 -0.108 0.0985 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 7.00e-01 0.0398 0.103 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 3.94e-01 -0.058 0.068 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0417 0.0466 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0129 0.0831 0.182 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 9.75e-01 0.00348 0.112 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 6.42e-01 0.0343 0.0737 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 455712 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0906 0.108 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 476422 sc-eQTL 1.55e-01 -0.152 0.107 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 8.50e-01 0.0192 0.101 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 8.25e-01 0.00954 0.043 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 sc-eQTL 2.39e-01 -0.123 0.104 0.183 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -761693 sc-eQTL 1.40e-01 0.133 0.0896 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 677279 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0856 0.0844 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 427018 sc-eQTL 2.39e-01 -0.126 0.107 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 375908 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0638 0.0435 0.181 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 427018 pQTL 0.0309 -0.0662 0.0306 0.0 0.0 0.207
ENSG00000112303 VNN2 427018 eQTL 0.0257 -0.0344 0.0154 0.0 0.0 0.208
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 eQTL 0.00238 -0.0805 0.0264 0.0 0.0 0.208

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 377138 1.27e-06 8.72e-07 3.05e-07 3.54e-07 2.28e-07 4.06e-07 8.7e-07 3.22e-07 1.14e-06 3.82e-07 1.16e-06 5.73e-07 1.48e-06 2.19e-07 4.55e-07 6.22e-07 7.72e-07 5.67e-07 4.49e-07 4.71e-07 3.5e-07 9.46e-07 6.63e-07 5.53e-07 1.66e-06 3.06e-07 6.37e-07 5e-07 8.4e-07 9.57e-07 4.61e-07 7.32e-08 1.5e-07 4.54e-07 3.6e-07 3.91e-07 3.65e-07 1.25e-07 1.71e-07 4.07e-08 2.76e-07 1.05e-06 6.94e-08 1.94e-08 1.81e-07 7.29e-08 2.08e-07 7.75e-08 9.5e-08