Genes within 1Mb (chr6:133172153:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 6.52e-02 -0.188 0.101 0.209 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00923 0.108 0.209 B L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0233 0.0406 0.209 B L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0116 0.0764 0.209 B L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 3.67e-01 0.0417 0.0461 0.209 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 7.42e-02 -0.173 0.0965 0.209 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 3.81e-01 -0.066 0.0752 0.209 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0811 0.0781 0.209 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 3.31e-02 -0.144 0.0671 0.209 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.40e-01 0.00935 0.0461 0.209 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.30e-02 -0.211 0.0922 0.209 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0527 0.0743 0.209 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0834 0.0774 0.209 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.39e-01 -0.107 0.0903 0.209 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0357 0.0309 0.209 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 8.21e-02 -0.162 0.093 0.209 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0916 0.115 0.207 DC L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0729 0.0715 0.207 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0394 0.0888 0.207 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00932 0.096 0.207 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0508 0.103 0.207 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0748 0.0573 0.207 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00129 0.0911 0.207 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 69025 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0404 0.0829 0.207 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.54e-02 0.159 0.0789 0.209 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0127 0.0533 0.209 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 5.43e-01 0.0557 0.0914 0.209 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 2.76e-01 0.107 0.0981 0.209 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.05e-03 -0.212 0.0679 0.209 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.99e-01 0.00527 0.0416 0.209 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 5.97e-02 -0.155 0.0816 0.209 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0275 0.0868 0.208 NK L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.89e-02 -0.132 0.0798 0.208 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 8.76e-01 0.0156 0.0999 0.208 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.36e-01 0.0196 0.0413 0.208 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.57e-01 0.116 0.102 0.209 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.62e-01 0.014 0.0803 0.209 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 1.65e-01 -0.135 0.0966 0.209 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.12e-01 0.00918 0.0385 0.209 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.19e-01 -0.129 0.105 0.209 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 5.88e-01 0.0633 0.117 0.222 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0135 0.107 0.222 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.33e-01 0.0624 0.1 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.24e-01 -0.129 0.106 0.222 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.24e-01 -0.028 0.057 0.222 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 4.30e-02 -0.201 0.0988 0.222 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.84e-01 -0.151 0.114 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 1.92e-01 -0.13 0.0997 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 4.68e-02 -0.13 0.0649 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0786 0.0985 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.40e-01 0.089 0.0601 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0727 0.109 0.21 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0813 0.108 0.207 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 1.19e-01 -0.156 0.0993 0.207 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0754 0.0782 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 1.00e-01 -0.168 0.102 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.79e-01 0.035 0.0493 0.207 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0754 0.103 0.207 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0368 0.101 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0427 0.111 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 6.44e-01 0.0224 0.0484 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.62e-01 0.105 0.0937 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.58e-01 0.0755 0.0533 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 9.22e-02 -0.174 0.103 0.209 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 8.41e-02 -0.185 0.107 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0857 0.105 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.36e-01 0.0118 0.0572 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 8.01e-01 0.0264 0.105 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.07e-01 0.0286 0.0555 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.23e-01 -0.129 0.106 0.208 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0703 0.107 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.43e-01 0.0211 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.12e-02 -0.246 0.106 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00673 0.0496 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.54e-01 -0.114 0.0996 0.211 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.42e-01 -0.1 0.0855 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0678 0.084 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0554 0.0779 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 9.93e-01 0.00047 0.0506 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 1.93e-01 -0.127 0.097 0.209 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.58e-01 -0.105 0.0929 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.26e-01 -0.113 0.0935 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 6.39e-03 -0.25 0.0908 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00568 0.0479 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 3.71e-02 -0.23 0.11 0.209 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.44e-01 0.157 0.107 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0111 0.108 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 5.65e-01 0.0595 0.103 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 5.37e-01 0.0262 0.0423 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 6.61e-02 -0.193 0.105 0.209 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 9.39e-01 0.00728 0.0956 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0538 0.0893 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000441 0.102 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0663 0.0541 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 8.68e-02 -0.18 0.105 0.209 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 6.29e-01 0.0491 0.101 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 1.11e-01 -0.172 0.108 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0334 0.0933 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 3.96e-01 0.0454 0.0533 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 6.90e-02 -0.194 0.106 0.209 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 6.81e-01 0.0484 0.118 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0693 0.109 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 1.34e-01 0.162 0.107 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 3.12e-01 0.0532 0.0526 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 3.36e-02 -0.244 0.114 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.103 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.38e-01 0.00878 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 1.63e-01 -0.156 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.13e-01 -0.0952 0.0597 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 6.45e-01 0.0525 0.114 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.84e-01 0.0751 0.107 0.21 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 3.37e-01 0.0978 0.102 0.21 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 1.53e-01 -0.148 0.103 0.21 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.98e-01 0.0346 0.0509 0.21 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 9.34e-01 0.00881 0.107 0.21 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 8.96e-01 0.0151 0.115 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0662 0.107 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.93e-01 0.114 0.108 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.78e-02 -0.11 0.0599 0.213 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 8.95e-01 0.0123 0.093 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.56e-02 -0.142 0.0846 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 6.48e-01 0.0487 0.106 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.28e-01 -0.00919 0.0423 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.11e-01 0.192 0.12 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 3.39e-01 0.105 0.11 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0177 0.111 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0388 0.0518 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0701 0.0965 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.73e-01 -0.103 0.0933 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 5.88e-01 0.0571 0.105 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0597 0.0569 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 9.05e-01 0.0156 0.13 0.219 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0532 0.111 0.219 PB L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0975 0.0921 0.219 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 3.30e-01 -0.11 0.113 0.219 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.27e-01 0.051 0.064 0.219 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0174 0.12 0.219 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00166 0.107 0.211 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.65e-01 -0.107 0.0956 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0936 0.103 0.211 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0077 0.0389 0.211 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.29e-01 -0.121 0.1 0.211 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 5.61e-01 -0.064 0.11 0.209 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.43e-01 0.00744 0.104 0.209 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.41e-01 -0.102 0.0869 0.209 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 7.79e-01 0.0108 0.0385 0.209 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0798 0.109 0.209 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.90e-01 -0.122 0.115 0.212 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.30e-01 0.0195 0.0907 0.212 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 1.19e-01 -0.14 0.0894 0.212 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 5.96e-01 0.0561 0.106 0.212 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 4.50e-01 -0.078 0.103 0.212 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00507 0.0509 0.212 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 4.57e-01 -0.075 0.101 0.212 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 69025 sc-eQTL 2.99e-01 0.0837 0.0804 0.212 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 3.52e-01 0.0846 0.0907 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.13e-01 -0.0452 0.0689 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 5.39e-01 0.06 0.0974 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 2.35e-01 0.117 0.098 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.20e-02 -0.179 0.0777 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.50e-01 -0.033 0.0436 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0415 0.0842 0.209 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.28e-01 0.156 0.102 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 7.54e-01 0.0233 0.0741 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 9.26e-01 0.00858 0.0926 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 7.01e-01 0.0386 0.101 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 5.58e-03 -0.181 0.0647 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 7.20e-01 0.017 0.0474 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 1.81e-02 -0.206 0.0866 0.209 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 4.62e-01 0.101 0.137 0.221 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 2.05e-01 -0.15 0.118 0.221 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 3.39e-01 0.125 0.131 0.221 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0516 0.0497 0.221 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 3.53e-02 -0.27 0.127 0.221 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 3.78e-01 0.0914 0.103 0.211 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 8.33e-01 0.0209 0.099 0.211 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0616 0.0999 0.211 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0312 0.0988 0.211 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.03e-01 -0.128 0.1 0.211 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0636 0.0435 0.211 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 2.54e-01 -0.121 0.106 0.211 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 3.37e-01 0.108 0.112 0.206 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 9.73e-01 0.00258 0.0762 0.206 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 2.06e-01 -0.136 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 7.22e-01 -0.038 0.107 0.206 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0966 0.102 0.206 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.44e-02 0.0949 0.051 0.206 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0715 0.0908 0.206 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 3.16e-01 0.13 0.129 0.206 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 1.63e-01 -0.12 0.0856 0.206 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 7.02e-01 0.0332 0.0867 0.206 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 8.79e-02 -0.15 0.0874 0.206 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0444 0.105 0.206 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0209 0.0723 0.206 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 3.63e-01 0.0975 0.107 0.206 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 69025 sc-eQTL 3.80e-01 -0.09 0.102 0.206 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.09e-01 -0.137 0.108 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 2.96e-01 -0.111 0.106 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 7.30e-02 -0.107 0.0595 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 7.52e-02 -0.168 0.0941 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 1.73e-01 0.0735 0.0538 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 1.06e-01 -0.16 0.0985 0.209 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.83e-01 -0.135 0.101 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 770678 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0722 0.111 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.62e-01 0.0264 0.0455 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 4.81e-01 0.0623 0.0884 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.15e-01 0.0436 0.0534 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 7.24e-02 -0.181 0.1 0.209 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 1.18e-01 0.129 0.0823 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0353 0.0575 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 4.99e-01 0.0635 0.0937 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 2.95e-01 0.103 0.0976 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 2.85e-03 -0.191 0.0634 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 8.23e-01 -0.00993 0.0444 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 1.36e-01 -0.117 0.0785 0.209 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 2.45e-01 0.124 0.106 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 5.19e-01 0.0453 0.0701 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 437388 sc-eQTL 2.73e-01 -0.113 0.103 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 458098 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0336 0.102 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 7.86e-02 -0.169 0.0958 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 4.21e-01 0.0329 0.0409 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 358814 sc-eQTL 1.58e-01 -0.14 0.0989 0.207 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780017 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0239 0.0858 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658955 sc-eQTL 1.57e-01 -0.114 0.0802 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 408694 sc-eQTL 9.87e-01 0.00166 0.102 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 357584 sc-eQTL 6.77e-01 0.0173 0.0416 0.209 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 770678 eQTL 0.0407 -0.0712 0.0347 0.0 0.0 0.225
ENSG00000093134 VNN3 437388 eQTL 0.0194 -0.0394 0.0168 0.0 0.0 0.225
ENSG00000112303 VNN2 408694 pQTL 0.00252 -0.0879 0.029 0.0 0.0 0.224
ENSG00000112303 VNN2 408694 eQTL 0.0189 -0.0352 0.015 0.0 0.0 0.225
ENSG00000234484 AL032821.1 419478 eQTL 0.000603 0.123 0.0358 0.0 0.0 0.225


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000234484 AL032821.1 419478 8.7e-07 8.23e-07 2.95e-07 5.17e-07 1.96e-07 5.15e-07 1.1e-06 8.86e-08 1.2e-06 3.11e-07 1.32e-06 6.36e-07 1.05e-06 2.68e-07 3.86e-07 4.14e-07 3.13e-07 5.65e-07 4.7e-07 3.93e-07 2.52e-07 5.5e-07 4.06e-07 5.76e-07 1.94e-06 2.57e-07 4.37e-07 4.11e-07 6.91e-07 1.2e-06 4.61e-07 8.14e-08 5.63e-08 2.31e-07 3.16e-07 4.09e-07 1.08e-07 1.41e-07 5.67e-08 8.2e-08 5.96e-08 4.55e-07 6.94e-08 1.93e-08 4.91e-08 3.41e-08 9.12e-08 2.89e-09 5.43e-08