logo

Genes within 1Mb (chr6:133171318:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0464 0.113 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0867 0.119 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.65e-01 0.0135 0.045 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 3.70e-01 0.0759 0.0845 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0142 0.0512 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00739 0.108 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 2.16e-01 0.104 0.0837 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.40e-01 0.0177 0.0873 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 7.42e-01 0.0249 0.0756 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.84e-01 0.036 0.0513 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0766 0.104 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.85e-01 0.0712 0.0818 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0498 0.0855 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.81e-01 -0.133 0.0995 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00366 0.0341 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 1.46e-01 -0.15 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 1.80e-01 0.171 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0792 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 4.06e-02 0.2 0.0971 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0777 0.106 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.14e-01 0.0572 0.113 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.17e-02 -0.107 0.0631 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0512 0.101 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 68190 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0914 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 4.36e-01 0.0692 0.0887 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.56e-01 0.00326 0.0594 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00612 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0823 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.88e-02 -0.141 0.0768 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0516 0.0463 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0918 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.50e-01 0.0893 0.0952 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 1.55e-01 -0.125 0.0878 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 2.11e-01 -0.137 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0591 0.0453 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.64e-02 -0.192 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00725 0.0423 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 7.68e-02 -0.204 0.115 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 5.40e-01 0.0733 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.111 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 3.52e-01 0.0596 0.0638 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0355 0.126 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00568 0.0722 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 4.13e-01 0.089 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 5.42e-01 0.0406 0.0665 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0144 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 2.12e-02 -0.276 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00735 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 2.16e-01 0.108 0.0868 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 6.10e-01 -0.028 0.0549 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.42e-01 0.0229 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0251 0.055 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0337 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00511 0.0608 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0208 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0974 0.0641 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.52e-01 0.169 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.45e-01 0.0479 0.0626 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 1.79e-01 0.158 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 9.99e-01 0.000158 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 5.25e-01 0.0346 0.0544 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 6.22e-01 0.0542 0.11 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.0959 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00637 0.094 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 7.69e-01 0.0256 0.0871 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.64e-01 0.0631 0.0563 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 1.15e-01 0.163 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 3.01e-01 0.108 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.74e-01 -0.14 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.86e-01 0.0145 0.0533 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0408 0.123 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.93e-03 -0.313 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 3.29e-01 0.0456 0.0466 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0667 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.75e-01 0.0282 0.0984 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 7.75e-02 -0.197 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.07e-01 0.0225 0.0598 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 9.08e-01 0.0128 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0255 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0954 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0425 0.0582 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0238 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0744 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0954 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.73e-01 0.0623 0.0567 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 9.26e-01 0.0116 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 4.60e-01 0.0841 0.113 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0671 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 6.62e-01 0.029 0.0663 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0793 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.10e-01 0.0746 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.115 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 5.84e-01 -0.031 0.0566 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0345 0.126 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 2.72e-01 0.131 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0108 0.0663 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.093 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 5.61e-02 -0.223 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0323 0.0463 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0906 0.124 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.05e-02 -0.203 0.112 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0349 0.114 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0596 0.0529 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.15e-01 0.108 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0359 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.75e-01 -0.158 0.116 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0379 0.0631 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 4.77e-01 0.109 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 4.96e-01 0.0741 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.79e-01 0.0551 0.133 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0854 0.075 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0812 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 8.08e-01 0.0275 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00403 0.0427 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.39e-01 0.00875 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 4.46e-01 0.0734 0.0961 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.25e-01 -0.015 0.0425 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 6.89e-01 0.0482 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 2.90e-01 0.137 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 2.98e-02 0.218 0.0994 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 5.00e-01 -0.08 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 8.31e-01 0.0247 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.92e-02 -0.0997 0.0565 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 68190 sc-eQTL 4.92e-01 -0.062 0.0901 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 5.78e-01 0.0576 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0389 0.0783 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 5.44e-01 0.0672 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0692 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0535 0.0893 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0376 0.0495 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0699 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0745 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.96e-01 -0.045 0.0847 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 7.71e-01 0.0334 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.17e-02 -0.14 0.0746 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0579 0.054 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 5.19e-01 0.0648 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.47e-02 -0.313 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 4.44e-01 0.0983 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0741 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.71e-02 0.0895 0.0536 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 3.39e-01 -0.134 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0272 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.75e-01 0.00353 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 7.43e-01 0.0373 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 1.24e-01 0.177 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0371 0.0502 0.156 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 2.06e-01 -0.154 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.01e-01 0.0205 0.0811 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 4.08e-01 0.0947 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 7.12e-02 -0.205 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0953 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0384 0.0548 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0988 0.0966 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.144 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0957 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 9.88e-02 0.159 0.0955 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0979 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 8.37e-01 0.0241 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0802 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 2.44e-02 -0.266 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 68190 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 4.38e-01 -0.094 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 4.20e-01 0.095 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 8.59e-01 0.0119 0.0667 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 6.05e-01 0.0311 0.0601 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 7.35e-01 0.0374 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.08e-01 0.0282 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 769843 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0333 0.0522 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 4.23e-01 0.0814 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 7.00e-01 0.0237 0.0614 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 8.28e-01 0.0202 0.0926 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00567 0.0644 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 7.98e-01 0.0269 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0876 0.0721 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0666 0.0494 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 6.75e-01 0.0499 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00563 0.0786 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 436553 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 457263 sc-eQTL 6.05e-02 -0.214 0.114 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0599 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00163 0.0458 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -780852 sc-eQTL 1.41e-01 0.139 0.0938 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 658120 sc-eQTL 5.72e-02 -0.168 0.0878 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 407859 sc-eQTL 9.93e-02 -0.184 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 356749 sc-eQTL 1.37e-01 -0.068 0.0455 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 457263 pQTL 0.0322 0.0949 0.0443 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112303 VNN2 407859 pQTL 0.00474 -0.09 0.0318 0.0 0.0 0.189
ENSG00000112303 VNN2 407859 eQTL 0.0144 -0.0392 0.016 0.0 0.0 0.189
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 eQTL 0.000172 -0.103 0.0274 0.0 0.0 0.189
ENSG00000234484 AL032821.1 418643 eQTL 0.0467 0.0764 0.0384 0.0 0.0 0.189

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 357979 1.25e-06 9.07e-07 1.57e-07 4.84e-07 1.87e-07 4.39e-07 9.92e-07 2.68e-07 8.92e-07 3.13e-07 1.32e-06 5.76e-07 1.53e-06 2.54e-07 4.34e-07 4.96e-07 7.79e-07 5.27e-07 3.84e-07 4.13e-07 2.54e-07 7.73e-07 6.33e-07 4.44e-07 1.86e-06 2.44e-07 5.83e-07 4.92e-07 7.45e-07 9.73e-07 4.54e-07 5.06e-08 1.27e-07 3.49e-07 4.28e-07 2.89e-07 1.89e-07 1.32e-07 1.12e-07 4.12e-08 1.2e-07 1.3e-06 5.09e-08 2.67e-08 1.87e-07 7.09e-08 1.78e-07 8.25e-08 5.77e-08