Genes within 1Mb (chr6:133166484:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0248 0.108 0.179 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 2.87e-01 -0.121 0.113 0.179 B L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0176 0.0429 0.179 B L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.93e-01 0.105 0.0803 0.179 B L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.02e-01 0.00602 0.0487 0.179 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00202 0.103 0.179 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 7.90e-02 0.14 0.0792 0.179 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00951 0.083 0.179 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 6.88e-01 0.0289 0.0718 0.179 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.67e-01 0.0543 0.0487 0.179 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0512 0.0988 0.179 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.82e-01 0.0838 0.0776 0.179 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0483 0.0812 0.179 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 2.91e-01 -0.1 0.0946 0.179 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 8.86e-01 0.00465 0.0324 0.179 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 1.90e-01 -0.128 0.0976 0.179 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.64e-01 0.137 0.123 0.18 DC L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0137 0.0764 0.18 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 3.92e-02 0.195 0.0937 0.18 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 4.52e-01 -0.077 0.102 0.18 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 5.19e-01 0.0706 0.109 0.18 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0437 0.0613 0.18 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0402 0.097 0.18 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 63356 sc-eQTL 6.43e-01 -0.041 0.0883 0.18 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 3.43e-01 0.0803 0.0844 0.179 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0206 0.0566 0.179 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0149 0.0972 0.179 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 2.13e-01 -0.13 0.104 0.179 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.96e-01 -0.0954 0.0735 0.179 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0383 0.0441 0.179 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 7.84e-01 -0.024 0.0875 0.179 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.82e-01 0.0977 0.0906 0.18 NK L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 4.28e-02 -0.169 0.0832 0.18 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 5.47e-02 -0.2 0.104 0.18 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0473 0.0431 0.18 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 8.25e-02 -0.184 0.105 0.179 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0149 0.0835 0.179 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.58e-01 0.142 0.101 0.179 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.35e-01 0.00328 0.04 0.179 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 1.45e-01 -0.16 0.109 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0942 0.126 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 6.64e-01 0.0499 0.115 0.176 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 1.23e-01 -0.166 0.107 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.36e-01 0.171 0.114 0.176 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 3.89e-01 0.0529 0.0613 0.176 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 1.95e-01 0.139 0.107 0.176 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0705 0.119 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 2.37e-01 0.124 0.104 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0194 0.0685 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 3.09e-01 0.105 0.103 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 8.16e-01 0.0147 0.0632 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00834 0.114 0.178 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.25e-02 -0.281 0.111 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00379 0.104 0.181 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.58e-01 0.0363 0.0818 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.38e-01 0.0219 0.107 0.181 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0179 0.0516 0.181 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 4.14e-01 -0.088 0.108 0.181 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.91e-01 0.115 0.109 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 1.14e-01 -0.189 0.119 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0404 0.0523 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.03e-01 0.0254 0.102 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0151 0.0579 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 1.58e-01 -0.157 0.111 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0181 0.115 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0589 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.46e-02 -0.112 0.0604 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.74e-01 0.152 0.111 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 6.96e-01 0.0232 0.0592 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.46e-02 0.208 0.112 0.18 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.37e-01 0.168 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 3.40e-01 0.107 0.112 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0128 0.113 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 5.22e-01 0.0335 0.0523 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 2.91e-01 0.111 0.105 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 5.84e-01 0.0499 0.091 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 9.93e-01 0.00075 0.0893 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 4.41e-01 0.0638 0.0826 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 1.51e-01 0.077 0.0534 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 8.85e-01 -0.015 0.103 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 9.32e-02 0.165 0.0976 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.42e-01 0.0326 0.099 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 9.94e-02 -0.16 0.0969 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.37e-01 0.017 0.0506 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0468 0.117 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.59e-01 -0.158 0.112 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 1.22e-02 -0.28 0.111 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.35e-01 0.161 0.107 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.59e-01 0.0499 0.0441 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0883 0.11 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.60e-01 0.14 0.099 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.81e-01 0.0259 0.093 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 6.81e-02 -0.192 0.105 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.90e-01 0.0151 0.0566 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 7.49e-01 -0.035 0.11 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 6.68e-01 0.0451 0.105 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0456 0.112 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0639 0.0964 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0431 0.0552 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 8.36e-01 0.023 0.111 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0525 0.12 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0611 0.111 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0758 0.11 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 4.01e-01 0.0451 0.0536 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0312 0.118 0.176 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 3.60e-01 0.0993 0.108 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 9.66e-01 0.00505 0.118 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0732 0.118 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.37e-01 0.0213 0.0633 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0551 0.12 0.18 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0872 0.113 0.18 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.107 0.18 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.06e-02 0.19 0.108 0.18 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0293 0.0536 0.18 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0703 0.112 0.18 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0152 0.12 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 3.14e-01 0.112 0.111 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.32e-01 0.169 0.112 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00604 0.0627 0.182 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 3.88e-01 0.0839 0.097 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 5.23e-02 -0.172 0.0882 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 3.42e-03 -0.323 0.109 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0322 0.0441 0.181 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 3.97e-01 -0.1 0.118 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.85e-02 -0.196 0.107 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 9.20e-01 -0.011 0.109 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0447 0.0508 0.189 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.11e-01 0.128 0.102 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0632 0.0988 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.38e-01 -0.165 0.111 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0197 0.0603 0.181 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.19e-01 0.117 0.145 0.167 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 8.99e-02 -0.209 0.122 0.167 PB L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.07e-01 0.0532 0.103 0.167 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.74e-01 0.02 0.126 0.167 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0851 0.0712 0.167 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 6.56e-01 -0.06 0.134 0.167 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 7.94e-01 0.0295 0.113 0.183 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0314 0.101 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.75e-01 0.017 0.108 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00098 0.0408 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 8.99e-01 0.0135 0.106 0.183 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 3.27e-01 0.112 0.115 0.179 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00751 0.108 0.179 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 8.05e-01 0.0225 0.091 0.179 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00237 0.0403 0.179 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 5.39e-01 0.0699 0.114 0.179 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.20e-01 0.193 0.123 0.18 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 2.21e-01 -0.119 0.097 0.18 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 2.94e-02 0.21 0.0954 0.18 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0817 0.114 0.18 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 6.12e-01 0.0562 0.111 0.18 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0617 0.0545 0.18 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 1.44e-01 0.158 0.108 0.18 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 63356 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0211 0.0866 0.18 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.25e-01 0.0781 0.0976 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0565 0.0741 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 4.95e-01 0.0716 0.105 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0913 0.106 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0227 0.0845 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0316 0.0469 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0785 0.0904 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0933 0.111 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0637 0.08 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0624 0.1 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 4.68e-01 -0.079 0.109 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.41e-01 -0.105 0.0708 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0531 0.0511 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 3.86e-01 0.0823 0.0947 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 5.73e-02 -0.274 0.143 0.182 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 8.99e-01 0.0158 0.124 0.182 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 9.62e-01 0.00657 0.138 0.182 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 1.98e-01 0.0674 0.0521 0.182 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 3.10e-01 -0.138 0.135 0.182 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0435 0.113 0.176 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0347 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0398 0.109 0.176 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0307 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 2.58e-02 0.243 0.108 0.176 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0239 0.0477 0.176 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0621 0.116 0.176 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.41e-01 0.17 0.115 0.181 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000102 0.0785 0.181 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 3.01e-01 0.115 0.111 0.181 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 4.49e-02 -0.22 0.109 0.181 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 3.35e-01 -0.102 0.106 0.181 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0266 0.053 0.181 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 3.16e-01 -0.094 0.0935 0.181 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0682 0.139 0.184 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 3.59e-01 0.085 0.0923 0.184 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 1.98e-01 0.12 0.0927 0.184 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 7.00e-01 0.0366 0.0948 0.184 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00779 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 5.51e-01 0.0464 0.0777 0.184 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 2.77e-02 -0.252 0.113 0.184 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 63356 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0777 0.11 0.184 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.68e-01 -0.157 0.114 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 8.70e-01 0.0181 0.111 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0229 0.0628 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 2.95e-01 0.104 0.0991 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 6.95e-01 0.0222 0.0566 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0119 0.104 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 2.67e-01 0.122 0.11 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 765009 sc-eQTL 1.68e-01 -0.166 0.12 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0627 0.0494 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 2.11e-01 0.12 0.0959 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 8.63e-01 0.01 0.0582 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 9.56e-01 0.00602 0.11 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 7.59e-01 0.0269 0.0879 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0298 0.0611 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 8.75e-01 0.0157 0.0996 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0485 0.104 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0498 0.0686 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0563 0.0469 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 7.72e-01 0.0244 0.0838 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 4.59e-01 0.0845 0.114 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0341 0.0752 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 431719 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0187 0.111 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 452429 sc-eQTL 2.70e-02 -0.242 0.108 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0476 0.103 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00252 0.0439 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0891 0.106 0.181 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -785686 sc-eQTL 1.43e-01 0.131 0.0891 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 653286 sc-eQTL 1.94e-02 -0.196 0.0831 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 403025 sc-eQTL 1.53e-02 -0.257 0.105 0.181 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351915 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0577 0.0433 0.181 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 403025 pQTL 0.0489 -0.0607 0.0308 0.0 0.0 0.206
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 eQTL 0.0032 -0.0786 0.0266 0.0 0.0 0.209


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 353145 1.31e-06 8.36e-07 2.05e-07 4.01e-07 1.81e-07 3.36e-07 7e-07 2.88e-07 8.66e-07 2.85e-07 1.09e-06 5.39e-07 1.2e-06 1.98e-07 4.15e-07 4.91e-07 6.29e-07 5.26e-07 3.64e-07 3.72e-07 2.54e-07 6.27e-07 5.63e-07 4.09e-07 1.42e-06 2.44e-07 5.05e-07 4.4e-07 7e-07 8.63e-07 4.47e-07 4.34e-08 1.28e-07 2.87e-07 3.28e-07 2.91e-07 1.91e-07 1.15e-07 1.01e-07 9.67e-09 2.38e-07 9.49e-07 6.11e-08 1.23e-08 1.7e-07 4.38e-08 1.68e-07 5.73e-08 5.77e-08