logo

Genes within 1Mb (chr6:133165858:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 9.07e-01 0.0122 0.104 0.197 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 3.28e-01 -0.107 0.109 0.197 B L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.32e-01 0.00877 0.0414 0.197 B L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 5.47e-01 0.0468 0.0777 0.197 B L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0422 0.0469 0.197 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00789 0.099 0.197 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.09e-01 0.0794 0.0778 0.197 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 2.24e-01 0.0986 0.0808 0.197 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 7.88e-01 0.0189 0.0702 0.197 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.34e-01 0.01 0.0477 0.197 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.45e-01 -0.019 0.0966 0.197 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.97e-01 0.0791 0.0757 0.197 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 7.37e-01 0.0266 0.0792 0.197 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0643 0.0924 0.197 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0187 0.0316 0.197 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 2.34e-01 -0.114 0.0952 0.197 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.62e-01 0.134 0.119 0.2 DC L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0166 0.0741 0.2 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 2.46e-02 0.205 0.0907 0.2 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0344 0.0991 0.2 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.87e-01 0.0918 0.106 0.2 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0846 0.0592 0.2 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.59e-01 0.0167 0.0941 0.2 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 62730 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0541 0.0856 0.2 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.97e-01 0.0868 0.083 0.197 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 6.32e-01 0.0267 0.0557 0.197 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00137 0.0956 0.197 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00872 0.103 0.197 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0329 0.0725 0.197 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0278 0.0434 0.197 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0108 0.086 0.197 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 6.24e-01 0.0434 0.0883 0.197 NK L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0605 0.0816 0.197 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0847 0.102 0.197 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 9.95e-02 -0.0692 0.0418 0.197 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.26e-02 -0.235 0.102 0.197 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 7.63e-01 0.0247 0.0816 0.197 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 5.03e-01 0.0661 0.0987 0.197 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0149 0.0391 0.197 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.197 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.06e-01 -0.152 0.12 0.194 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 8.09e-01 0.0267 0.11 0.194 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.63e-01 -0.144 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.37e-01 0.106 0.11 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 2.90e-01 0.0624 0.0588 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 6.06e-01 0.0533 0.103 0.194 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 4.36e-01 -0.09 0.115 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 1.26e-01 0.155 0.101 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00504 0.0664 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.71e-01 0.0721 0.0999 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0125 0.0612 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000308 0.11 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 1.13e-01 -0.177 0.111 0.198 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 6.49e-01 0.0471 0.103 0.198 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 5.71e-01 0.046 0.0809 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0257 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0438 0.0509 0.198 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.82e-01 0.0158 0.106 0.198 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00464 0.105 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 2.04e-01 -0.147 0.115 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0527 0.0505 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 5.90e-01 -0.053 0.0983 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0261 0.056 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 5.72e-02 -0.205 0.107 0.197 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.28e-01 0.109 0.112 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000594 0.109 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0799 0.0592 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.56e-01 0.101 0.109 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 7.49e-01 0.0185 0.0578 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.15e-02 0.186 0.109 0.197 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 1.30e-01 0.166 0.109 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.21e-01 0.169 0.108 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 9.57e-01 0.00594 0.11 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00518 0.0509 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 4.31e-01 0.0808 0.102 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 7.80e-01 0.025 0.0892 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.12e-01 0.0717 0.0873 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 8.60e-01 0.0143 0.081 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.87e-01 0.0455 0.0525 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00926 0.101 0.197 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.64e-01 0.0882 0.0969 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.10e-01 0.156 0.0972 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 2.52e-01 -0.11 0.0961 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00672 0.05 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0315 0.116 0.197 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 1.15e-01 -0.173 0.11 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.38e-02 -0.222 0.109 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.91e-01 0.0909 0.106 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 6.47e-01 0.0199 0.0434 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 3.20e-01 -0.108 0.108 0.197 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 5.55e-01 0.0575 0.0973 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.78e-01 0.0646 0.091 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0899 0.103 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.31e-01 0.0119 0.0554 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0643 0.107 0.197 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 7.50e-01 0.0329 0.103 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.23e-01 0.0246 0.11 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.32e-01 -0.0454 0.0947 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 1.16e-01 -0.0852 0.054 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.65e-01 0.00482 0.109 0.197 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 5.31e-01 0.0747 0.119 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 5.37e-01 -0.068 0.11 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 1.89e-01 -0.143 0.109 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 4.33e-01 0.0418 0.0532 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.39e-01 0.0238 0.117 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 5.69e-01 0.06 0.105 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.40e-01 0.0887 0.115 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0642 0.114 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.34e-01 0.0383 0.0614 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 2.85e-01 -0.124 0.116 0.196 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.09e-01 -0.112 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.93e-01 0.136 0.104 0.195 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 3.23e-01 0.105 0.106 0.195 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0557 0.0523 0.195 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0242 0.11 0.195 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00698 0.117 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 7.45e-02 0.192 0.107 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 1.07e-01 0.177 0.109 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.52e-01 0.0114 0.0612 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 7.89e-01 0.0253 0.0945 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 5.64e-01 -0.05 0.0865 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.39e-02 -0.2 0.107 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0421 0.0429 0.198 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0499 0.116 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 3.74e-02 -0.219 0.105 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0109 0.107 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 1.59e-01 -0.0702 0.0497 0.208 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.94e-01 0.085 0.0994 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.95e-01 0.0128 0.0965 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0742 0.108 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0538 0.0587 0.198 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 6.67e-01 0.06 0.139 0.178 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 3.94e-01 -0.101 0.118 0.178 PB L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 5.00e-01 0.067 0.0989 0.178 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.55e-01 0.0542 0.121 0.178 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0703 0.0684 0.178 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0324 0.129 0.178 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 8.46e-01 0.0213 0.11 0.2 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.41e-01 0.0196 0.0978 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00718 0.105 0.2 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.69e-01 0.0227 0.0397 0.2 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000483 0.103 0.2 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 4.53e-01 0.0847 0.113 0.197 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.75e-01 0.0167 0.106 0.197 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 8.14e-01 0.021 0.0894 0.197 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0118 0.0396 0.197 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 1.20e-01 0.173 0.111 0.197 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 8.18e-02 0.209 0.119 0.202 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.81e-01 -0.126 0.0939 0.202 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 2.61e-02 0.207 0.0924 0.202 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0565 0.11 0.202 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 5.47e-01 0.0646 0.107 0.202 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.21e-02 -0.103 0.0524 0.202 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 4.03e-01 0.0877 0.105 0.202 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 62730 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0477 0.0838 0.202 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 4.57e-01 0.0717 0.0961 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.60e-01 0.0129 0.073 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 6.59e-01 0.0456 0.103 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 9.97e-01 0.000378 0.104 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 7.23e-01 0.0295 0.0833 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00492 0.0463 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0914 0.089 0.197 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000909 0.109 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0668 0.0787 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0123 0.0985 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 4.26e-01 0.0852 0.107 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0501 0.0699 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.13e-01 -0.033 0.0504 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 3.06e-01 0.0956 0.0931 0.197 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 1.10e-02 -0.362 0.14 0.209 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 4.33e-01 0.097 0.123 0.209 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0976 0.136 0.209 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 7.88e-02 0.0912 0.0515 0.209 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0796 0.134 0.209 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00882 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0207 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 9.34e-01 0.00887 0.107 0.193 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 3.75e-01 0.0936 0.105 0.193 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.66e-02 0.196 0.106 0.193 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.91e-01 0.00639 0.0467 0.193 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0608 0.114 0.193 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 4.20e-01 0.0903 0.112 0.201 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 2.94e-01 0.0794 0.0754 0.201 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 3.42e-02 0.225 0.106 0.201 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0517 0.106 0.201 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 9.17e-01 0.0106 0.102 0.201 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0515 0.051 0.201 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 1.72e-01 -0.123 0.0898 0.201 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0656 0.133 0.209 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.08e-01 0.0216 0.0885 0.209 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 5.96e-02 0.167 0.0881 0.209 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 2.97e-01 0.0946 0.0904 0.209 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0293 0.108 0.209 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0338 0.0743 0.209 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 2.00e-01 -0.141 0.11 0.209 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 62730 sc-eQTL 2.05e-01 -0.133 0.105 0.209 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 2.90e-01 -0.118 0.111 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 4.30e-01 0.0855 0.108 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0129 0.0613 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 8.19e-01 0.0223 0.097 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0162 0.0553 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 4.80e-01 0.0716 0.101 0.197 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.24e-01 0.105 0.107 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 764383 sc-eQTL 2.54e-01 -0.134 0.117 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0497 0.048 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 6.68e-01 0.0401 0.0934 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00248 0.0565 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0145 0.107 0.197 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 4.90e-01 0.0598 0.0866 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 7.92e-01 0.016 0.0603 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 8.41e-01 0.0198 0.0982 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 6.09e-01 0.0525 0.102 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 9.99e-01 8.22e-05 0.0678 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0298 0.0464 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 8.47e-01 0.016 0.0827 0.197 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 7.55e-01 0.0348 0.112 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 6.78e-01 0.0306 0.0736 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 431093 sc-eQTL 3.95e-01 0.0922 0.108 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 451803 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0717 0.107 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 7.62e-01 0.0307 0.101 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 8.62e-01 -0.00749 0.0429 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0853 0.104 0.198 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -786312 sc-eQTL 3.72e-01 0.0783 0.0874 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 652660 sc-eQTL 1.68e-01 -0.113 0.0819 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 402399 sc-eQTL 2.28e-01 -0.126 0.104 0.198 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 351289 sc-eQTL 5.16e-02 -0.0825 0.0421 0.198 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 451803 pQTL 0.0167 0.0993 0.0415 0.0 0.0 0.22
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 eQTL 0.00136 -0.083 0.0258 0.0 0.0 0.222

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 352519 1.27e-06 9.88e-07 2.71e-07 1.23e-06 2.66e-07 4.57e-07 1.22e-06 3.28e-07 1.46e-06 6.14e-07 1.35e-06 6.62e-07 1.75e-06 2.76e-07 5.42e-07 9.36e-07 8.95e-07 6.58e-07 7.08e-07 5.11e-07 7.54e-07 1.56e-06 9.01e-07 5.54e-07 1.94e-06 4.27e-07 9.09e-07 8.75e-07 1.04e-06 1.25e-06 5.91e-07 5.76e-07 3.25e-07 5.78e-07 5.17e-07 5.41e-07 7.05e-07 2.71e-07 4.52e-07 2.26e-07 2.59e-07 1.57e-06 3.32e-07 9.61e-08 2.96e-07 1.19e-07 2.42e-07 2.43e-07 2.97e-07