logo

Genes within 1Mb (chr6:133164320:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0464 0.113 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0867 0.119 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.65e-01 0.0135 0.045 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 3.70e-01 0.0759 0.0845 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0142 0.0512 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00739 0.108 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 2.16e-01 0.104 0.0837 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.40e-01 0.0177 0.0873 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 7.42e-01 0.0249 0.0756 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.84e-01 0.036 0.0513 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0766 0.104 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.85e-01 0.0712 0.0818 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0498 0.0855 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.81e-01 -0.133 0.0995 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00366 0.0341 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 1.46e-01 -0.15 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 1.80e-01 0.171 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0792 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 4.06e-02 0.2 0.0971 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0777 0.106 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.14e-01 0.0572 0.113 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.17e-02 -0.107 0.0631 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0512 0.101 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 61192 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0914 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 4.36e-01 0.0692 0.0887 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.56e-01 0.00326 0.0594 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00612 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0823 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.88e-02 -0.141 0.0768 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0516 0.0463 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0918 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.50e-01 0.0893 0.0952 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 1.55e-01 -0.125 0.0878 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 2.11e-01 -0.137 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0591 0.0453 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.64e-02 -0.192 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00725 0.0423 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 7.68e-02 -0.204 0.115 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 5.40e-01 0.0733 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.111 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 3.52e-01 0.0596 0.0638 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0355 0.126 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00568 0.0722 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 4.13e-01 0.089 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 5.42e-01 0.0406 0.0665 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0144 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 2.12e-02 -0.276 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00735 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 2.16e-01 0.108 0.0868 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 6.10e-01 -0.028 0.0549 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.42e-01 0.0229 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0251 0.055 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0337 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00511 0.0608 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0208 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0974 0.0641 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.52e-01 0.169 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.45e-01 0.0479 0.0626 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 1.79e-01 0.158 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 9.99e-01 0.000158 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 5.25e-01 0.0346 0.0544 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 6.22e-01 0.0542 0.11 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.0959 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00637 0.094 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 7.69e-01 0.0256 0.0871 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.64e-01 0.0631 0.0563 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 1.15e-01 0.163 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 3.01e-01 0.108 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.74e-01 -0.14 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.86e-01 0.0145 0.0533 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0408 0.123 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.93e-03 -0.313 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 3.29e-01 0.0456 0.0466 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0667 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.75e-01 0.0282 0.0984 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 7.75e-02 -0.197 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.07e-01 0.0225 0.0598 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 9.08e-01 0.0128 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0255 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0954 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0425 0.0582 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0238 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0744 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0954 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.73e-01 0.0623 0.0567 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 9.26e-01 0.0116 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 4.60e-01 0.0841 0.113 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0671 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 6.62e-01 0.029 0.0663 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0793 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.10e-01 0.0746 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.115 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 5.84e-01 -0.031 0.0566 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0345 0.126 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 2.72e-01 0.131 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0108 0.0663 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.093 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 5.61e-02 -0.223 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0323 0.0463 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0906 0.124 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.05e-02 -0.203 0.112 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0349 0.114 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0596 0.0529 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.15e-01 0.108 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0359 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.75e-01 -0.158 0.116 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0379 0.0631 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 4.77e-01 0.109 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 4.96e-01 0.0741 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.79e-01 0.0551 0.133 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0854 0.075 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0812 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 8.08e-01 0.0275 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00403 0.0427 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.39e-01 0.00875 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 4.46e-01 0.0734 0.0961 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.25e-01 -0.015 0.0425 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 6.89e-01 0.0482 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 2.90e-01 0.137 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 2.98e-02 0.218 0.0994 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 5.00e-01 -0.08 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 8.31e-01 0.0247 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.92e-02 -0.0997 0.0565 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 61192 sc-eQTL 4.92e-01 -0.062 0.0901 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 5.78e-01 0.0576 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0389 0.0783 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 5.44e-01 0.0672 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0692 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0535 0.0893 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0376 0.0495 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0699 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0745 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.96e-01 -0.045 0.0847 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 7.71e-01 0.0334 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.17e-02 -0.14 0.0746 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0579 0.054 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 5.19e-01 0.0648 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.47e-02 -0.313 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 4.44e-01 0.0983 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0741 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.71e-02 0.0895 0.0536 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 3.39e-01 -0.134 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0272 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.75e-01 0.00353 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 7.43e-01 0.0373 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 1.24e-01 0.177 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0371 0.0502 0.156 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 2.06e-01 -0.154 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.01e-01 0.0205 0.0811 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 4.08e-01 0.0947 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 7.12e-02 -0.205 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0953 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0384 0.0548 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0988 0.0966 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.144 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0957 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 9.88e-02 0.159 0.0955 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0979 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 8.37e-01 0.0241 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0802 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 2.44e-02 -0.266 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 61192 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 4.38e-01 -0.094 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 4.20e-01 0.095 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 8.59e-01 0.0119 0.0667 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 6.05e-01 0.0311 0.0601 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 7.35e-01 0.0374 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.08e-01 0.0282 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 762845 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0333 0.0522 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 4.23e-01 0.0814 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 7.00e-01 0.0237 0.0614 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 8.28e-01 0.0202 0.0926 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00567 0.0644 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 7.98e-01 0.0269 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0876 0.0721 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0666 0.0494 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 6.75e-01 0.0499 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00563 0.0786 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 429555 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 450265 sc-eQTL 6.05e-02 -0.214 0.114 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0599 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00163 0.0458 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -787850 sc-eQTL 1.41e-01 0.139 0.0938 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 651122 sc-eQTL 5.72e-02 -0.168 0.0878 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 400861 sc-eQTL 9.93e-02 -0.184 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 349751 sc-eQTL 1.37e-01 -0.068 0.0455 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 450265 pQTL 0.0288 0.0966 0.0441 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 400861 pQTL 0.00403 -0.0914 0.0317 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 400861 eQTL 0.0159 -0.0385 0.0159 0.0 0.0 0.19
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 eQTL 0.00018 -0.103 0.0273 0.0 0.0 0.19
ENSG00000234484 AL032821.1 411645 eQTL 0.0436 0.0773 0.0382 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 350981 1.58e-06 2.63e-06 3.32e-07 1.74e-06 4.25e-07 7.82e-07 1.3e-06 4.28e-07 1.78e-06 7.7e-07 1.97e-06 1.39e-06 3.24e-06 1.42e-06 8.18e-07 1.16e-06 9.67e-07 1.54e-06 9.83e-07 7.37e-07 6.02e-07 1.94e-06 1.6e-06 8.04e-07 2.59e-06 1.07e-06 1.15e-06 1.04e-06 1.69e-06 1.66e-06 1.16e-06 2.87e-07 3.44e-07 8.18e-07 9e-07 6.2e-07 8.3e-07 3.3e-07 1.11e-06 3.33e-07 2.6e-07 2.66e-06 6.16e-07 1.98e-07 2.95e-07 3.17e-07 3.77e-07 2.54e-07 2.89e-07