logo

Genes within 1Mb (chr6:133162882:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0464 0.113 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0867 0.119 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.65e-01 0.0135 0.045 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 3.70e-01 0.0759 0.0845 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0142 0.0512 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00739 0.108 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 2.16e-01 0.104 0.0837 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.40e-01 0.0177 0.0873 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 7.42e-01 0.0249 0.0756 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.84e-01 0.036 0.0513 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0766 0.104 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.85e-01 0.0712 0.0818 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0498 0.0855 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.81e-01 -0.133 0.0995 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00366 0.0341 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 1.46e-01 -0.15 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 1.80e-01 0.171 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0792 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 4.06e-02 0.2 0.0971 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0777 0.106 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.14e-01 0.0572 0.113 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.17e-02 -0.107 0.0631 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0512 0.101 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 59754 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0914 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 4.36e-01 0.0692 0.0887 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.56e-01 0.00326 0.0594 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00612 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0823 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.88e-02 -0.141 0.0768 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0516 0.0463 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0918 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.50e-01 0.0893 0.0952 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 1.55e-01 -0.125 0.0878 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 2.11e-01 -0.137 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0591 0.0453 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.64e-02 -0.192 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00725 0.0423 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 7.68e-02 -0.204 0.115 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 5.40e-01 0.0733 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.111 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 3.52e-01 0.0596 0.0638 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0355 0.126 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00568 0.0722 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 4.13e-01 0.089 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 5.42e-01 0.0406 0.0665 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0144 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 2.12e-02 -0.276 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00735 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 2.16e-01 0.108 0.0868 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 6.10e-01 -0.028 0.0549 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.42e-01 0.0229 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0251 0.055 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0337 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00511 0.0608 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0208 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0974 0.0641 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.52e-01 0.169 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.45e-01 0.0479 0.0626 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 1.79e-01 0.158 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 9.99e-01 0.000158 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 5.25e-01 0.0346 0.0544 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 6.22e-01 0.0542 0.11 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.0959 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00637 0.094 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 7.69e-01 0.0256 0.0871 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.64e-01 0.0631 0.0563 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 1.15e-01 0.163 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 3.01e-01 0.108 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.74e-01 -0.14 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.86e-01 0.0145 0.0533 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0408 0.123 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.93e-03 -0.313 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 3.29e-01 0.0456 0.0466 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0667 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.75e-01 0.0282 0.0984 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 7.75e-02 -0.197 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.07e-01 0.0225 0.0598 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 9.08e-01 0.0128 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0255 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0954 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0425 0.0582 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0238 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0744 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0954 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.73e-01 0.0623 0.0567 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 9.26e-01 0.0116 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 4.60e-01 0.0841 0.113 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0671 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 6.62e-01 0.029 0.0663 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0793 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.10e-01 0.0746 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.115 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 5.84e-01 -0.031 0.0566 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0345 0.126 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 2.72e-01 0.131 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0108 0.0663 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.093 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 5.61e-02 -0.223 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0323 0.0463 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0906 0.124 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.05e-02 -0.203 0.112 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0349 0.114 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0596 0.0529 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.15e-01 0.108 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0359 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.75e-01 -0.158 0.116 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0379 0.0631 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 4.77e-01 0.109 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 4.96e-01 0.0741 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.79e-01 0.0551 0.133 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0854 0.075 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0812 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 8.08e-01 0.0275 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00403 0.0427 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.39e-01 0.00875 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 4.46e-01 0.0734 0.0961 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.25e-01 -0.015 0.0425 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 6.89e-01 0.0482 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 2.90e-01 0.137 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 2.98e-02 0.218 0.0994 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 5.00e-01 -0.08 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 8.31e-01 0.0247 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.92e-02 -0.0997 0.0565 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 59754 sc-eQTL 4.92e-01 -0.062 0.0901 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 5.78e-01 0.0576 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0389 0.0783 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 5.44e-01 0.0672 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0692 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0535 0.0893 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0376 0.0495 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0699 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0745 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.96e-01 -0.045 0.0847 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 7.71e-01 0.0334 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.17e-02 -0.14 0.0746 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0579 0.054 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 5.19e-01 0.0648 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.47e-02 -0.313 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 4.44e-01 0.0983 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0741 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.71e-02 0.0895 0.0536 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 3.39e-01 -0.134 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0272 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.75e-01 0.00353 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 7.43e-01 0.0373 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 1.24e-01 0.177 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0371 0.0502 0.156 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 2.06e-01 -0.154 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.01e-01 0.0205 0.0811 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 4.08e-01 0.0947 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 7.12e-02 -0.205 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0953 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0384 0.0548 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0988 0.0966 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.144 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0957 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 9.88e-02 0.159 0.0955 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0979 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 8.37e-01 0.0241 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0802 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 2.44e-02 -0.266 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 59754 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 4.38e-01 -0.094 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 4.20e-01 0.095 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 8.59e-01 0.0119 0.0667 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 6.05e-01 0.0311 0.0601 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 7.35e-01 0.0374 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.08e-01 0.0282 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 761407 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0333 0.0522 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 4.23e-01 0.0814 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 7.00e-01 0.0237 0.0614 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 8.28e-01 0.0202 0.0926 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00567 0.0644 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 7.98e-01 0.0269 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0876 0.0721 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0666 0.0494 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 6.75e-01 0.0499 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00563 0.0786 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 428117 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 448827 sc-eQTL 6.05e-02 -0.214 0.114 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0599 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00163 0.0458 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -789288 sc-eQTL 1.41e-01 0.139 0.0938 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 649684 sc-eQTL 5.72e-02 -0.168 0.0878 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 399423 sc-eQTL 9.93e-02 -0.184 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 348313 sc-eQTL 1.37e-01 -0.068 0.0455 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 448827 pQTL 0.0296 0.0961 0.0441 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 399423 pQTL 0.00375 -0.0921 0.0317 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 399423 eQTL 0.0152 -0.0387 0.0159 0.0 0.0 0.191
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 eQTL 0.000174 -0.103 0.0273 0.0 0.0 0.191
ENSG00000234484 AL032821.1 410207 eQTL 0.043 0.0775 0.0382 0.0 0.0 0.191

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 349543 1.39e-06 1.31e-06 3.08e-07 1.25e-06 4.9e-07 6.05e-07 1.49e-06 4.27e-07 1.74e-06 6.44e-07 2.08e-06 9.17e-07 2.53e-06 2.82e-07 4.03e-07 1.02e-06 1.03e-06 1.1e-06 5.75e-07 5.44e-07 7.33e-07 1.97e-06 1.12e-06 6.2e-07 2.49e-06 8.08e-07 1.02e-06 8.75e-07 1.65e-06 1.23e-06 8.51e-07 2.44e-07 2.98e-07 5.4e-07 5.15e-07 5.46e-07 7.46e-07 2.92e-07 5.13e-07 1.86e-07 3.2e-07 1.68e-06 1.93e-07 9.66e-08 3.38e-07 2.15e-07 2.56e-07 6.02e-08 2.46e-07