logo

Genes within 1Mb (chr6:133161096:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0464 0.113 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0867 0.119 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.65e-01 0.0135 0.045 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 3.70e-01 0.0759 0.0845 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0142 0.0512 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00739 0.108 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 2.16e-01 0.104 0.0837 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.40e-01 0.0177 0.0873 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 7.42e-01 0.0249 0.0756 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.84e-01 0.036 0.0513 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0766 0.104 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.85e-01 0.0712 0.0818 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0498 0.0855 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.81e-01 -0.133 0.0995 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00366 0.0341 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 1.46e-01 -0.15 0.103 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 1.80e-01 0.171 0.127 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0296 0.0792 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 4.06e-02 0.2 0.0971 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0777 0.106 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.14e-01 0.0572 0.113 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.17e-02 -0.107 0.0631 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0512 0.101 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 57968 sc-eQTL 4.01e-01 -0.077 0.0914 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 4.36e-01 0.0692 0.0887 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.56e-01 0.00326 0.0594 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00612 0.102 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0823 0.11 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.88e-02 -0.141 0.0768 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0516 0.0463 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0264 0.0918 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.50e-01 0.0893 0.0952 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 1.55e-01 -0.125 0.0878 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 2.11e-01 -0.137 0.109 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0591 0.0453 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.64e-02 -0.192 0.111 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0151 0.0882 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 3.39e-01 0.102 0.106 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 8.64e-01 -0.00725 0.0423 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 7.68e-02 -0.204 0.115 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.99e-01 -0.111 0.131 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 5.40e-01 0.0733 0.12 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 1.32e-01 -0.169 0.111 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.19e-01 0.186 0.119 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 3.52e-01 0.0596 0.0638 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 2.73e-01 0.123 0.112 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0355 0.126 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 1.46e-01 0.16 0.11 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00568 0.0722 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 4.13e-01 0.089 0.109 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 5.42e-01 0.0406 0.0665 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0144 0.12 0.159 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 2.12e-02 -0.276 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00735 0.111 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 2.16e-01 0.108 0.0868 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0471 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 6.10e-01 -0.028 0.0549 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0114 0.115 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.42e-01 0.0229 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 2.51e-01 -0.144 0.125 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0251 0.055 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0337 0.107 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00511 0.0608 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 1.09e-01 -0.188 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0208 0.121 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0231 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0974 0.0641 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.52e-01 0.169 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.45e-01 0.0479 0.0626 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 2.07e-01 0.151 0.119 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 1.79e-01 0.158 0.117 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 3.30e-01 0.114 0.116 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 9.99e-01 0.000158 0.118 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 5.25e-01 0.0346 0.0544 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 6.22e-01 0.0542 0.11 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00778 0.0959 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00637 0.094 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 7.69e-01 0.0256 0.0871 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.64e-01 0.0631 0.0563 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0511 0.109 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 1.15e-01 0.163 0.103 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 3.01e-01 0.108 0.104 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.74e-01 -0.14 0.102 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.86e-01 0.0145 0.0533 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0408 0.123 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.93e-03 -0.313 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 2.72e-01 0.125 0.114 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 3.29e-01 0.0456 0.0466 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0667 0.116 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.04e-01 0.108 0.105 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.75e-01 0.0282 0.0984 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 7.75e-02 -0.197 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.07e-01 0.0225 0.0598 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 3.14e-01 -0.117 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 9.08e-01 0.0128 0.111 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0255 0.118 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0954 0.102 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0425 0.0582 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0238 0.127 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0744 0.117 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0954 0.116 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.73e-01 0.0623 0.0567 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 9.26e-01 0.0116 0.125 0.155 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 4.60e-01 0.0841 0.113 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.48e-01 0.0237 0.124 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0671 0.123 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 6.62e-01 0.029 0.0663 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 4.04e-01 -0.105 0.125 0.16 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0793 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.10e-01 0.0746 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 2.61e-01 0.129 0.115 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 5.84e-01 -0.031 0.0566 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 3.15e-01 -0.119 0.118 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0345 0.126 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 2.26e-01 0.142 0.117 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 2.72e-01 0.131 0.119 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0108 0.0663 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.57e-01 0.094 0.102 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.093 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 5.61e-02 -0.223 0.116 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0323 0.0463 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0906 0.124 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.05e-02 -0.203 0.112 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0349 0.114 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0596 0.0529 0.171 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.15e-01 0.108 0.107 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0359 0.104 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.75e-01 -0.158 0.116 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0379 0.0631 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 4.77e-01 0.109 0.152 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 1.67e-01 -0.18 0.129 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 4.96e-01 0.0741 0.109 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.79e-01 0.0551 0.133 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0854 0.075 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0812 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 7.83e-01 0.0325 0.118 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 8.08e-01 0.0275 0.113 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00403 0.0427 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.111 0.163 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.89e-01 0.105 0.121 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.39e-01 0.00875 0.114 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 4.46e-01 0.0734 0.0961 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.25e-01 -0.015 0.0425 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 6.89e-01 0.0482 0.12 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 2.90e-01 0.137 0.129 0.161 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 2.33e-01 -0.121 0.101 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 2.98e-02 0.218 0.0994 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 5.00e-01 -0.08 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 8.31e-01 0.0247 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.92e-02 -0.0997 0.0565 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 3.11e-01 0.114 0.112 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 57968 sc-eQTL 4.92e-01 -0.062 0.0901 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 5.78e-01 0.0576 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0389 0.0783 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 5.44e-01 0.0672 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0692 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0535 0.0893 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0376 0.0495 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0699 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0745 0.117 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.96e-01 -0.045 0.0847 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 8.50e-01 -0.02 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 7.71e-01 0.0334 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.17e-02 -0.14 0.0746 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0579 0.054 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 5.19e-01 0.0648 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.47e-02 -0.313 0.147 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 4.44e-01 0.0983 0.128 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0741 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.71e-02 0.0895 0.0536 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 3.39e-01 -0.134 0.139 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0272 0.119 0.156 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.75e-01 0.00353 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0202 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 7.43e-01 0.0373 0.114 0.156 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 1.24e-01 0.177 0.115 0.156 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0371 0.0502 0.156 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 2.06e-01 -0.154 0.122 0.156 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 3.88e-01 0.104 0.12 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.01e-01 0.0205 0.0811 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 4.08e-01 0.0947 0.114 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 7.12e-02 -0.205 0.113 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0953 0.109 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0384 0.0548 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0988 0.0966 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0197 0.144 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 7.51e-01 0.0304 0.0957 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 9.88e-02 0.159 0.0955 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 5.39e-01 0.0602 0.0979 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 8.37e-01 0.0241 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0671 0.0802 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 2.44e-02 -0.266 0.117 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 57968 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.113 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 4.38e-01 -0.094 0.121 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 4.20e-01 0.095 0.118 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 8.59e-01 0.0119 0.0667 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 6.27e-01 0.0513 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 6.05e-01 0.0311 0.0601 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 7.35e-01 0.0374 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.08e-01 0.0282 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 759621 sc-eQTL 3.64e-01 -0.116 0.127 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0333 0.0522 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 4.23e-01 0.0814 0.101 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 7.00e-01 0.0237 0.0614 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0352 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 8.28e-01 0.0202 0.0926 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00567 0.0644 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 7.98e-01 0.0269 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 9.81e-01 0.00255 0.109 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0876 0.0721 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 1.79e-01 -0.0666 0.0494 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 8.31e-01 0.0188 0.0883 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 6.75e-01 0.0499 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00563 0.0786 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 426331 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0213 0.116 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 447041 sc-eQTL 6.05e-02 -0.214 0.114 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0599 0.108 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00163 0.0458 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 sc-eQTL 1.32e-01 -0.167 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -791074 sc-eQTL 1.41e-01 0.139 0.0938 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 647898 sc-eQTL 5.72e-02 -0.168 0.0878 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 397637 sc-eQTL 9.93e-02 -0.184 0.111 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 346527 sc-eQTL 1.37e-01 -0.068 0.0455 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 447041 pQTL 0.0285 0.0968 0.0441 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 397637 pQTL 0.00415 -0.0911 0.0317 0.0 0.0 0.19
ENSG00000112303 VNN2 397637 eQTL 0.0164 -0.0383 0.0159 0.0 0.0 0.19
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 eQTL 0.000176 -0.103 0.0273 0.0 0.0 0.19
ENSG00000234484 AL032821.1 408421 eQTL 0.0443 0.077 0.0382 0.0 0.0 0.19

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 347757 1.32e-06 1.01e-06 3.2e-07 1.28e-06 9.33e-08 4.39e-07 1.15e-06 9.69e-08 8.92e-07 2.69e-07 1.09e-06 5.22e-07 1.75e-06 2.68e-07 3.94e-07 2.69e-07 8.26e-07 4.16e-07 2.51e-07 8.39e-08 2.51e-07 5.18e-07 5.77e-07 1.25e-07 1.42e-06 2.48e-07 3.93e-07 2.65e-07 1.24e-06 1.32e-06 4.39e-07 5.4e-08 4.93e-08 2.12e-07 4.25e-07 4.41e-07 1.31e-07 1.26e-07 7.9e-08 3.05e-08 5.13e-08 1.55e-06 2.9e-07 1.61e-07 1.29e-07 7.64e-08 1.18e-07 3.3e-09 4.67e-08