Genes within 1Mb (chr6:133149369:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0635 0.11 0.169 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0759 0.116 0.169 B L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.06e-01 0.0166 0.0438 0.169 B L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.35e-01 0.0794 0.0821 0.169 B L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0224 0.0497 0.169 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00536 0.105 0.169 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 2.42e-01 0.0959 0.0817 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.69e-01 0.0486 0.0852 0.169 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.29e-01 0.0357 0.0738 0.169 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.37e-01 0.0237 0.0502 0.169 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0458 0.102 0.169 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.58e-01 0.0739 0.0802 0.169 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0592 0.0838 0.169 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 2.62e-01 -0.11 0.0977 0.169 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 9.70e-01 0.00125 0.0335 0.169 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 1.97e-01 -0.131 0.101 0.169 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 2.48e-01 0.144 0.124 0.171 DC L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.71e-01 0.0127 0.0776 0.171 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 5.02e-02 0.188 0.0953 0.171 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0934 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.50e-01 0.0504 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 2.41e-01 -0.073 0.0621 0.171 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0064 0.0986 0.171 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 46241 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0969 0.0895 0.171 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.20e-01 0.0564 0.0875 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.10e-01 0.0141 0.0586 0.169 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 9.50e-01 0.00638 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.169 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.42e-01 -0.112 0.076 0.169 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0294 0.0457 0.169 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.22e-01 0.00883 0.0906 0.169 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.39e-01 0.0573 0.0932 0.17 NK L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 1.77e-01 -0.116 0.0859 0.17 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 2.52e-01 -0.123 0.107 0.17 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0402 0.0443 0.17 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 1.63e-01 -0.153 0.109 0.169 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.0865 0.169 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 2.94e-01 0.11 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 8.79e-01 0.00634 0.0415 0.169 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 1.68e-01 -0.156 0.113 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.01e-01 -0.107 0.127 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 2.39e-01 0.137 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 6.35e-02 -0.202 0.108 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.06e-01 0.187 0.115 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.33e-01 0.0603 0.0621 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.171 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0119 0.123 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 2.76e-01 0.117 0.107 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.14e-01 0.0166 0.0704 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 8.10e-01 0.0255 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.87e-01 0.0262 0.0649 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.79e-01 0.00312 0.117 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 6.17e-02 -0.219 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0562 0.108 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 2.01e-01 0.108 0.0846 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0362 0.111 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0257 0.0535 0.17 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.68e-01 0.00445 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 8.88e-01 0.0158 0.112 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 2.21e-01 -0.15 0.122 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0188 0.0537 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0246 0.104 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 9.02e-01 0.00731 0.0594 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 1.85e-01 -0.152 0.114 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0606 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 7.63e-01 0.0348 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 9.36e-02 -0.105 0.0623 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 5.29e-01 0.0384 0.0609 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 4.77e-01 0.0827 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.08e-01 0.118 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.53e-01 0.068 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0158 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 4.21e-01 0.043 0.0533 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00154 0.108 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0329 0.0937 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.28e-01 0.02 0.0919 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 5.88e-01 0.0461 0.0851 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 4.17e-01 0.0448 0.0551 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0281 0.106 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.40e-02 0.203 0.1 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.25e-01 -0.154 0.0998 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.89e-01 0.0139 0.052 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00809 0.121 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 1.46e-01 -0.169 0.116 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 1.43e-02 -0.284 0.115 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.08e-01 0.0468 0.0457 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0148 0.114 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.67e-01 0.0934 0.103 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.61e-01 0.0295 0.0966 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.53e-01 -0.157 0.109 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 5.26e-01 0.0373 0.0587 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0997 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 7.46e-01 0.0353 0.109 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0523 0.116 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0874 0.0996 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0377 0.0571 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 7.41e-01 0.0379 0.115 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0141 0.124 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0814 0.115 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.72e-01 0.0496 0.0554 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.00e-01 0.0153 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.90e-01 0.0769 0.111 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.96e-01 0.0829 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0474 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.81e-01 0.0268 0.065 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.123 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0869 0.117 0.169 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.17e-01 0.0902 0.111 0.169 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.38e-01 0.108 0.113 0.169 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0193 0.0555 0.169 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0957 0.116 0.169 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0358 0.124 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 3.07e-01 0.117 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.08e-01 0.119 0.116 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 8.59e-01 0.0115 0.065 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.22e-01 0.064 0.0998 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 2.03e-01 -0.116 0.0911 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 4.90e-02 -0.224 0.113 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0235 0.0454 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.62e-02 -0.22 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0537 0.0521 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.10e-01 0.0859 0.104 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00747 0.101 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.113 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0197 0.0616 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.71e-01 0.134 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 9.25e-02 -0.214 0.126 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.85e-01 0.0584 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 5.83e-01 0.0718 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0609 0.0738 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.56e-01 0.00768 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.115 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.72e-01 0.0166 0.103 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 8.46e-01 0.0215 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 5.50e-01 0.025 0.0418 0.172 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 7.69e-01 0.0319 0.108 0.172 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.55e-01 0.11 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.97e-01 0.0289 0.112 0.169 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.00e-01 0.0494 0.0941 0.169 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0131 0.0416 0.169 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 8.81e-01 0.0176 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.126 0.173 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 3.19e-01 -0.099 0.099 0.173 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 1.03e-01 0.16 0.0979 0.173 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.92e-01 0.0448 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0764 0.0555 0.173 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 3.23e-01 0.109 0.11 0.173 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 46241 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0548 0.0882 0.173 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.10e-01 0.0669 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0137 0.077 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 5.67e-01 0.0624 0.109 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 3.02e-01 -0.113 0.11 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0351 0.0878 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0137 0.0488 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.094 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0442 0.0831 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 8.02e-01 0.0261 0.104 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 8.99e-01 0.0143 0.113 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 9.91e-02 -0.122 0.0734 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.25e-01 -0.026 0.0532 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 3.19e-01 0.0982 0.0983 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 4.13e-02 -0.298 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 4.63e-01 0.0927 0.126 0.173 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0471 0.14 0.173 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.29e-02 0.095 0.0526 0.173 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0735 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 7.77e-01 -0.033 0.117 0.164 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00491 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 6.57e-01 0.0494 0.111 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 7.38e-02 0.202 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0149 0.0492 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 9.07e-02 -0.202 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0138 0.0799 0.172 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 5.46e-01 0.0682 0.113 0.172 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 3.96e-02 -0.229 0.111 0.172 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0211 0.054 0.172 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0675 0.0952 0.172 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0712 0.14 0.178 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 3.02e-01 0.096 0.0927 0.178 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 5.04e-02 0.182 0.0925 0.178 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 4.16e-01 0.0775 0.0951 0.178 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0157 0.113 0.178 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0731 0.0779 0.178 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 1.61e-01 -0.162 0.115 0.178 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 46241 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0557 0.118 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 6.65e-01 0.0497 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.43e-01 0.0213 0.0649 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 9.15e-01 0.011 0.103 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 8.13e-01 0.0139 0.0585 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 6.57e-01 0.0478 0.107 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 9.94e-01 0.000853 0.113 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 747894 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0746 0.124 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0339 0.0508 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.54e-01 0.0914 0.0985 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.92e-01 0.0236 0.0597 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0441 0.113 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 9.14e-01 0.0098 0.0911 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 7.39e-01 0.0212 0.0634 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 6.89e-01 0.0414 0.103 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0623 0.0711 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0419 0.0488 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 5.43e-01 0.0529 0.0868 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 5.72e-01 0.0664 0.117 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00737 0.0775 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 414604 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0266 0.114 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 435314 sc-eQTL 4.15e-02 -0.23 0.112 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 5.93e-01 -0.057 0.106 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 6.31e-01 0.0218 0.0452 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 sc-eQTL 7.38e-02 -0.196 0.109 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -802801 sc-eQTL 2.44e-01 0.107 0.0918 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 636171 sc-eQTL 8.81e-02 -0.147 0.0859 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 385910 sc-eQTL 1.34e-01 -0.164 0.109 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 334800 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0491 0.0446 0.17 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 435314 pQTL 0.0206 0.102 0.044 0.0 0.0 0.193
ENSG00000112303 VNN2 385910 pQTL 0.0118 -0.0799 0.0317 0.0 0.0 0.193
ENSG00000112303 VNN2 385910 eQTL 0.027 -0.0351 0.0159 0.0 0.0 0.194
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 eQTL 8.67e-06 -0.121 0.0271 0.0 0.0 0.194
ENSG00000234484 AL032821.1 396694 eQTL 0.0301 0.0827 0.0381 0.0 0.0 0.194


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 747894 3.1e-07 1.56e-07 6.45e-08 2.24e-07 1.08e-07 8.75e-08 2.4e-07 6.2e-08 1.86e-07 1.05e-07 1.86e-07 1.52e-07 2.38e-07 8.15e-08 6.2e-08 9.35e-08 5.42e-08 2.04e-07 7.36e-08 6.03e-08 1.24e-07 1.81e-07 1.69e-07 4.17e-08 2.28e-07 1.56e-07 1.31e-07 1.28e-07 1.39e-07 1.29e-07 1.26e-07 4.61e-08 4.37e-08 9.5e-08 5.16e-08 3.18e-08 3.91e-08 8.17e-08 6.35e-08 6.07e-08 5.36e-08 1.59e-07 3.99e-08 7.47e-09 3.55e-08 8.31e-09 7e-08 2.07e-09 4.83e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 336030 1.28e-06 9.55e-07 3.14e-07 6.75e-07 3.47e-07 4.7e-07 1.34e-06 3.69e-07 1.39e-06 4.66e-07 1.56e-06 6.58e-07 2.02e-06 2.55e-07 5.28e-07 9.17e-07 8.54e-07 6.8e-07 7.73e-07 6.97e-07 6.13e-07 1.38e-06 8.96e-07 6.44e-07 2.05e-06 4.39e-07 8.68e-07 6.93e-07 1.25e-06 1.23e-06 5.88e-07 2.05e-07 1.99e-07 6.94e-07 5.32e-07 4.5e-07 5.17e-07 1.65e-07 3.89e-07 3.24e-07 2.68e-07 1.53e-06 5.77e-08 4.15e-08 1.67e-07 1.27e-07 2.28e-07 7e-08 1.56e-07