logo

Genes within 1Mb (chr6:133142542:A:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0635 0.11 0.169 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0759 0.116 0.169 B L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.06e-01 0.0166 0.0438 0.169 B L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.35e-01 0.0794 0.0821 0.169 B L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0224 0.0497 0.169 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00536 0.105 0.169 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 2.42e-01 0.0959 0.0817 0.169 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.69e-01 0.0486 0.0852 0.169 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.29e-01 0.0357 0.0738 0.169 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.37e-01 0.0237 0.0502 0.169 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0458 0.102 0.169 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.58e-01 0.0739 0.0802 0.169 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0592 0.0838 0.169 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 2.62e-01 -0.11 0.0977 0.169 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 9.70e-01 0.00125 0.0335 0.169 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 1.97e-01 -0.131 0.101 0.169 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 2.48e-01 0.144 0.124 0.171 DC L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.71e-01 0.0127 0.0776 0.171 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 5.02e-02 0.188 0.0953 0.171 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0934 0.104 0.171 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.50e-01 0.0504 0.111 0.171 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 2.41e-01 -0.073 0.0621 0.171 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0064 0.0986 0.171 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 39414 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0969 0.0895 0.171 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.20e-01 0.0564 0.0875 0.169 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.10e-01 0.0141 0.0586 0.169 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 9.50e-01 0.00638 0.101 0.169 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 3.01e-01 -0.112 0.108 0.169 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.42e-01 -0.112 0.076 0.169 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0294 0.0457 0.169 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.22e-01 0.00883 0.0906 0.169 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.39e-01 0.0573 0.0932 0.17 NK L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 1.77e-01 -0.116 0.0859 0.17 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 2.52e-01 -0.123 0.107 0.17 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0402 0.0443 0.17 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 1.63e-01 -0.153 0.109 0.169 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.64e-01 0.0149 0.0865 0.169 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 2.94e-01 0.11 0.104 0.169 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 8.79e-01 0.00634 0.0415 0.169 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 1.68e-01 -0.156 0.113 0.169 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.01e-01 -0.107 0.127 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 2.39e-01 0.137 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 6.35e-02 -0.202 0.108 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.06e-01 0.187 0.115 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.33e-01 0.0603 0.0621 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.171 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0119 0.123 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 2.76e-01 0.117 0.107 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.14e-01 0.0166 0.0704 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 8.10e-01 0.0255 0.106 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.87e-01 0.0262 0.0649 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.79e-01 0.00312 0.117 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 6.17e-02 -0.219 0.116 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0562 0.108 0.17 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 2.01e-01 0.108 0.0846 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0362 0.111 0.17 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0257 0.0535 0.17 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.68e-01 0.00445 0.112 0.17 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 8.88e-01 0.0158 0.112 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 2.21e-01 -0.15 0.122 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0188 0.0537 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0246 0.104 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 9.02e-01 0.00731 0.0594 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 1.85e-01 -0.152 0.114 0.169 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0606 0.118 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 7.63e-01 0.0348 0.115 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 9.36e-02 -0.105 0.0623 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.31e-01 0.173 0.114 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 5.29e-01 0.0384 0.0609 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 4.77e-01 0.0827 0.116 0.17 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.08e-01 0.118 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.53e-01 0.068 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0158 0.116 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 4.21e-01 0.043 0.0533 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00154 0.108 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0329 0.0937 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.28e-01 0.02 0.0919 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 5.88e-01 0.0461 0.0851 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 4.17e-01 0.0448 0.0551 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0281 0.106 0.169 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.40e-02 0.203 0.1 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 1.45e-01 0.148 0.101 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.25e-01 -0.154 0.0998 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.89e-01 0.0139 0.052 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00809 0.121 0.169 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 1.46e-01 -0.169 0.116 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 1.43e-02 -0.284 0.115 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 2.41e-01 0.131 0.111 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.08e-01 0.0468 0.0457 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0148 0.114 0.169 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.67e-01 0.0934 0.103 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.61e-01 0.0295 0.0966 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.53e-01 -0.157 0.109 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 5.26e-01 0.0373 0.0587 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0997 0.114 0.169 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 7.46e-01 0.0353 0.109 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0523 0.116 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0874 0.0996 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0377 0.0571 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 7.41e-01 0.0379 0.115 0.169 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0141 0.124 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0814 0.115 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.21e-01 -0.113 0.114 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.72e-01 0.0496 0.0554 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.00e-01 0.0153 0.122 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.90e-01 0.0769 0.111 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.96e-01 0.0829 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0474 0.121 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.81e-01 0.0268 0.065 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 2.90e-01 -0.13 0.123 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0869 0.117 0.169 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.17e-01 0.0902 0.111 0.169 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.38e-01 0.108 0.113 0.169 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0193 0.0555 0.169 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0957 0.116 0.169 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0358 0.124 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 3.07e-01 0.117 0.115 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.08e-01 0.119 0.116 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 8.59e-01 0.0115 0.065 0.171 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.22e-01 0.064 0.0998 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 2.03e-01 -0.116 0.0911 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 4.90e-02 -0.224 0.113 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0235 0.0454 0.17 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.32e-01 -0.118 0.121 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.62e-02 -0.22 0.11 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.112 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0537 0.0521 0.176 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.10e-01 0.0859 0.104 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00747 0.101 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.53e-01 -0.106 0.113 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0197 0.0616 0.17 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.71e-01 0.134 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 9.25e-02 -0.214 0.126 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.85e-01 0.0584 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 5.83e-01 0.0718 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0609 0.0738 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.56e-01 0.00768 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.71e-01 0.103 0.115 0.172 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.72e-01 0.0166 0.103 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 8.46e-01 0.0215 0.111 0.172 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 5.50e-01 0.025 0.0418 0.172 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 7.69e-01 0.0319 0.108 0.172 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.55e-01 0.11 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.97e-01 0.0289 0.112 0.169 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.00e-01 0.0494 0.0941 0.169 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0131 0.0416 0.169 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 8.81e-01 0.0176 0.118 0.169 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.52e-01 0.118 0.126 0.173 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 3.19e-01 -0.099 0.099 0.173 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 1.03e-01 0.16 0.0979 0.173 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 2.42e-01 -0.136 0.115 0.173 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.92e-01 0.0448 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0764 0.0555 0.173 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 3.23e-01 0.109 0.11 0.173 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 39414 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0548 0.0882 0.173 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.10e-01 0.0669 0.101 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0137 0.077 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 5.67e-01 0.0624 0.109 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 3.02e-01 -0.113 0.11 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0351 0.0878 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0137 0.0488 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0337 0.094 0.169 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 3.31e-01 -0.112 0.115 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0442 0.0831 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 8.02e-01 0.0261 0.104 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 8.99e-01 0.0143 0.113 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 9.91e-02 -0.122 0.0734 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.25e-01 -0.026 0.0532 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 3.19e-01 0.0982 0.0983 0.169 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 4.13e-02 -0.298 0.145 0.173 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 4.63e-01 0.0927 0.126 0.173 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0471 0.14 0.173 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.29e-02 0.095 0.0526 0.173 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0735 0.137 0.173 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 7.77e-01 -0.033 0.117 0.164 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.28e-01 0.0704 0.111 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00491 0.113 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 6.57e-01 0.0494 0.111 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 7.38e-02 0.202 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0149 0.0492 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 9.07e-02 -0.202 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 2.48e-01 0.136 0.118 0.172 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0138 0.0799 0.172 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 5.46e-01 0.0682 0.113 0.172 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 3.96e-02 -0.229 0.111 0.172 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.17e-01 -0.108 0.107 0.172 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0211 0.054 0.172 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0675 0.0952 0.172 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0712 0.14 0.178 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 3.02e-01 0.096 0.0927 0.178 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 5.04e-02 0.182 0.0925 0.178 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 4.16e-01 0.0775 0.0951 0.178 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0157 0.113 0.178 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0731 0.0779 0.178 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 1.61e-01 -0.162 0.115 0.178 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 39414 sc-eQTL 1.63e-01 -0.154 0.11 0.178 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0557 0.118 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 6.65e-01 0.0497 0.115 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.43e-01 0.0213 0.0649 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 9.15e-01 0.011 0.103 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 8.13e-01 0.0139 0.0585 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 6.57e-01 0.0478 0.107 0.169 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 9.94e-01 0.000853 0.113 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 741067 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0746 0.124 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0339 0.0508 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.54e-01 0.0914 0.0985 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.92e-01 0.0236 0.0597 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0441 0.113 0.169 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 9.14e-01 0.0098 0.0911 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 7.39e-01 0.0212 0.0634 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 6.89e-01 0.0414 0.103 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0283 0.108 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0623 0.0711 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0419 0.0488 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 5.43e-01 0.0529 0.0868 0.169 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 5.72e-01 0.0664 0.117 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00737 0.0775 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 407777 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0266 0.114 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 428487 sc-eQTL 4.15e-02 -0.23 0.112 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 5.93e-01 -0.057 0.106 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 6.31e-01 0.0218 0.0452 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 sc-eQTL 7.38e-02 -0.196 0.109 0.17 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -809628 sc-eQTL 2.44e-01 0.107 0.0918 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 629344 sc-eQTL 8.81e-02 -0.147 0.0859 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 379083 sc-eQTL 1.34e-01 -0.164 0.109 0.17 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 327973 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0491 0.0446 0.17 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 428487 pQTL 0.0162 0.106 0.0441 0.0 0.0 0.193
ENSG00000112303 VNN2 379083 pQTL 0.0109 -0.081 0.0317 0.0 0.0 0.193
ENSG00000112303 VNN2 379083 eQTL 0.0289 -0.0348 0.0159 0.0 0.0 0.193
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 eQTL 6.62e-06 -0.123 0.0271 0.0 0.0 0.193
ENSG00000234484 AL032821.1 389867 eQTL 0.0276 0.0841 0.0381 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 741067 3.53e-07 1.7e-07 6.57e-08 2.27e-07 1.08e-07 7.75e-08 2.63e-07 6.2e-08 1.98e-07 1.11e-07 2.07e-07 1.57e-07 2.94e-07 8.44e-08 6.6e-08 1.01e-07 5.42e-08 2.15e-07 7.36e-08 6.02e-08 1.23e-07 1.89e-07 1.75e-07 4.27e-08 2.48e-07 1.65e-07 1.25e-07 1.42e-07 1.37e-07 1.36e-07 1.26e-07 4.61e-08 4.37e-08 1.02e-07 5.41e-08 3.3e-08 4.07e-08 7.63e-08 6.33e-08 6.31e-08 4.78e-08 1.6e-07 3.35e-08 1.1e-08 3.48e-08 6.68e-09 7e-08 2.13e-09 4.94e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 329203 1.24e-06 9.33e-07 3.28e-07 7.82e-07 3.5e-07 4.76e-07 1.52e-06 3.82e-07 1.48e-06 4.78e-07 1.79e-06 7.32e-07 2.16e-06 2.73e-07 5.36e-07 9.16e-07 8.42e-07 6.96e-07 7.76e-07 6.4e-07 6.56e-07 1.56e-06 8.76e-07 6.39e-07 2.26e-06 4.83e-07 9.02e-07 7.19e-07 1.29e-06 1.27e-06 6.29e-07 1.92e-07 2.08e-07 6.69e-07 6.22e-07 4.42e-07 5.02e-07 1.68e-07 3.87e-07 2.91e-07 3.03e-07 1.49e-06 5.04e-08 4.23e-08 2.16e-07 1.22e-07 2.37e-07 5.28e-08 1.25e-07