logo

Genes within 1Mb (chr6:133130340:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.37e-01 0.185 0.124 0.13 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 4.37e-01 -0.102 0.132 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00119 0.0497 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0943 0.0932 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 9.19e-02 -0.095 0.0561 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.46e-01 0.112 0.119 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0466 0.0779 0.13 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.03e-02 -0.184 0.0893 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 2.41e-01 -0.11 0.0935 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000165 0.0812 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0682 0.055 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 1.61e-01 0.157 0.111 0.13 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 5.03e-02 -0.174 0.0882 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0924 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 4.16e-03 -0.308 0.106 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.08e-01 -0.019 0.037 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.112 0.13 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 5.81e-01 0.0758 0.137 0.131 DC L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 1.61e-01 -0.119 0.085 0.131 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 8.65e-01 0.018 0.106 0.131 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 4.41e-01 0.0882 0.114 0.131 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.32e-02 -0.276 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.94e-01 -0.027 0.0686 0.131 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0694 0.108 0.131 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 27212 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0417 0.0987 0.131 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0475 0.0972 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0655 0.0649 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0624 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 1.60e-01 -0.168 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0456 0.0847 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0298 0.0508 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 8.31e-01 0.0215 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 2.95e-01 0.109 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 3.04e-01 -0.099 0.0962 0.131 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.46e-01 -0.113 0.12 0.131 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 3.49e-01 0.0465 0.0496 0.131 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 7.56e-02 0.22 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0314 0.0976 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.64e-01 -0.164 0.118 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0396 0.0467 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.86e-02 0.34 0.143 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 7.70e-02 -0.234 0.132 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0427 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00868 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0893 0.0707 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.13 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 6.49e-01 0.0634 0.139 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 2.36e-01 -0.145 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0834 0.0799 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.18e-01 -0.148 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0564 0.0738 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.32e-01 0.129 0.133 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 2.25e-02 0.257 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0314 0.131 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00857 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.10e-02 0.16 0.0944 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.70e-01 -0.17 0.124 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0641 0.0597 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 4.04e-01 0.104 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 2.16e-01 0.144 0.116 0.129 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 8.36e-01 0.027 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 6.02e-01 0.0749 0.143 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.22e-01 0.00618 0.0627 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 1.40e-01 -0.102 0.069 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.51e-01 0.125 0.134 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 9.19e-01 0.00898 0.0886 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 2.70e-01 0.152 0.138 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 3.44e-01 0.128 0.134 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0153 0.0734 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.56e-01 -0.124 0.135 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 1.08e-01 -0.114 0.0709 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 2.17e-01 -0.168 0.136 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0243 0.0944 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 2.11e-01 -0.164 0.131 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 5.30e-01 -0.082 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0799 0.131 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0707 0.0606 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 4.97e-01 0.0833 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0982 0.103 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0445 0.101 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0286 0.0936 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0577 0.0606 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.27e-01 0.115 0.117 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 3.36e-01 -0.108 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0858 0.113 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.88e-01 0.146 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0465 0.0575 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.61e-02 0.222 0.133 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.06e-01 0.213 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 1.11e-01 0.21 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.40e-01 -0.187 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0611 0.0519 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 2.49e-01 0.149 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 5.20e-01 0.0747 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.22e-02 -0.182 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.73e-02 -0.27 0.122 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0541 0.0658 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.14e-01 0.128 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.75e-02 -0.291 0.122 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 5.07e-01 0.0871 0.131 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.32e-01 -0.135 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 9.52e-01 0.0039 0.0648 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 1.88e-01 0.171 0.13 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00389 0.144 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0581 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.75e-01 0.145 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 5.34e-02 -0.124 0.064 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.48e-01 0.133 0.141 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.55e-01 -0.177 0.124 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 8.43e-02 -0.235 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 4.42e-01 -0.105 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0766 0.0728 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0463 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 3.76e-02 0.272 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0206 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.44e-01 0.12 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.22e-02 -0.116 0.0619 0.13 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 2.56e-01 -0.149 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.46e-01 0.106 0.138 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0546 0.128 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 8.36e-03 -0.341 0.128 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.40e-01 0.034 0.0726 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.68e-02 0.188 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 1.70e-01 -0.142 0.103 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 2.96e-01 -0.135 0.129 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.05e-01 0.0651 0.0512 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.59e-01 0.00711 0.137 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0655 0.125 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.39e-01 0.00977 0.127 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 1.92e-01 0.0768 0.0587 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00518 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 3.59e-01 -0.103 0.113 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0919 0.127 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 3.91e-01 0.0591 0.0687 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.115 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 5.82e-01 0.0442 0.08 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 6.24e-01 0.0737 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0986 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.40e-02 -0.329 0.133 0.126 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 8.28e-01 0.0262 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.17e-01 -0.129 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0353 0.0488 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 4.59e-02 -0.252 0.125 0.126 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0995 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 2.41e-01 -0.151 0.128 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.43e-01 0.158 0.108 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.04e-02 -0.0977 0.0474 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0847 0.135 0.13 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0174 0.14 0.129 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0523 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0205 0.109 0.129 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 6.87e-01 0.052 0.129 0.129 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 7.79e-02 -0.22 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.22e-01 0.0497 0.0618 0.129 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.71e-01 0.00448 0.123 0.129 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 27212 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0262 0.0979 0.129 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.22e-01 0.0877 0.109 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00772 0.0829 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 8.72e-01 -0.019 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 3.05e-01 -0.121 0.118 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0664 0.0945 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0215 0.0525 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0086 0.101 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 3.17e-01 -0.125 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0954 0.0902 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 7.24e-02 -0.22 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0397 0.0803 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 9.87e-01 0.000979 0.0578 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 8.74e-01 0.0169 0.107 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.54e-01 0.247 0.172 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 4.19e-01 -0.121 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00708 0.165 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0499 0.0626 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 6.08e-01 0.0833 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 5.16e-01 0.0832 0.128 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 3.20e-01 -0.121 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0749 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 8.21e-02 -0.211 0.121 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0161 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 2.96e-01 0.0563 0.0538 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.58e-01 0.121 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 6.49e-02 -0.248 0.133 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 3.84e-01 0.0793 0.0908 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0285 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 9.25e-02 -0.206 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00777 0.0615 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 1.38e-01 0.161 0.108 0.133 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0726 0.17 0.113 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 5.25e-02 -0.218 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 8.70e-01 0.0186 0.114 0.113 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 7.40e-01 0.0386 0.116 0.113 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0841 0.138 0.113 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 7.54e-01 0.0298 0.095 0.113 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.31e-01 -0.137 0.14 0.113 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 27212 sc-eQTL 7.13e-01 0.0496 0.135 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.46e-01 0.101 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0304 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0132 0.0729 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 3.01e-01 -0.119 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 4.39e-01 -0.051 0.0656 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 6.24e-02 0.224 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 1.24e-01 0.179 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 6.88e-01 0.0515 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 728865 sc-eQTL 5.17e-01 0.0912 0.141 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 7.70e-01 0.0169 0.0578 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 8.29e-01 0.0243 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 1.13e-01 -0.107 0.0675 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.72e-01 0.00452 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 998452 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0488 0.0813 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 9.81e-01 0.00236 0.1 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0584 0.0696 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 6.10e-01 -0.058 0.114 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 1.59e-01 -0.167 0.118 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0562 0.0783 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0211 0.0537 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 9.99e-01 8.69e-05 0.0956 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0994 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00933 0.0837 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 395575 sc-eQTL 6.21e-01 -0.061 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 416285 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0503 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 1.25e-01 -0.176 0.114 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 9.31e-01 0.00426 0.0488 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 317001 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.118 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821830 sc-eQTL 1.39e-01 0.153 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617142 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0965 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366881 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0716 0.123 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315771 sc-eQTL 1.92e-01 0.0653 0.0499 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 728865 eQTL 0.0217 0.101 0.0441 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 416285 pQTL 6.69e-05 -0.211 0.0528 0.0 0.0 0.119
ENSG00000112299 VNN1 416285 eQTL 0.00392 -0.092 0.0318 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 416285 8.21e-07 3.23e-07 3.69e-08 2.35e-07 9.91e-08 9.9e-08 3.57e-07 5.21e-08 1.45e-07 4.38e-08 1.63e-07 8.55e-08 2.05e-07 7.37e-08 6.04e-08 7.3e-08 4.63e-08 1.51e-07 5.21e-08 3.88e-08 1.05e-07 1.26e-07 2.26e-07 4.67e-08 1.72e-07 1.13e-07 1.06e-07 9.61e-08 1.34e-07 1.07e-07 1.14e-07 3.72e-08 2.74e-08 8.11e-08 3.4e-08 3.97e-08 5.54e-08 9.26e-08 8e-08 3.67e-08 3.07e-08 1.01e-06 3.4e-08 0.0 9.88e-08 1.83e-08 1.45e-07 4.82e-09 4.61e-08