logo

Genes within 1Mb (chr6:133130286:GC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.37e-01 0.185 0.124 0.13 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 4.37e-01 -0.102 0.132 0.13 B L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00119 0.0497 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0943 0.0932 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 9.19e-02 -0.095 0.0561 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.46e-01 0.112 0.119 0.13 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0466 0.0779 0.13 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.03e-02 -0.184 0.0893 0.13 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 2.41e-01 -0.11 0.0935 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000165 0.0812 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0682 0.055 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 1.61e-01 0.157 0.111 0.13 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 5.03e-02 -0.174 0.0882 0.13 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 1.44e-01 -0.135 0.0924 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 4.16e-03 -0.308 0.106 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.08e-01 -0.019 0.037 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 1.69e-01 0.154 0.112 0.13 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 5.81e-01 0.0758 0.137 0.131 DC L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 1.61e-01 -0.119 0.085 0.131 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 8.65e-01 0.018 0.106 0.131 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 4.41e-01 0.0882 0.114 0.131 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.32e-02 -0.276 0.121 0.131 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.94e-01 -0.027 0.0686 0.131 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0694 0.108 0.131 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 27158 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0417 0.0987 0.131 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0475 0.0972 0.13 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0655 0.0649 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0624 0.112 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 1.60e-01 -0.168 0.12 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0456 0.0847 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0298 0.0508 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 8.31e-01 0.0215 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 2.95e-01 0.109 0.104 0.131 NK L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 3.04e-01 -0.099 0.0962 0.131 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.46e-01 -0.113 0.12 0.131 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 3.49e-01 0.0465 0.0496 0.131 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 7.56e-02 0.22 0.123 0.13 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0314 0.0976 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.64e-01 -0.164 0.118 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0396 0.0467 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 4.01e-01 -0.108 0.128 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.86e-02 0.34 0.143 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 7.70e-02 -0.234 0.132 0.13 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0427 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00868 0.133 0.13 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0893 0.0707 0.13 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.27e-01 0.0114 0.124 0.13 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 2.83e-01 -0.127 0.118 0.13 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 6.49e-01 0.0634 0.139 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 2.36e-01 -0.145 0.122 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0834 0.0799 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.18e-01 -0.148 0.12 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0564 0.0738 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.32e-01 0.129 0.133 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 2.25e-02 0.257 0.112 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0314 0.131 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00857 0.121 0.129 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.10e-02 0.16 0.0944 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.70e-01 -0.17 0.124 0.129 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0641 0.0597 0.129 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 4.04e-01 0.104 0.125 0.129 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 2.16e-01 0.144 0.116 0.129 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 8.36e-01 0.027 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 6.02e-01 0.0749 0.143 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.22e-01 0.00618 0.0627 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.56e-01 0.138 0.121 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 1.40e-01 -0.102 0.069 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.51e-01 0.125 0.134 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 9.19e-01 0.00898 0.0886 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 2.70e-01 0.152 0.138 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 3.44e-01 0.128 0.134 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0153 0.0734 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.56e-01 -0.124 0.135 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 1.08e-01 -0.114 0.0709 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 2.17e-01 -0.168 0.136 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0243 0.0944 0.129 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 2.11e-01 -0.164 0.131 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 5.30e-01 -0.082 0.13 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0799 0.131 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0707 0.0606 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 4.97e-01 0.0833 0.122 0.125 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0982 0.103 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0445 0.101 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0286 0.0936 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0577 0.0606 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.27e-01 0.115 0.117 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 3.36e-01 -0.108 0.112 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0858 0.113 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.88e-01 0.146 0.111 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0465 0.0575 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.61e-02 0.222 0.133 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.06e-01 0.213 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 1.11e-01 0.21 0.131 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.40e-01 -0.187 0.126 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0611 0.0519 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 2.49e-01 0.149 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 5.20e-01 0.0747 0.116 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.22e-02 -0.182 0.108 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.73e-02 -0.27 0.122 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0541 0.0658 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.14e-01 0.128 0.127 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.75e-02 -0.291 0.122 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 5.07e-01 0.0871 0.131 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.32e-01 -0.135 0.113 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 9.52e-01 0.0039 0.0648 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 1.88e-01 0.171 0.13 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00389 0.144 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0581 0.134 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.75e-01 0.145 0.132 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 5.34e-02 -0.124 0.064 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.48e-01 0.133 0.141 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.55e-01 -0.177 0.124 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 8.43e-02 -0.235 0.135 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 4.42e-01 -0.105 0.136 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0766 0.0728 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0463 0.138 0.128 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 3.76e-02 0.272 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0206 0.125 0.13 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.44e-01 0.12 0.127 0.13 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.22e-02 -0.116 0.0619 0.13 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 2.56e-01 -0.149 0.13 0.13 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.46e-01 0.106 0.138 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0546 0.128 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 8.36e-03 -0.341 0.128 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.40e-01 0.034 0.0726 0.127 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.68e-02 0.188 0.112 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 1.70e-01 -0.142 0.103 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 2.96e-01 -0.135 0.129 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.05e-01 0.0651 0.0512 0.129 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.59e-01 0.00711 0.137 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0655 0.125 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.39e-01 0.00977 0.127 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 1.92e-01 0.0768 0.0587 0.135 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00518 0.116 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 3.59e-01 -0.103 0.113 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0919 0.127 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 3.91e-01 0.0591 0.0687 0.129 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.115 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 5.82e-01 0.0442 0.08 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 6.24e-01 0.0737 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0986 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.40e-02 -0.329 0.133 0.126 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 8.28e-01 0.0262 0.12 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.17e-01 -0.129 0.129 0.126 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0353 0.0488 0.126 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 4.59e-02 -0.252 0.125 0.126 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0995 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 2.41e-01 -0.151 0.128 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.43e-01 0.158 0.108 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.04e-02 -0.0977 0.0474 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0847 0.135 0.13 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0174 0.14 0.129 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0523 0.11 0.129 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 8.52e-01 -0.0205 0.109 0.129 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 6.87e-01 0.052 0.129 0.129 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 7.79e-02 -0.22 0.124 0.129 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.22e-01 0.0497 0.0618 0.129 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.71e-01 0.00448 0.123 0.129 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 27158 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0262 0.0979 0.129 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.22e-01 0.0877 0.109 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00772 0.0829 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 8.72e-01 -0.019 0.117 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 3.05e-01 -0.121 0.118 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0664 0.0945 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0215 0.0525 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0086 0.101 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 3.17e-01 -0.125 0.125 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0954 0.0902 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 2.58e-01 -0.128 0.113 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 7.24e-02 -0.22 0.122 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0397 0.0803 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 9.87e-01 0.000979 0.0578 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 8.74e-01 0.0169 0.107 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.54e-01 0.247 0.172 0.124 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 4.19e-01 -0.121 0.149 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00708 0.165 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0499 0.0626 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 6.08e-01 0.0833 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 5.16e-01 0.0832 0.128 0.133 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 3.20e-01 -0.121 0.122 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0749 0.123 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 8.21e-02 -0.211 0.121 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0161 0.124 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 2.96e-01 0.0563 0.0538 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.58e-01 0.121 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 6.49e-02 -0.248 0.133 0.133 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 3.84e-01 0.0793 0.0908 0.133 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 9.15e-01 0.0138 0.128 0.133 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0285 0.127 0.133 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 9.25e-02 -0.206 0.122 0.133 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00777 0.0615 0.133 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 1.38e-01 0.161 0.108 0.133 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0726 0.17 0.113 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 5.25e-02 -0.218 0.112 0.113 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 8.70e-01 0.0186 0.114 0.113 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 7.40e-01 0.0386 0.116 0.113 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0841 0.138 0.113 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 7.54e-01 0.0298 0.095 0.113 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.31e-01 -0.137 0.14 0.113 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 27158 sc-eQTL 7.13e-01 0.0496 0.135 0.113 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.46e-01 0.101 0.132 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0304 0.129 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0132 0.0729 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 3.01e-01 -0.119 0.115 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 4.39e-01 -0.051 0.0656 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 6.24e-02 0.224 0.12 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 1.24e-01 0.179 0.116 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 6.88e-01 0.0515 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 728811 sc-eQTL 5.17e-01 0.0912 0.141 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 7.70e-01 0.0169 0.0578 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 8.29e-01 0.0243 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 1.13e-01 -0.107 0.0675 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.72e-01 0.00452 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 998398 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0488 0.0813 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 9.81e-01 0.00236 0.1 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0584 0.0696 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 6.10e-01 -0.058 0.114 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 1.59e-01 -0.167 0.118 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0562 0.0783 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0211 0.0537 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 9.99e-01 8.69e-05 0.0956 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0994 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00933 0.0837 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 395521 sc-eQTL 6.21e-01 -0.061 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 416231 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0503 0.122 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 1.25e-01 -0.176 0.114 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 9.31e-01 0.00426 0.0488 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 316947 sc-eQTL 3.85e-01 0.103 0.118 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -821884 sc-eQTL 1.39e-01 0.153 0.103 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 617088 sc-eQTL 1.87e-01 -0.128 0.0965 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 366827 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0716 0.123 0.129 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 315717 sc-eQTL 1.92e-01 0.0653 0.0499 0.129 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 728811 eQTL 0.0231 0.1 0.0441 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 416231 pQTL 7.39e-05 -0.21 0.0528 0.0 0.0 0.119
ENSG00000112299 VNN1 416231 eQTL 0.00426 -0.0911 0.0318 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 416231 1.22e-06 5.13e-06 1.12e-07 1.49e-06 1.1e-07 3.12e-07 1.33e-06 7.52e-08 1.74e-06 3.77e-07 3.8e-06 3.32e-06 3.49e-06 1.78e-06 3.34e-07 8.62e-07 4.54e-07 1.12e-06 3.43e-07 8.25e-08 3.24e-07 1.96e-06 8.53e-07 1.58e-07 2.26e-06 2.54e-07 5.49e-07 3.24e-07 1.25e-06 7.92e-07 1.94e-06 3.98e-08 3.16e-08 2.17e-07 5.34e-07 5.23e-08 5.7e-08 8.71e-08 4.74e-08 3.99e-08 3.27e-08 4.11e-06 3.55e-08 1.2e-08 4.92e-08 8.94e-09 8.84e-08 3.95e-09 4.79e-08