logo

Genes within 1Mb (chr6:133126923:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 7.73e-02 0.219 0.123 0.132 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0764 0.131 0.132 B L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00453 0.0494 0.132 B L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0986 0.0927 0.132 B L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0901 0.0559 0.132 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.57e-01 0.088 0.118 0.132 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0442 0.0776 0.132 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 4.19e-02 -0.182 0.0891 0.132 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0932 0.132 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00476 0.081 0.132 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0665 0.0549 0.132 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.00e-01 0.143 0.111 0.132 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 4.64e-02 -0.176 0.0878 0.132 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.28e-01 -0.141 0.0921 0.132 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.70e-03 -0.321 0.106 0.132 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0187 0.0369 0.132 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.111 0.132 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 4.35e-01 0.107 0.136 0.133 DC L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.88e-01 -0.112 0.0845 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 6.92e-01 0.0417 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 3.53e-01 0.105 0.113 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.03e-02 -0.28 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0247 0.0681 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0598 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 23795 sc-eQTL 5.15e-01 -0.064 0.098 0.133 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0486 0.097 0.132 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0641 0.0648 0.132 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0711 0.111 0.132 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0471 0.0846 0.132 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0249 0.0507 0.132 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00748 0.1 0.132 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.53e-01 0.0964 0.104 0.133 NK L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0924 0.0958 0.133 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.52e-01 -0.137 0.119 0.133 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.82e-01 0.0433 0.0493 0.133 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 6.74e-02 0.225 0.122 0.132 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0504 0.097 0.132 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.02e-01 -0.192 0.117 0.132 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0415 0.0464 0.132 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.127 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 8.98e-03 0.372 0.141 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 5.04e-02 -0.256 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0195 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0348 0.131 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0695 0.07 0.133 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00522 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0873 0.117 0.133 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 5.77e-01 0.0773 0.139 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 3.33e-01 -0.118 0.121 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0864 0.0794 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.12 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0403 0.0734 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.16e-01 0.108 0.132 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 3.08e-02 0.242 0.111 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0391 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00757 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.09e-01 0.151 0.094 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0538 0.0595 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.69e-01 0.0901 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.116 0.131 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 5.57e-01 0.0763 0.13 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 4.50e-01 0.108 0.143 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 8.63e-01 0.0108 0.0624 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 5.16e-01 0.0787 0.121 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 1.46e-01 -0.1 0.0686 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.75e-01 0.0951 0.133 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 9.63e-01 0.00412 0.0882 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.84e-01 0.182 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 2.97e-01 0.14 0.133 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0354 0.0729 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 3.95e-01 -0.114 0.134 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 1.38e-01 -0.105 0.0705 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.24e-01 -0.164 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0356 0.0937 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 2.57e-01 -0.148 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0762 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0827 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.54e-01 -0.069 0.0603 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.99e-01 0.0825 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.27e-01 -0.101 0.103 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0616 0.101 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0934 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0555 0.0605 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.116 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0792 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.09e-01 0.139 0.11 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0437 0.0571 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 1.19e-01 0.206 0.132 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.58e-01 0.185 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.37e-01 -0.188 0.126 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0598 0.0517 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.54e-01 0.147 0.128 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 5.98e-01 0.061 0.116 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.69e-02 -0.292 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0577 0.0656 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.127 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.72e-02 -0.291 0.121 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.13e-01 0.0662 0.131 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.27e-01 -0.136 0.112 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 8.93e-01 0.00869 0.0646 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 8.11e-01 0.0344 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0608 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.64e-01 0.147 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 5.60e-02 -0.123 0.0638 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.18e-01 0.141 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.15e-01 -0.196 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.19e-02 -0.253 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 3.72e-01 -0.121 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.66e-01 -0.081 0.0726 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0247 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 2.85e-02 0.285 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0409 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 4.51e-01 0.0952 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 8.18e-02 -0.108 0.0617 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 2.16e-01 -0.161 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0433 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 7.79e-03 -0.342 0.127 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 6.80e-01 0.0298 0.0722 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.38e-01 0.167 0.112 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 1.93e-01 -0.134 0.103 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.128 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 1.93e-01 0.0666 0.051 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 9.57e-01 0.00732 0.137 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0631 0.124 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0136 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.01e-01 0.0751 0.0584 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0194 0.116 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 4.27e-01 -0.1 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.91e-01 0.0588 0.0684 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.115 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 5.82e-01 0.0442 0.08 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 6.24e-01 0.0737 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0986 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.23e-02 -0.333 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 8.77e-01 0.0186 0.12 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 2.52e-01 -0.147 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0394 0.0485 0.128 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 5.67e-02 -0.239 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0759 0.135 0.132 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 2.81e-01 -0.138 0.127 0.132 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.25e-01 0.165 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 6.19e-02 -0.0885 0.0471 0.132 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.134 0.132 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0353 0.11 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00486 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 5.42e-01 0.078 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 7.67e-02 -0.22 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 4.22e-01 0.0495 0.0615 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 8.02e-01 0.0307 0.122 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 23795 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0509 0.0974 0.132 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.97e-01 0.0923 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00333 0.0826 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0208 0.117 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0795 0.118 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0593 0.0941 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 7.89e-01 -0.014 0.0523 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0921 0.0898 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 2.41e-01 -0.132 0.112 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 1.41e-01 -0.179 0.121 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0374 0.0799 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 9.29e-01 0.00516 0.0575 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0144 0.107 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 9.69e-02 0.286 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 3.40e-01 -0.142 0.148 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0284 0.165 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0571 0.0625 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 8.21e-01 0.0368 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 5.54e-01 0.0752 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 3.90e-01 -0.104 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0941 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 5.73e-02 -0.229 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 9.74e-01 0.00394 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 3.17e-01 0.0536 0.0534 0.136 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.28e-01 0.128 0.13 0.136 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 4.44e-02 -0.268 0.132 0.136 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 4.45e-01 0.0691 0.0902 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.127 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.121 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00227 0.061 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0302 0.169 0.116 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 6.45e-02 -0.207 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 6.26e-01 0.0553 0.113 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 7.25e-01 0.0407 0.115 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0925 0.137 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 7.41e-01 0.0312 0.0945 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.01e-01 -0.145 0.139 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 23795 sc-eQTL 8.66e-01 0.0227 0.134 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00745 0.128 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0172 0.0726 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 3.39e-01 -0.11 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0385 0.0654 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 9.87e-02 0.198 0.119 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 4.33e-01 0.0999 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 725448 sc-eQTL 4.03e-01 0.117 0.14 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 8.37e-01 0.0119 0.0574 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00571 0.112 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 1.33e-01 -0.101 0.0671 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00355 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 995035 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0554 0.0808 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 9.13e-01 0.0109 0.0999 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0561 0.0694 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0593 0.113 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 2.80e-01 -0.128 0.118 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0564 0.078 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0141 0.0535 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0278 0.0953 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 3.28e-01 -0.123 0.126 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0832 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 392158 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0714 0.122 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 412868 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.121 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 1.40e-01 -0.168 0.114 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 8.49e-01 0.00925 0.0485 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 313584 sc-eQTL 3.77e-01 0.104 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -825247 sc-eQTL 1.78e-01 0.138 0.102 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 613725 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0961 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 363464 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0997 0.122 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 312354 sc-eQTL 2.17e-01 0.0615 0.0497 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 725448 eQTL 0.0216 0.102 0.0441 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 412868 pQTL 6.65e-05 -0.211 0.0528 0.0 0.0 0.119
ENSG00000112299 VNN1 412868 eQTL 0.00394 -0.0919 0.0318 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 412868 1.07e-06 9.07e-07 1.05e-07 3.89e-07 1.07e-07 2.63e-07 6.52e-07 1.59e-07 8.32e-07 2.8e-07 1.09e-06 5.22e-07 1.43e-06 2.1e-07 2.86e-07 2.1e-07 3.93e-07 4.16e-07 2.42e-07 1.89e-07 1.87e-07 4.11e-07 4e-07 1.94e-07 1.47e-06 2.55e-07 3.1e-07 3.18e-07 4.33e-07 7.39e-07 4.59e-07 5.99e-08 5.51e-08 1.9e-07 3.23e-07 6.85e-08 1.01e-07 7.66e-08 8.24e-08 8.36e-09 8.75e-08 9.76e-07 1.7e-08 1.21e-08 9.15e-08 1.88e-08 9.34e-08 2.75e-09 4.68e-08