logo

Genes within 1Mb (chr6:133125488:TTAA:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 7.73e-02 0.219 0.123 0.132 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0764 0.131 0.132 B L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00453 0.0494 0.132 B L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0986 0.0927 0.132 B L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0901 0.0559 0.132 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.57e-01 0.088 0.118 0.132 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0442 0.0776 0.132 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 4.19e-02 -0.182 0.0891 0.132 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0932 0.132 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00476 0.081 0.132 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0665 0.0549 0.132 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.00e-01 0.143 0.111 0.132 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 4.64e-02 -0.176 0.0878 0.132 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.28e-01 -0.141 0.0921 0.132 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.70e-03 -0.321 0.106 0.132 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0187 0.0369 0.132 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.111 0.132 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 4.35e-01 0.107 0.136 0.133 DC L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.88e-01 -0.112 0.0845 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 6.92e-01 0.0417 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 3.53e-01 0.105 0.113 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.03e-02 -0.28 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0247 0.0681 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0598 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 22360 sc-eQTL 5.15e-01 -0.064 0.098 0.133 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0486 0.097 0.132 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0641 0.0648 0.132 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0711 0.111 0.132 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0471 0.0846 0.132 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0249 0.0507 0.132 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00748 0.1 0.132 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.53e-01 0.0964 0.104 0.133 NK L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0924 0.0958 0.133 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.52e-01 -0.137 0.119 0.133 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.82e-01 0.0433 0.0493 0.133 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 6.74e-02 0.225 0.122 0.132 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0504 0.097 0.132 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.02e-01 -0.192 0.117 0.132 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0415 0.0464 0.132 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.127 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 8.98e-03 0.372 0.141 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 5.04e-02 -0.256 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0195 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0348 0.131 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0695 0.07 0.133 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00522 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0873 0.117 0.133 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 5.77e-01 0.0773 0.139 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 3.33e-01 -0.118 0.121 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0864 0.0794 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.12 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0403 0.0734 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.16e-01 0.108 0.132 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 3.08e-02 0.242 0.111 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0391 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00757 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.09e-01 0.151 0.094 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0538 0.0595 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.69e-01 0.0901 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.116 0.131 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 5.57e-01 0.0763 0.13 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 4.50e-01 0.108 0.143 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 8.63e-01 0.0108 0.0624 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 5.16e-01 0.0787 0.121 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 1.46e-01 -0.1 0.0686 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.75e-01 0.0951 0.133 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 9.63e-01 0.00412 0.0882 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.84e-01 0.182 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 2.97e-01 0.14 0.133 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0354 0.0729 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 3.95e-01 -0.114 0.134 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 1.38e-01 -0.105 0.0705 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.24e-01 -0.164 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0356 0.0937 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 2.57e-01 -0.148 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0762 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0827 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.54e-01 -0.069 0.0603 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.99e-01 0.0825 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.27e-01 -0.101 0.103 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0616 0.101 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0934 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0555 0.0605 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.116 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0792 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.09e-01 0.139 0.11 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0437 0.0571 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 1.19e-01 0.206 0.132 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.58e-01 0.185 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.37e-01 -0.188 0.126 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0598 0.0517 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.54e-01 0.147 0.128 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 5.98e-01 0.061 0.116 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.69e-02 -0.292 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0577 0.0656 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.127 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.72e-02 -0.291 0.121 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.13e-01 0.0662 0.131 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.27e-01 -0.136 0.112 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 8.93e-01 0.00869 0.0646 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 8.11e-01 0.0344 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0608 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.64e-01 0.147 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 5.60e-02 -0.123 0.0638 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.18e-01 0.141 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.15e-01 -0.196 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.19e-02 -0.253 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 3.72e-01 -0.121 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.66e-01 -0.081 0.0726 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0247 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 2.85e-02 0.285 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0409 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 4.51e-01 0.0952 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 8.18e-02 -0.108 0.0617 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 2.16e-01 -0.161 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0433 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 7.79e-03 -0.342 0.127 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 6.80e-01 0.0298 0.0722 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.38e-01 0.167 0.112 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 1.93e-01 -0.134 0.103 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.128 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 1.93e-01 0.0666 0.051 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 9.57e-01 0.00732 0.137 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0631 0.124 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0136 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.01e-01 0.0751 0.0584 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0194 0.116 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 4.27e-01 -0.1 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.91e-01 0.0588 0.0684 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.115 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 5.82e-01 0.0442 0.08 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 6.24e-01 0.0737 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0986 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.23e-02 -0.333 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 8.77e-01 0.0186 0.12 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 2.52e-01 -0.147 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0394 0.0485 0.128 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 5.67e-02 -0.239 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0759 0.135 0.132 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 2.81e-01 -0.138 0.127 0.132 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.25e-01 0.165 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 6.19e-02 -0.0885 0.0471 0.132 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.134 0.132 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0353 0.11 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00486 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 5.42e-01 0.078 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 7.67e-02 -0.22 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 4.22e-01 0.0495 0.0615 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 8.02e-01 0.0307 0.122 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 22360 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0509 0.0974 0.132 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.97e-01 0.0923 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00333 0.0826 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0208 0.117 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0795 0.118 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0593 0.0941 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 7.89e-01 -0.014 0.0523 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0921 0.0898 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 2.41e-01 -0.132 0.112 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 1.41e-01 -0.179 0.121 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0374 0.0799 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 9.29e-01 0.00516 0.0575 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0144 0.107 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 9.69e-02 0.286 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 3.40e-01 -0.142 0.148 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0284 0.165 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0571 0.0625 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 8.21e-01 0.0368 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 5.54e-01 0.0752 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 3.90e-01 -0.104 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0941 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 5.73e-02 -0.229 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 9.74e-01 0.00394 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 3.17e-01 0.0536 0.0534 0.136 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.28e-01 0.128 0.13 0.136 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 4.44e-02 -0.268 0.132 0.136 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 4.45e-01 0.0691 0.0902 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.127 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.121 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00227 0.061 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0302 0.169 0.116 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 6.45e-02 -0.207 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 6.26e-01 0.0553 0.113 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 7.25e-01 0.0407 0.115 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0925 0.137 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 7.41e-01 0.0312 0.0945 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.01e-01 -0.145 0.139 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 22360 sc-eQTL 8.66e-01 0.0227 0.134 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00745 0.128 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0172 0.0726 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 3.39e-01 -0.11 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0385 0.0654 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 9.87e-02 0.198 0.119 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 4.33e-01 0.0999 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 724013 sc-eQTL 4.03e-01 0.117 0.14 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 8.37e-01 0.0119 0.0574 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00571 0.112 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 1.33e-01 -0.101 0.0671 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00355 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 993600 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0554 0.0808 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 9.13e-01 0.0109 0.0999 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0561 0.0694 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0593 0.113 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 2.80e-01 -0.128 0.118 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0564 0.078 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0141 0.0535 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0278 0.0953 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 3.28e-01 -0.123 0.126 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0832 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 390723 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0714 0.122 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 411433 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.121 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 1.40e-01 -0.168 0.114 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 8.49e-01 0.00925 0.0485 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 312149 sc-eQTL 3.77e-01 0.104 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -826682 sc-eQTL 1.78e-01 0.138 0.102 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 612290 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0961 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 362029 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0997 0.122 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 310919 sc-eQTL 2.17e-01 0.0615 0.0497 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 724013 eQTL 0.0216 0.102 0.0441 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 411433 pQTL 6.65e-05 -0.211 0.0528 0.0 0.0 0.119
ENSG00000112299 VNN1 411433 eQTL 0.00394 -0.0919 0.0318 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 411433 5.59e-07 1.07e-06 1.45e-07 3.19e-07 9.16e-08 1.03e-07 5.82e-07 5.75e-08 4.3e-07 1.15e-07 6.39e-07 5.22e-07 6.98e-07 2.08e-07 5.97e-08 1.49e-07 5.27e-08 3.79e-07 7.09e-08 4.2e-08 1.52e-07 2.45e-07 4e-07 2.79e-08 7.72e-07 1.65e-07 1.39e-07 2.65e-07 2.19e-07 1.69e-07 4.32e-07 3.72e-08 3.3e-08 9.8e-08 1.27e-07 3.28e-08 4.67e-08 9.55e-08 7.47e-08 6.79e-08 3.34e-08 3.85e-07 4.83e-08 0.0 5.87e-08 1.37e-08 1.23e-07 4.33e-09 4.74e-08