logo

Genes within 1Mb (chr6:133122141:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0735 0.11 0.167 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0832 0.116 0.167 B L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.61e-01 0.0134 0.0439 0.167 B L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 2.37e-01 0.0975 0.0823 0.167 B L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0252 0.0499 0.167 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0132 0.105 0.167 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0968 0.0686 0.167 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 2.53e-01 0.0939 0.082 0.167 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 6.57e-01 0.038 0.0854 0.167 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 5.27e-01 0.0469 0.074 0.167 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.66e-01 0.0218 0.0503 0.167 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0451 0.102 0.167 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 2.86e-01 0.086 0.0804 0.167 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0734 0.084 0.167 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 2.07e-01 -0.124 0.0979 0.167 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 9.64e-01 0.00152 0.0336 0.167 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 1.97e-01 -0.131 0.101 0.167 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 2.83e-01 0.134 0.125 0.169 DC L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 9.08e-01 0.00896 0.0778 0.169 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 4.11e-02 0.196 0.0954 0.169 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0813 0.104 0.169 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.73e-01 0.047 0.111 0.169 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0645 0.0623 0.169 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.67e-01 0.0041 0.0988 0.169 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 19013 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0848 0.0897 0.169 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.63e-01 0.0508 0.0876 0.167 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.88e-01 0.0158 0.0587 0.167 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 9.83e-01 0.00212 0.101 0.167 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 3.23e-01 -0.107 0.108 0.167 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.17e-01 -0.12 0.076 0.167 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0261 0.0458 0.167 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.76e-01 0.0142 0.0907 0.167 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 4.37e-01 0.0727 0.0933 0.167 NK L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 1.41e-01 -0.127 0.086 0.167 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 2.41e-01 -0.126 0.107 0.167 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 3.23e-01 -0.044 0.0444 0.167 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 1.29e-01 -0.167 0.11 0.167 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.74e-01 0.0249 0.0867 0.167 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.69e-01 0.0942 0.105 0.167 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 9.32e-01 0.00358 0.0416 0.167 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 1.70e-01 -0.156 0.113 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 4.01e-01 -0.107 0.127 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 2.39e-01 0.137 0.116 0.171 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 6.35e-02 -0.202 0.108 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.06e-01 0.187 0.115 0.171 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 3.33e-01 0.0603 0.0621 0.171 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 3.04e-01 0.112 0.109 0.171 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0649 0.104 0.171 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0328 0.123 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 2.24e-01 0.131 0.108 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.94e-01 0.0185 0.0706 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 8.69e-01 0.0176 0.106 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.99e-01 0.0253 0.0651 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00755 0.117 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 2.66e-01 -0.111 0.0994 0.165 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 7.73e-02 -0.207 0.117 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0595 0.108 0.168 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 2.08e-01 0.107 0.0848 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0351 0.111 0.168 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0299 0.0536 0.168 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0272 0.112 0.168 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 1.91e-01 -0.136 0.104 0.168 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 9.83e-01 0.00236 0.112 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0215 0.0539 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 9.87e-01 0.00174 0.105 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 9.94e-01 0.000462 0.0597 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 2.51e-01 -0.132 0.115 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 7.70e-02 -0.135 0.0757 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0618 0.118 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 6.91e-01 0.0459 0.115 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.77e-02 -0.111 0.0624 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 7.57e-02 0.204 0.114 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 5.57e-01 0.0359 0.061 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 4.23e-01 0.0935 0.116 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0404 0.0807 0.167 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 2.90e-01 0.122 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.84e-01 0.0629 0.115 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0117 0.116 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.37e-01 0.0416 0.0535 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00346 0.108 0.166 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 6.78e-01 -0.039 0.0939 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 9.59e-01 0.00478 0.0921 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 5.12e-01 0.056 0.0852 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.32e-01 0.0435 0.0553 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0339 0.107 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 4.26e-02 0.205 0.1 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 1.60e-01 0.143 0.102 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.30e-01 -0.152 0.1 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 8.41e-01 0.0105 0.0522 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00557 0.121 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 1.92e-01 -0.152 0.116 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 1.76e-02 -0.276 0.115 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.71e-01 0.153 0.112 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 3.71e-01 0.0412 0.0459 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0254 0.114 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.11e-01 0.105 0.104 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 8.53e-01 0.018 0.097 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.20e-01 -0.171 0.11 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 5.47e-01 0.0356 0.0589 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 3.44e-01 -0.108 0.114 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 7.62e-01 0.033 0.109 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0672 0.116 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0903 0.0999 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0387 0.0573 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 7.00e-01 0.0444 0.115 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00748 0.124 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0777 0.115 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 2.61e-01 -0.128 0.114 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.07e-01 0.0461 0.0555 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.29e-01 0.0264 0.122 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.62e-01 0.102 0.111 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.86e-01 0.0664 0.122 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0495 0.121 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.42e-01 0.0215 0.0652 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 2.48e-01 -0.142 0.123 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.79e-01 -0.103 0.117 0.167 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 3.91e-01 0.0956 0.111 0.167 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 4.11e-01 0.0931 0.113 0.167 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0191 0.0557 0.167 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.117 0.167 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0359 0.124 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 2.80e-01 0.124 0.115 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.02e-01 0.121 0.117 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.70e-01 0.0191 0.0651 0.169 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 4.42e-01 0.0771 0.1 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 1.75e-01 -0.124 0.0913 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 5.11e-02 -0.223 0.114 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0313 0.0455 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.31e-01 -0.119 0.122 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 3.82e-02 -0.229 0.11 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0197 0.112 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0614 0.0522 0.174 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.08e-01 0.106 0.104 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0345 0.101 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.05e-01 -0.117 0.114 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0211 0.0618 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.71e-01 0.134 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 9.25e-02 -0.214 0.126 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.85e-01 0.0584 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 5.83e-01 0.0718 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0609 0.0738 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 9.56e-01 0.00768 0.139 0.156 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0604 0.0911 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.90e-01 0.0996 0.116 0.17 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.68e-01 0.0305 0.103 0.17 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 9.86e-01 0.0019 0.111 0.17 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.43e-01 0.0195 0.042 0.17 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 7.10e-01 0.0404 0.109 0.17 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.97e-01 0.101 0.119 0.167 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 9.58e-01 0.00597 0.112 0.167 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 5.60e-01 0.0551 0.0945 0.167 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0121 0.0418 0.167 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.81e-01 0.0177 0.118 0.167 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.13e-01 0.0829 0.126 0.171 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 2.82e-01 -0.107 0.0991 0.171 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 8.70e-02 0.168 0.0979 0.171 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 2.98e-01 -0.121 0.116 0.171 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.97e-01 0.0441 0.113 0.171 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0644 0.0556 0.171 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 2.22e-01 0.135 0.11 0.171 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 19013 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0454 0.0883 0.171 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.73e-01 0.0572 0.101 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 8.67e-01 -0.013 0.077 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 6.05e-01 0.0563 0.109 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 3.57e-01 -0.101 0.11 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.01e-01 -0.046 0.0878 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 8.58e-01 -0.00874 0.0488 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0328 0.0941 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 3.50e-01 -0.108 0.115 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0288 0.0832 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 7.33e-01 0.0355 0.104 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 9.37e-01 0.00899 0.113 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.49e-02 -0.136 0.0733 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0204 0.0532 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 2.86e-01 0.105 0.0983 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.48e-02 -0.281 0.145 0.17 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 4.81e-01 0.0892 0.126 0.17 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0543 0.14 0.17 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 1.09e-01 0.0852 0.0528 0.17 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0687 0.138 0.17 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0183 0.117 0.162 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 5.29e-01 0.0702 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00674 0.113 0.162 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 5.56e-01 0.0656 0.111 0.162 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 4.85e-02 0.222 0.112 0.162 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0164 0.0492 0.162 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.93e-02 -0.203 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 2.82e-01 0.128 0.118 0.17 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0192 0.0801 0.17 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 6.46e-01 0.052 0.113 0.17 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 3.65e-02 -0.234 0.111 0.17 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.15e-01 -0.109 0.108 0.17 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0256 0.0541 0.17 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0582 0.0956 0.17 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0547 0.14 0.175 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 2.75e-01 0.102 0.0929 0.175 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 4.74e-02 0.185 0.0927 0.175 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 3.77e-01 0.0844 0.0953 0.175 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0322 0.114 0.175 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0792 0.0781 0.175 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 1.34e-01 -0.174 0.115 0.175 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 19013 sc-eQTL 2.05e-01 -0.14 0.11 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0621 0.118 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 5.97e-01 0.0608 0.115 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 7.34e-01 0.0221 0.0652 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 9.34e-01 0.00861 0.103 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 8.59e-01 0.0104 0.0587 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.23e-01 0.0241 0.108 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0873 0.104 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 9.16e-01 -0.012 0.113 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 720666 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0881 0.124 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0394 0.0509 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.85e-01 0.131 0.0987 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 7.51e-01 0.0191 0.0599 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0257 0.113 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 990253 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0934 0.0715 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 9.74e-01 0.00298 0.0911 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 6.93e-01 0.025 0.0634 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 7.03e-01 0.0394 0.103 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0217 0.108 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0717 0.0711 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0366 0.0488 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 5.14e-01 0.0568 0.0868 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 5.99e-01 0.062 0.118 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0132 0.0777 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 387376 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0409 0.114 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 408086 sc-eQTL 3.96e-02 -0.232 0.112 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0545 0.107 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 6.76e-01 0.0189 0.0453 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 sc-eQTL 7.65e-02 -0.194 0.109 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -830029 sc-eQTL 1.74e-01 0.125 0.0919 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 608943 sc-eQTL 6.39e-02 -0.16 0.086 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 358682 sc-eQTL 1.23e-01 -0.169 0.109 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 307572 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0551 0.0446 0.168 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 408086 pQTL 0.0156 0.107 0.0443 0.0 0.0 0.192
ENSG00000112303 VNN2 358682 pQTL 0.0118 -0.0805 0.0319 0.0 0.0 0.192
ENSG00000112303 VNN2 358682 eQTL 0.0263 -0.0355 0.016 0.0 0.0 0.193
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 eQTL 8.8e-06 -0.122 0.0273 0.0 0.0 0.193
ENSG00000234484 AL032821.1 369466 eQTL 0.0368 0.0801 0.0383 0.0 0.0 0.193

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 720666 5.74e-07 2.88e-07 9.71e-08 2.53e-07 1.07e-07 1.25e-07 4.09e-07 9.69e-08 2.81e-07 1.65e-07 3.92e-07 2.28e-07 4.74e-07 9.15e-08 1.26e-07 1.96e-07 1.35e-07 3.3e-07 1.36e-07 8.11e-08 1.76e-07 2.86e-07 2.56e-07 9.01e-08 4.27e-07 2.4e-07 1.97e-07 1.88e-07 2.4e-07 2.19e-07 1.93e-07 5.54e-08 5.41e-08 1.21e-07 1.67e-07 6.23e-08 7.52e-08 5.71e-08 5.7e-08 5.12e-08 7.96e-08 2.74e-07 3.46e-08 1.08e-08 8.59e-08 8.24e-09 9.1e-08 0.0 5.54e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 308802 1.36e-06 1.39e-06 2.59e-07 1.23e-06 4.43e-07 6.36e-07 1.26e-06 4.75e-07 1.73e-06 7.2e-07 1.98e-06 1.13e-06 2.62e-06 3.61e-07 3.44e-07 1.15e-06 1.14e-06 1.27e-06 5.4e-07 7.99e-07 6.5e-07 1.96e-06 1.4e-06 8.52e-07 2.34e-06 1.13e-06 1.05e-06 1.07e-06 1.66e-06 1.3e-06 8.15e-07 2.7e-07 3.98e-07 7.63e-07 6.82e-07 6.03e-07 7.26e-07 3.65e-07 4.83e-07 3.33e-07 1.96e-07 2.05e-06 2.87e-07 1.31e-07 3.62e-07 2.3e-07 2.9e-07 1.41e-07 1.89e-07