Genes within 1Mb (chr6:133111410:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 7.73e-02 0.219 0.123 0.132 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0764 0.131 0.132 B L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00453 0.0494 0.132 B L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0986 0.0927 0.132 B L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 1.08e-01 -0.0901 0.0559 0.132 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.57e-01 0.088 0.118 0.132 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0442 0.0776 0.132 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 4.19e-02 -0.182 0.0891 0.132 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 2.09e-01 -0.117 0.0932 0.132 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00476 0.081 0.132 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0665 0.0549 0.132 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.00e-01 0.143 0.111 0.132 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 4.64e-02 -0.176 0.0878 0.132 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.28e-01 -0.141 0.0921 0.132 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.70e-03 -0.321 0.106 0.132 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0187 0.0369 0.132 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.14e-01 0.139 0.111 0.132 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 4.35e-01 0.107 0.136 0.133 DC L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.88e-01 -0.112 0.0845 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 6.92e-01 0.0417 0.105 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 3.53e-01 0.105 0.113 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.03e-02 -0.28 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0247 0.0681 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0598 0.108 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 8282 sc-eQTL 5.15e-01 -0.064 0.098 0.133 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0486 0.097 0.132 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0641 0.0648 0.132 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0711 0.111 0.132 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.132 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0471 0.0846 0.132 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0249 0.0507 0.132 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00748 0.1 0.132 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.53e-01 0.0964 0.104 0.133 NK L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0924 0.0958 0.133 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.52e-01 -0.137 0.119 0.133 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.82e-01 0.0433 0.0493 0.133 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 6.74e-02 0.225 0.122 0.132 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0504 0.097 0.132 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.02e-01 -0.192 0.117 0.132 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0415 0.0464 0.132 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.33e-01 -0.123 0.127 0.132 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 8.98e-03 0.372 0.141 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 5.04e-02 -0.256 0.13 0.133 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0195 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0348 0.131 0.133 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0695 0.07 0.133 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00522 0.123 0.133 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0873 0.117 0.133 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 5.77e-01 0.0773 0.139 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 3.33e-01 -0.118 0.121 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0864 0.0794 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.28e-01 -0.144 0.12 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0403 0.0734 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.16e-01 0.108 0.132 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 3.08e-02 0.242 0.111 0.133 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0391 0.131 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00757 0.121 0.131 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.09e-01 0.151 0.094 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.03e-01 -0.157 0.123 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0538 0.0595 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.69e-01 0.0901 0.124 0.131 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 2.65e-01 0.129 0.116 0.131 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 5.57e-01 0.0763 0.13 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 4.50e-01 0.108 0.143 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 8.63e-01 0.0108 0.0624 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 5.16e-01 0.0787 0.121 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 1.46e-01 -0.1 0.0686 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.75e-01 0.0951 0.133 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 9.63e-01 0.00412 0.0882 0.132 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.84e-01 0.182 0.137 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 2.97e-01 0.14 0.133 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0354 0.0729 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 3.95e-01 -0.114 0.134 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 1.38e-01 -0.105 0.0705 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.24e-01 -0.164 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0356 0.0937 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 2.57e-01 -0.148 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0762 0.13 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0827 0.131 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.54e-01 -0.069 0.0603 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.99e-01 0.0825 0.122 0.127 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.27e-01 -0.101 0.103 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0616 0.101 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0264 0.0934 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0555 0.0605 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.70e-01 0.105 0.116 0.132 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 2.84e-01 -0.119 0.111 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0792 0.112 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.09e-01 0.139 0.11 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0437 0.0571 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 1.19e-01 0.206 0.132 0.132 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.58e-01 0.185 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.61e-01 0.184 0.131 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.37e-01 -0.188 0.126 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.48e-01 -0.0598 0.0517 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.54e-01 0.147 0.128 0.132 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 5.98e-01 0.061 0.116 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.02e-01 -0.176 0.107 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.69e-02 -0.292 0.121 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0577 0.0656 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.12e-01 0.104 0.127 0.132 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.72e-02 -0.291 0.121 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.13e-01 0.0662 0.131 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.27e-01 -0.136 0.112 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 8.93e-01 0.00869 0.0646 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.33e-01 0.154 0.129 0.132 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 8.11e-01 0.0344 0.144 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0608 0.133 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.64e-01 0.147 0.132 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 5.60e-02 -0.123 0.0638 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.18e-01 0.141 0.141 0.125 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.15e-01 -0.196 0.124 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.19e-02 -0.253 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 3.72e-01 -0.121 0.135 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.66e-01 -0.081 0.0726 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0247 0.138 0.13 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 2.85e-02 0.285 0.129 0.132 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0409 0.124 0.132 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 4.51e-01 0.0952 0.126 0.132 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 8.18e-02 -0.108 0.0617 0.132 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 2.16e-01 -0.161 0.13 0.132 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.74e-01 0.122 0.137 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0433 0.128 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 7.79e-03 -0.342 0.127 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 6.80e-01 0.0298 0.0722 0.129 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.38e-01 0.167 0.112 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 1.93e-01 -0.134 0.103 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.33e-01 -0.154 0.128 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 1.93e-01 0.0666 0.051 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 9.57e-01 0.00732 0.137 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0631 0.124 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0136 0.126 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.01e-01 0.0751 0.0584 0.137 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0194 0.116 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0895 0.112 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 4.27e-01 -0.1 0.126 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.91e-01 0.0588 0.0684 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0137 0.162 0.13 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0798 0.138 0.13 PB L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 7.45e-01 0.0377 0.115 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0133 0.141 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 5.82e-01 0.0442 0.08 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 6.24e-01 0.0737 0.15 0.13 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 6.46e-01 0.0454 0.0986 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.23e-02 -0.333 0.132 0.128 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 8.77e-01 0.0186 0.12 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 2.52e-01 -0.147 0.128 0.128 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0394 0.0485 0.128 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 5.67e-02 -0.239 0.125 0.128 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0759 0.135 0.132 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 2.81e-01 -0.138 0.127 0.132 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.25e-01 0.165 0.107 0.132 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 6.19e-02 -0.0885 0.0471 0.132 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 4.54e-01 -0.101 0.134 0.132 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 9.40e-01 0.0105 0.14 0.132 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 7.48e-01 -0.0353 0.11 0.132 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00486 0.109 0.132 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 5.42e-01 0.078 0.128 0.132 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 7.67e-02 -0.22 0.124 0.132 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 4.22e-01 0.0495 0.0615 0.132 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 8.02e-01 0.0307 0.122 0.132 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 8282 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0509 0.0974 0.132 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.97e-01 0.0923 0.109 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00333 0.0826 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0208 0.117 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0795 0.118 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0593 0.0941 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 7.89e-01 -0.014 0.0523 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0319 0.101 0.132 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0921 0.0898 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 2.41e-01 -0.132 0.112 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 1.41e-01 -0.179 0.121 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0374 0.0799 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 9.29e-01 0.00516 0.0575 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0144 0.107 0.132 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 9.69e-02 0.286 0.171 0.127 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 3.40e-01 -0.142 0.148 0.127 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0284 0.165 0.127 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0571 0.0625 0.127 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 8.21e-01 0.0368 0.162 0.127 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 5.54e-01 0.0752 0.127 0.136 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 3.90e-01 -0.104 0.121 0.136 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0941 0.122 0.136 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 5.73e-02 -0.229 0.12 0.136 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 9.74e-01 0.00394 0.123 0.136 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 3.17e-01 0.0536 0.0534 0.136 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.28e-01 0.128 0.13 0.136 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 4.44e-02 -0.268 0.132 0.136 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 4.45e-01 0.0691 0.0902 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 9.15e-01 0.0137 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 8.97e-01 0.0164 0.127 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.121 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00227 0.061 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.107 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0302 0.169 0.116 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 6.45e-02 -0.207 0.111 0.116 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 6.26e-01 0.0553 0.113 0.116 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 7.25e-01 0.0407 0.115 0.116 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0925 0.137 0.116 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 7.41e-01 0.0312 0.0945 0.116 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.01e-01 -0.145 0.139 0.116 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 8282 sc-eQTL 8.66e-01 0.0227 0.134 0.116 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.95e-01 0.112 0.132 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00745 0.128 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0172 0.0726 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 3.39e-01 -0.11 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0385 0.0654 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 9.87e-02 0.198 0.119 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 1.23e-01 0.179 0.115 0.132 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 4.33e-01 0.0999 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 709935 sc-eQTL 4.03e-01 0.117 0.14 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 8.37e-01 0.0119 0.0574 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00571 0.112 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 1.33e-01 -0.101 0.0671 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00355 0.127 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 979522 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0554 0.0808 0.132 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 9.13e-01 0.0109 0.0999 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0561 0.0694 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0593 0.113 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 2.80e-01 -0.128 0.118 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0564 0.078 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0141 0.0535 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0278 0.0953 0.132 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 3.28e-01 -0.123 0.126 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0103 0.0832 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 376645 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0714 0.122 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 397355 sc-eQTL 8.89e-01 -0.017 0.121 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 1.40e-01 -0.168 0.114 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 8.49e-01 0.00925 0.0485 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 298071 sc-eQTL 3.77e-01 0.104 0.118 0.134 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -840760 sc-eQTL 1.78e-01 0.138 0.102 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 598212 sc-eQTL 2.10e-01 -0.121 0.0961 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 347951 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0997 0.122 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 296841 sc-eQTL 2.17e-01 0.0615 0.0497 0.131 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 709935 eQTL 0.0223 0.101 0.0443 0.0 0.0 0.124
ENSG00000112299 VNN1 397355 pQTL 5.48e-05 -0.214 0.053 0.0 0.0 0.119
ENSG00000112299 VNN1 397355 eQTL 0.00478 -0.0903 0.0319 0.0 0.0 0.124


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 397355 1.01e-06 6.65e-07 1.63e-07 4.27e-07 9.77e-08 2.95e-07 6.08e-07 2.03e-07 6.27e-07 3.1e-07 9e-07 5.01e-07 9.57e-07 1.54e-07 3.13e-07 3.35e-07 5.55e-07 4.27e-07 2.79e-07 2.15e-07 2.57e-07 5.11e-07 4.01e-07 2.6e-07 9.82e-07 2.49e-07 4.34e-07 3.51e-07 5.03e-07 7.09e-07 3.49e-07 4.25e-08 4.98e-08 1.67e-07 3.82e-07 1.82e-07 1.23e-07 1.18e-07 7.81e-08 2.24e-08 1.16e-07 6.19e-07 6.04e-08 5.64e-09 2.03e-07 3.92e-08 1.41e-07 7.35e-08 5.26e-08