logo

Genes within 1Mb (chr6:133104526:T:TA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 5.61e-01 0.0547 0.0941 0.235 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 4.62e-01 0.0731 0.0993 0.235 B L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 9.60e-01 0.00187 0.0375 0.235 B L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.26e-01 0.0561 0.0704 0.235 B L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 5.90e-01 0.023 0.0426 0.235 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0134 0.0897 0.235 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0665 0.0587 0.235 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.21e-01 0.0679 0.0682 0.235 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0286 0.0711 0.235 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 9.68e-01 0.00247 0.0616 0.235 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 5.57e-01 0.0246 0.0418 0.235 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 8.27e-01 0.0185 0.0847 0.235 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 8.92e-01 -0.00929 0.0682 0.235 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.32e-01 -0.069 0.071 0.235 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.99e-02 -0.192 0.082 0.235 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 3.35e-01 0.0274 0.0283 0.235 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 8.40e-01 0.0173 0.0858 0.235 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0135 0.104 0.236 DC L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 8.78e-01 -0.01 0.0649 0.236 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 3.93e-02 0.165 0.0796 0.236 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 8.62e-01 0.0151 0.0869 0.236 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0231 0.0929 0.236 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 7.17e-01 0.0189 0.0521 0.236 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0766 0.0823 0.236 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 1398 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0107 0.0751 0.236 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 2.03e-01 0.0938 0.0734 0.235 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.83e-01 -0.043 0.0492 0.235 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00357 0.0846 0.235 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 1.89e-02 -0.213 0.0898 0.235 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.53e-02 -0.128 0.0636 0.235 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0445 0.0384 0.235 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 9.67e-01 0.00316 0.0762 0.235 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 4.99e-01 0.0533 0.0785 0.236 NK L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 5.00e-02 -0.142 0.072 0.236 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 3.51e-02 -0.19 0.0895 0.236 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.00e-01 0.0479 0.0373 0.236 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 8.96e-01 0.012 0.0921 0.235 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 4.66e-01 0.0529 0.0724 0.235 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0348 0.0876 0.235 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.08e-01 0.0437 0.0346 0.235 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 2.34e-01 -0.113 0.0948 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.75e-02 0.194 0.109 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0219 0.101 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0721 0.0941 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.95e-01 0.13 0.0999 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00134 0.0538 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0174 0.0942 0.235 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0724 0.0896 0.235 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0317 0.102 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 4.21e-01 0.0721 0.0895 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 5.98e-01 0.031 0.0586 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0748 0.0882 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.32e-01 0.0647 0.0539 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 1.66e-01 0.135 0.097 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0449 0.0828 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 4.91e-03 -0.272 0.0956 0.235 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00803 0.0899 0.235 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.17e-01 0.0705 0.0703 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0634 0.0921 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 6.09e-01 0.0228 0.0444 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 1.33e-01 -0.139 0.0922 0.235 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0927 0.0862 0.235 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.10e-01 0.151 0.0943 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 8.64e-01 0.0179 0.104 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 8.59e-01 -0.00812 0.0456 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 2.67e-01 0.0983 0.0883 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 5.38e-01 0.0311 0.0504 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 2.93e-01 -0.102 0.0971 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0999 0.0641 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 2.66e-01 0.111 0.0999 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 7.85e-02 0.171 0.0969 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.75e-01 -0.058 0.0531 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.0973 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 9.15e-01 0.00552 0.0517 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00198 0.0987 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0247 0.0684 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00254 0.0973 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0821 0.0965 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0939 0.0973 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.40e-01 0.053 0.0449 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 5.75e-01 0.0509 0.0907 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 6.75e-01 0.0328 0.0782 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 5.20e-01 0.0494 0.0766 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 7.91e-01 0.0189 0.0711 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.74e-01 0.0505 0.046 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 6.41e-01 0.0414 0.0887 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 9.75e-02 0.138 0.0831 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0713 0.0841 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0552 0.083 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 6.08e-01 0.0221 0.043 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00219 0.0997 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00848 0.0978 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.38e-01 -0.115 0.0976 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 2.65e-01 0.105 0.0937 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 3.73e-01 0.0343 0.0385 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 7.58e-01 0.0296 0.0958 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.53e-01 0.123 0.0859 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0299 0.0807 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 6.35e-04 -0.309 0.0892 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 7.52e-01 0.0155 0.0491 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0653 0.095 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0561 0.0917 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 8.72e-01 0.0158 0.0977 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0679 0.0842 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.06e-01 0.0401 0.0482 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 7.58e-02 0.172 0.0962 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 2.58e-01 -0.119 0.105 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 7.29e-01 0.0338 0.0974 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0998 0.0964 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 8.40e-01 0.00952 0.0471 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.43e-01 0.0792 0.103 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0885 0.0936 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00644 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0588 0.102 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0103 0.0548 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 8.38e-01 0.0213 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0573 0.098 0.236 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.87e-01 0.0993 0.093 0.236 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.47e-01 0.137 0.0943 0.236 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 6.14e-01 0.0235 0.0466 0.236 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 2.16e-01 -0.121 0.0974 0.236 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0149 0.105 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 6.22e-01 -0.048 0.0972 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 8.25e-01 0.0219 0.0987 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 6.88e-01 0.0221 0.055 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.22e-01 0.13 0.0837 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 1.16e-01 -0.121 0.0766 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 6.28e-03 -0.261 0.0947 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 1.48e-01 0.0552 0.0381 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.26e-01 -0.101 0.103 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.29e-01 -0.113 0.0934 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0293 0.0949 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 1.98e-01 0.0568 0.044 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.91e-01 0.0235 0.0884 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0669 0.0855 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 6.96e-02 -0.174 0.0955 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 1.84e-01 0.0693 0.052 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.98e-01 0.166 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 1.42e-01 -0.162 0.109 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.24e-01 0.112 0.0916 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.23e-01 0.0903 0.112 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.50e-01 0.0483 0.0638 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 3.90e-01 -0.103 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00469 0.0788 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 8.57e-01 0.0178 0.0987 0.233 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 7.64e-01 0.0265 0.0881 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.40e-01 -0.139 0.094 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 1.73e-01 0.0487 0.0356 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0375 0.0925 0.233 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0326 0.1 0.235 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 8.80e-01 0.0142 0.0945 0.235 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 7.42e-01 0.0262 0.0795 0.235 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0211 0.0352 0.235 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0838 0.0992 0.235 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 6.16e-01 0.0535 0.107 0.244 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00733 0.0837 0.244 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 7.16e-02 0.149 0.0824 0.244 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0366 0.0977 0.244 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0538 0.0951 0.244 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.64e-01 0.0344 0.0469 0.244 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.03e-01 0.0778 0.0929 0.244 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 1398 sc-eQTL 8.65e-01 0.0127 0.0744 0.244 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.37e-01 0.123 0.0825 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0784 0.0627 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 6.97e-01 0.0346 0.0889 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 2.02e-01 -0.114 0.0894 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0952 0.0715 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0314 0.0398 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 7.56e-01 -0.024 0.0769 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.02e-01 -0.036 0.0941 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0645 0.0678 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 9.99e-01 0.000124 0.0849 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 1.63e-02 -0.22 0.0909 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 2.87e-02 -0.132 0.0597 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0294 0.0434 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.25e-01 0.0642 0.0804 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00723 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.81e-01 -0.118 0.109 0.224 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0524 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.12e-01 0.0574 0.0458 0.224 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0603 0.119 0.224 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 5.71e-02 0.178 0.0932 0.236 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 7.35e-01 0.0304 0.0897 0.236 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0538 0.0905 0.236 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 6.49e-02 -0.165 0.0888 0.236 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 2.56e-01 0.103 0.0908 0.236 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 4.14e-01 0.0324 0.0396 0.236 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 3.04e-01 -0.0991 0.0962 0.236 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00305 0.1 0.24 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00272 0.0676 0.24 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 2.13e-01 0.119 0.0951 0.24 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 4.09e-02 -0.193 0.0938 0.24 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 7.09e-02 -0.164 0.0904 0.24 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0117 0.0457 0.24 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0334 0.0807 0.24 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.33e-01 -0.112 0.116 0.243 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 8.11e-01 0.0185 0.0774 0.243 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 1.40e-01 0.115 0.0774 0.243 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 9.86e-01 0.00144 0.0793 0.243 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0734 0.0942 0.243 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 8.21e-01 0.0148 0.065 0.243 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.13e-02 -0.195 0.095 0.243 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 1398 sc-eQTL 7.84e-01 0.0252 0.0921 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 2.10e-01 -0.122 0.0973 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 6.78e-01 0.0394 0.0949 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 6.13e-01 0.0272 0.0537 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0449 0.085 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 1.79e-01 0.0651 0.0483 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 3.62e-01 0.0811 0.0888 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0786 0.0856 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 7.89e-02 0.166 0.0942 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 703051 sc-eQTL 2.62e-01 0.117 0.104 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0309 0.0427 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.16e-01 0.13 0.0826 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 5.26e-01 0.0319 0.0502 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0697 0.0947 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 972638 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0788 0.06 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.17e-01 0.0756 0.0754 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0561 0.0525 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 8.61e-01 0.015 0.0857 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 9.82e-02 -0.148 0.0888 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0968 0.0587 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0469 0.0404 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 6.81e-01 0.0297 0.0721 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 3.11e-01 0.0984 0.0968 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0271 0.064 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 369761 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0233 0.0941 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 390471 sc-eQTL 1.79e-02 -0.22 0.0921 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 4.26e-02 -0.178 0.0871 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 3.58e-01 0.0343 0.0373 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 sc-eQTL 1.59e-01 -0.128 0.0902 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -847644 sc-eQTL 1.84e-01 0.103 0.0773 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 591328 sc-eQTL 3.19e-02 -0.156 0.0721 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 341067 sc-eQTL 1.85e-02 -0.216 0.0911 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 289957 sc-eQTL 2.05e-01 0.0477 0.0375 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 390471 pQTL 0.00443 -0.116 0.0406 0.0 0.0 0.241
ENSG00000112303 VNN2 341067 pQTL 0.0402 -0.0601 0.0293 0.0 0.0 0.241
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 eQTL 5e-06 -0.116 0.0253 0.0 0.0 0.243
ENSG00000234484 AL032821.1 351851 eQTL 0.0129 0.0887 0.0356 0.0 0.0 0.243

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 291187 6.7e-06 5.08e-06 6.5e-07 3.15e-06 4.41e-07 8.3e-07 5.66e-06 4.25e-07 3.65e-06 1.04e-06 4.16e-06 1.86e-06 7.74e-06 2.31e-06 1.35e-06 2.43e-06 1.99e-06 3.95e-06 1.33e-06 1.37e-06 2.55e-06 3.94e-06 4.46e-06 1.05e-06 5.46e-06 1.24e-06 1.39e-06 1.84e-06 4.26e-06 3.32e-06 2.83e-06 3.05e-07 5.05e-07 1.28e-06 1.91e-06 8.85e-07 8.3e-07 3.15e-07 4.83e-07 2.94e-07 2.72e-07 1e-05 4.9e-07 3.36e-08 1.74e-07 3.6e-07 3.93e-07 5.79e-08 8.38e-08