Genes within 1Mb (chr6:133100353:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0415 0.109 0.16 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 8.16e-01 0.027 0.115 0.16 B L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0158 0.0436 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.43e-02 0.157 0.0812 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.47e-01 0.0466 0.0494 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 8.76e-01 0.0163 0.104 0.16 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0295 0.0684 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 9.02e-02 0.136 0.0797 0.16 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0735 0.0833 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 4.66e-01 0.0527 0.0721 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.09e-01 0.05 0.049 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.87e-01 0.00161 0.0994 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.49e-01 0.06 0.0792 0.16 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0776 0.0826 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0308 0.0966 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 2.85e-01 0.0353 0.0329 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0166 0.0998 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.86e-01 -0.132 0.123 0.162 DC L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 6.03e-01 0.0399 0.0766 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 5.03e-02 0.185 0.0941 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0798 0.102 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 2.45e-01 0.128 0.109 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 9.12e-01 0.0068 0.0615 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0878 0.0972 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -2775 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00989 0.0886 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.44e-01 0.0999 0.0856 0.16 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0219 0.0574 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0456 0.0985 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 5.01e-02 -0.207 0.105 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.72e-01 -0.102 0.0745 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0458 0.0447 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.93e-01 0.0233 0.0887 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.34e-01 0.0716 0.0915 0.161 NK L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.79e-02 -0.199 0.0836 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.10e-01 -0.168 0.105 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 8.27e-01 -0.00953 0.0436 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0936 0.107 0.16 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.49e-01 0.0792 0.0844 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.75e-01 0.139 0.102 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.32e-01 0.0393 0.0404 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 1.92e-01 -0.145 0.111 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0475 0.126 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 2.96e-01 0.12 0.115 0.158 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0957 0.108 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.63e-01 0.16 0.114 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 4.74e-01 0.0441 0.0614 0.158 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.62e-01 0.00512 0.108 0.158 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0608 0.103 0.158 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 7.06e-01 0.0452 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 2.51e-01 0.12 0.105 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 9.53e-01 0.00402 0.0686 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 8.94e-01 0.0138 0.103 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.94e-01 0.0249 0.0633 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 4.65e-01 0.0834 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 1.14e-01 -0.153 0.0963 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.78e-02 -0.224 0.113 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 9.98e-01 0.00032 0.105 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 6.77e-01 0.0344 0.0823 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0167 0.108 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.58e-01 0.023 0.0519 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 5.72e-02 -0.205 0.107 0.159 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 7.29e-02 -0.181 0.1 0.159 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.85e-01 0.0778 0.111 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 2.67e-01 -0.136 0.122 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0379 0.0534 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 2.10e-01 0.13 0.103 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.68e-01 0.0532 0.059 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 5.34e-01 -0.071 0.114 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0616 0.0755 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0183 0.117 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 2.55e-01 0.13 0.114 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0859 0.062 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 8.94e-02 0.194 0.114 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 4.18e-01 0.0491 0.0604 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 3.03e-01 0.119 0.115 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0475 0.08 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 9.14e-01 0.0123 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0734 0.113 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0793 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 1.69e-01 0.0722 0.0523 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.49e-01 -0.0068 0.106 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 6.40e-01 0.0431 0.0918 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0206 0.09 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 3.94e-01 0.0712 0.0833 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 2.10e-01 0.0678 0.0539 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.79e-01 0.0293 0.104 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.58e-02 0.206 0.0975 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 2.81e-01 -0.107 0.0989 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 3.05e-01 -0.1 0.0975 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.50e-01 0.023 0.0506 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.44e-01 0.0384 0.117 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.71e-01 -0.125 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.24e-01 -0.174 0.113 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 3.70e-02 0.226 0.108 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 2.48e-01 0.0515 0.0445 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0314 0.111 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.06e-01 0.127 0.1 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 9.81e-01 0.00226 0.0939 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.18e-01 -0.167 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.59e-01 0.0252 0.0571 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0929 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.79e-01 0.0755 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0726 0.114 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0301 0.0981 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.59e-01 0.0248 0.0562 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 8.92e-02 0.191 0.112 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 6.70e-02 -0.221 0.12 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 6.67e-01 0.0483 0.112 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.85e-02 -0.202 0.11 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.04e-01 0.0282 0.0543 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 8.19e-01 0.0273 0.119 0.157 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 6.58e-01 0.0479 0.108 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.30e-01 0.115 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 9.37e-01 0.00926 0.117 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 7.52e-01 -0.02 0.0631 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 6.20e-01 0.0591 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0964 0.114 0.16 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 2.41e-01 0.127 0.108 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.27e-02 0.213 0.109 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.60e-01 0.0496 0.054 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 2.63e-01 -0.127 0.113 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 8.93e-01 0.0164 0.121 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 8.16e-01 0.0263 0.113 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 7.71e-02 0.202 0.113 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.81e-01 0.0262 0.0637 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.63e-01 0.0892 0.0977 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.92e-02 -0.209 0.0885 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 2.97e-02 -0.243 0.111 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00502 0.0445 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 1.88e-01 -0.158 0.119 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 5.12e-02 -0.212 0.108 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0438 0.11 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0252 0.0514 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 5.31e-01 0.0644 0.103 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0817 0.0993 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.98e-01 -0.144 0.111 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 4.21e-01 0.0489 0.0606 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 1.05e-01 0.247 0.151 0.144 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 6.59e-02 -0.238 0.128 0.144 PB L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 4.88e-01 0.0756 0.108 0.144 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 3.27e-01 0.13 0.132 0.144 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 9.85e-01 0.00138 0.0754 0.144 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0486 0.141 0.144 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0867 0.0925 0.144 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.02e-01 0.119 0.115 0.163 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 5.67e-01 0.0588 0.103 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0442 0.11 0.163 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 1.60e-01 0.0585 0.0415 0.163 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0373 0.108 0.163 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 5.19e-01 0.0748 0.116 0.16 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0521 0.109 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.56e-01 -0.041 0.0919 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 8.78e-01 0.00625 0.0407 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 6.77e-01 -0.048 0.115 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0913 0.123 0.168 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0257 0.0966 0.168 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 6.13e-02 0.179 0.095 0.168 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.92e-01 0.059 0.11 0.168 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 7.23e-01 0.0193 0.0542 0.168 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.26e-01 0.00994 0.107 0.168 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -2775 sc-eQTL 2.37e-01 0.102 0.0856 0.168 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.80e-01 0.106 0.0978 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0789 0.0742 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 8.81e-01 0.0158 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 2.53e-01 -0.121 0.106 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0243 0.0849 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0469 0.047 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.00e-01 0.0115 0.0909 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0563 0.111 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 8.99e-01 0.0102 0.0801 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0407 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 1.99e-01 -0.139 0.108 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 2.99e-01 -0.074 0.071 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0269 0.0512 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 2.34e-01 0.113 0.0946 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.27e-01 -0.182 0.15 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0432 0.13 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00288 0.144 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 1.45e-01 0.0796 0.0543 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0986 0.141 0.158 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.53e-01 0.0843 0.112 0.158 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 9.55e-01 0.00609 0.107 0.158 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0329 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0347 0.107 0.158 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.90e-02 0.205 0.108 0.158 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 5.48e-01 0.0285 0.0473 0.158 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 6.71e-02 -0.21 0.114 0.158 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.40e-01 -0.076 0.0794 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 2.01e-01 0.144 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 1.10e-02 -0.282 0.11 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.89e-02 -0.195 0.106 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 9.23e-01 0.00519 0.0538 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0895 0.0948 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 1.78e-01 -0.184 0.136 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 2.03e-01 0.116 0.0906 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 3.27e-01 0.0898 0.0914 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 9.49e-01 0.00595 0.0933 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 9.43e-01 0.00545 0.0765 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 2.26e-01 -0.137 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -2775 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0772 0.108 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0911 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 6.85e-01 0.0453 0.112 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00553 0.0632 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 4.61e-01 0.0738 0.0999 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.56e-01 0.0526 0.0569 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00363 0.105 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 2.25e-01 -0.122 0.101 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 5.82e-01 0.0614 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 698878 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0144 0.122 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0675 0.05 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 3.66e-02 0.203 0.0964 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.37e-01 0.0566 0.0588 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 8.72e-01 0.0179 0.111 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 968465 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0423 0.0706 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 5.63e-01 0.0514 0.0888 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00747 0.0618 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0278 0.101 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 2.95e-01 -0.11 0.105 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0469 0.0694 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 1.30e-01 -0.072 0.0474 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 3.81e-01 0.0743 0.0846 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 2.05e-01 0.146 0.115 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0756 0.0759 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 365588 sc-eQTL 8.23e-01 0.0251 0.112 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 386298 sc-eQTL 1.05e-02 -0.282 0.109 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 1.86e-01 -0.138 0.104 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 3.01e-01 0.0459 0.0442 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 sc-eQTL 4.96e-02 -0.211 0.107 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -851817 sc-eQTL 3.38e-01 0.0866 0.0902 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 587155 sc-eQTL 1.15e-02 -0.213 0.0837 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 336894 sc-eQTL 5.12e-02 -0.209 0.107 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 285784 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0148 0.0439 0.162 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 698878 eQTL 0.0277 -0.0837 0.038 0.0 0.0 0.173
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 eQTL 1.83e-06 -0.134 0.0279 0.0 0.0 0.173


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 287014 1.24e-06 1.08e-06 3.03e-07 1.14e-06 1.19e-07 4.49e-07 1.64e-06 3.25e-07 1.42e-06 3.99e-07 1.52e-06 5.86e-07 2.53e-06 3e-07 5.51e-07 7.3e-07 7.97e-07 5.76e-07 5.88e-07 6.8e-07 2.86e-07 1.11e-06 8.84e-07 6.02e-07 2.16e-06 3.75e-07 7.73e-07 5.67e-07 1.28e-06 1.19e-06 7.05e-07 3.8e-08 1.73e-07 5.82e-07 5.28e-07 2.54e-07 4.74e-07 1.42e-07 3.76e-07 1.67e-07 1.85e-07 1.58e-06 5.29e-08 1.06e-07 1.81e-07 7.5e-08 1.46e-07 5.66e-08 6.14e-08