logo

Genes within 1Mb (chr6:133097634:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 5.85e-01 0.052 0.0952 0.237 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 2.52e-01 0.115 0.1 0.237 B L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 9.66e-01 0.00161 0.0379 0.237 B L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.86e-01 0.0619 0.0712 0.237 B L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 6.21e-01 0.0213 0.0431 0.237 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00454 0.0907 0.237 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 3.74e-01 -0.053 0.0594 0.237 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 2.72e-01 0.0761 0.0691 0.237 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0394 0.072 0.237 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 9.21e-01 0.00619 0.0624 0.237 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 4.96e-01 0.0289 0.0424 0.237 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 8.50e-01 0.0163 0.0858 0.237 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0101 0.0691 0.237 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0764 0.072 0.237 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.29e-02 -0.179 0.0834 0.237 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.11e-01 0.0292 0.0287 0.237 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.02e-01 0.0333 0.087 0.237 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0232 0.106 0.239 DC L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.15e-01 -0.024 0.0656 0.239 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 3.12e-02 0.175 0.0805 0.239 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 8.53e-01 0.0163 0.0879 0.239 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00629 0.094 0.239 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 9.12e-01 0.00585 0.0527 0.239 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0738 0.0833 0.239 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -5494 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00734 0.0759 0.239 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 3.79e-01 0.0656 0.0744 0.237 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0497 0.0498 0.237 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 9.03e-01 0.0105 0.0856 0.237 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 1.61e-02 -0.22 0.0909 0.237 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.54e-02 -0.115 0.0645 0.237 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0553 0.0388 0.237 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.01e-01 0.0296 0.0771 0.237 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 4.96e-01 0.0544 0.0797 0.238 NK L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 4.76e-02 -0.146 0.0731 0.238 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 5.56e-02 -0.175 0.091 0.238 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.09e-01 0.0477 0.0378 0.238 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.40e-01 0.0188 0.0932 0.237 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.83e-01 0.0787 0.0731 0.237 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 8.59e-01 0.0158 0.0887 0.237 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.72e-01 0.0386 0.0351 0.237 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 1.92e-01 -0.125 0.0959 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.34e-01 0.168 0.111 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 9.44e-01 0.00724 0.102 0.237 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0781 0.0958 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 2.84e-01 0.11 0.102 0.237 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 8.43e-01 0.0108 0.0547 0.237 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0274 0.0959 0.237 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0559 0.0913 0.237 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 9.78e-01 0.0029 0.103 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 3.76e-01 0.0804 0.0905 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 6.01e-01 0.0311 0.0593 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0683 0.0893 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.02e-01 0.0565 0.0546 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 1.60e-01 0.138 0.0982 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0298 0.0838 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 4.36e-03 -0.279 0.0966 0.237 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 8.27e-01 0.0199 0.0909 0.237 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.67e-01 0.0644 0.0712 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0518 0.0932 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 6.48e-01 0.0205 0.0449 0.237 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.40e-02 -0.167 0.0931 0.237 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0979 0.0871 0.237 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.16e-01 0.151 0.0958 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 6.38e-01 0.0498 0.106 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0087 0.0463 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.02e-01 0.0928 0.0897 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.97e-01 0.0434 0.0511 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0858 0.0987 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0785 0.0652 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 2.71e-01 0.112 0.101 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 2.01e-02 0.228 0.0975 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0679 0.0536 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 1.53e-01 0.141 0.0983 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 7.96e-01 0.0136 0.0523 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 9.57e-01 0.00536 0.0998 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0304 0.0692 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0216 0.0985 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0754 0.0977 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0886 0.0985 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.74e-01 0.0499 0.0455 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.18e-01 0.0332 0.0919 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 5.76e-01 0.0443 0.0792 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.28e-01 0.0271 0.0777 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.25e-01 0.0254 0.072 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.21e-01 0.0463 0.0466 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 5.47e-01 0.0542 0.0898 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.58e-02 0.145 0.0841 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0844 0.085 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0512 0.0839 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 5.57e-01 0.0256 0.0435 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 9.86e-01 0.00178 0.101 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0168 0.099 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.92e-01 -0.104 0.0988 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 2.23e-01 0.116 0.0948 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.88e-01 0.0337 0.0389 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 8.92e-01 0.0132 0.0969 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.32e-01 0.132 0.0869 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0284 0.0817 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 1.14e-03 -0.299 0.0905 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 7.45e-01 0.0162 0.0497 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0538 0.0962 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0707 0.0926 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00337 0.0988 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0843 0.0851 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 4.60e-01 0.0361 0.0488 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 4.56e-02 0.195 0.097 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.71e-01 -0.146 0.106 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.81e-01 0.0274 0.0987 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0988 0.0977 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 9.41e-01 0.00351 0.0477 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 2.79e-01 0.113 0.104 0.231 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0839 0.0951 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.54e-01 0.0326 0.104 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0834 0.103 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 7.20e-01 -0.02 0.0556 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 8.84e-01 0.0154 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0395 0.0995 0.238 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.51e-01 0.108 0.0942 0.238 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.14e-02 0.173 0.0954 0.238 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 7.63e-01 0.0143 0.0473 0.238 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 1.49e-01 -0.143 0.0986 0.238 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0206 0.106 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0295 0.0984 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 6.71e-01 0.0424 0.0999 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 6.83e-01 0.0227 0.0557 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.02e-01 0.139 0.0847 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 1.08e-01 -0.125 0.0776 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 1.19e-02 -0.244 0.0961 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 1.43e-01 0.0567 0.0385 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 3.34e-01 -0.101 0.104 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.53e-01 -0.108 0.0946 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0397 0.0961 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.11e-01 0.056 0.0446 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 9.46e-01 0.00613 0.0896 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0746 0.0866 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.47e-02 -0.173 0.0969 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 1.58e-01 0.0747 0.0527 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 2.05e-01 0.164 0.128 0.23 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 1.35e-01 -0.165 0.109 0.23 PB L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.98e-01 0.0958 0.0917 0.23 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.56e-01 0.104 0.112 0.23 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 7.79e-01 0.018 0.0639 0.23 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 3.92e-01 -0.103 0.119 0.23 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00682 0.0788 0.23 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 9.11e-01 0.0112 0.0999 0.235 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 5.76e-01 0.05 0.0891 0.235 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 2.33e-01 -0.114 0.0953 0.235 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.57e-01 0.041 0.0361 0.235 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0539 0.0936 0.235 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0166 0.102 0.237 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0118 0.0958 0.237 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 8.53e-01 0.0149 0.0806 0.237 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0225 0.0356 0.237 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 2.97e-01 -0.105 0.1 0.237 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 7.12e-01 0.04 0.108 0.246 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0429 0.0848 0.246 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 5.78e-02 0.159 0.0835 0.246 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0488 0.099 0.246 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0394 0.0965 0.246 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 6.51e-01 0.0216 0.0476 0.246 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 5.05e-01 0.0631 0.0943 0.246 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -5494 sc-eQTL 6.50e-01 0.0343 0.0754 0.246 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 2.46e-01 0.0976 0.0839 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0966 0.0635 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 5.31e-01 0.0566 0.0902 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 1.73e-01 -0.124 0.0907 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0786 0.0726 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0441 0.0403 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 9.32e-01 0.00662 0.078 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0563 0.0953 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0743 0.0687 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 9.73e-01 0.00287 0.086 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 2.29e-02 -0.212 0.0923 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.16e-02 -0.11 0.0607 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0371 0.044 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 3.44e-01 0.0771 0.0814 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0233 0.129 0.224 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0947 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00237 0.123 0.224 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 1.50e-01 0.0673 0.0466 0.224 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0443 0.121 0.224 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.74e-02 0.163 0.0948 0.238 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.43e-01 0.03 0.0912 0.238 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0595 0.092 0.238 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 7.38e-02 -0.162 0.0903 0.238 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 3.04e-01 0.0951 0.0923 0.238 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 4.73e-01 0.0289 0.0402 0.238 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 4.15e-01 -0.08 0.0979 0.238 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00994 0.101 0.242 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 9.74e-01 0.00221 0.0685 0.242 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 1.06e-01 0.156 0.096 0.242 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 2.89e-02 -0.209 0.0948 0.242 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 7.92e-02 -0.162 0.0915 0.242 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0186 0.0462 0.242 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0373 0.0817 0.242 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 3.33e-01 -0.115 0.119 0.246 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 8.08e-01 0.0193 0.0792 0.246 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 1.33e-01 0.12 0.0791 0.246 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 6.06e-01 0.0419 0.0811 0.246 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0585 0.0965 0.246 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 9.79e-01 0.00175 0.0665 0.246 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 6.59e-02 -0.18 0.0974 0.246 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -5494 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00393 0.0942 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 2.33e-01 -0.118 0.0985 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 5.11e-01 0.0631 0.0959 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 6.90e-01 0.0217 0.0544 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 6.01e-01 -0.045 0.086 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.27e-01 0.0592 0.0488 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 4.33e-01 0.0705 0.0898 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0875 0.0866 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 8.68e-02 0.165 0.0957 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 696159 sc-eQTL 1.03e-01 0.172 0.105 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0337 0.0433 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 1.19e-01 0.131 0.0838 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 3.98e-01 0.0431 0.0509 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0546 0.0961 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 965746 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0641 0.061 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 5.39e-01 0.0471 0.0766 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0673 0.0531 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 7.53e-01 0.0274 0.0868 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 9.53e-02 -0.151 0.09 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 1.57e-01 -0.0847 0.0596 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0575 0.0409 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 4.20e-01 0.0589 0.073 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 3.81e-01 0.0862 0.0982 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0201 0.0649 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 362869 sc-eQTL 9.76e-01 0.00289 0.0955 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 383579 sc-eQTL 1.39e-02 -0.231 0.0933 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 4.26e-02 -0.18 0.0884 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 4.76e-01 0.027 0.0378 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 sc-eQTL 2.01e-01 -0.118 0.0916 0.239 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -854536 sc-eQTL 1.96e-01 0.102 0.0784 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 584436 sc-eQTL 3.00e-02 -0.16 0.0731 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 334175 sc-eQTL 2.94e-02 -0.203 0.0925 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 283065 sc-eQTL 2.04e-01 0.0485 0.038 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 383579 pQTL 0.00454 -0.115 0.0406 0.0 0.0 0.241
ENSG00000112303 VNN2 334175 pQTL 0.043 -0.0593 0.0293 0.0 0.0 0.241
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 eQTL 7.01e-06 -0.114 0.0253 0.0 0.0 0.243
ENSG00000234484 AL032821.1 344959 eQTL 0.0135 0.0881 0.0356 0.0 0.0 0.243

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 284295 1.29e-06 2.57e-06 2.18e-07 1.84e-06 3.92e-07 6.47e-07 1.25e-06 4.04e-07 1.77e-06 7.2e-07 2.05e-06 1.41e-06 2.67e-06 1.19e-06 8.99e-07 1.01e-06 9.01e-07 1.13e-06 5.56e-07 6.44e-07 7.96e-07 1.97e-06 1.12e-06 9.78e-07 2.41e-06 6.01e-07 1.02e-06 1.08e-06 1.64e-06 1.66e-06 8.55e-07 2.24e-07 1.88e-07 1.22e-06 6.64e-07 7.09e-07 6.89e-07 1.25e-07 5.15e-07 3.11e-07 1.16e-07 1.71e-06 3.5e-07 6.46e-08 1.74e-07 3.28e-07 2.29e-07 5.92e-08 6.51e-08