logo

Genes within 1Mb (chr6:133091689:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 5.84e-01 0.0522 0.0953 0.235 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 3.07e-01 0.103 0.1 0.235 B L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 9.32e-01 0.00326 0.038 0.235 B L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.21e-01 0.0575 0.0713 0.235 B L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 6.27e-01 0.021 0.0431 0.235 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0108 0.0908 0.235 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 3.65e-01 -0.054 0.0595 0.235 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 2.23e-01 0.0846 0.0691 0.235 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0357 0.0721 0.235 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00247 0.0625 0.235 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.78e-01 0.0302 0.0424 0.235 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 8.67e-01 0.0144 0.0859 0.235 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00384 0.0691 0.235 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0801 0.0719 0.235 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.49e-02 -0.168 0.0834 0.235 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 3.36e-01 0.0277 0.0287 0.235 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 6.91e-01 0.0347 0.087 0.235 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0241 0.105 0.236 DC L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0204 0.0655 0.236 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 2.50e-02 0.181 0.0802 0.236 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 8.56e-01 0.0159 0.0876 0.236 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0139 0.0938 0.236 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 8.20e-01 0.012 0.0526 0.236 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.87e-01 -0.072 0.083 0.236 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -11439 sc-eQTL 8.43e-01 -0.015 0.0757 0.236 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 4.76e-01 0.053 0.0743 0.235 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0467 0.0496 0.235 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 8.41e-01 0.0172 0.0854 0.235 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 1.90e-02 -0.214 0.0907 0.235 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 7.89e-02 -0.114 0.0644 0.235 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0532 0.0387 0.235 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 6.73e-01 0.0325 0.0768 0.235 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 4.42e-01 0.0612 0.0796 0.236 NK L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 5.77e-02 -0.139 0.0731 0.236 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 5.69e-02 -0.174 0.0909 0.236 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.00e-01 0.0486 0.0378 0.236 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.33e-01 0.0196 0.0932 0.235 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.00e-01 0.0759 0.0731 0.235 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 8.49e-01 0.0169 0.0887 0.235 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.79e-01 0.0381 0.0351 0.235 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 1.71e-01 -0.132 0.0959 0.235 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.51e-01 0.16 0.111 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000746 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0756 0.0956 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.10e-01 0.103 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 8.17e-01 0.0126 0.0546 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0398 0.0956 0.235 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0414 0.0912 0.235 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.18e-01 0.0106 0.103 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 4.76e-01 0.0648 0.0906 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.05e-01 0.0308 0.0593 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.34e-01 -0.07 0.0893 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.86e-01 0.0584 0.0546 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 1.55e-01 0.14 0.0982 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0415 0.0838 0.236 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 2.91e-03 -0.29 0.0964 0.235 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 8.31e-01 0.0194 0.0908 0.235 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.54e-01 0.0661 0.0711 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0521 0.0931 0.235 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 5.27e-01 0.0284 0.0449 0.235 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 7.59e-02 -0.166 0.093 0.235 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0897 0.0871 0.235 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.16e-01 0.152 0.0959 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 6.46e-01 0.0487 0.106 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00482 0.0464 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 2.70e-01 0.0994 0.0898 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.17e-01 0.0416 0.0512 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0975 0.0987 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0797 0.0653 0.235 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 2.75e-01 0.111 0.101 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 2.18e-02 0.225 0.0976 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0648 0.0536 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.99e-01 0.127 0.0984 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 8.94e-01 0.007 0.0523 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.40e-01 0.00757 0.0998 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0344 0.0692 0.234 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0165 0.0984 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0766 0.0976 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0957 0.0984 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.45e-01 0.0529 0.0454 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 7.13e-01 0.0338 0.0919 0.234 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 4.74e-01 0.0568 0.0793 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.84e-01 0.0318 0.0778 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 7.84e-01 0.0198 0.0721 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.67e-01 0.0519 0.0466 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 5.97e-01 0.0476 0.09 0.235 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 7.67e-02 0.15 0.084 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0778 0.0851 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0656 0.0839 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 5.11e-01 0.0287 0.0435 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00156 0.101 0.235 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0244 0.099 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.77e-01 -0.108 0.0989 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 2.16e-01 0.118 0.0948 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.07e-01 0.0324 0.039 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.18e-01 0.00998 0.097 0.235 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.17e-01 0.137 0.0869 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0299 0.0816 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.63e-03 -0.289 0.0906 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 7.29e-01 0.0172 0.0496 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0582 0.0961 0.235 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0546 0.0928 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00427 0.0989 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0914 0.0851 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.45e-01 0.0373 0.0488 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.44e-02 0.207 0.097 0.235 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.22e-01 -0.164 0.106 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 7.22e-01 0.0351 0.0986 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0861 0.0977 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 8.56e-01 0.00869 0.0477 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 2.65e-01 0.116 0.104 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 3.14e-01 -0.096 0.095 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 8.00e-01 0.0264 0.104 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.74e-01 -0.074 0.103 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0146 0.0556 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.26e-01 0.00977 0.105 0.237 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0344 0.0995 0.236 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.37e-01 0.112 0.0942 0.236 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 9.15e-02 0.162 0.0955 0.236 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 7.74e-01 0.0136 0.0473 0.236 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 1.18e-01 -0.155 0.0986 0.236 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00772 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0246 0.0983 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 6.64e-01 0.0434 0.0998 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 6.80e-01 0.023 0.0556 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.23e-02 0.143 0.0846 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 1.16e-01 -0.122 0.0775 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.06e-02 -0.248 0.096 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.39e-01 0.0572 0.0385 0.237 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0966 0.104 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0989 0.0947 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 7.08e-01 -0.036 0.0961 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.71e-01 0.0612 0.0446 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.38e-01 0.00696 0.0895 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0677 0.0865 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 8.10e-02 -0.17 0.0967 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.34e-01 0.0791 0.0526 0.237 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.81e-01 0.173 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 1.67e-01 -0.152 0.109 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.82e-01 0.0805 0.0918 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.50e-01 0.105 0.112 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.71e-01 0.0461 0.0637 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.66e-01 -0.108 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0157 0.0787 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0141 0.0997 0.233 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.01e-01 0.0466 0.089 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 2.69e-01 -0.106 0.0952 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 2.71e-01 0.0398 0.036 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 6.39e-01 -0.044 0.0935 0.233 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 7.83e-01 -0.028 0.102 0.235 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0132 0.0959 0.235 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 7.83e-01 0.0223 0.0806 0.235 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0189 0.0357 0.235 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.19e-01 -0.1 0.101 0.235 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 7.40e-01 0.0358 0.108 0.244 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0478 0.0845 0.244 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 4.56e-02 0.167 0.0831 0.244 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 5.99e-01 -0.052 0.0987 0.244 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 6.04e-01 -0.05 0.0962 0.244 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 6.07e-01 0.0245 0.0475 0.244 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 5.24e-01 0.06 0.094 0.244 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -11439 sc-eQTL 7.36e-01 0.0254 0.0752 0.244 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 3.09e-01 0.0855 0.0839 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 1.20e-01 -0.099 0.0634 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 4.83e-01 0.0633 0.0901 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 1.94e-01 -0.118 0.0906 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0746 0.0726 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0417 0.0403 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 9.21e-01 0.00775 0.0779 0.235 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0622 0.0952 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0676 0.0687 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 8.93e-01 0.0116 0.086 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 2.54e-02 -0.208 0.0922 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 7.53e-02 -0.108 0.0607 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0367 0.044 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 3.41e-01 0.0776 0.0813 0.235 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.48e-01 0.00851 0.13 0.221 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.99e-01 -0.116 0.111 0.221 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 8.22e-01 0.0277 0.123 0.221 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.29e-01 0.0713 0.0466 0.221 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0456 0.121 0.221 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.43e-02 0.164 0.0947 0.236 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 7.12e-01 0.0337 0.0911 0.236 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 4.87e-01 -0.064 0.0918 0.236 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 9.66e-02 -0.151 0.0903 0.236 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 3.20e-01 0.0919 0.0922 0.236 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.85e-01 0.0281 0.0402 0.236 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0654 0.0978 0.236 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 9.68e-01 -0.004 0.101 0.24 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 8.51e-01 0.0128 0.0685 0.24 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 9.43e-02 0.161 0.096 0.24 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 3.29e-02 -0.204 0.0948 0.24 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.02e-01 -0.15 0.0916 0.24 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0129 0.0463 0.24 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0359 0.0817 0.24 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 3.08e-01 -0.121 0.119 0.243 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.46e-01 0.0364 0.0791 0.243 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 1.22e-01 0.123 0.0791 0.243 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 5.55e-01 0.0479 0.081 0.243 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0468 0.0965 0.243 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 8.98e-01 0.00851 0.0665 0.243 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 8.46e-02 -0.169 0.0975 0.243 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -11439 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0106 0.0942 0.243 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 2.21e-01 -0.121 0.0984 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 6.04e-01 0.0498 0.0959 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 6.96e-01 0.0213 0.0543 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0478 0.0859 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.77e-01 0.0661 0.0488 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 4.39e-01 0.0696 0.0898 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 3.50e-01 -0.081 0.0866 0.235 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 8.20e-02 0.167 0.0958 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 690214 sc-eQTL 1.10e-01 0.169 0.105 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0313 0.0434 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.30e-01 0.128 0.0839 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.42e-01 0.0393 0.051 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0599 0.0962 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 959801 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0673 0.061 0.235 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 6.57e-01 0.034 0.0765 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0671 0.053 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 6.94e-01 0.0341 0.0867 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 1.03e-01 -0.147 0.0899 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 1.60e-01 -0.084 0.0595 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.71e-01 -0.056 0.0408 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 4.11e-01 0.0601 0.0729 0.235 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 3.56e-01 0.0907 0.098 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0118 0.0648 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 356924 sc-eQTL 9.66e-01 0.00411 0.0953 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 377634 sc-eQTL 1.64e-02 -0.225 0.0932 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 4.93e-02 -0.175 0.0883 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 4.23e-01 0.0303 0.0377 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 sc-eQTL 2.45e-01 -0.107 0.0915 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -860481 sc-eQTL 1.85e-01 0.104 0.0783 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 578491 sc-eQTL 3.67e-02 -0.154 0.0731 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 328230 sc-eQTL 2.93e-02 -0.203 0.0924 0.237 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 277120 sc-eQTL 1.88e-01 0.0501 0.038 0.237 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 377634 pQTL 0.00359 -0.118 0.0406 0.0 0.0 0.24
ENSG00000112303 VNN2 328230 pQTL 0.0469 -0.0583 0.0293 0.0 0.0 0.24
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 eQTL 6.43e-06 -0.115 0.0253 0.0 0.0 0.242
ENSG00000234484 AL032821.1 339014 eQTL 0.015 0.0868 0.0356 0.0 0.0 0.242

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 278350 1.27e-06 9.47e-07 2.48e-07 8.58e-07 3.48e-07 5.26e-07 1.47e-06 3.65e-07 1.49e-06 5.11e-07 1.65e-06 7e-07 2.02e-06 2.73e-07 5.36e-07 9.14e-07 9.2e-07 6.94e-07 8.35e-07 6.43e-07 7.37e-07 1.63e-06 8.59e-07 5.77e-07 2.11e-06 6.17e-07 9.41e-07 6.88e-07 1.43e-06 1.32e-06 6.14e-07 2.56e-07 2.56e-07 6.83e-07 5.85e-07 4.46e-07 5.93e-07 2.42e-07 4.2e-07 3.02e-07 2.72e-07 1.49e-06 1.09e-07 5.71e-08 2.49e-07 1.38e-07 2.6e-07 4.85e-08 1.91e-07