logo

Genes within 1Mb (chr6:133088364:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0492 0.191 0.053 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 4.89e-01 -0.14 0.202 0.053 B L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.92e-02 0.149 0.0754 0.053 B L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 2.03e-01 -0.182 0.143 0.053 B L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.03e-01 -0.11 0.0862 0.053 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 2.97e-01 -0.19 0.182 0.053 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 6.96e-01 0.0468 0.119 0.053 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.14e-01 0.144 0.143 0.053 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 1.50e-02 0.359 0.147 0.053 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 2.31e-01 0.154 0.128 0.053 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.55e-01 -0.081 0.0874 0.053 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 3.41e-01 -0.169 0.177 0.053 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.69e-01 0.00541 0.14 0.053 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.19e-01 0.118 0.145 0.053 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.07e-01 0.141 0.17 0.053 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 8.36e-01 -0.012 0.0581 0.053 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 3.77e-01 -0.155 0.175 0.053 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.50e-01 0.0132 0.211 0.056 DC L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 3.41e-01 0.125 0.131 0.056 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 3.42e-02 -0.343 0.161 0.056 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 4.96e-01 -0.12 0.175 0.056 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 1.92e-01 -0.245 0.187 0.056 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0216 0.105 0.056 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0474 0.166 0.056 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -14764 sc-eQTL 2.93e-01 0.159 0.151 0.056 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.49e-01 -0.218 0.15 0.053 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 5.29e-03 0.279 0.099 0.053 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0761 0.173 0.053 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 3.96e-02 0.382 0.184 0.053 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00491 0.131 0.053 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0864 0.0786 0.053 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.93e-01 0.041 0.156 0.053 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.20e-02 0.346 0.16 0.054 NK L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.29e-02 0.278 0.149 0.054 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.80e-02 0.368 0.185 0.054 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0971 0.077 0.054 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0762 0.198 0.053 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.83e-01 0.168 0.156 0.053 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.80e-01 -0.105 0.189 0.053 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0192 0.0749 0.053 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0528 0.205 0.053 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.51e-01 -0.166 0.219 0.056 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 8.73e-01 0.0321 0.2 0.056 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 5.21e-01 0.121 0.188 0.056 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.26e-01 -0.127 0.2 0.056 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.42e-01 -0.125 0.107 0.056 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 3.09e-01 0.191 0.187 0.056 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 2.38e-01 0.211 0.178 0.056 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.77e-01 0.292 0.216 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 7.13e-01 0.0699 0.19 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.65e-02 0.275 0.123 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.85e-01 -0.131 0.187 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0868 0.115 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 1.98e-01 -0.266 0.206 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 8.43e-01 0.0348 0.176 0.054 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.90e-01 0.141 0.204 0.054 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 5.14e-02 0.366 0.187 0.054 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 1.50e-01 0.213 0.147 0.054 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0988 0.193 0.054 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.42e-01 -0.109 0.093 0.054 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 6.49e-02 0.358 0.193 0.054 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 1.19e-01 0.283 0.18 0.054 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.67e-01 -0.138 0.19 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 2.95e-01 -0.219 0.209 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 5.69e-03 0.251 0.0898 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 9.93e-01 -0.00151 0.178 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.69e-01 -0.139 0.101 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0976 0.195 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0313 0.129 0.053 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0958 0.202 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 9.27e-01 -0.018 0.197 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.22e-01 0.131 0.107 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 2.22e-01 -0.241 0.197 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 5.17e-02 -0.202 0.103 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 9.63e-01 0.00915 0.199 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0785 0.138 0.054 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.17e-01 0.319 0.203 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.97e-01 0.0789 0.203 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.67e-01 0.0606 0.205 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0889 0.0943 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 1.83e-02 0.447 0.188 0.055 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.68e-01 0.119 0.163 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.89e-02 0.348 0.158 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 9.31e-01 -0.0129 0.148 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0917 0.096 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 4.27e-01 -0.147 0.185 0.053 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.90e-01 0.00225 0.175 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 9.27e-02 0.296 0.175 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 1.27e-01 0.266 0.173 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.27e-01 -0.138 0.0897 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 4.49e-01 -0.158 0.209 0.053 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.51e-01 0.19 0.203 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.03e-02 0.417 0.202 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 9.95e-01 0.00127 0.196 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0201 0.0802 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0256 0.199 0.053 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 5.62e-01 0.106 0.183 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0402 0.171 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.92e-02 0.341 0.193 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.20e-01 0.162 0.104 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.42e-01 0.0664 0.202 0.053 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 8.59e-01 -0.034 0.19 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.51e-02 0.405 0.201 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.49e-01 -0.056 0.175 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 9.84e-02 -0.165 0.0996 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 6.77e-01 -0.0838 0.201 0.053 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 2.22e-01 -0.276 0.225 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 1.80e-01 0.28 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.55e-01 -0.065 0.208 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 8.04e-02 -0.177 0.101 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 3.35e-01 -0.214 0.222 0.051 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 7.10e-01 0.0739 0.199 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.65e-01 0.158 0.217 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 8.90e-02 0.366 0.214 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 5.12e-01 0.0761 0.116 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 8.10e-01 0.0527 0.219 0.053 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0198 0.2 0.054 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0285 0.19 0.054 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.25e-01 0.0682 0.194 0.054 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0769 0.0951 0.054 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.80e-01 -0.056 0.2 0.054 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 8.19e-01 0.0518 0.226 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.40e-01 0.246 0.209 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0785 0.213 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0603 0.118 0.051 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.23e-01 0.274 0.177 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.02e-02 0.376 0.161 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 3.17e-01 0.204 0.203 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.28e-01 -0.123 0.0804 0.054 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 2.30e-01 -0.275 0.229 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 9.48e-01 0.0136 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.36e-02 0.407 0.209 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0172 0.0985 0.05 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.82e-02 0.303 0.182 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.11e-01 0.222 0.177 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 6.78e-03 0.537 0.196 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.69e-01 -0.12 0.108 0.054 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.35e-01 -0.185 0.235 0.059 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 7.57e-01 0.0626 0.201 0.059 PB L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.96e-01 -0.176 0.167 0.059 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.14e-01 0.134 0.205 0.059 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0513 0.117 0.059 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 9.95e-01 0.00147 0.219 0.059 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 6.99e-01 0.0558 0.144 0.059 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 6.02e-01 -0.106 0.204 0.052 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 9.39e-01 0.0139 0.182 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 6.94e-01 -0.077 0.195 0.052 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 9.23e-02 -0.124 0.0733 0.052 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 8.58e-01 0.0342 0.191 0.052 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 5.77e-01 -0.116 0.207 0.053 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.19e-01 0.0971 0.195 0.053 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 1.46e-01 0.239 0.163 0.053 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 7.15e-01 0.0265 0.0727 0.053 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 1.52e-01 -0.294 0.204 0.053 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 5.16e-01 0.138 0.212 0.061 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 8.26e-02 0.289 0.165 0.061 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0167 0.166 0.061 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 5.64e-01 -0.112 0.195 0.061 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 3.69e-01 -0.17 0.189 0.061 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0254 0.0936 0.061 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 5.48e-01 -0.111 0.185 0.061 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -14764 sc-eQTL 9.18e-01 0.0153 0.148 0.061 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.83e-01 -0.148 0.169 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.22e-02 0.239 0.127 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 4.83e-01 -0.127 0.181 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 7.44e-02 0.326 0.182 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0839 0.146 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.44e-01 -0.077 0.0812 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 4.90e-01 -0.109 0.157 0.053 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 2.79e-01 -0.207 0.191 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 1.58e-02 0.332 0.136 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 8.53e-01 0.0321 0.173 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 1.53e-01 0.268 0.187 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 6.24e-01 0.0603 0.123 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.96e-01 -0.075 0.0883 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 3.46e-01 0.154 0.163 0.053 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0159 0.264 0.055 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0659 0.227 0.055 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.21e-01 -0.162 0.251 0.055 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 9.96e-02 -0.157 0.0948 0.055 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 4.80e-01 -0.175 0.247 0.055 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 5.42e-01 -0.117 0.191 0.056 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 3.99e-01 -0.154 0.183 0.056 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 5.61e-01 -0.108 0.184 0.056 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 3.60e-01 0.167 0.182 0.056 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.21e-01 0.149 0.185 0.056 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 4.62e-02 -0.16 0.0799 0.056 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 5.20e-02 0.381 0.195 0.056 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.28e-01 -0.198 0.202 0.057 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.47e-01 0.0628 0.137 0.057 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0895 0.193 0.057 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 8.44e-02 0.33 0.191 0.057 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.25e-01 0.147 0.184 0.057 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0787 0.0924 0.057 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 4.96e-01 -0.111 0.163 0.057 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 3.06e-01 -0.245 0.238 0.056 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 4.99e-01 0.108 0.159 0.056 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 1.08e-01 -0.257 0.159 0.056 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0504 0.163 0.056 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 3.47e-01 -0.183 0.194 0.056 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.90e-01 -0.175 0.133 0.056 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0183 0.198 0.056 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -14764 sc-eQTL 2.98e-01 0.197 0.189 0.056 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.20e-01 0.317 0.203 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 5.89e-01 0.107 0.199 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 7.40e-03 0.299 0.111 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 1.82e-01 -0.237 0.177 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.89e-01 -0.107 0.101 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 9.95e-01 -0.00123 0.186 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 3.75e-01 0.159 0.179 0.053 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 2.75e-01 -0.21 0.192 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 686889 sc-eQTL 2.64e-01 -0.236 0.211 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 1.70e-02 0.206 0.0856 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 4.41e-01 -0.13 0.168 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 1.24e-01 -0.157 0.101 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 7.40e-01 -0.064 0.192 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 956476 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0896 0.122 0.053 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 2.26e-01 -0.189 0.155 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 2.84e-03 0.321 0.106 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0652 0.177 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 4.14e-02 0.374 0.182 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 8.55e-01 0.0223 0.122 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0834 0.0834 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0172 0.149 0.053 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 4.07e-01 -0.164 0.197 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0526 0.13 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 353599 sc-eQTL 3.47e-01 -0.18 0.191 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 374309 sc-eQTL 6.18e-02 0.353 0.188 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 8.04e-02 0.312 0.178 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 6.38e-02 -0.14 0.0753 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 275025 sc-eQTL 1.84e-01 0.245 0.184 0.054 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -863806 sc-eQTL 1.08e-01 0.257 0.16 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 575166 sc-eQTL 6.98e-02 0.273 0.15 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 324905 sc-eQTL 5.11e-02 0.371 0.189 0.054 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 273795 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0841 0.0777 0.054 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 575166 eQTL 8.89e-19 0.32 0.0354 0.0 0.0 0.0476
ENSG00000112299 VNN1 374309 pQTL 0.000194 0.288 0.0772 0.0 0.0 0.0527
ENSG00000112303 VNN2 324905 eQTL 0.00668 0.0815 0.03 0.0 0.0 0.0476
ENSG00000234484 AL032821.1 335689 eQTL 0.000165 -0.271 0.0717 0.00577 0.0 0.0476

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079950 STX7 575166 3.77e-07 2.5e-07 5.72e-08 2.57e-07 1.03e-07 1.03e-07 2.74e-07 5.82e-08 1.75e-07 7.6e-08 1.96e-07 1.37e-07 3.95e-07 8.66e-08 5.62e-08 8.08e-08 5.27e-08 1.8e-07 7.27e-08 8.87e-08 1.18e-07 1.7e-07 1.86e-07 4.07e-08 2.99e-07 1.23e-07 1.22e-07 1.28e-07 1.34e-07 2.01e-07 1.43e-07 3.84e-08 4.27e-08 9.98e-08 1.27e-07 3.11e-08 6.57e-08 7.51e-08 4.99e-08 7.77e-08 3.24e-08 2.19e-07 5.39e-08 7.26e-09 3.2e-08 6.39e-09 1e-07 1.98e-09 4.8e-08
ENSG00000112303 VNN2 324905 1.26e-06 9.83e-07 1.54e-07 9.87e-07 1.07e-07 4.51e-07 1.08e-06 2.71e-07 1.08e-06 3.11e-07 1.33e-06 5.62e-07 2.02e-06 2.68e-07 4.21e-07 4.12e-07 7.7e-07 5.27e-07 4.7e-07 6.96e-07 2.54e-07 7.21e-07 7.96e-07 4.87e-07 1.88e-06 2.64e-07 5.49e-07 4.96e-07 8.97e-07 1.24e-06 5.62e-07 4.31e-08 1.79e-07 5.53e-07 5.63e-07 3.32e-07 5.1e-07 1.5e-07 3.76e-07 2.93e-07 2.71e-07 1.54e-06 5.91e-08 4.18e-08 1.71e-07 7.03e-08 1.18e-07 5.93e-08 5.86e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 335689 1.25e-06 9.15e-07 1.5e-07 8.58e-07 9.93e-08 4.23e-07 9.74e-07 2.66e-07 8.61e-07 3.1e-07 1.25e-06 5.75e-07 1.99e-06 2.72e-07 4.15e-07 3.79e-07 7.68e-07 5.16e-07 3.95e-07 6.97e-07 2.26e-07 6.2e-07 7.16e-07 4.38e-07 1.94e-06 2.49e-07 4.91e-07 4.7e-07 8.4e-07 1.22e-06 5.3e-07 4.1e-08 1.5e-07 4.91e-07 4.91e-07 3.05e-07 4.77e-07 1.59e-07 3.25e-07 3.2e-07 3.01e-07 1.43e-06 5.51e-08 3.39e-08 1.49e-07 5.94e-08 1.27e-07 4.41e-08 6.15e-08