logo

Genes within 1Mb (chr6:133086900:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.37e-01 0.24 0.161 0.077 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.077 B L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 5.43e-01 0.0391 0.0642 0.077 B L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.74e-01 -0.164 0.12 0.077 B L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0401 0.073 0.077 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0486 0.154 0.077 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 3.83e-01 -0.088 0.101 0.077 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0716 0.117 0.077 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 7.19e-01 0.0439 0.122 0.077 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0946 0.105 0.077 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0239 0.0716 0.077 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 7.67e-01 0.0431 0.145 0.077 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.77e-01 -0.156 0.115 0.077 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0486 0.121 0.077 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.78e-03 -0.436 0.138 0.077 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.91e-01 0.00661 0.0482 0.077 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 3.77e-01 0.129 0.146 0.077 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 2.47e-01 0.203 0.175 0.077 DC L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.077 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 4.32e-01 0.107 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 1.56e-01 0.207 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 7.61e-02 -0.277 0.155 0.077 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.78e-01 0.00237 0.0877 0.077 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0257 0.139 0.077 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -16228 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000218 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0272 0.125 0.077 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0929 0.0832 0.077 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 3.81e-01 0.126 0.143 0.077 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 2.44e-01 -0.18 0.154 0.077 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 3.24e-01 -0.107 0.109 0.077 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0581 0.0651 0.077 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 7.93e-01 0.0338 0.129 0.077 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 9.99e-01 0.000227 0.135 0.077 NK L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 8.97e-01 0.0163 0.125 0.077 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 3.78e-01 -0.137 0.155 0.077 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 1.37e-02 0.158 0.0634 0.077 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.02e-01 0.259 0.158 0.077 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.58e-01 0.0554 0.125 0.077 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 8.81e-02 -0.257 0.15 0.077 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 6.63e-01 0.0262 0.0599 0.077 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0479 0.164 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 2.40e-03 0.551 0.179 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 1.58e-01 -0.236 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00627 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0461 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0646 0.0896 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0846 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0207 0.15 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0911 0.177 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0284 0.156 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.18e-01 0.0826 0.102 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.31e-01 -0.232 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 2.35e-01 0.112 0.0936 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 1.86e-01 0.224 0.169 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 8.21e-02 0.25 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 5.34e-02 -0.327 0.168 0.078 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 7.09e-01 0.0584 0.156 0.078 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.123 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 4.69e-01 -0.116 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.01e-01 0.00965 0.0774 0.078 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0389 0.161 0.078 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 4.60e-01 0.111 0.15 0.078 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.02e-01 0.266 0.162 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 1.47e-02 0.435 0.177 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.70e-01 0.0567 0.0784 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0139 0.152 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.08e-01 0.0101 0.0868 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0933 0.167 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0928 0.111 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 3.62e-02 0.357 0.169 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 2.44e-02 0.374 0.165 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0105 0.0908 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0109 0.167 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0658 0.0882 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 1.57e-01 -0.238 0.168 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 9.02e-01 0.0145 0.117 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0889 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 7.27e-01 -0.058 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0832 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.67e-01 -0.013 0.0774 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 4.80e-01 0.11 0.156 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.95e-01 0.0347 0.133 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.58e-01 0.12 0.131 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0783 0.121 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0118 0.0786 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 5.44e-01 0.0918 0.151 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0199 0.142 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.143 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 6.46e-01 0.0649 0.141 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.39e-01 0.0244 0.0732 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0751 0.169 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.57e-01 0.25 0.176 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.08e-01 0.0907 0.177 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 2.85e-01 -0.181 0.169 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0181 0.0695 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 4.94e-01 0.118 0.173 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 4.94e-01 0.101 0.148 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0863 0.138 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.48e-03 -0.494 0.153 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00835 0.0841 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 7.70e-01 0.0476 0.163 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.74e-02 -0.377 0.157 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.71e-01 0.152 0.169 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 2.14e-01 -0.182 0.146 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 5.42e-01 0.0512 0.0838 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 3.73e-01 0.15 0.168 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 6.69e-01 0.0817 0.191 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0318 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 2.93e-01 0.184 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0584 0.0852 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 1.15e-01 0.294 0.186 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 2.98e-02 -0.351 0.16 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.54e-01 -0.164 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.35e-01 -0.262 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0129 0.0947 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0885 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 5.56e-01 0.101 0.172 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 8.33e-01 0.0345 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 8.47e-01 0.032 0.166 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0701 0.0815 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 4.24e-01 -0.137 0.171 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0938 0.178 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.96e-01 -0.14 0.165 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 5.95e-02 -0.316 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.35e-01 0.00762 0.0937 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.49e-01 0.211 0.146 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.67e-01 0.0976 0.134 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 2.91e-01 -0.177 0.167 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 6.88e-03 0.178 0.0654 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.67e-01 0.0521 0.175 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.57e-01 0.147 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0184 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.48e-03 0.212 0.0737 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 4.23e-01 -0.12 0.15 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0349 0.146 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 2.72e-01 -0.18 0.163 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 2.35e-01 0.105 0.0885 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.76e-01 -0.233 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 9.13e-01 0.0169 0.154 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.45e-01 -0.241 0.164 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00904 0.0625 0.072 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0771 0.162 0.072 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 2.01e-01 -0.227 0.178 0.077 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.06e-01 0.0868 0.168 0.077 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 3.13e-01 0.143 0.141 0.077 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 1.79e-01 -0.084 0.0623 0.077 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 2.34e-01 -0.21 0.176 0.077 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 8.54e-02 0.311 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0652 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 6.73e-01 0.0599 0.141 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 2.73e-01 0.182 0.166 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.39e-01 -0.239 0.161 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.14e-01 0.0189 0.08 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 3.25e-01 0.156 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -16228 sc-eQTL 3.28e-01 -0.124 0.126 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.03e-01 0.053 0.139 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.21e-01 -0.104 0.105 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 4.12e-01 0.122 0.148 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0944 0.15 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.70e-01 -0.165 0.119 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 6.96e-01 -0.026 0.0666 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00491 0.128 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0406 0.158 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.81e-02 -0.225 0.113 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 5.26e-01 0.0907 0.143 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 5.32e-02 -0.299 0.154 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0475 0.073 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0172 0.135 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 1.14e-01 0.376 0.237 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 2.97e-01 -0.214 0.204 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000864 0.227 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.28e-01 0.0301 0.0864 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 6.69e-01 0.0958 0.223 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 6.95e-02 0.293 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 6.34e-01 0.0737 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 5.11e-01 -0.103 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 9.99e-03 -0.395 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 3.31e-01 -0.153 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.26e-01 0.024 0.0683 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 2.11e-01 0.208 0.166 0.08 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 5.70e-02 -0.321 0.167 0.079 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 1.54e-01 0.163 0.114 0.079 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 3.90e-01 0.139 0.161 0.079 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000706 0.16 0.079 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0492 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0624 0.0771 0.079 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 5.56e-01 0.0803 0.136 0.079 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.29e-01 0.0714 0.205 0.079 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 1.36e-01 -0.204 0.136 0.079 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 2.62e-01 0.154 0.137 0.079 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 4.26e-01 0.112 0.14 0.079 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0663 0.167 0.079 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00706 0.115 0.079 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 1.77e-01 -0.229 0.169 0.079 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -16228 sc-eQTL 3.19e-01 0.162 0.162 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 3.81e-01 -0.149 0.17 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 5.96e-01 0.0877 0.165 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 4.14e-01 0.0766 0.0935 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 4.52e-02 -0.296 0.147 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 4.77e-01 0.0601 0.0843 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 1.60e-01 0.217 0.154 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 9.51e-01 0.00925 0.149 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 3.67e-02 0.339 0.161 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 685425 sc-eQTL 3.17e-03 0.523 0.175 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 5.13e-01 0.048 0.0733 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0593 0.142 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 9.80e-01 0.00212 0.0862 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 2.32e-01 -0.194 0.162 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 955012 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0928 0.103 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 8.47e-01 0.0244 0.127 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 5.46e-02 -0.169 0.0875 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 3.60e-01 0.132 0.143 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 2.07e-01 -0.189 0.149 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.68e-01 -0.137 0.0987 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 8.72e-01 -0.011 0.068 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.121 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0559 0.164 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 3.70e-01 0.0969 0.108 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 352135 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0426 0.159 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 372845 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0719 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 1.38e-01 -0.22 0.148 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0178 0.063 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 273561 sc-eQTL 5.14e-01 0.0998 0.153 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -865270 sc-eQTL 4.37e-01 0.104 0.133 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 573702 sc-eQTL 9.68e-01 0.00502 0.125 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 323441 sc-eQTL 4.18e-01 -0.129 0.158 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 272331 sc-eQTL 7.53e-03 0.172 0.0637 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 685425 eQTL 0.00187 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 372845 pQTL 2.31e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 685425 2.91e-07 1.42e-07 4.08e-08 2.09e-07 9.25e-08 9.48e-08 1.81e-07 5.48e-08 1.5e-07 5.67e-08 1.59e-07 1.01e-07 2.29e-07 7.95e-08 5.91e-08 7.49e-08 4.09e-08 1.4e-07 5.97e-08 4.3e-08 1.19e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.79e-08 1.85e-07 1.21e-07 1.07e-07 9.74e-08 1.23e-07 1e-07 1.09e-07 3.26e-08 3.66e-08 8.89e-08 3.46e-08 3.65e-08 5.8e-08 9.3e-08 6.43e-08 4.47e-08 5.39e-08 1.52e-07 4.52e-08 1.32e-08 5.15e-08 1.84e-08 1.19e-07 3.89e-09 4.85e-08