logo

Genes within 1Mb (chr6:133085251:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.37e-01 0.24 0.161 0.077 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 1.10e-01 0.272 0.169 0.077 B L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 5.43e-01 0.0391 0.0642 0.077 B L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.74e-01 -0.164 0.12 0.077 B L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0401 0.073 0.077 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0486 0.154 0.077 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 3.83e-01 -0.088 0.101 0.077 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0716 0.117 0.077 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 7.19e-01 0.0439 0.122 0.077 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0946 0.105 0.077 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0239 0.0716 0.077 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 7.67e-01 0.0431 0.145 0.077 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.77e-01 -0.156 0.115 0.077 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0486 0.121 0.077 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.78e-03 -0.436 0.138 0.077 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.91e-01 0.00661 0.0482 0.077 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 3.77e-01 0.129 0.146 0.077 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 2.47e-01 0.203 0.175 0.077 DC L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 1.76e-01 -0.148 0.109 0.077 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 4.32e-01 0.107 0.135 0.077 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 1.56e-01 0.207 0.145 0.077 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 7.61e-02 -0.277 0.155 0.077 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.78e-01 0.00237 0.0877 0.077 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0257 0.139 0.077 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -17877 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000218 0.126 0.077 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0272 0.125 0.077 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0929 0.0832 0.077 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 3.81e-01 0.126 0.143 0.077 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 2.44e-01 -0.18 0.154 0.077 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 3.24e-01 -0.107 0.109 0.077 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0581 0.0651 0.077 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 7.93e-01 0.0338 0.129 0.077 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 9.99e-01 0.000227 0.135 0.077 NK L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 8.97e-01 0.0163 0.125 0.077 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 3.78e-01 -0.137 0.155 0.077 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 1.37e-02 0.158 0.0634 0.077 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.02e-01 0.259 0.158 0.077 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.58e-01 0.0554 0.125 0.077 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 8.81e-02 -0.257 0.15 0.077 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 6.63e-01 0.0262 0.0599 0.077 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0479 0.164 0.077 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 2.40e-03 0.551 0.179 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 1.58e-01 -0.236 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00627 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0461 0.167 0.079 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0646 0.0896 0.079 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0846 0.157 0.079 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0207 0.15 0.079 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0911 0.177 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0284 0.156 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.18e-01 0.0826 0.102 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.31e-01 -0.232 0.153 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 2.35e-01 0.112 0.0936 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 1.86e-01 0.224 0.169 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 8.21e-02 0.25 0.143 0.077 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 5.34e-02 -0.327 0.168 0.078 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 7.09e-01 0.0584 0.156 0.078 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.51e-01 0.115 0.123 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 4.69e-01 -0.116 0.16 0.078 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.01e-01 0.00965 0.0774 0.078 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0389 0.161 0.078 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 4.60e-01 0.111 0.15 0.078 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.02e-01 0.266 0.162 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 1.47e-02 0.435 0.177 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.70e-01 0.0567 0.0784 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0139 0.152 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.08e-01 0.0101 0.0868 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0933 0.167 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0928 0.111 0.077 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 3.62e-02 0.357 0.169 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 2.44e-02 0.374 0.165 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0105 0.0908 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 9.48e-01 -0.0109 0.167 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0658 0.0882 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 1.57e-01 -0.238 0.168 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 9.02e-01 0.0145 0.117 0.077 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0889 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 7.27e-01 -0.058 0.166 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0832 0.167 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.67e-01 -0.013 0.0774 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 4.80e-01 0.11 0.156 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.95e-01 0.0347 0.133 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.58e-01 0.12 0.131 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0783 0.121 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0118 0.0786 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 5.44e-01 0.0918 0.151 0.077 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0199 0.142 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0154 0.143 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 6.46e-01 0.0649 0.141 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.39e-01 0.0244 0.0732 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0751 0.169 0.077 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.57e-01 0.25 0.176 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.08e-01 0.0907 0.177 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 2.85e-01 -0.181 0.169 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0181 0.0695 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 4.94e-01 0.118 0.173 0.077 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 4.94e-01 0.101 0.148 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0863 0.138 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.48e-03 -0.494 0.153 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00835 0.0841 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 7.70e-01 0.0476 0.163 0.077 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.74e-02 -0.377 0.157 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.71e-01 0.152 0.169 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 2.14e-01 -0.182 0.146 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 5.42e-01 0.0512 0.0838 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 3.73e-01 0.15 0.168 0.077 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 6.69e-01 0.0817 0.191 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0318 0.176 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 2.93e-01 0.184 0.175 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0584 0.0852 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 1.15e-01 0.294 0.186 0.074 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 2.98e-02 -0.351 0.16 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.54e-01 -0.164 0.177 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.35e-01 -0.262 0.175 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0129 0.0947 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0885 0.179 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 5.56e-01 0.101 0.172 0.078 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 8.33e-01 0.0345 0.163 0.078 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 8.47e-01 0.032 0.166 0.078 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0701 0.0815 0.078 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 4.24e-01 -0.137 0.171 0.078 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0938 0.178 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.96e-01 -0.14 0.165 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 5.95e-02 -0.316 0.167 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.35e-01 0.00762 0.0937 0.073 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.49e-01 0.211 0.146 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.67e-01 0.0976 0.134 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 2.91e-01 -0.177 0.167 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 6.88e-03 0.178 0.0654 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.67e-01 0.0521 0.175 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.57e-01 0.147 0.159 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0184 0.162 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.48e-03 0.212 0.0737 0.08 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 4.23e-01 -0.12 0.15 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0349 0.146 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 2.72e-01 -0.18 0.163 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 2.35e-01 0.105 0.0885 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.76e-01 -0.233 0.172 0.072 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 9.13e-01 0.0169 0.154 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.45e-01 -0.241 0.164 0.072 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00904 0.0625 0.072 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0771 0.162 0.072 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 2.01e-01 -0.227 0.178 0.077 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.06e-01 0.0868 0.168 0.077 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 3.13e-01 0.143 0.141 0.077 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 1.79e-01 -0.084 0.0623 0.077 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 2.34e-01 -0.21 0.176 0.077 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 8.54e-02 0.311 0.18 0.078 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0652 0.142 0.078 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 6.73e-01 0.0599 0.141 0.078 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 2.73e-01 0.182 0.166 0.078 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.39e-01 -0.239 0.161 0.078 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.14e-01 0.0189 0.08 0.078 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 3.25e-01 0.156 0.158 0.078 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -17877 sc-eQTL 3.28e-01 -0.124 0.126 0.078 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.03e-01 0.053 0.139 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.21e-01 -0.104 0.105 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 4.12e-01 0.122 0.148 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0944 0.15 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.70e-01 -0.165 0.119 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 6.96e-01 -0.026 0.0666 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00491 0.128 0.077 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0406 0.158 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.81e-02 -0.225 0.113 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 5.26e-01 0.0907 0.143 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 5.32e-02 -0.299 0.154 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.33e-01 -0.152 0.101 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0475 0.073 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0172 0.135 0.077 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 1.14e-01 0.376 0.237 0.067 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 2.97e-01 -0.214 0.204 0.067 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000864 0.227 0.067 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.28e-01 0.0301 0.0864 0.067 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 6.69e-01 0.0958 0.223 0.067 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 6.95e-02 0.293 0.161 0.08 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 6.34e-01 0.0737 0.155 0.08 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 5.11e-01 -0.103 0.156 0.08 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 9.99e-03 -0.395 0.152 0.08 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 3.31e-01 -0.153 0.157 0.08 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.26e-01 0.024 0.0683 0.08 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 2.11e-01 0.208 0.166 0.08 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 5.70e-02 -0.321 0.167 0.079 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 1.54e-01 0.163 0.114 0.079 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 3.90e-01 0.139 0.161 0.079 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000706 0.16 0.079 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0492 0.154 0.079 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0624 0.0771 0.079 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 5.56e-01 0.0803 0.136 0.079 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.29e-01 0.0714 0.205 0.079 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 1.36e-01 -0.204 0.136 0.079 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 2.62e-01 0.154 0.137 0.079 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 4.26e-01 0.112 0.14 0.079 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0663 0.167 0.079 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00706 0.115 0.079 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 1.77e-01 -0.229 0.169 0.079 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -17877 sc-eQTL 3.19e-01 0.162 0.162 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 3.81e-01 -0.149 0.17 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 5.96e-01 0.0877 0.165 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 4.14e-01 0.0766 0.0935 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 4.52e-02 -0.296 0.147 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 4.77e-01 0.0601 0.0843 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 1.60e-01 0.217 0.154 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 9.51e-01 0.00925 0.149 0.077 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 3.67e-02 0.339 0.161 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 683776 sc-eQTL 3.17e-03 0.523 0.175 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 5.13e-01 0.048 0.0733 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0593 0.142 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 9.80e-01 0.00212 0.0862 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 2.32e-01 -0.194 0.162 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 953363 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0928 0.103 0.077 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 8.47e-01 0.0244 0.127 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 5.46e-02 -0.169 0.0875 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 3.60e-01 0.132 0.143 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 2.07e-01 -0.189 0.149 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.68e-01 -0.137 0.0987 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 8.72e-01 -0.011 0.068 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 9.34e-01 0.01 0.121 0.077 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0559 0.164 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 3.70e-01 0.0969 0.108 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 350486 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0426 0.159 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 371196 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0719 0.157 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 1.38e-01 -0.22 0.148 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0178 0.063 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 271912 sc-eQTL 5.14e-01 0.0998 0.153 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -866919 sc-eQTL 4.37e-01 0.104 0.133 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 572053 sc-eQTL 9.68e-01 0.00502 0.125 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 321792 sc-eQTL 4.18e-01 -0.129 0.158 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 270682 sc-eQTL 7.53e-03 0.172 0.0637 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 683776 eQTL 0.00187 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 371196 pQTL 2.31e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 683776 2.67e-07 1.34e-07 4.48e-08 2.05e-07 9.16e-08 9.76e-08 1.61e-07 5.37e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.54e-07 8.68e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.17e-08 7.3e-08 4.17e-08 1.26e-07 5.39e-08 4.1e-08 1.08e-07 1.28e-07 1.45e-07 2.95e-08 1.55e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.16e-07 1.07e-07 9.92e-08 3.26e-08 3.16e-08 8.44e-08 4.84e-08 3.62e-08 5.11e-08 9.26e-08 6.54e-08 3.71e-08 5.34e-08 1.46e-07 4.04e-08 7.35e-09 5.19e-08 1.84e-08 1.21e-07 3.83e-09 5.09e-08