logo

Genes within 1Mb (chr6:133083553:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 1.05e-01 0.272 0.167 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0634 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.119 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0306 0.072 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0457 0.152 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0477 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.72e-01 0.0349 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0877 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0707 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.81e-01 0.0398 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.25e-01 -0.042 0.119 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.49e-03 -0.417 0.136 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.51e-01 0.00293 0.0476 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 3.05e-01 0.178 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 5.02e-01 0.0899 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.41e-02 -0.31 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0866 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0337 0.137 0.079 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -19575 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0822 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0529 0.0644 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.42e-01 0.0421 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00342 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.91e-01 -0.106 0.153 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 2.14e-02 0.145 0.0627 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.11e-01 0.25 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.99e-01 0.0478 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 8.26e-02 -0.259 0.149 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 6.51e-01 0.0268 0.0593 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 8.78e-01 -0.025 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 8.88e-04 0.593 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 2.33e-01 -0.197 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0591 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0882 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0446 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 3.55e-01 0.093 0.1 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.22e-01 -0.234 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0924 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.52e-01 0.239 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.26e-02 -0.311 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 7.56e-01 0.048 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0764 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 4.88e-01 0.103 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.18e-01 0.251 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 1.53e-02 0.427 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.54e-01 0.0243 0.0774 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00256 0.15 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0992 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0857 0.109 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 3.53e-02 0.354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 1.48e-02 0.399 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0897 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0335 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0576 0.0871 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.44e-01 -0.243 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 5.37e-01 0.0713 0.115 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.29e-01 -0.08 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0935 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00477 0.0765 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 7.47e-01 0.0424 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0641 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0775 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0482 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 7.26e-01 0.049 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 6.72e-01 0.0306 0.0723 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.65e-01 -0.122 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 8.52e-02 0.299 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.47e-01 0.0564 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0123 0.0686 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 5.16e-01 0.0948 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0975 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.67e-03 -0.482 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.083 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.40e-01 0.0534 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 2.51e-02 -0.35 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.71e-01 -0.159 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 5.64e-01 0.0478 0.0827 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.83e-01 0.0767 0.188 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0721 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.00e-01 0.221 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0643 0.084 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.79e-01 0.247 0.183 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 3.56e-02 -0.335 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.35e-01 -0.137 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0934 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 6.27e-01 -0.086 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 9.23e-01 0.0156 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0665 0.0805 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0821 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 2.76e-01 -0.178 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 6.98e-02 -0.3 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0924 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.70e-01 0.198 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 5.82e-01 0.0729 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.37e-01 -0.129 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 1.15e-02 0.165 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.99e-01 0.0672 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 9.85e-01 0.00294 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 5.55e-03 0.205 0.0729 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 3.70e-01 -0.133 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0513 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.57e-01 -0.183 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 2.55e-01 0.0997 0.0873 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00478 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0619 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0376 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 2.56e-01 -0.199 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.14e-01 0.0836 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0879 0.0613 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 2.84e-01 -0.187 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 1.75e-01 0.242 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 7.28e-01 0.0484 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 3.87e-01 0.142 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.05e-01 0.00946 0.0788 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -19575 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0907 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.00e-01 0.0719 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 3.54e-01 0.136 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 5.44e-01 -0.09 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0236 0.0659 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 9.63e-01 0.00588 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0342 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.35e-02 -0.227 0.112 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 6.98e-01 0.0548 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0998 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0416 0.0722 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.83e-01 -0.14 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 9.81e-01 0.00539 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0842 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 7.32e-01 0.0747 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 8.33e-02 0.276 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 7.15e-01 0.056 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 1.05e-02 -0.388 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 6.66e-01 0.0291 0.0674 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.67e-01 0.227 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.79e-02 -0.304 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 5.53e-01 0.0945 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0321 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0314 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0459 0.0761 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 5.06e-01 0.0896 0.134 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 6.50e-01 0.0918 0.202 0.082 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.137 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0881 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00263 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 2.24e-01 -0.203 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -19575 sc-eQTL 4.43e-01 0.123 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 3.45e-01 -0.159 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 6.65e-01 0.0708 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0923 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 3.76e-01 0.0738 0.0832 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 4.39e-02 0.323 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 682078 sc-eQTL 2.46e-03 0.529 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 6.95e-01 0.0284 0.0724 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0623 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.32e-01 0.00731 0.085 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 1.92e-01 -0.209 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 951665 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 7.59e-01 0.0384 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 4.47e-02 -0.174 0.0864 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 2.10e-01 -0.186 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0976 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00865 0.0672 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0569 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 5.57e-01 0.0628 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 348788 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0876 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 369498 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00364 0.0622 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 270214 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -868617 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 570355 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 320094 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0988 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 268984 sc-eQTL 1.21e-02 0.159 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 682078 eQTL 0.00187 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 369498 pQTL 2.31e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 682078 2.74e-07 3.11e-07 4.47e-08 2.22e-07 9.02e-08 9.65e-08 1.53e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.4e-08 1.52e-07 1.23e-07 1.52e-07 8.15e-08 6.25e-08 7.3e-08 3.87e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.07e-08 1.04e-07 1.24e-07 1.32e-07 4.05e-08 1.46e-07 1.16e-07 1.11e-07 9.32e-08 1.05e-07 1.12e-07 1.06e-07 3.82e-08 2.74e-08 8e-08 3.02e-08 3.96e-08 5.01e-08 9.55e-08 7.23e-08 3.54e-08 3.27e-08 1.35e-07 4.52e-08 7.28e-09 8.16e-08 1.68e-08 1.19e-07 4.04e-09 5.04e-08