logo

Genes within 1Mb (chr6:133074854:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 1.05e-01 0.272 0.167 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0634 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.119 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0306 0.072 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0457 0.152 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0477 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.72e-01 0.0349 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0877 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0707 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.81e-01 0.0398 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.25e-01 -0.042 0.119 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.49e-03 -0.417 0.136 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.51e-01 0.00293 0.0476 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 3.05e-01 0.178 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 5.02e-01 0.0899 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.41e-02 -0.31 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0866 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0337 0.137 0.079 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -28274 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0822 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0529 0.0644 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.42e-01 0.0421 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00342 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.91e-01 -0.106 0.153 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 2.14e-02 0.145 0.0627 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.11e-01 0.25 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.99e-01 0.0478 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 8.26e-02 -0.259 0.149 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 6.51e-01 0.0268 0.0593 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 8.78e-01 -0.025 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 8.88e-04 0.593 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 2.33e-01 -0.197 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0591 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0882 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0446 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 3.55e-01 0.093 0.1 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.22e-01 -0.234 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0924 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.52e-01 0.239 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.26e-02 -0.311 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 7.56e-01 0.048 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0764 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 4.88e-01 0.103 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.18e-01 0.251 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 1.53e-02 0.427 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.54e-01 0.0243 0.0774 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00256 0.15 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0992 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0857 0.109 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 3.53e-02 0.354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 1.48e-02 0.399 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0897 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0335 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0576 0.0871 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.44e-01 -0.243 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 5.37e-01 0.0713 0.115 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.29e-01 -0.08 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0935 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00477 0.0765 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 7.47e-01 0.0424 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0641 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0775 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0482 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 7.26e-01 0.049 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 6.72e-01 0.0306 0.0723 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.65e-01 -0.122 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 8.52e-02 0.299 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.47e-01 0.0564 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0123 0.0686 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 5.16e-01 0.0948 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0975 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.67e-03 -0.482 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.083 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.40e-01 0.0534 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 2.51e-02 -0.35 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.71e-01 -0.159 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 5.64e-01 0.0478 0.0827 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.83e-01 0.0767 0.188 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0721 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.00e-01 0.221 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0643 0.084 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.79e-01 0.247 0.183 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 3.56e-02 -0.335 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.35e-01 -0.137 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0934 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 6.27e-01 -0.086 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 9.23e-01 0.0156 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0665 0.0805 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0821 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 2.76e-01 -0.178 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 6.98e-02 -0.3 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0924 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.70e-01 0.198 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 5.82e-01 0.0729 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.37e-01 -0.129 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 1.15e-02 0.165 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.99e-01 0.0672 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 9.85e-01 0.00294 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 5.55e-03 0.205 0.0729 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 3.70e-01 -0.133 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0513 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.57e-01 -0.183 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 2.55e-01 0.0997 0.0873 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00478 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0619 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0376 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 2.56e-01 -0.199 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.14e-01 0.0836 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0879 0.0613 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 2.84e-01 -0.187 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 1.75e-01 0.242 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 7.28e-01 0.0484 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 3.87e-01 0.142 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.05e-01 0.00946 0.0788 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -28274 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0907 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.00e-01 0.0719 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 3.54e-01 0.136 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 5.44e-01 -0.09 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0236 0.0659 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 9.63e-01 0.00588 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0342 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.35e-02 -0.227 0.112 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 6.98e-01 0.0548 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0998 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0416 0.0722 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.83e-01 -0.14 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 9.81e-01 0.00539 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0842 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 7.32e-01 0.0747 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 8.33e-02 0.276 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 7.15e-01 0.056 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 1.05e-02 -0.388 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 6.66e-01 0.0291 0.0674 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.67e-01 0.227 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.79e-02 -0.304 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 5.53e-01 0.0945 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0321 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0314 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0459 0.0761 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 5.06e-01 0.0896 0.134 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 6.50e-01 0.0918 0.202 0.082 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.137 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0881 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00263 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 2.24e-01 -0.203 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -28274 sc-eQTL 4.43e-01 0.123 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 3.45e-01 -0.159 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 6.65e-01 0.0708 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0923 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 3.76e-01 0.0738 0.0832 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 4.39e-02 0.323 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 673379 sc-eQTL 2.46e-03 0.529 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 6.95e-01 0.0284 0.0724 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0623 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.32e-01 0.00731 0.085 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 1.92e-01 -0.209 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 942966 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 7.59e-01 0.0384 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 4.47e-02 -0.174 0.0864 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 2.10e-01 -0.186 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0976 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00865 0.0672 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0569 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 5.57e-01 0.0628 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 340089 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0876 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 360799 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00364 0.0622 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 261515 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -877316 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 561656 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 311395 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0988 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 260285 sc-eQTL 1.21e-02 0.159 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 673379 eQTL 0.00188 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 360799 pQTL 2.3e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 673379 3.02e-07 1.42e-07 5.93e-08 2.05e-07 9.82e-08 8.21e-08 1.99e-07 5.82e-08 1.59e-07 8.53e-08 1.63e-07 1.2e-07 1.95e-07 7.95e-08 5.94e-08 8.08e-08 4.31e-08 1.72e-07 7.12e-08 5.07e-08 1.22e-07 1.47e-07 1.58e-07 3.4e-08 1.98e-07 1.31e-07 1.17e-07 1.04e-07 1.31e-07 1.06e-07 1.09e-07 3.6e-08 3.21e-08 9.76e-08 3.02e-08 2.68e-08 5.58e-08 8.37e-08 6.76e-08 3.67e-08 5.48e-08 1.52e-07 5.39e-08 7.39e-09 2.82e-08 1.65e-08 8.74e-08 1.92e-09 4.82e-08