logo

Genes within 1Mb (chr6:133071380:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0566 0.109 0.162 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 8.30e-01 0.0249 0.116 0.162 B L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0198 0.0436 0.162 B L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 5.11e-02 0.159 0.0812 0.162 B L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 4.18e-01 0.0401 0.0495 0.162 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 1.00e+00 3.64e-05 0.104 0.162 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0292 0.0684 0.162 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 9.16e-02 0.135 0.0798 0.162 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0679 0.0834 0.162 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 4.60e-01 0.0534 0.0722 0.162 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.34e-01 0.0475 0.0491 0.162 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0188 0.0995 0.162 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.63e-01 0.0584 0.0794 0.162 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0652 0.0829 0.162 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 7.73e-01 -0.028 0.0969 0.162 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 2.86e-01 0.0354 0.033 0.162 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0143 0.1 0.162 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.38e-01 -0.118 0.123 0.164 DC L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.24e-01 0.0612 0.0764 0.164 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 7.35e-02 0.169 0.0942 0.164 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0996 0.102 0.164 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.53e-01 0.125 0.109 0.164 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 8.18e-01 0.0141 0.0615 0.164 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0814 0.0971 0.164 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -31748 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00137 0.0885 0.164 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 1.83e-01 0.114 0.0856 0.162 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0275 0.0575 0.162 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0624 0.0986 0.162 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 4.58e-02 -0.211 0.105 0.162 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0919 0.0747 0.162 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0516 0.0448 0.162 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.07e-01 0.0104 0.0889 0.162 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.35e-01 0.0718 0.0919 0.163 NK L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.94e-02 -0.175 0.0842 0.163 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 9.79e-02 -0.175 0.105 0.163 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00479 0.0438 0.163 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0976 0.107 0.162 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.31e-01 0.0822 0.0844 0.162 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.17e-01 0.126 0.102 0.162 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.72e-01 0.0362 0.0405 0.162 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 2.71e-01 -0.122 0.111 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0773 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 2.36e-01 0.136 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.50e-01 -0.101 0.107 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.03e-01 0.146 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.19e-01 0.0396 0.0614 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 7.95e-01 0.028 0.108 0.161 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0612 0.103 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.51e-01 0.0541 0.12 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 2.95e-01 0.11 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000441 0.0687 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 8.33e-01 0.0218 0.103 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 8.07e-01 0.0155 0.0633 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.81e-01 0.0804 0.114 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0964 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 5.86e-02 -0.215 0.113 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00764 0.105 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.46e-01 0.0268 0.0824 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0154 0.108 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 8.24e-01 0.0116 0.052 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.68e-02 -0.215 0.107 0.162 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 1.10e-01 -0.161 0.1 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.19e-01 0.0556 0.112 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 2.58e-01 -0.139 0.122 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0347 0.0536 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.31e-01 0.125 0.104 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 4.17e-01 0.0482 0.0593 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0824 0.114 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0604 0.0758 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0174 0.117 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 2.71e-01 0.126 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 1.26e-01 -0.0953 0.062 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 9.35e-02 0.192 0.114 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.17e-01 0.0393 0.0606 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.05e-01 0.0963 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0629 0.0801 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 8.50e-01 0.0216 0.114 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0868 0.113 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0519 0.114 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 1.55e-01 0.0747 0.0524 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00678 0.106 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.65e-01 0.0399 0.092 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0218 0.0902 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 3.63e-01 0.0761 0.0834 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 2.13e-01 0.0675 0.054 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.42e-01 0.00754 0.104 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.86e-02 0.203 0.0976 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0956 0.099 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.94e-01 -0.103 0.0976 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 7.11e-01 0.0188 0.0507 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 8.61e-01 0.0206 0.117 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.90e-01 -0.12 0.113 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 1.32e-01 -0.171 0.113 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 3.46e-02 0.229 0.108 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 2.71e-01 0.0492 0.0446 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0395 0.111 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.45e-01 0.117 0.1 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 8.59e-01 0.0167 0.0942 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 1.20e-01 -0.166 0.106 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 6.79e-01 0.0237 0.0573 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0707 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 5.25e-01 0.0682 0.107 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0724 0.114 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0242 0.0984 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 6.36e-01 0.0267 0.0563 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 1.10e-01 0.18 0.112 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.96e-02 -0.219 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.10e-01 0.0418 0.112 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 7.15e-02 -0.2 0.111 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.80e-01 0.0301 0.0543 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 7.33e-01 0.0407 0.119 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.23e-01 0.0533 0.108 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.07e-01 0.121 0.118 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 8.88e-01 0.0166 0.117 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0387 0.0631 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 5.41e-01 0.073 0.119 0.167 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.30e-01 -0.111 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 2.37e-01 0.128 0.108 0.162 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 6.25e-02 0.205 0.11 0.162 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.97e-01 0.046 0.0542 0.162 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 3.13e-01 -0.115 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 8.93e-01 0.0164 0.121 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 8.16e-01 0.0263 0.113 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 7.71e-02 0.202 0.113 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 6.81e-01 0.0262 0.0637 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.48e-01 0.114 0.0984 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.71e-02 -0.188 0.0894 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 3.55e-02 -0.237 0.112 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 9.65e-01 0.00198 0.0449 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.69e-01 -0.132 0.12 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.71e-02 -0.216 0.108 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0342 0.11 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 7.56e-01 -0.016 0.0514 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.79e-01 0.073 0.103 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0815 0.0995 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 1.66e-01 -0.155 0.112 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.71e-01 0.0544 0.0607 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 7.84e-02 0.265 0.149 0.148 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 5.66e-02 -0.244 0.127 0.148 PB L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 5.31e-01 0.0675 0.107 0.148 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 3.40e-01 0.126 0.131 0.148 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00538 0.0747 0.148 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0939 0.14 0.148 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0734 0.0918 0.148 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.00e-01 0.147 0.114 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 6.22e-01 0.0504 0.102 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0372 0.11 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 1.51e-01 0.0595 0.0413 0.165 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0186 0.107 0.165 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.34e-01 0.091 0.116 0.162 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.36e-01 -0.037 0.11 0.162 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0516 0.0922 0.162 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 8.61e-01 0.00714 0.0408 0.162 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0447 0.115 0.162 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0913 0.123 0.168 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0257 0.0966 0.168 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 6.13e-02 0.179 0.095 0.168 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 1.92e-01 -0.147 0.112 0.168 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 5.92e-01 0.059 0.11 0.168 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 7.23e-01 0.0193 0.0542 0.168 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.26e-01 0.00994 0.107 0.168 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -31748 sc-eQTL 2.37e-01 0.102 0.0856 0.168 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.04e-01 0.125 0.0981 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0963 0.0744 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00307 0.106 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 2.21e-01 -0.13 0.106 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0203 0.0852 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0478 0.0472 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.99e-01 -0.000163 0.0913 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 7.32e-01 -0.038 0.111 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 9.19e-01 0.00809 0.0799 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0502 0.0997 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 1.85e-01 -0.144 0.108 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.84e-01 -0.076 0.0707 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0318 0.051 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 2.94e-01 0.0993 0.0943 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.27e-01 -0.182 0.15 0.158 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0432 0.13 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00288 0.144 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 1.45e-01 0.0796 0.0543 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0986 0.141 0.158 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.18e-01 0.0911 0.112 0.16 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 8.46e-01 0.0208 0.107 0.16 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0408 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0486 0.107 0.16 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 4.52e-02 0.217 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 5.63e-01 0.0274 0.0473 0.16 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 5.78e-02 -0.218 0.114 0.16 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.27e-01 0.142 0.117 0.163 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 3.40e-01 -0.076 0.0794 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 2.01e-01 0.144 0.112 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 1.10e-02 -0.282 0.11 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 6.89e-02 -0.195 0.106 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 9.23e-01 0.00519 0.0538 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0895 0.0948 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 1.78e-01 -0.184 0.136 0.167 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 2.03e-01 0.116 0.0906 0.167 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 3.27e-01 0.0898 0.0914 0.167 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 9.49e-01 0.00595 0.0933 0.167 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0481 0.111 0.167 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 9.43e-01 0.00545 0.0765 0.167 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 2.26e-01 -0.137 0.113 0.167 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -31748 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0772 0.108 0.167 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0844 0.115 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 7.71e-01 0.0326 0.112 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00969 0.0634 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 3.93e-01 0.0858 0.1 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 4.85e-01 0.0399 0.0571 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00989 0.105 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 3.03e-01 -0.104 0.101 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 6.90e-01 0.0446 0.112 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 669905 sc-eQTL 9.01e-01 -0.0153 0.123 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 1.48e-01 -0.0726 0.0501 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 4.39e-02 0.196 0.0968 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 4.00e-01 0.0497 0.059 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00366 0.112 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 939492 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0465 0.0708 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.94e-01 0.0759 0.0889 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0188 0.0619 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0443 0.101 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 2.71e-01 -0.116 0.105 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0407 0.0696 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 1.30e-01 -0.0722 0.0475 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 4.56e-01 0.0634 0.0848 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 2.88e-01 0.122 0.115 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0591 0.0759 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 336615 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00356 0.112 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 357325 sc-eQTL 6.09e-03 -0.302 0.109 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 2.02e-01 -0.133 0.104 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 3.36e-01 0.0427 0.0442 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 sc-eQTL 3.65e-02 -0.224 0.107 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -880790 sc-eQTL 3.07e-01 0.0928 0.0906 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 558182 sc-eQTL 2.34e-02 -0.192 0.0843 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307921 sc-eQTL 4.79e-02 -0.213 0.107 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256811 sc-eQTL 8.37e-01 -0.00906 0.0441 0.164 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 669905 eQTL 0.0241 -0.0855 0.0378 0.0 0.0 0.175
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 eQTL 3.02e-07 -0.143 0.0277 0.0 0.0 0.175

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 258041 1.38e-06 1.29e-06 2.54e-07 1.21e-06 5.07e-07 6.06e-07 1.38e-06 4.23e-07 1.7e-06 6.9e-07 2.06e-06 1.25e-06 2.62e-06 3.41e-07 3.61e-07 9.79e-07 1.04e-06 1.17e-06 5.38e-07 5.67e-07 6.58e-07 1.93e-06 1.33e-06 8.07e-07 2.43e-06 9.19e-07 1.03e-06 8.36e-07 1.65e-06 1.26e-06 8.49e-07 2.45e-07 3.76e-07 6.49e-07 6.46e-07 5.42e-07 6.87e-07 3.65e-07 4.82e-07 2.29e-07 3.05e-07 1.95e-06 2.92e-07 1.32e-07 3.91e-07 2.3e-07 3.2e-07 1.44e-07 3.01e-07