Genes within 1Mb (chr6:133070776:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 1.05e-01 0.272 0.167 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0634 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.119 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0306 0.072 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0457 0.152 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0477 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.72e-01 0.0349 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0877 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0707 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.81e-01 0.0398 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.25e-01 -0.042 0.119 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.49e-03 -0.417 0.136 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.51e-01 0.00293 0.0476 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 3.05e-01 0.178 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 5.02e-01 0.0899 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.41e-02 -0.31 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0866 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0337 0.137 0.079 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -32352 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0822 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0529 0.0644 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.42e-01 0.0421 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00342 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.91e-01 -0.106 0.153 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 2.14e-02 0.145 0.0627 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.11e-01 0.25 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.99e-01 0.0478 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 8.26e-02 -0.259 0.149 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 6.51e-01 0.0268 0.0593 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 8.78e-01 -0.025 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 8.88e-04 0.593 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 2.33e-01 -0.197 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0591 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0882 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0446 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 3.55e-01 0.093 0.1 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.22e-01 -0.234 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0924 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.52e-01 0.239 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.26e-02 -0.311 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 7.56e-01 0.048 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0764 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 4.88e-01 0.103 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.18e-01 0.251 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 1.53e-02 0.427 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.54e-01 0.0243 0.0774 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00256 0.15 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0992 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0857 0.109 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 3.53e-02 0.354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 1.48e-02 0.399 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0897 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0335 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0576 0.0871 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.44e-01 -0.243 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 5.37e-01 0.0713 0.115 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.29e-01 -0.08 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0935 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00477 0.0765 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 7.47e-01 0.0424 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0641 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0775 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0482 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 7.26e-01 0.049 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 6.72e-01 0.0306 0.0723 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.65e-01 -0.122 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 8.52e-02 0.299 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.47e-01 0.0564 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0123 0.0686 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 5.16e-01 0.0948 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0975 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.67e-03 -0.482 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.083 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.40e-01 0.0534 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 2.51e-02 -0.35 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.71e-01 -0.159 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 5.64e-01 0.0478 0.0827 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.83e-01 0.0767 0.188 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0721 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.00e-01 0.221 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0643 0.084 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.79e-01 0.247 0.183 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 3.56e-02 -0.335 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.35e-01 -0.137 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0934 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 6.27e-01 -0.086 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 9.23e-01 0.0156 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0665 0.0805 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0821 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 2.76e-01 -0.178 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 6.98e-02 -0.3 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0924 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.70e-01 0.198 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 5.82e-01 0.0729 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.37e-01 -0.129 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 1.15e-02 0.165 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.99e-01 0.0672 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 9.85e-01 0.00294 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 5.55e-03 0.205 0.0729 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 3.70e-01 -0.133 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0513 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.57e-01 -0.183 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 2.55e-01 0.0997 0.0873 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00478 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0619 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0376 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 2.56e-01 -0.199 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.14e-01 0.0836 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0879 0.0613 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 2.84e-01 -0.187 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 1.75e-01 0.242 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 7.28e-01 0.0484 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 3.87e-01 0.142 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.05e-01 0.00946 0.0788 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -32352 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0907 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.00e-01 0.0719 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 3.54e-01 0.136 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 5.44e-01 -0.09 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0236 0.0659 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 9.63e-01 0.00588 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0342 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.35e-02 -0.227 0.112 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 6.98e-01 0.0548 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0998 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0416 0.0722 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.83e-01 -0.14 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 9.81e-01 0.00539 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0842 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 7.32e-01 0.0747 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 8.33e-02 0.276 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 7.15e-01 0.056 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 1.05e-02 -0.388 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 6.66e-01 0.0291 0.0674 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.67e-01 0.227 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.79e-02 -0.304 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 5.53e-01 0.0945 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0321 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0314 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0459 0.0761 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 5.06e-01 0.0896 0.134 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 6.50e-01 0.0918 0.202 0.082 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.137 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0881 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00263 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 2.24e-01 -0.203 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -32352 sc-eQTL 4.43e-01 0.123 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 3.45e-01 -0.159 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 6.65e-01 0.0708 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0923 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 3.76e-01 0.0738 0.0832 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 4.39e-02 0.323 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 669301 sc-eQTL 2.46e-03 0.529 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 6.95e-01 0.0284 0.0724 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0623 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.32e-01 0.00731 0.085 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 1.92e-01 -0.209 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 938888 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 7.59e-01 0.0384 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 4.47e-02 -0.174 0.0864 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 2.10e-01 -0.186 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0976 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00865 0.0672 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0569 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 5.57e-01 0.0628 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 336011 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0876 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 356721 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00364 0.0622 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 257437 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -881394 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 557578 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 307317 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0988 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 256207 sc-eQTL 1.21e-02 0.159 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 669301 eQTL 0.00187 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 356721 pQTL 2.3e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 669301 5.74e-07 7.58e-07 2.92e-07 2.66e-07 1.03e-07 1.54e-07 4.05e-07 5.62e-08 2.6e-07 1.6e-07 3.92e-07 3.48e-07 6.77e-07 1.59e-07 2.77e-07 1.92e-07 5.41e-07 3.82e-07 1.77e-07 7.4e-08 1.92e-07 3.49e-07 2.77e-07 4.91e-08 6.87e-07 2.46e-07 1.57e-07 2.71e-07 2.98e-07 3.39e-07 1.93e-07 8.37e-08 5.39e-08 1.69e-07 2.7e-07 7.86e-08 4.54e-07 1.06e-07 3.82e-08 3.05e-08 2.84e-08 4.02e-07 6.18e-08 1.92e-08 3.71e-08 1.46e-08 1.04e-07 7.35e-08 5.58e-08