logo

Genes within 1Mb (chr6:133069989:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 1.05e-01 0.272 0.167 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0634 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.119 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0306 0.072 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0457 0.152 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0477 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.72e-01 0.0349 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0877 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0707 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.81e-01 0.0398 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.25e-01 -0.042 0.119 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.49e-03 -0.417 0.136 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.51e-01 0.00293 0.0476 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 3.05e-01 0.178 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 5.02e-01 0.0899 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.41e-02 -0.31 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0866 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0337 0.137 0.079 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -33139 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0822 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0529 0.0644 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.42e-01 0.0421 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00342 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.91e-01 -0.106 0.153 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 2.14e-02 0.145 0.0627 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.11e-01 0.25 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.99e-01 0.0478 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 8.26e-02 -0.259 0.149 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 6.51e-01 0.0268 0.0593 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 8.78e-01 -0.025 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 8.88e-04 0.593 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 2.33e-01 -0.197 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0591 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0882 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0446 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 3.55e-01 0.093 0.1 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.22e-01 -0.234 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0924 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.52e-01 0.239 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.26e-02 -0.311 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 7.56e-01 0.048 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0764 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 4.88e-01 0.103 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.18e-01 0.251 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 1.53e-02 0.427 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.54e-01 0.0243 0.0774 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00256 0.15 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0992 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0857 0.109 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 3.53e-02 0.354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 1.48e-02 0.399 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0897 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0335 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0576 0.0871 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.44e-01 -0.243 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 5.37e-01 0.0713 0.115 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.29e-01 -0.08 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0935 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00477 0.0765 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 7.47e-01 0.0424 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0641 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0775 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0482 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 7.26e-01 0.049 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 6.72e-01 0.0306 0.0723 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.65e-01 -0.122 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 8.52e-02 0.299 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.47e-01 0.0564 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0123 0.0686 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 5.16e-01 0.0948 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0975 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.67e-03 -0.482 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.083 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.40e-01 0.0534 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 2.51e-02 -0.35 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.71e-01 -0.159 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 5.64e-01 0.0478 0.0827 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.83e-01 0.0767 0.188 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0721 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.00e-01 0.221 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0643 0.084 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.79e-01 0.247 0.183 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 3.56e-02 -0.335 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.35e-01 -0.137 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0934 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 6.27e-01 -0.086 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 9.23e-01 0.0156 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0665 0.0805 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0821 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 2.76e-01 -0.178 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 6.98e-02 -0.3 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0924 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.70e-01 0.198 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 5.82e-01 0.0729 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.37e-01 -0.129 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 1.15e-02 0.165 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.99e-01 0.0672 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 9.85e-01 0.00294 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 5.55e-03 0.205 0.0729 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 3.70e-01 -0.133 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0513 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.57e-01 -0.183 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 2.55e-01 0.0997 0.0873 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00478 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0619 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0376 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 2.56e-01 -0.199 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.14e-01 0.0836 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0879 0.0613 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 2.84e-01 -0.187 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 1.75e-01 0.242 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 7.28e-01 0.0484 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 3.87e-01 0.142 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.05e-01 0.00946 0.0788 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -33139 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0907 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.00e-01 0.0719 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 3.54e-01 0.136 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 5.44e-01 -0.09 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0236 0.0659 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 9.63e-01 0.00588 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0342 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.35e-02 -0.227 0.112 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 6.98e-01 0.0548 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0998 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0416 0.0722 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.83e-01 -0.14 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 9.81e-01 0.00539 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0842 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 7.32e-01 0.0747 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 8.33e-02 0.276 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 7.15e-01 0.056 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 1.05e-02 -0.388 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 6.66e-01 0.0291 0.0674 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.67e-01 0.227 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.79e-02 -0.304 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 5.53e-01 0.0945 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0321 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0314 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0459 0.0761 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 5.06e-01 0.0896 0.134 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 6.50e-01 0.0918 0.202 0.082 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.137 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0881 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00263 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 2.24e-01 -0.203 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -33139 sc-eQTL 4.43e-01 0.123 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 3.45e-01 -0.159 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 6.65e-01 0.0708 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0923 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 3.76e-01 0.0738 0.0832 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 4.39e-02 0.323 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 668514 sc-eQTL 2.46e-03 0.529 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 6.95e-01 0.0284 0.0724 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0623 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.32e-01 0.00731 0.085 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 1.92e-01 -0.209 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 938101 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 7.59e-01 0.0384 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 4.47e-02 -0.174 0.0864 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 2.10e-01 -0.186 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0976 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00865 0.0672 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0569 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 5.57e-01 0.0628 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 335224 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0876 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 355934 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00364 0.0622 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 256650 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -882181 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 556791 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 306530 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0988 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 255420 sc-eQTL 1.21e-02 0.159 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 668514 eQTL 0.00188 0.184 0.059 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 355934 pQTL 2.3e-06 -0.318 0.067 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 668514 3.07e-07 1.59e-07 6.57e-08 3.43e-07 1.03e-07 1.03e-07 1.99e-07 5.75e-08 1.86e-07 1.05e-07 1.69e-07 1.2e-07 4.27e-07 8.15e-08 5.69e-08 9.11e-08 4.25e-08 1.56e-07 7.27e-08 6.02e-08 1.23e-07 1.65e-07 1.64e-07 4.37e-08 2.17e-07 1.31e-07 1.25e-07 1.26e-07 1.26e-07 1.38e-07 1.09e-07 5.54e-08 3.38e-08 1.21e-07 1.56e-07 4.86e-08 6.77e-08 6.66e-08 5.7e-08 2.8e-08 5.09e-08 1.59e-07 4.76e-08 1.8e-08 2.64e-08 1.29e-08 7.92e-08 0.0 4.83e-08