Genes within 1Mb (chr6:133061361:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0377 0.111 0.162 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 7.29e-01 0.0406 0.117 0.162 B L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0109 0.0442 0.162 B L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 4.23e-02 0.168 0.0824 0.162 B L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.75e-01 0.0549 0.0502 0.162 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.81e-01 0.0436 0.106 0.162 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00665 0.0695 0.162 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 9.35e-02 0.136 0.0804 0.162 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0624 0.0841 0.162 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 6.36e-01 0.0346 0.0729 0.162 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 3.77e-01 0.0438 0.0495 0.162 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0459 0.1 0.162 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.67e-01 0.0586 0.0804 0.162 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 8.22e-01 -0.019 0.0841 0.162 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0651 0.0981 0.162 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 3.33e-01 0.0325 0.0335 0.162 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 8.85e-01 0.0147 0.101 0.162 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 2.58e-01 -0.14 0.124 0.164 DC L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 7.28e-01 0.0268 0.077 0.164 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 1.50e-01 0.137 0.0951 0.164 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0809 0.103 0.164 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.86e-01 0.118 0.11 0.164 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0188 0.0619 0.164 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 1.94e-01 -0.127 0.0975 0.164 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -41767 sc-eQTL 8.99e-01 0.0113 0.0891 0.164 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 1.95e-01 0.11 0.085 0.162 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0403 0.057 0.162 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0438 0.0979 0.162 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 2.00e-01 -0.135 0.105 0.162 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 1.51e-01 -0.107 0.074 0.162 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0612 0.0444 0.162 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0106 0.0882 0.162 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 2.37e-01 0.11 0.0929 0.163 NK L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 3.40e-02 -0.182 0.0853 0.163 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 1.28e-01 -0.163 0.107 0.163 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 8.65e-01 -0.00758 0.0444 0.163 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0715 0.108 0.162 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 6.58e-01 0.0377 0.0849 0.162 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 3.80e-01 0.0903 0.103 0.162 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 3.50e-01 0.0381 0.0407 0.162 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 2.42e-01 -0.13 0.111 0.162 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0808 0.126 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 2.94e-01 0.121 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0625 0.108 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 4.93e-01 0.0788 0.115 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 4.32e-01 0.0484 0.0615 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 8.38e-01 0.0221 0.108 0.161 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 3.51e-01 -0.096 0.103 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 8.43e-01 0.0239 0.12 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 2.14e-01 0.131 0.105 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00497 0.0692 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 3.25e-01 0.103 0.104 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 4.60e-01 0.0472 0.0637 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.19e-01 0.0572 0.115 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 2.13e-01 -0.122 0.0973 0.163 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 8.88e-02 -0.194 0.114 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00679 0.106 0.162 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0138 0.0828 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0687 0.108 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 4.73e-01 0.0375 0.0521 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 1.75e-01 -0.148 0.108 0.162 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 1.12e-01 -0.161 0.101 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.68e-01 0.0819 0.113 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0768 0.124 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 6.99e-01 -0.021 0.0542 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.46e-01 0.122 0.105 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 3.14e-01 0.0604 0.0598 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0693 0.116 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0467 0.0765 0.162 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0197 0.118 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 4.71e-01 0.0833 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0655 0.0628 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.33e-02 0.223 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.64e-01 0.0683 0.061 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 1.28e-01 0.177 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0533 0.0808 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 9.24e-01 -0.011 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0353 0.115 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0238 0.116 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 1.27e-01 0.0815 0.0531 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.32e-01 0.00914 0.108 0.164 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.44e-01 0.0564 0.0927 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0295 0.091 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 4.75e-01 0.0602 0.0842 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.91e-01 0.0577 0.0545 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00548 0.105 0.162 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 1.54e-01 0.141 0.0987 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 1.97e-01 -0.129 0.0995 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.74e-01 -0.108 0.0981 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 6.48e-01 0.0233 0.051 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0337 0.118 0.162 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.83e-01 -0.08 0.114 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 1.35e-01 -0.17 0.114 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 3.88e-02 0.226 0.108 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.70e-01 0.0495 0.0448 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0617 0.112 0.162 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 9.67e-02 0.168 0.101 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 4.78e-01 0.0672 0.0945 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.63e-02 -0.204 0.107 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 4.84e-01 0.0403 0.0574 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0474 0.111 0.162 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 6.02e-01 0.0565 0.108 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0426 0.115 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0365 0.0994 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 6.78e-01 0.0237 0.0569 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 5.63e-02 0.217 0.113 0.162 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 9.99e-03 -0.314 0.121 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 8.70e-01 0.0186 0.114 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.77e-02 -0.247 0.111 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 5.57e-01 0.0322 0.0549 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 3.92e-01 0.103 0.12 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.73e-01 0.0781 0.109 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 5.52e-01 0.0706 0.119 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0247 0.118 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0126 0.0635 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.75e-01 0.0505 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0694 0.115 0.162 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 2.54e-01 0.124 0.109 0.162 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 8.72e-02 0.189 0.11 0.162 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.73e-01 0.0598 0.0544 0.162 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 2.97e-01 -0.119 0.114 0.162 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.62e-01 0.0714 0.123 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00122 0.114 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 8.00e-02 0.202 0.115 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 8.48e-01 0.0124 0.0645 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.0992 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 2.35e-02 -0.206 0.0901 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 1.02e-01 -0.186 0.113 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 7.81e-01 0.0126 0.0453 0.164 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 3.61e-01 -0.111 0.121 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 2.81e-01 -0.119 0.11 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0374 0.112 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0104 0.0521 0.164 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.10e-01 0.0857 0.104 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 3.64e-01 -0.0914 0.1 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 1.20e-01 -0.176 0.113 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 3.01e-01 0.0636 0.0613 0.164 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 3.51e-01 0.141 0.151 0.152 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 6.48e-02 -0.237 0.127 0.152 PB L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 4.80e-01 0.0761 0.108 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.00e-01 0.0889 0.131 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0212 0.0747 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 2.05e-01 -0.177 0.139 0.152 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0853 0.0918 0.152 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.89e-01 0.0791 0.114 0.165 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0155 0.102 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0652 0.109 0.165 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 6.10e-01 0.0211 0.0414 0.165 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 3.51e-01 -0.1 0.107 0.165 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.28e-01 0.0931 0.117 0.162 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 6.38e-01 0.0522 0.111 0.162 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 6.61e-01 -0.041 0.0932 0.162 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 6.23e-01 0.0203 0.0412 0.162 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0509 0.116 0.162 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0897 0.123 0.168 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0601 0.0969 0.168 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 3.65e-02 0.201 0.0952 0.168 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 3.32e-01 -0.11 0.113 0.168 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 7.43e-01 0.0362 0.11 0.168 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 8.34e-01 0.0114 0.0545 0.168 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 8.00e-01 0.0274 0.108 0.168 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -41767 sc-eQTL 2.70e-01 0.0951 0.086 0.168 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 2.08e-01 0.123 0.0976 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 6.65e-02 -0.136 0.0737 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 7.74e-01 0.0301 0.105 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0536 0.106 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0334 0.0847 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0586 0.0469 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00844 0.0908 0.162 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000979 0.11 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 9.32e-01 0.00686 0.0798 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0709 0.0995 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0979 0.108 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 3.03e-01 -0.073 0.0707 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0372 0.051 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 4.58e-01 0.0701 0.0943 0.162 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 3.37e-01 -0.146 0.152 0.164 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0665 0.131 0.164 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0198 0.145 0.164 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.84e-01 0.0592 0.0551 0.164 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 3.57e-01 -0.132 0.143 0.164 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.93e-01 0.0601 0.112 0.16 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0101 0.107 0.16 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0553 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0719 0.107 0.16 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 9.40e-02 0.182 0.108 0.16 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 7.52e-01 0.015 0.0473 0.16 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.69e-02 -0.191 0.114 0.16 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 3.32e-01 0.115 0.118 0.161 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0563 0.0799 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 1.78e-01 0.152 0.112 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 3.52e-02 -0.235 0.111 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 1.22e-01 -0.166 0.107 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00411 0.054 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0999 0.0952 0.161 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 1.75e-01 -0.188 0.138 0.164 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 3.92e-01 0.0793 0.0923 0.164 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 6.57e-01 0.0414 0.0931 0.164 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0153 0.0948 0.164 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0416 0.113 0.164 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 5.89e-01 -0.042 0.0776 0.164 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 4.28e-02 -0.232 0.114 0.164 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -41767 sc-eQTL 5.43e-01 -0.067 0.11 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0874 0.116 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 6.69e-01 0.0484 0.113 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0186 0.0641 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.74e-01 0.111 0.101 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 1.93e-01 0.0752 0.0575 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00584 0.106 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0864 0.102 0.162 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 5.45e-01 0.0685 0.113 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 659886 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0112 0.124 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0519 0.0508 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 4.36e-02 0.199 0.0979 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 2.55e-01 0.068 0.0597 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.55e-01 0.0505 0.113 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 929473 sc-eQTL 6.16e-01 -0.036 0.0717 0.162 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 3.48e-01 0.0832 0.0884 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0545 0.0615 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0213 0.1 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0486 0.105 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 4.27e-01 -0.055 0.0691 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 9.82e-02 -0.0784 0.0472 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 6.04e-01 0.0438 0.0844 0.162 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 2.81e-01 0.124 0.115 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0467 0.0757 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 326596 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0222 0.111 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 347306 sc-eQTL 2.37e-02 -0.249 0.109 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 2.22e-01 -0.127 0.104 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 5.38e-01 0.0272 0.0442 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 sc-eQTL 4.69e-02 -0.212 0.106 0.164 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -890809 sc-eQTL 1.77e-01 0.124 0.0917 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 548163 sc-eQTL 2.30e-02 -0.196 0.0854 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 297902 sc-eQTL 7.77e-02 -0.193 0.109 0.164 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 246792 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0115 0.0447 0.164 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 659886 eQTL 0.0237 -0.0859 0.0379 0.0 0.0 0.172
ENSG00000112303 VNN2 297902 pQTL 0.0268 -0.0722 0.0326 0.0 0.0 0.17
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 eQTL 9.51e-07 -0.137 0.0278 0.0 0.0 0.172


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 SLC18B1 248022 1.3e-06 9.83e-07 3.43e-07 1.15e-06 3.23e-07 5.4e-07 1.46e-06 3.66e-07 1.49e-06 4.52e-07 1.89e-06 7.5e-07 2.5e-06 2.87e-07 5.65e-07 9.33e-07 9.14e-07 7.78e-07 8.21e-07 6.34e-07 5.61e-07 1.6e-06 8.94e-07 5.61e-07 2.31e-06 4.23e-07 9.02e-07 6.93e-07 1.47e-06 1.2e-06 7.64e-07 1.55e-07 2.42e-07 6.95e-07 5.87e-07 4.47e-07 5.12e-07 1.7e-07 4.2e-07 3.12e-07 2.82e-07 1.65e-06 6.13e-08 4.23e-08 3.1e-07 1.22e-07 2.26e-07 7.75e-08 1.11e-07