logo

Genes within 1Mb (chr6:133053375:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.73e-01 0.217 0.159 0.079 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 1.05e-01 0.272 0.167 0.079 B L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.60e-01 0.0279 0.0634 0.079 B L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.55e-01 -0.169 0.119 0.079 B L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0306 0.072 0.079 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0457 0.152 0.079 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0479 0.0995 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0477 0.115 0.079 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.72e-01 0.0349 0.12 0.079 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0877 0.104 0.079 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0191 0.0707 0.079 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.81e-01 0.0398 0.143 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 2.00e-01 -0.146 0.114 0.079 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.25e-01 -0.042 0.119 0.079 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.49e-03 -0.417 0.136 0.079 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.51e-01 0.00293 0.0476 0.079 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.12e-01 0.118 0.144 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 3.05e-01 0.178 0.173 0.079 DC L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 3.08e-01 -0.11 0.108 0.079 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 5.02e-01 0.0899 0.134 0.079 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 2.05e-01 0.183 0.144 0.079 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.41e-02 -0.31 0.153 0.079 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.79e-01 0.00225 0.0866 0.079 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0337 0.137 0.079 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -49753 sc-eQTL 9.69e-01 0.00481 0.125 0.079 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0145 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 1.86e-01 -0.109 0.0822 0.079 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 3.88e-01 0.122 0.141 0.079 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 2.30e-01 -0.183 0.152 0.079 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 3.33e-01 -0.104 0.107 0.079 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0529 0.0644 0.079 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.42e-01 0.0421 0.128 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00342 0.133 0.079 NK L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 9.35e-01 -0.01 0.123 0.079 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.91e-01 -0.106 0.153 0.079 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 2.14e-02 0.145 0.0627 0.079 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.11e-01 0.25 0.156 0.079 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.99e-01 0.0478 0.124 0.079 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 8.26e-02 -0.259 0.149 0.079 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 6.51e-01 0.0268 0.0593 0.079 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 8.78e-01 -0.025 0.162 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 8.88e-04 0.593 0.175 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 2.33e-01 -0.197 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 9.82e-01 0.00356 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0591 0.165 0.082 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0775 0.0882 0.082 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0446 0.155 0.082 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 8.65e-01 0.0251 0.148 0.082 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 4.73e-01 -0.126 0.175 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0576 0.154 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 3.55e-01 0.093 0.1 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.22e-01 -0.234 0.151 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 1.66e-01 0.129 0.0924 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.52e-01 0.239 0.166 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 1.07e-01 0.228 0.141 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.26e-02 -0.311 0.166 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 7.56e-01 0.048 0.154 0.08 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.46e-01 0.0925 0.121 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.55e-01 -0.119 0.158 0.08 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.20e-01 0.0174 0.0764 0.08 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0255 0.159 0.08 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 4.88e-01 0.103 0.148 0.08 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.18e-01 0.251 0.16 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 1.53e-02 0.427 0.175 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.54e-01 0.0243 0.0774 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00256 0.15 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.65e-01 0.0146 0.0856 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0992 0.165 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0857 0.109 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 3.53e-02 0.354 0.167 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 1.48e-02 0.399 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0137 0.0897 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0335 0.165 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0576 0.0871 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.44e-01 -0.243 0.166 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 5.37e-01 0.0713 0.115 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.29e-01 -0.08 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0665 0.164 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0935 0.165 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00477 0.0765 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 5.17e-01 0.1 0.154 0.077 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 7.47e-01 0.0424 0.132 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 3.30e-01 0.126 0.129 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0641 0.119 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0127 0.0775 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.94e-01 0.102 0.149 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0138 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0482 0.142 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 7.26e-01 0.049 0.139 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 6.72e-01 0.0306 0.0723 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.65e-01 -0.122 0.167 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 8.52e-02 0.299 0.173 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.47e-01 0.0564 0.174 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.39e-01 -0.197 0.167 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0123 0.0686 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.72e-01 0.123 0.17 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 5.16e-01 0.0948 0.146 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0975 0.136 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.67e-03 -0.482 0.151 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0024 0.083 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.40e-01 0.0534 0.161 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 2.51e-02 -0.35 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 2.80e-01 0.181 0.167 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.71e-01 -0.159 0.144 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 5.64e-01 0.0478 0.0827 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 3.95e-01 0.141 0.166 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.83e-01 0.0767 0.188 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0721 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.00e-01 0.221 0.172 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0643 0.084 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.79e-01 0.247 0.183 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 3.56e-02 -0.335 0.158 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.35e-01 -0.137 0.174 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.09e-01 -0.278 0.173 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000538 0.0934 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 6.27e-01 -0.086 0.177 0.078 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 5.38e-01 0.104 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 9.23e-01 0.0156 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 8.64e-01 0.028 0.164 0.08 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0665 0.0805 0.08 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 5.03e-01 -0.113 0.169 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0821 0.176 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 2.76e-01 -0.178 0.163 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 6.98e-02 -0.3 0.165 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0117 0.0924 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.70e-01 0.198 0.144 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 5.82e-01 0.0729 0.132 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.37e-01 -0.129 0.165 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 1.15e-02 0.165 0.0647 0.08 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.99e-01 0.0672 0.173 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 5.75e-01 0.0884 0.158 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 9.85e-01 0.00294 0.16 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 5.55e-03 0.205 0.0729 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 3.70e-01 -0.133 0.148 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0513 0.144 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.57e-01 -0.183 0.161 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 2.55e-01 0.0997 0.0873 0.08 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0311 0.197 0.085 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 9.28e-01 0.0152 0.168 0.085 PB L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.93e-01 0.0965 0.14 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 8.88e-01 0.0242 0.172 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 6.87e-01 0.0394 0.0973 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 3.90e-01 -0.157 0.182 0.085 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 2.83e-01 0.129 0.119 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.91e-01 -0.223 0.17 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00478 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.24e-01 -0.251 0.163 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0152 0.0619 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0376 0.16 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 2.56e-01 -0.199 0.175 0.079 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.14e-01 0.0836 0.166 0.079 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 3.97e-01 0.118 0.139 0.079 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0879 0.0613 0.079 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 2.84e-01 -0.187 0.174 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 1.75e-01 0.242 0.178 0.08 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 9.76e-01 0.00418 0.14 0.08 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 7.28e-01 0.0484 0.139 0.08 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 3.87e-01 0.142 0.163 0.08 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 9.15e-02 -0.269 0.158 0.08 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.05e-01 0.00946 0.0788 0.08 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.75e-01 0.112 0.156 0.08 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -49753 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0907 0.125 0.08 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.00e-01 0.0719 0.137 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 2.61e-01 -0.117 0.104 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 3.54e-01 0.136 0.147 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 5.44e-01 -0.09 0.148 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 2.09e-01 -0.149 0.118 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0236 0.0659 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 9.63e-01 0.00588 0.127 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0342 0.156 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.35e-02 -0.227 0.112 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 6.98e-01 0.0548 0.141 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 5.14e-02 -0.298 0.152 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.10e-01 -0.16 0.0998 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0416 0.0722 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0198 0.134 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 2.28e-01 0.28 0.231 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.83e-01 -0.14 0.2 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 9.81e-01 0.00539 0.221 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0842 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 7.32e-01 0.0747 0.218 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 8.33e-02 0.276 0.159 0.082 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 7.15e-01 0.056 0.153 0.082 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 4.23e-01 -0.124 0.154 0.082 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 1.05e-02 -0.388 0.15 0.082 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.92e-01 -0.107 0.155 0.082 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 6.66e-01 0.0291 0.0674 0.082 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.67e-01 0.227 0.163 0.082 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.79e-02 -0.304 0.165 0.081 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 2.64e-01 0.126 0.112 0.081 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 5.53e-01 0.0945 0.159 0.081 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0321 0.158 0.081 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0314 0.152 0.081 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0459 0.0761 0.081 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 5.06e-01 0.0896 0.134 0.081 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 6.50e-01 0.0918 0.202 0.082 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 1.51e-01 -0.192 0.133 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 2.66e-01 0.15 0.135 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 4.52e-01 0.103 0.137 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0881 0.164 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00263 0.113 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 2.24e-01 -0.203 0.166 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -49753 sc-eQTL 4.43e-01 0.123 0.159 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 3.45e-01 -0.159 0.168 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 6.65e-01 0.0708 0.163 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.06e-01 0.0769 0.0923 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 4.79e-02 -0.288 0.145 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 3.76e-01 0.0738 0.0832 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.27e-01 0.233 0.152 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 8.22e-01 0.0332 0.148 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 4.39e-02 0.323 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 651900 sc-eQTL 2.46e-03 0.529 0.173 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 6.95e-01 0.0284 0.0724 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0623 0.14 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.32e-01 0.00731 0.085 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 1.92e-01 -0.209 0.16 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 921487 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0526 0.102 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 7.59e-01 0.0384 0.125 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 4.47e-02 -0.174 0.0864 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 3.62e-01 0.129 0.142 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 2.10e-01 -0.186 0.148 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.69e-01 -0.135 0.0976 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 8.98e-01 -0.00865 0.0672 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 9.06e-01 0.0141 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0569 0.162 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 5.57e-01 0.0628 0.107 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 318610 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0876 0.157 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 339320 sc-eQTL 5.16e-01 -0.101 0.155 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 1.98e-01 -0.189 0.146 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00364 0.0622 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 240036 sc-eQTL 4.36e-01 0.118 0.151 0.08 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -898795 sc-eQTL 4.94e-01 0.0901 0.132 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 540177 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0166 0.124 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 289916 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0988 0.156 0.08 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 238806 sc-eQTL 1.21e-02 0.159 0.0629 0.08 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 651900 eQTL 0.00187 0.184 0.0591 0.0 0.0 0.0702
ENSG00000112299 VNN1 339320 pQTL 2.3e-06 -0.318 0.0671 0.0 0.0 0.0712

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 651900 4.68e-07 2.4e-07 7.45e-08 2.44e-07 1.03e-07 1.28e-07 3.42e-07 6.72e-08 2.04e-07 1.21e-07 2.62e-07 1.91e-07 3.77e-07 8.26e-08 7.79e-08 1.13e-07 7.3e-08 2.66e-07 8e-08 8.87e-08 1.39e-07 2.15e-07 2.04e-07 5.11e-08 3.41e-07 1.71e-07 1.37e-07 1.48e-07 1.54e-07 2.1e-07 1.52e-07 4.75e-08 4.76e-08 9.09e-08 1.01e-07 4.77e-08 5.96e-08 7.1e-08 4.9e-08 8.2e-08 3.43e-08 2.41e-07 3.13e-08 7.37e-09 5.84e-08 1.01e-08 9.23e-08 0.0 4.68e-08