logo

Genes within 1Mb (chr6:133042854:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 2.73e-01 0.17 0.155 0.075 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 1.44e-01 0.24 0.163 0.075 B L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 3.42e-01 0.0588 0.0618 0.075 B L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0924 0.116 0.075 B L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 2.01e-02 0.163 0.0695 0.075 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.55e-01 0.0662 0.148 0.075 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 1.52e-01 0.139 0.0967 0.075 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 9.41e-01 0.00851 0.115 0.075 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.26e-03 0.33 0.117 0.075 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 1.86e-01 -0.136 0.103 0.075 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0116 0.0701 0.075 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0385 0.142 0.075 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 2.74e-01 0.123 0.112 0.075 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.02e-02 0.3 0.116 0.075 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0281 0.137 0.075 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 3.48e-01 0.044 0.0468 0.075 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0499 0.142 0.075 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 9.39e-02 -0.305 0.181 0.074 DC L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 3.60e-01 0.104 0.113 0.074 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 6.92e-01 0.0558 0.141 0.074 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 6.03e-01 0.079 0.152 0.074 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0721 0.162 0.074 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.39e-02 0.162 0.0904 0.074 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.39e-01 0.0481 0.144 0.074 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -60274 sc-eQTL 2.50e-01 0.151 0.131 0.074 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 9.64e-01 0.00551 0.122 0.075 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.25e-01 0.0521 0.0818 0.075 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0189 0.14 0.075 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 1.70e-01 -0.207 0.151 0.075 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.93e-01 -0.112 0.106 0.075 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.55e-01 0.02 0.0639 0.075 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.31e-01 0.151 0.126 0.075 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 5.57e-01 0.0775 0.132 0.075 NK L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.122 0.075 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.59e-01 -0.171 0.151 0.075 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.69e-01 0.0104 0.0628 0.075 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0537 0.156 0.075 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0383 0.123 0.075 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 9.55e-01 0.00841 0.149 0.075 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 6.47e-01 -0.027 0.059 0.075 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 1.95e-01 0.209 0.161 0.075 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 4.46e-01 -0.144 0.188 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 9.07e-01 0.0202 0.172 0.074 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.09e-01 0.107 0.161 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.02e-03 -0.459 0.168 0.074 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 2.30e-01 0.11 0.0916 0.074 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 5.30e-01 0.101 0.161 0.074 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 4.71e-01 0.111 0.153 0.074 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.24e-01 -0.17 0.172 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 4.17e-01 0.123 0.151 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0535 0.0991 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0348 0.149 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.05e-01 0.148 0.0909 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0851 0.165 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 3.17e-01 -0.14 0.14 0.075 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.37e-01 0.158 0.164 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 2.25e-01 0.184 0.151 0.073 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.87e-01 0.157 0.119 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.80e-01 -0.137 0.156 0.073 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.97e-01 0.097 0.0749 0.073 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0383 0.157 0.073 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 7.05e-01 0.0554 0.146 0.073 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 5.45e-01 0.0948 0.156 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 3.62e-01 0.157 0.172 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 6.64e-01 0.0326 0.0752 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0546 0.146 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.58e-01 0.117 0.0828 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.73e-01 0.176 0.16 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 2.19e-01 0.131 0.106 0.075 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 1.61e-01 0.231 0.164 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 5.18e-01 0.104 0.16 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.19e-01 0.136 0.087 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0276 0.161 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.16e-01 0.133 0.0845 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 3.90e-01 -0.139 0.162 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 5.93e-01 0.0601 0.112 0.075 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0689 0.163 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 7.69e-01 0.0478 0.162 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.58e-01 0.151 0.163 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.27e-01 0.0165 0.0757 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0293 0.153 0.075 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0943 0.131 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 3.29e-02 0.273 0.127 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 1.68e-01 -0.164 0.119 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.53e-01 0.0244 0.0773 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0143 0.149 0.075 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 1.01e-01 0.23 0.14 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 8.16e-03 0.372 0.139 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0195 0.14 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.45e-01 0.0142 0.0723 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 3.83e-01 -0.146 0.167 0.075 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 2.42e-01 0.192 0.163 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.30e-01 -0.13 0.164 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0558 0.157 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 5.04e-01 0.0432 0.0645 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.85e-01 0.0439 0.161 0.075 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 8.34e-01 -0.03 0.143 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.75e-01 0.182 0.133 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 4.78e-01 -0.108 0.152 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 6.47e-01 0.0374 0.0815 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.70e-01 0.0673 0.158 0.075 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 1.24e-01 0.236 0.153 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.31e-02 0.316 0.162 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 1.01e-01 0.231 0.141 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.19e-01 0.0292 0.081 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.67e-01 -0.07 0.162 0.075 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 9.23e-01 -0.0168 0.173 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0658 0.16 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0584 0.159 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 4.36e-02 0.156 0.0768 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0355 0.17 0.079 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0711 0.158 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.43e-01 0.132 0.172 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 5.42e-01 -0.105 0.171 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 6.72e-01 0.0391 0.0921 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 9.87e-01 0.00278 0.174 0.075 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 5.11e-01 -0.108 0.164 0.076 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.18e-01 0.101 0.156 0.076 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.40e-01 -0.152 0.158 0.076 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 6.45e-01 0.036 0.0781 0.076 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.99e-01 0.0418 0.164 0.076 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.98e-01 0.067 0.172 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.63e-01 0.118 0.16 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0497 0.162 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00685 0.0905 0.076 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.64e-01 0.0616 0.141 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 7.85e-01 0.0354 0.13 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 9.74e-01 -0.0052 0.162 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 4.62e-01 0.0473 0.0642 0.075 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 9.91e-01 0.00201 0.172 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.06e-01 0.253 0.156 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.90e-02 -0.326 0.157 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 4.96e-01 0.0504 0.0738 0.078 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 5.37e-01 0.091 0.147 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 8.23e-01 0.032 0.142 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.77e-01 -0.142 0.16 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 4.52e-01 0.0654 0.0868 0.075 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.83e-01 -0.184 0.21 0.074 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 6.60e-01 0.0793 0.18 0.074 PB L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.47e-01 0.217 0.149 0.074 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.91e-01 -0.157 0.183 0.074 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0256 0.104 0.074 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.06e-01 -0.246 0.194 0.074 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0695 0.128 0.074 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0234 0.164 0.074 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0865 0.146 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 6.65e-01 0.068 0.157 0.074 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0554 0.0592 0.074 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.65e-01 0.171 0.153 0.074 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0961 0.166 0.075 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.85e-01 -0.208 0.156 0.075 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.76e-01 0.0205 0.132 0.075 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00622 0.0583 0.075 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0202 0.165 0.075 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 2.03e-01 -0.245 0.192 0.071 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.80e-01 -0.107 0.151 0.071 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 3.08e-01 0.153 0.15 0.071 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00197 0.177 0.071 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 4.58e-01 -0.128 0.172 0.071 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0318 0.0851 0.071 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 4.90e-01 -0.117 0.168 0.071 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -60274 sc-eQTL 1.07e-01 0.217 0.134 0.071 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.81e-01 -0.122 0.139 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 9.74e-01 0.00351 0.106 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 2.26e-01 -0.181 0.149 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 2.27e-01 -0.182 0.15 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.80e-01 -0.13 0.12 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00207 0.067 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 9.25e-03 0.334 0.127 0.075 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0801 0.158 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.64e-01 0.159 0.114 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 8.67e-01 0.0238 0.142 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 1.29e-01 -0.235 0.154 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.29e-01 -0.122 0.101 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0204 0.0729 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.44e-02 -0.249 0.134 0.075 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 4.32e-01 -0.167 0.212 0.07 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.96e-01 0.236 0.182 0.07 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.23e-01 0.247 0.201 0.07 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0167 0.077 0.07 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.20e-01 0.244 0.198 0.07 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 6.13e-01 0.087 0.172 0.069 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 1.48e-01 0.237 0.163 0.069 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 3.53e-01 0.154 0.165 0.069 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 4.08e-01 0.136 0.164 0.069 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 6.95e-02 -0.302 0.165 0.069 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 3.86e-01 0.0628 0.0724 0.069 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 6.55e-01 0.0789 0.176 0.069 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.52e-01 0.156 0.168 0.075 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.41e-01 0.0695 0.113 0.075 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 8.31e-01 0.0342 0.16 0.075 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 5.08e-01 -0.105 0.159 0.075 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 8.17e-02 -0.266 0.152 0.075 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 5.27e-01 0.0486 0.0767 0.075 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 2.09e-03 0.413 0.132 0.075 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 2.20e-01 -0.249 0.202 0.071 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 5.11e-01 0.0892 0.135 0.071 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0428 0.136 0.071 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 6.14e-01 0.0702 0.139 0.071 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0616 0.165 0.071 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 9.54e-01 0.00652 0.114 0.071 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 7.65e-01 0.0505 0.168 0.071 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -60274 sc-eQTL 2.98e-01 0.168 0.161 0.071 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0331 0.166 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 3.39e-01 0.154 0.16 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 2.42e-01 0.107 0.0908 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 3.36e-01 -0.139 0.144 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.57e-01 0.116 0.0817 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 3.11e-01 -0.153 0.15 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 6.77e-01 0.0606 0.145 0.075 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.45e-01 0.147 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 641379 sc-eQTL 2.07e-01 0.215 0.17 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 2.93e-01 0.0736 0.0699 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0827 0.136 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 1.35e-01 0.123 0.0818 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 8.65e-01 0.0264 0.155 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 910966 sc-eQTL 1.40e-01 0.145 0.0981 0.075 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0914 0.126 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.72e-01 0.0631 0.0876 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 4.50e-01 -0.108 0.143 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 8.15e-02 -0.259 0.148 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.59e-01 -0.111 0.0982 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00304 0.0676 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 4.21e-01 0.0967 0.12 0.075 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 3.08e-01 0.164 0.161 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 2.85e-01 0.113 0.106 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 308089 sc-eQTL 1.52e-01 0.223 0.155 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 328799 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0636 0.155 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.60e-01 -0.164 0.145 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0142 0.0619 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 229515 sc-eQTL 1.22e-01 0.232 0.149 0.075 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -909316 sc-eQTL 7.55e-01 0.0407 0.13 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 529656 sc-eQTL 4.46e-01 0.0933 0.122 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 279395 sc-eQTL 2.62e-01 -0.174 0.155 0.075 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 228285 sc-eQTL 7.35e-01 0.0214 0.0633 0.075 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 308089 eQTL 0.0479 -0.0578 0.0292 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000112299 VNN1 328799 eQTL 0.00111 0.142 0.0433 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000112303 VNN2 279395 pQTL 0.000333 -0.183 0.0508 0.0 0.0 0.0668
ENSG00000112303 VNN2 279395 eQTL 0.00154 -0.082 0.0258 0.0 0.0 0.0682
ENSG00000234484 AL032821.1 290179 eQTL 2.07e-05 0.264 0.0617 0.0 0.0 0.0682

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 328799 1.26e-06 9.44e-07 2.72e-07 4.15e-07 1.54e-07 3.54e-07 8.36e-07 2.88e-07 9.42e-07 3.11e-07 1.15e-06 6.07e-07 1.47e-06 2.29e-07 4.3e-07 5.49e-07 7.47e-07 5.27e-07 3.95e-07 4.13e-07 2.8e-07 7.06e-07 6.1e-07 4.55e-07 1.69e-06 2.54e-07 6.23e-07 4.98e-07 8.16e-07 9.3e-07 4.59e-07 3.67e-08 1.35e-07 3.58e-07 4.28e-07 3.59e-07 3.1e-07 1.55e-07 1.34e-07 8.93e-08 2.75e-07 1.19e-06 5.65e-08 5.87e-09 1.92e-07 7.43e-08 1.83e-07 8.57e-08 4.96e-08
ENSG00000112303 VNN2 279395 1.31e-06 9.53e-07 3.45e-07 1.01e-06 2.76e-07 4.7e-07 1.33e-06 3.54e-07 1.29e-06 4.28e-07 1.48e-06 6.2e-07 1.98e-06 2.79e-07 5.51e-07 8.28e-07 7.97e-07 6.13e-07 6.4e-07 6.84e-07 4.99e-07 1.22e-06 9.21e-07 6.37e-07 2.05e-06 4.11e-07 8.29e-07 7.81e-07 1.24e-06 1.23e-06 6.16e-07 1.55e-07 2.19e-07 6.8e-07 5.85e-07 4.37e-07 5.17e-07 1.92e-07 3.6e-07 2.94e-07 2.83e-07 1.49e-06 6.17e-08 2.64e-08 2.22e-07 1.23e-07 2.38e-07 8.37e-08 1.04e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 290179 1.29e-06 1.01e-06 3.27e-07 8.58e-07 2.58e-07 4.53e-07 1.18e-06 3.49e-07 1.2e-06 3.83e-07 1.35e-06 5.98e-07 1.95e-06 2.83e-07 4.35e-07 7.78e-07 8.43e-07 5.5e-07 5.54e-07 6.76e-07 4.43e-07 1.17e-06 8.1e-07 6.06e-07 1.88e-06 3.79e-07 7.55e-07 7.19e-07 1.17e-06 1.12e-06 5.45e-07 9.54e-08 2.31e-07 5.78e-07 5.63e-07 4.59e-07 4.52e-07 1.55e-07 3.2e-07 3.21e-07 2.89e-07 1.57e-06 5.81e-08 1.94e-08 1.65e-07 1.17e-07 2.09e-07 8.73e-08 8.37e-08