logo

Genes within 1Mb (chr6:133030098:GTCTC:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 6.23e-01 0.0491 0.0997 0.224 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0949 0.105 0.224 B L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.87e-02 -0.0655 0.0395 0.224 B L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0307 0.0746 0.224 B L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00184 0.0452 0.224 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 4.49e-01 0.0719 0.0949 0.224 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 7.98e-01 0.0159 0.0623 0.224 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0584 0.0739 0.224 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.84e-01 0.00157 0.0769 0.224 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.70e-02 -0.132 0.066 0.224 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0194 0.0453 0.224 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.23e-01 0.112 0.0913 0.224 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.15e-01 0.0596 0.073 0.224 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0787 0.0761 0.224 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 9.96e-01 0.000472 0.0891 0.224 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.89e-02 -0.0553 0.0302 0.224 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 3.25e-01 0.0907 0.0919 0.224 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 1.28e-01 0.171 0.112 0.218 DC L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 2.58e-01 -0.0789 0.0695 0.218 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0449 0.0864 0.218 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 3.63e-01 0.085 0.0932 0.218 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 2.12e-01 0.125 0.0995 0.218 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0524 0.0559 0.218 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 4.94e-01 0.0606 0.0885 0.218 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -73030 sc-eQTL 7.55e-02 -0.143 0.08 0.218 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 7.55e-01 0.0243 0.0777 0.224 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0725 0.0518 0.224 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 5.41e-01 0.0546 0.0892 0.224 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 1.84e-01 0.128 0.0957 0.224 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.56e-01 0.0505 0.0677 0.224 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.11e-01 0.00457 0.0406 0.224 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 7.28e-01 -0.028 0.0803 0.224 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 6.98e-01 -0.033 0.0848 0.223 NK L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 7.28e-01 0.0273 0.0784 0.223 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.66e-01 0.0165 0.0976 0.223 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.62e-01 0.00191 0.0404 0.223 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.18e-01 0.0102 0.0986 0.224 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.20e-01 -0.12 0.0771 0.224 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.89e-01 -0.065 0.0937 0.224 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.74e-01 0.0331 0.0371 0.224 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00111 0.102 0.224 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 1.91e-01 0.149 0.113 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 1.51e-01 -0.149 0.103 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0969 0.0971 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.45e-01 0.0203 0.104 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0348 0.0554 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 9.07e-02 -0.164 0.0964 0.23 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0319 0.0927 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.91e-01 0.00126 0.108 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 6.10e-01 0.0486 0.0951 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.52e-02 -0.131 0.0616 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 9.40e-01 0.00703 0.0938 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 5.69e-01 0.0328 0.0574 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.58e-01 0.117 0.103 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 4.63e-01 0.0645 0.0878 0.225 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 2.18e-01 -0.128 0.104 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 6.87e-02 -0.174 0.0951 0.224 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.52e-02 -0.181 0.0741 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 7.84e-01 -0.027 0.0983 0.224 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 8.45e-01 0.00926 0.0474 0.224 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 1.29e-01 0.15 0.0983 0.224 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0374 0.0921 0.224 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 5.23e-01 0.063 0.0984 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 8.95e-01 0.0143 0.108 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0499 0.0472 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 1.44e-01 -0.134 0.0915 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 2.47e-01 0.0606 0.0522 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0995 0.101 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 6.82e-01 0.0274 0.0669 0.224 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 8.41e-01 0.0211 0.105 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 1.23e-02 -0.255 0.101 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0425 0.0558 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0367 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.01e-01 0.0285 0.0543 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.15e-01 0.128 0.103 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 6.69e-01 0.0308 0.0719 0.225 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 3.09e-01 0.109 0.107 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 8.37e-01 0.0218 0.106 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 1.05e-02 -0.272 0.105 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0239 0.0494 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.29e-01 -0.12 0.0993 0.22 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0541 0.0845 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 5.60e-01 0.0483 0.0828 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0637 0.0767 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.89e-01 -0.02 0.0498 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 4.62e-01 0.0705 0.0958 0.224 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 2.62e-01 -0.101 0.0898 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0865 0.0905 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 7.21e-02 -0.16 0.0887 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 8.89e-01 0.00648 0.0463 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.93e-01 0.113 0.107 0.224 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0372 0.104 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0521 0.104 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 3.39e-01 0.0953 0.0995 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.83e-01 0.000848 0.0409 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 6.31e-01 0.0488 0.102 0.224 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.99e-01 8.09e-05 0.0938 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.03e-01 0.0107 0.0877 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.27e-01 0.0218 0.0996 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 5.90e-01 0.0287 0.0533 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 8.73e-01 0.0165 0.103 0.224 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 3.19e-01 0.0984 0.0986 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.74e-01 -0.143 0.105 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.83e-01 0.0134 0.0908 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0455 0.0519 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 7.76e-01 0.0297 0.104 0.224 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.65e-02 0.225 0.112 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0465 0.105 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.03e-01 0.026 0.104 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.57e-01 0.0467 0.0506 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0355 0.111 0.222 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00823 0.1 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0262 0.109 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.91e-01 0.0748 0.108 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 4.41e-01 0.045 0.0583 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 8.70e-01 0.0181 0.11 0.228 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.20e-01 0.086 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.94e-01 0.0863 0.101 0.221 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 2.02e-01 -0.131 0.103 0.221 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.62e-01 0.0024 0.0506 0.221 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 4.88e-01 0.0737 0.106 0.221 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0257 0.112 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.45e-02 0.219 0.103 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 5.60e-01 0.0616 0.105 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.50e-01 0.0037 0.0588 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0252 0.0903 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0569 0.0826 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0233 0.103 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 8.67e-01 0.0069 0.041 0.224 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.98e-01 0.0754 0.111 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 5.20e-01 0.0652 0.101 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 3.34e-01 0.0991 0.102 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0262 0.0477 0.224 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.62e-01 0.00445 0.0934 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 6.07e-02 0.169 0.0897 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 5.37e-01 0.0629 0.102 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0445 0.0551 0.224 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 1.93e-01 -0.168 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 1.04e-01 -0.179 0.109 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.35e-02 -0.185 0.0904 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 1.45e-01 -0.164 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0299 0.0638 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 3.85e-01 0.104 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 3.17e-01 0.0788 0.0784 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.98e-01 0.0702 0.103 0.228 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 2.14e-01 -0.115 0.0921 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 1.94e-01 -0.129 0.0988 0.228 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 1.83e-01 0.0499 0.0374 0.228 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 7.72e-01 0.0281 0.0971 0.228 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 2.38e-01 -0.125 0.106 0.224 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.84e-02 0.165 0.0993 0.224 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0636 0.084 0.224 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 1.56e-01 0.0527 0.037 0.224 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 1.68e-01 0.145 0.105 0.224 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 2.70e-01 0.124 0.112 0.22 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.28e-02 -0.148 0.0877 0.22 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0686 0.0876 0.22 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 2.38e-01 0.122 0.103 0.22 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 6.55e-02 0.185 0.0996 0.22 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0497 0.0495 0.22 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.25e-01 0.119 0.0979 0.22 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -73030 sc-eQTL 1.72e-01 -0.107 0.0782 0.22 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0266 0.0885 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0843 0.0669 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 8.83e-01 0.014 0.0949 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 3.19e-01 0.0953 0.0955 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 6.44e-01 0.0354 0.0765 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 6.42e-01 0.0198 0.0425 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0834 0.0818 0.224 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 5.16e-01 0.0652 0.1 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0581 0.0723 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 3.54e-01 0.0839 0.0903 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 2.60e-01 0.11 0.0979 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 7.80e-01 0.018 0.0643 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.67e-01 0.00194 0.0463 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 6.15e-01 0.0431 0.0857 0.224 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 7.15e-01 0.0478 0.131 0.233 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 2.25e-01 -0.136 0.112 0.233 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 2.27e-01 0.15 0.124 0.233 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.11e-01 -0.048 0.0472 0.233 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 7.50e-02 -0.217 0.121 0.233 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0473 0.101 0.222 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 8.71e-02 -0.165 0.0961 0.222 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0833 0.0976 0.222 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 4.38e-01 0.0751 0.0965 0.222 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 1.21e-01 0.152 0.0977 0.222 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0471 0.0426 0.222 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 1.90e-01 0.136 0.104 0.222 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 1.75e-01 0.143 0.105 0.224 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0417 0.0714 0.224 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0769 0.101 0.224 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 7.29e-01 0.0347 0.1 0.224 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 4.40e-02 0.193 0.0953 0.224 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00137 0.0483 0.224 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 6.89e-02 -0.155 0.0846 0.224 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 3.20e-02 0.267 0.123 0.218 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0702 0.083 0.218 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 2.60e-01 0.0943 0.0834 0.218 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0262 0.0852 0.218 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.54e-01 0.0188 0.102 0.218 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0507 0.0698 0.218 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 8.37e-01 0.0213 0.103 0.218 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -73030 sc-eQTL 1.08e-01 -0.159 0.0982 0.218 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.86e-01 0.00186 0.104 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0563 0.101 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.21e-03 -0.183 0.0556 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00984 0.0902 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 7.42e-01 0.017 0.0514 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 2.36e-01 0.112 0.094 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 6.32e-01 0.0436 0.091 0.224 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 2.77e-01 0.108 0.0986 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 628623 sc-eQTL 1.43e-01 -0.159 0.108 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0316 0.0445 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 2.22e-01 -0.106 0.0862 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 3.20e-01 0.052 0.0522 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 8.77e-01 0.0153 0.0987 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 898210 sc-eQTL 7.61e-01 0.0191 0.0627 0.224 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.49e-01 0.00519 0.0809 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 1.37e-01 -0.0836 0.0559 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 4.84e-01 0.0641 0.0915 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 2.31e-01 0.114 0.0953 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 5.51e-01 0.0377 0.0631 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 5.56e-01 0.0255 0.0433 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0351 0.0771 0.224 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 4.80e-01 0.0731 0.103 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0509 0.0681 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 295333 sc-eQTL 1.13e-01 -0.159 0.0998 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 316043 sc-eQTL 6.90e-01 0.0396 0.0994 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 8.20e-02 0.163 0.0931 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0114 0.0398 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 sc-eQTL 6.37e-01 0.0456 0.0965 0.222 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -922072 sc-eQTL 9.41e-01 0.00615 0.0835 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 516900 sc-eQTL 9.34e-01 0.00646 0.0785 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 266639 sc-eQTL 9.99e-01 0.000167 0.0993 0.224 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 215529 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0149 0.0405 0.224 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 295333 eQTL 0.00573 0.0456 0.0165 0.0 0.0 0.249
ENSG00000112299 VNN1 316043 pQTL 0.00049 -0.139 0.0396 0.0 0.0 0.248
ENSG00000112299 VNN1 316043 eQTL 0.00216 -0.0754 0.0245 0.0 0.0 0.249
ENSG00000112303 VNN2 266639 pQTL 4.62e-05 0.116 0.0285 0.0 0.0 0.248
ENSG00000112303 VNN2 266639 eQTL 0.0415 0.0299 0.0147 0.0 0.0 0.249
ENSG00000146409 SLC18B1 216759 eQTL 0.0158 0.0609 0.0252 0.0 0.0 0.249
ENSG00000234484 AL032821.1 277423 eQTL 3.01e-06 -0.164 0.0349 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 628623 2.91e-07 1.11e-07 5.64e-08 2.2e-07 9.02e-08 8.21e-08 3.25e-07 5.49e-08 1.85e-07 4.74e-08 1.83e-07 1.11e-07 2.55e-07 6.56e-08 4.89e-08 7.5e-08 4.94e-08 1.4e-07 7.39e-08 3.29e-08 1.21e-07 1.56e-07 1.45e-07 4.53e-08 1.55e-07 1.16e-07 1.06e-07 9.32e-08 1.16e-07 1.69e-07 1.07e-07 3.19e-08 2.74e-08 8.89e-08 3.51e-08 3.97e-08 4.63e-08 9.55e-08 8.19e-08 3.34e-08 3.44e-08 1.46e-07 3.91e-08 7.56e-09 1.09e-07 1.01e-08 1.25e-07 4.82e-09 4.61e-08
ENSG00000093134 VNN3 295333 1.34e-06 4.93e-07 2.81e-07 4.72e-07 1.11e-07 3.69e-07 1.6e-06 7.12e-08 1.24e-06 2.57e-07 1.75e-06 5.69e-07 1.95e-06 1.23e-07 6.17e-08 3.96e-07 4.25e-08 4.31e-07 5.29e-07 6.02e-08 2.26e-07 1.08e-06 6.04e-07 1.06e-07 1.35e-06 2.4e-07 2.57e-07 1.97e-07 5.56e-07 1.2e-06 4.61e-07 3.95e-08 3.89e-08 3.55e-07 4.22e-07 5.04e-08 6.39e-08 7.66e-08 5.8e-08 4.41e-08 5.14e-08 7.54e-07 2.99e-08 1.28e-08 4.92e-08 5.94e-08 8.46e-08 4.14e-09 5.04e-08
ENSG00000112299 VNN1 316043 1.26e-06 3.47e-07 2.7e-07 3.44e-07 1.06e-07 3.2e-07 1.38e-06 5.84e-08 1.13e-06 2.26e-07 1.39e-06 5.28e-07 1.63e-06 1.07e-07 6e-08 3.36e-07 4.18e-08 4.11e-07 4.24e-07 5.48e-08 2.5e-07 8.58e-07 5.49e-07 6.65e-08 1.02e-06 2.29e-07 2.08e-07 1.77e-07 4.63e-07 1.32e-06 4.02e-07 3.76e-08 3.61e-08 2.72e-07 3.21e-07 3.94e-08 5.76e-08 6.89e-08 6.45e-08 3.75e-08 3.57e-08 6.19e-07 2.16e-08 5.96e-09 5.43e-08 4.23e-08 9.96e-08 4.2e-09 4.91e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 277423 1.3e-06 5.74e-07 3.2e-07 6.38e-07 9.93e-08 4.39e-07 1.53e-06 8.11e-08 1.39e-06 2.87e-07 1.84e-06 5.7e-07 2.04e-06 1.48e-07 6.02e-08 4.53e-07 5.57e-08 4.65e-07 6.62e-07 8e-08 2.82e-07 1.24e-06 8.03e-07 1.25e-07 1.54e-06 2.49e-07 2.72e-07 2.44e-07 6.91e-07 1.3e-06 4.65e-07 3.84e-08 3.73e-08 4.51e-07 4.36e-07 5.23e-08 7.52e-08 8.15e-08 4.74e-08 5.45e-08 5.42e-08 9.58e-07 4.53e-08 2.67e-08 4.67e-08 7.22e-08 7.83e-08 4.09e-09 4.79e-08