logo

Genes within 1Mb (chr6:133020045:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.06e-01 0.0516 0.0998 0.226 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0811 0.105 0.226 B L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0651 0.0395 0.226 B L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 6.69e-01 -0.032 0.0747 0.226 B L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00337 0.0452 0.226 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 3.88e-01 0.0821 0.095 0.226 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 8.25e-01 0.0138 0.0624 0.226 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0571 0.074 0.226 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00158 0.077 0.226 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 4.74e-02 -0.132 0.0661 0.226 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0196 0.0453 0.226 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 2.18e-01 0.113 0.0914 0.226 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.03e-01 0.0611 0.073 0.226 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0895 0.0761 0.226 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 8.94e-01 0.0119 0.0892 0.226 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.86e-02 -0.0553 0.0302 0.226 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 3.08e-01 0.0939 0.0919 0.226 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 1.25e-01 0.172 0.111 0.221 DC L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0866 0.0694 0.221 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0406 0.0864 0.221 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 3.02e-01 0.0962 0.093 0.221 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 2.01e-01 0.128 0.0994 0.221 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0512 0.0558 0.221 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 4.54e-01 0.0663 0.0884 0.221 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -83083 sc-eQTL 8.44e-02 -0.139 0.08 0.221 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.17e-01 0.0389 0.0778 0.226 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.58e-01 -0.0735 0.0518 0.226 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 4.77e-01 0.0636 0.0893 0.226 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 1.60e-01 0.135 0.0958 0.226 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 5.47e-01 0.0409 0.0678 0.226 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.34e-01 0.00339 0.0407 0.226 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0224 0.0805 0.226 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0348 0.0849 0.225 NK L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 7.22e-01 0.028 0.0785 0.225 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 9.36e-01 0.0079 0.0978 0.225 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.13e-01 0.00441 0.0405 0.225 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.16e-01 0.0104 0.0987 0.226 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.34e-01 -0.116 0.0772 0.226 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0559 0.0938 0.226 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 4.05e-01 0.031 0.0372 0.226 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00457 0.102 0.226 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.53e-01 0.13 0.113 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 2.30e-01 -0.124 0.103 0.232 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.34e-01 -0.116 0.0968 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 8.47e-01 0.02 0.103 0.232 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0332 0.0554 0.232 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.02e-01 -0.158 0.0964 0.232 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0449 0.0926 0.232 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.70e-01 0.00402 0.109 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 5.12e-01 0.0625 0.0951 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 3.81e-02 -0.129 0.0617 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 9.64e-01 0.00419 0.0939 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.73e-01 0.0324 0.0574 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 2.67e-01 0.115 0.103 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 4.40e-01 0.068 0.0879 0.227 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.87e-01 -0.111 0.104 0.226 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 7.81e-02 -0.169 0.0954 0.226 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.63e-02 -0.18 0.0744 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0242 0.0986 0.226 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 8.69e-01 0.00787 0.0475 0.226 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.27e-01 0.151 0.0986 0.226 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0311 0.0924 0.226 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.12e-01 0.0501 0.0986 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 7.75e-01 0.0311 0.108 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.82e-01 -0.051 0.0473 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 2.04e-01 -0.117 0.0918 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 2.38e-01 0.0619 0.0523 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 3.90e-01 -0.087 0.101 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 6.66e-01 0.0289 0.067 0.226 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 8.09e-01 0.0255 0.105 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 1.32e-02 -0.253 0.101 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0445 0.0559 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0575 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.18e-01 0.0272 0.0544 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.63e-01 0.145 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 6.26e-01 0.0352 0.072 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.89e-01 0.113 0.107 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 7.52e-01 0.0336 0.106 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 1.12e-02 -0.27 0.105 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0215 0.0494 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 2.65e-01 -0.111 0.0994 0.223 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0598 0.0845 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 5.49e-01 0.0498 0.0829 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0577 0.0768 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0214 0.0499 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 4.71e-01 0.0692 0.0959 0.226 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0917 0.09 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0972 0.0906 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 4.62e-02 -0.178 0.0887 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.05e-01 0.00554 0.0464 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 2.66e-01 0.12 0.107 0.226 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0333 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0563 0.104 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 3.87e-01 0.0864 0.0996 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.98e-01 -8.04e-05 0.0409 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 7.08e-01 0.0381 0.102 0.226 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.76e-01 0.00288 0.0939 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 9.95e-01 0.000532 0.0877 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 7.92e-01 0.0264 0.0997 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.35e-01 0.0331 0.0533 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 9.14e-01 0.0112 0.103 0.226 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 3.16e-01 0.0993 0.0987 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.54e-01 -0.15 0.105 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 8.90e-01 0.0126 0.0909 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0432 0.052 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 7.26e-01 0.0367 0.104 0.226 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 3.55e-02 0.237 0.112 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0681 0.105 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 6.28e-01 0.0505 0.104 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 3.68e-01 0.0457 0.0507 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0377 0.111 0.225 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0121 0.1 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0237 0.109 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 3.99e-01 0.0917 0.108 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 4.06e-01 0.0485 0.0583 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 8.52e-01 0.0206 0.11 0.231 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.33e-01 0.0837 0.106 0.223 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.14e-01 0.0829 0.101 0.223 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 1.60e-01 -0.145 0.103 0.223 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.83e-01 0.00107 0.0507 0.223 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 5.82e-01 0.0585 0.106 0.223 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0434 0.112 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 3.44e-02 0.219 0.103 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 6.83e-01 0.0431 0.105 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.24e-01 0.00563 0.0588 0.227 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0183 0.0905 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0616 0.0827 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0335 0.104 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 7.98e-01 0.0105 0.0411 0.226 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.26e-01 0.0887 0.111 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.87e-01 0.0705 0.101 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 3.85e-01 0.0891 0.102 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0277 0.0477 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000905 0.0934 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.93e-02 0.177 0.0897 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 5.27e-01 0.0643 0.102 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0433 0.0551 0.226 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 1.93e-01 -0.168 0.128 0.226 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 1.04e-01 -0.179 0.109 0.226 PB L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.35e-02 -0.185 0.0904 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 1.45e-01 -0.164 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0299 0.0638 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 3.85e-01 0.104 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 3.17e-01 0.0788 0.0784 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.56e-01 0.0773 0.103 0.23 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.11e-01 -0.115 0.0921 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 2.01e-01 -0.127 0.0988 0.23 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 1.99e-01 0.0482 0.0374 0.23 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 6.13e-01 0.0492 0.097 0.23 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.66e-01 -0.118 0.106 0.226 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.11e-01 0.159 0.0994 0.226 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0679 0.084 0.226 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 1.36e-01 0.0555 0.037 0.226 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.73e-01 0.143 0.105 0.226 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.82e-01 0.121 0.112 0.222 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 7.47e-02 -0.157 0.0876 0.222 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0745 0.0876 0.222 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 2.06e-01 0.13 0.103 0.222 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 6.33e-02 0.186 0.0996 0.222 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0499 0.0495 0.222 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.77e-01 0.133 0.0978 0.222 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -83083 sc-eQTL 1.66e-01 -0.109 0.0782 0.222 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0183 0.0887 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0862 0.067 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 8.00e-01 0.0241 0.0951 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 2.91e-01 0.101 0.0957 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 7.06e-01 0.029 0.0767 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 6.39e-01 0.02 0.0426 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0839 0.082 0.226 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 4.78e-01 0.0713 0.1 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0564 0.0725 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 3.26e-01 0.0889 0.0904 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 2.22e-01 0.12 0.0981 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 9.30e-01 0.00567 0.0645 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00088 0.0464 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 5.58e-01 0.0503 0.0858 0.226 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 6.84e-01 0.0533 0.131 0.236 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 2.83e-01 -0.121 0.112 0.236 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 1.63e-01 0.174 0.124 0.236 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0505 0.0473 0.236 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 8.22e-02 -0.212 0.121 0.236 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0182 0.102 0.224 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.15e-01 -0.153 0.0964 0.224 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0697 0.0978 0.224 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 4.96e-01 0.066 0.0967 0.224 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 1.80e-01 0.132 0.098 0.224 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 2.03e-01 -0.0544 0.0427 0.224 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 1.48e-01 0.151 0.104 0.224 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 1.75e-01 0.144 0.105 0.226 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0501 0.0715 0.226 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 4.52e-01 -0.076 0.101 0.226 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 7.08e-01 0.0375 0.1 0.226 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 5.07e-02 0.188 0.0955 0.226 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00221 0.0484 0.226 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 5.40e-02 -0.164 0.0846 0.226 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.35e-02 0.281 0.123 0.22 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.41e-01 -0.064 0.083 0.22 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 2.19e-01 0.103 0.0833 0.22 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00579 0.0852 0.22 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 7.08e-01 0.038 0.101 0.22 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0436 0.0697 0.22 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 9.17e-01 0.0108 0.103 0.22 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -83083 sc-eQTL 1.55e-01 -0.14 0.0983 0.22 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.25e-01 0.00981 0.104 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 6.91e-01 -0.04 0.101 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.09e-03 -0.184 0.0557 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0126 0.0903 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 7.46e-01 0.0167 0.0515 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 2.32e-01 0.113 0.0942 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 6.54e-01 0.0409 0.0911 0.226 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 2.98e-01 0.103 0.0988 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 618570 sc-eQTL 1.70e-01 -0.149 0.108 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0307 0.0446 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 2.20e-01 -0.106 0.0863 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 3.18e-01 0.0524 0.0523 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 7.34e-01 0.0336 0.0989 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 888157 sc-eQTL 7.26e-01 0.022 0.0628 0.226 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 8.60e-01 0.0143 0.081 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 1.31e-01 -0.085 0.056 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 4.35e-01 0.0716 0.0917 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 2.00e-01 0.123 0.0954 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 6.61e-01 0.0278 0.0633 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 5.78e-01 0.0242 0.0434 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0318 0.0772 0.226 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 3.85e-01 0.09 0.103 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0512 0.0682 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 285280 sc-eQTL 1.29e-01 -0.152 0.0999 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 305990 sc-eQTL 7.01e-01 0.0383 0.0995 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 9.87e-02 0.155 0.0933 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0148 0.0398 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 sc-eQTL 5.69e-01 0.0551 0.0966 0.224 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -932125 sc-eQTL 9.21e-01 0.00831 0.0836 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 506847 sc-eQTL 9.29e-01 0.00697 0.0786 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 256586 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00435 0.0995 0.226 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 205476 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0118 0.0406 0.226 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 285280 eQTL 0.00524 0.0461 0.0165 0.0 0.0 0.25
ENSG00000112299 VNN1 305990 pQTL 0.00046 -0.139 0.0397 0.0 0.0 0.248
ENSG00000112299 VNN1 305990 eQTL 0.0021 -0.0756 0.0245 0.0 0.0 0.25
ENSG00000112303 VNN2 256586 pQTL 4.44e-05 0.117 0.0285 0.0 0.0 0.248
ENSG00000112303 VNN2 256586 eQTL 0.0328 0.0314 0.0147 0.0 0.0 0.25
ENSG00000146409 SLC18B1 206706 eQTL 0.0146 0.0617 0.0252 0.0 0.0 0.25
ENSG00000234484 AL032821.1 267370 eQTL 3.1e-06 -0.164 0.0349 0.0 0.0 0.25

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 \N 618570 3.71e-07 1.78e-07 6.99e-08 2.26e-07 1.03e-07 1.03e-07 2.74e-07 7.52e-08 2.01e-07 1.21e-07 2.07e-07 1.62e-07 2.94e-07 8.55e-08 6.53e-08 1.13e-07 7.3e-08 2.56e-07 7.76e-08 6.58e-08 1.34e-07 2.06e-07 1.86e-07 3.41e-08 2.48e-07 1.9e-07 1.31e-07 1.47e-07 1.48e-07 1.59e-07 1.35e-07 4.29e-08 4.74e-08 9.81e-08 6.78e-08 4.68e-08 6.24e-08 6.32e-08 5.78e-08 6.92e-08 4.78e-08 1.63e-07 3.65e-08 1.43e-08 4.06e-08 9.86e-09 9.1e-08 0.0 4.61e-08
ENSG00000093134 VNN3 285280 1.32e-06 9.33e-07 2.56e-07 7.39e-07 3.43e-07 4.76e-07 1.45e-06 4.1e-07 1.49e-06 4.78e-07 1.57e-06 6.63e-07 1.97e-06 2.67e-07 5.23e-07 9.33e-07 9.33e-07 6.94e-07 8.35e-07 6.31e-07 7.11e-07 1.6e-06 8.53e-07 6.34e-07 2.05e-06 6.42e-07 9.02e-07 7.08e-07 1.39e-06 1.24e-06 6.18e-07 2.09e-07 2.02e-07 6.93e-07 5.63e-07 4.56e-07 6.08e-07 2.31e-07 3.95e-07 3.02e-07 2.87e-07 1.49e-06 9.55e-08 5.67e-08 2.96e-07 1.27e-07 2.18e-07 3.7e-08 1.6e-07
ENSG00000112299 VNN1 305990 1.24e-06 9.3e-07 3.45e-07 5.51e-07 3.23e-07 4.46e-07 1.16e-06 3.68e-07 1.28e-06 4.28e-07 1.36e-06 6.08e-07 1.76e-06 2.59e-07 4.61e-07 8.28e-07 8e-07 5.99e-07 6.91e-07 6.8e-07 5.47e-07 1.24e-06 8.95e-07 6.21e-07 1.98e-06 4.27e-07 7.61e-07 7.25e-07 1.25e-06 1.18e-06 5.62e-07 1.72e-07 2.19e-07 6.99e-07 4.4e-07 4.5e-07 5.17e-07 1.54e-07 2.95e-07 2.55e-07 2.6e-07 1.48e-06 5.85e-08 3.38e-08 1.67e-07 1.24e-07 2.42e-07 8.48e-08 1.35e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 267370 1.27e-06 1.01e-06 2.77e-07 1.02e-06 3.67e-07 5.95e-07 1.6e-06 4.13e-07 1.42e-06 6.05e-07 1.84e-06 7.84e-07 2.25e-06 2.81e-07 5.42e-07 9.57e-07 8.85e-07 8.27e-07 8.15e-07 5.73e-07 8.02e-07 1.69e-06 8.95e-07 5.38e-07 2.29e-06 7.64e-07 9.28e-07 8.37e-07 1.44e-06 1.28e-06 6.78e-07 3.01e-07 2.89e-07 6.27e-07 5.28e-07 4.91e-07 7.24e-07 2.71e-07 5.03e-07 2.96e-07 2.56e-07 1.55e-06 1.37e-07 7.3e-08 2.87e-07 1.59e-07 2.56e-07 6.05e-08 2.04e-07