Genes within 1Mb (chr6:132990116:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0364 0.111 0.167 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 7.42e-01 0.0387 0.117 0.167 B L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.02e-01 -0.017 0.0443 0.167 B L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 2.29e-02 0.188 0.0822 0.167 B L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.87e-01 0.0664 0.0501 0.167 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 8.33e-01 0.0224 0.106 0.167 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0131 0.0695 0.167 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 1.20e-01 0.125 0.0803 0.167 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0875 0.0838 0.167 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 5.87e-01 0.0395 0.0727 0.167 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.17e-01 0.061 0.0493 0.167 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0906 0.0999 0.167 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.99e-01 0.0678 0.0802 0.167 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0247 0.0838 0.167 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0718 0.0978 0.167 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.12e-01 0.0417 0.0333 0.167 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00596 0.101 0.167 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.17e-01 -0.152 0.123 0.169 DC L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.57e-01 0.0237 0.0765 0.169 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 1.24e-01 0.146 0.0943 0.169 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0816 0.102 0.169 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 3.07e-01 0.112 0.109 0.169 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00366 0.0614 0.169 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 1.85e-01 -0.129 0.0968 0.169 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -113012 sc-eQTL 9.80e-01 0.00218 0.0885 0.169 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.68e-01 0.0939 0.0845 0.167 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0302 0.0567 0.167 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0503 0.0973 0.167 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 1.62e-01 -0.146 0.104 0.167 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.48e-01 -0.107 0.0735 0.167 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0521 0.0441 0.167 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0263 0.0876 0.167 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.44e-01 0.108 0.0925 0.167 NK L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.82e-02 -0.202 0.0847 0.167 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.30e-01 -0.161 0.106 0.167 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.57e-01 0.0024 0.0442 0.167 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0754 0.107 0.167 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 6.37e-01 0.04 0.0845 0.167 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 3.62e-01 0.0932 0.102 0.167 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.93e-01 0.0426 0.0404 0.167 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 2.67e-01 -0.123 0.111 0.167 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.125 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 3.33e-01 0.111 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0473 0.107 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 3.63e-01 0.104 0.114 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 3.52e-01 0.057 0.0611 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.76e-01 0.0449 0.107 0.166 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 2.71e-01 -0.113 0.102 0.166 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 9.88e-01 0.00181 0.12 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 2.77e-01 0.114 0.105 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0351 0.0687 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 2.31e-01 0.124 0.103 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.71e-01 0.0697 0.0632 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.08e-01 0.0587 0.114 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 2.46e-01 -0.113 0.0967 0.167 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 1.33e-01 -0.171 0.114 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 9.09e-01 -0.0121 0.105 0.166 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000389 0.0826 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0382 0.108 0.166 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 4.09e-01 0.043 0.052 0.166 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 1.66e-01 -0.15 0.108 0.166 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 1.52e-01 -0.145 0.101 0.166 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.48e-01 0.0856 0.113 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0875 0.124 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0201 0.0541 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.44e-01 0.154 0.105 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.69e-01 0.0824 0.0596 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 3.49e-01 -0.108 0.115 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0482 0.0765 0.167 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0222 0.118 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 4.46e-01 0.0878 0.115 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0662 0.0625 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 6.19e-02 0.214 0.114 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.80e-01 0.0816 0.0607 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 1.65e-01 0.161 0.116 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0646 0.0805 0.165 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00552 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0367 0.114 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 9.92e-01 0.00119 0.115 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.12e-01 0.0842 0.0528 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 8.25e-01 0.0237 0.107 0.168 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 5.93e-01 0.0494 0.0925 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0557 0.0906 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 4.66e-01 0.0613 0.0839 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.80e-01 0.073 0.0543 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0467 0.105 0.167 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.39e-01 0.116 0.0985 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.46e-01 -0.145 0.099 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0915 0.0979 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 4.55e-01 0.038 0.0508 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0623 0.118 0.167 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0991 0.113 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.16e-01 -0.179 0.113 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.95e-02 0.253 0.108 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.34e-01 0.0669 0.0445 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0914 0.111 0.167 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 1.16e-01 0.158 0.1 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 4.01e-01 0.0789 0.0939 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.26e-02 -0.191 0.106 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 4.27e-01 0.0455 0.0571 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0584 0.111 0.167 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.17e-01 0.0873 0.107 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0626 0.114 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0349 0.0988 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 3.63e-01 0.0515 0.0565 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 9.87e-02 0.187 0.113 0.167 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 7.82e-03 -0.322 0.12 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 8.47e-01 0.0217 0.113 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 4.65e-02 -0.222 0.111 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 5.72e-01 0.0309 0.0545 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 4.64e-01 0.0877 0.119 0.162 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.108 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 6.04e-01 0.0613 0.118 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0446 0.117 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0126 0.0631 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.39e-01 0.056 0.119 0.169 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 5.52e-01 -0.068 0.114 0.167 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 2.74e-01 0.119 0.108 0.167 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.93e-02 0.193 0.11 0.167 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.84e-01 0.0722 0.0541 0.167 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0941 0.114 0.167 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.59e-01 0.0903 0.122 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 9.31e-01 0.0098 0.113 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 8.21e-02 0.199 0.114 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 7.14e-01 0.0235 0.0639 0.167 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.15e-01 0.123 0.0987 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.43e-02 -0.221 0.0894 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.03e-01 -0.184 0.113 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 6.86e-01 0.0182 0.045 0.168 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.89e-01 -0.104 0.12 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.98e-01 -0.141 0.109 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0362 0.111 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00542 0.0518 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 5.11e-01 0.0679 0.103 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.85e-01 -0.132 0.0996 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.01e-01 -0.184 0.112 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.84e-01 0.0811 0.0608 0.168 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.71e-01 0.108 0.15 0.156 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 1.24e-01 -0.197 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 3.61e-01 0.0979 0.107 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 4.64e-01 0.0959 0.13 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000968 0.0742 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 2.75e-01 -0.152 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0829 0.0912 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.44e-01 0.0871 0.113 0.17 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0119 0.101 0.17 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 5.21e-01 -0.07 0.109 0.17 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 4.70e-01 0.0298 0.0411 0.17 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 2.57e-01 -0.121 0.106 0.17 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.67e-01 0.105 0.117 0.167 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 7.42e-01 0.0363 0.11 0.167 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0512 0.0925 0.167 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 3.60e-01 0.0375 0.0409 0.167 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0389 0.116 0.167 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.04e-01 -0.103 0.123 0.173 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0587 0.0963 0.173 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 2.97e-02 0.207 0.0945 0.173 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 2.79e-01 -0.122 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.44e-01 0.0358 0.11 0.173 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 6.47e-01 0.0249 0.0541 0.173 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 8.00e-01 0.0272 0.107 0.173 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -113012 sc-eQTL 3.05e-01 0.088 0.0855 0.173 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.17e-01 0.12 0.0968 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 1.24e-01 -0.113 0.0733 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 7.82e-01 0.0289 0.104 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0686 0.105 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0285 0.0841 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0497 0.0466 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00556 0.0901 0.167 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00928 0.11 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 9.15e-01 0.00848 0.0793 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0895 0.0989 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 3.39e-01 -0.103 0.107 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 2.87e-01 -0.075 0.0703 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0303 0.0507 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.76e-01 0.0393 0.0939 0.167 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.53e-01 -0.173 0.151 0.167 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0748 0.13 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0215 0.144 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 3.02e-01 0.0567 0.0548 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 3.67e-01 -0.128 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 7.56e-01 0.0347 0.112 0.164 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0197 0.107 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0423 0.108 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0743 0.107 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 9.46e-02 0.181 0.108 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 6.78e-01 0.0196 0.0471 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 9.31e-02 -0.192 0.114 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.43e-01 0.0901 0.117 0.165 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0626 0.0793 0.165 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 1.46e-01 0.163 0.112 0.165 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 3.44e-02 -0.234 0.11 0.165 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.24e-01 -0.164 0.106 0.165 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00169 0.0537 0.165 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 3.38e-01 -0.0909 0.0946 0.165 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 1.60e-01 -0.192 0.136 0.169 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 4.27e-01 0.0726 0.0912 0.169 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 5.64e-01 0.0531 0.0919 0.169 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00294 0.0936 0.169 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0379 0.111 0.169 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0291 0.0767 0.169 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 3.61e-02 -0.237 0.112 0.169 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -113012 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0859 0.109 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0913 0.116 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 8.59e-01 0.0201 0.113 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0324 0.0639 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 1.49e-01 0.146 0.101 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.01e-01 0.0943 0.0573 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00529 0.106 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0849 0.102 0.167 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 5.59e-01 0.066 0.113 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 588641 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0123 0.124 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0559 0.0508 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 3.31e-02 0.21 0.0978 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.46e-01 0.0869 0.0595 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 8.83e-01 0.0167 0.113 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 858228 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0472 0.0716 0.167 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.84e-01 0.0766 0.0878 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0389 0.0611 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0267 0.0997 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0607 0.104 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 4.33e-01 -0.054 0.0687 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0686 0.0469 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 6.98e-01 0.0326 0.0839 0.167 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 3.97e-01 0.0969 0.114 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0497 0.0753 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 255351 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0116 0.111 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 276061 sc-eQTL 2.21e-02 -0.25 0.109 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 2.10e-01 -0.13 0.103 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 5.12e-01 0.0289 0.0439 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 sc-eQTL 4.93e-02 -0.209 0.106 0.168 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 sc-eQTL 2.17e-01 0.113 0.0912 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 476918 sc-eQTL 9.91e-03 -0.22 0.0847 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 226657 sc-eQTL 7.62e-02 -0.193 0.108 0.168 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 175547 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00409 0.0444 0.168 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028839 TBPL1 -962054 eQTL 0.0233 0.0363 0.016 0.0 0.0 0.184
ENSG00000079931 MOXD1 588641 eQTL 0.00123 -0.12 0.037 0.00137 0.0 0.184
ENSG00000079950 STX7 476918 pQTL 0.0456 -0.0568 0.0284 0.0 0.0 0.182
ENSG00000112303 VNN2 226657 pQTL 0.0155 -0.0766 0.0316 0.0 0.0 0.182
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 eQTL 6.81e-11 -0.178 0.027 0.0 0.0 0.184


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 588641 4.21e-07 2.17e-07 7.76e-08 2.41e-07 1.07e-07 1.19e-07 2.95e-07 7.46e-08 2.26e-07 1.37e-07 2.38e-07 1.86e-07 3.48e-07 8.54e-08 7.79e-08 1.17e-07 8.53e-08 2.75e-07 8.68e-08 8.69e-08 1.35e-07 2.24e-07 2e-07 4.81e-08 2.99e-07 1.94e-07 1.48e-07 1.52e-07 1.54e-07 1.89e-07 1.43e-07 5.4e-08 4.87e-08 9.61e-08 9.25e-08 5.23e-08 5.76e-08 5.8e-08 4.75e-08 7.17e-08 4.9e-08 1.79e-07 3.2e-08 7.3e-09 5.4e-08 8.07e-09 9.25e-08 0.0 4.68e-08
ENSG00000146409 SLC18B1 176777 2.69e-06 2.44e-06 4.43e-07 1.71e-06 6.82e-07 8.2e-07 1.85e-06 8.31e-07 1.88e-06 1.11e-06 2.53e-06 1.42e-06 3.27e-06 1.34e-06 9.26e-07 1.68e-06 1.23e-06 2.25e-06 1.29e-06 1.39e-06 1.34e-06 3.06e-06 2.47e-06 1.22e-06 3.45e-06 1.03e-06 1.36e-06 1.79e-06 2.28e-06 1.97e-06 1.67e-06 3.78e-07 5.7e-07 1.28e-06 1.27e-06 1e-06 7.18e-07 4.46e-07 1.18e-06 3.8e-07 2.54e-07 3.32e-06 4.85e-07 1.96e-07 3.44e-07 3.47e-07 8.12e-07 2.28e-07 1.57e-07