Genes within 1Mb (chr6:132964147:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.48e-01 0.129 0.17 0.064 B L1
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 4.68e-01 -0.13 0.179 0.064 B L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0289 0.0676 0.064 B L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 2.48e-01 -0.147 0.127 0.064 B L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.46e-01 -0.112 0.0765 0.064 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 3.29e-01 0.158 0.162 0.064 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0276 0.106 0.064 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0469 0.127 0.064 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 1.77e-01 0.179 0.132 0.064 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0605 0.115 0.064 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.53e-01 -0.111 0.0776 0.064 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.58e-01 0.178 0.157 0.064 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.96e-01 0.0859 0.126 0.064 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 4.92e-01 0.0907 0.132 0.064 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 1.26e-01 0.235 0.153 0.064 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 2.21e-02 -0.12 0.0519 0.064 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0406 0.159 0.064 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.22e-01 0.124 0.194 0.063 DC L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 1.71e-01 -0.165 0.12 0.063 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 2.70e-01 0.165 0.149 0.063 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 4.83e-01 0.113 0.161 0.063 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 6.30e-01 0.0834 0.173 0.063 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 6.95e-01 0.038 0.0969 0.063 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 1.82e-01 0.205 0.153 0.063 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -138981 sc-eQTL 7.66e-01 0.0415 0.14 0.063 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.07e-02 -0.243 0.134 0.064 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0302 0.0901 0.064 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 4.41e-01 0.119 0.154 0.064 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 1.54e-02 0.401 0.164 0.064 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.25e-01 0.0937 0.117 0.064 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 4.04e-01 0.0587 0.0703 0.064 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 6.14e-01 0.0702 0.139 0.064 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.26e-01 -0.117 0.147 0.064 NK L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 2.58e-01 0.154 0.136 0.064 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 8.85e-01 0.0245 0.169 0.064 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.44e-01 -0.102 0.0697 0.064 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 9.23e-02 -0.289 0.171 0.064 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 2.64e-01 0.151 0.135 0.064 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 8.45e-01 -0.032 0.164 0.064 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0421 0.0648 0.064 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 4.68e-01 -0.129 0.177 0.064 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.11e-01 -0.165 0.201 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0579 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.01e-01 -0.116 0.172 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 7.32e-01 0.0629 0.183 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 9.48e-01 0.00643 0.0981 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.69e-01 -0.19 0.171 0.064 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 7.88e-01 0.0441 0.164 0.064 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0363 0.19 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 6.21e-01 0.0823 0.166 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0265 0.109 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 9.03e-01 0.0199 0.164 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.02e-01 -0.164 0.0998 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 1.33e-01 0.272 0.18 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 6.08e-01 -0.079 0.154 0.064 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0179 0.184 0.065 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 4.17e-01 0.138 0.169 0.065 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 3.51e-01 -0.124 0.133 0.065 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0161 0.174 0.065 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 4.74e-02 -0.166 0.0831 0.065 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.48e-01 0.202 0.175 0.065 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 9.24e-01 0.0156 0.163 0.065 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.08e-01 -0.113 0.17 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0933 0.187 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 2.94e-01 -0.0859 0.0816 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 7.72e-02 -0.28 0.158 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0875 0.0903 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 5.65e-01 -0.101 0.174 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0307 0.116 0.064 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 6.48e-02 0.331 0.178 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 4.40e-01 -0.135 0.175 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 2.81e-01 -0.103 0.0952 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 1.65e-01 -0.243 0.174 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.97e-01 -0.12 0.0925 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.28e-02 0.401 0.175 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 5.75e-01 0.0688 0.123 0.064 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0423 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 9.23e-01 0.0174 0.179 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.35e-01 -0.141 0.18 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.20e-01 -0.083 0.0833 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.78e-01 0.183 0.168 0.064 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0623 0.145 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.58e-02 0.252 0.141 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.71e-01 0.0949 0.131 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0981 0.0851 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 9.99e-01 -0.00017 0.164 0.064 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0514 0.159 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 6.81e-01 0.0659 0.16 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 1.21e-01 -0.245 0.157 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.73e-01 -0.073 0.0817 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 3.13e-01 0.191 0.189 0.064 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.27e-01 0.0637 0.182 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0628 0.182 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0264 0.175 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0787 0.0714 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00597 0.178 0.064 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0525 0.165 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 3.52e-01 0.143 0.154 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.99e-02 0.342 0.173 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00969 0.0936 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0731 0.181 0.064 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 6.79e-01 0.0707 0.171 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 4.95e-01 -0.124 0.182 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.75e-02 0.297 0.156 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 2.41e-03 -0.27 0.088 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 8.81e-01 0.0269 0.18 0.064 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 1.32e-01 0.294 0.194 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0473 0.181 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.68e-01 -0.102 0.179 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.92e-01 -0.114 0.0869 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 1.13e-01 0.303 0.19 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.13e-01 -0.118 0.181 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.67e-02 0.375 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 7.06e-01 0.0743 0.196 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0344 0.106 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 3.25e-01 -0.197 0.199 0.062 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0454 0.186 0.061 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 1.95e-01 0.229 0.176 0.061 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.53e-01 -0.135 0.18 0.061 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0646 0.0883 0.061 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0292 0.185 0.061 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0457 0.187 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.23e-02 0.31 0.172 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 3.71e-01 0.157 0.175 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0888 0.0977 0.067 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.22e-01 -0.101 0.157 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.91e-01 0.0775 0.144 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.51e-01 -0.136 0.18 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0715 0.0713 0.065 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0234 0.189 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 3.22e-01 -0.171 0.172 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.12e-01 0.143 0.174 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0708 0.0811 0.068 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0313 0.163 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 1.81e-01 0.211 0.157 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.67e-01 0.129 0.177 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0915 0.096 0.065 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 3.78e-01 -0.222 0.25 0.056 PB L2
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0965 0.214 0.056 PB L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0516 0.179 0.056 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 6.93e-01 0.0863 0.218 0.056 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 8.10e-01 0.0299 0.124 0.056 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 8.85e-01 0.0337 0.232 0.056 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0697 0.153 0.056 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0751 0.181 0.065 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0599 0.161 0.065 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0192 0.173 0.065 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 6.78e-01 0.0272 0.0654 0.065 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0553 0.169 0.065 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.21e-01 0.15 0.186 0.064 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.44e-01 0.107 0.175 0.064 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0819 0.148 0.064 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00531 0.0653 0.064 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 7.55e-02 0.327 0.183 0.064 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.34e-02 0.346 0.192 0.066 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 1.44e-01 -0.222 0.151 0.066 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 1.43e-01 0.221 0.15 0.066 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 5.26e-01 0.113 0.177 0.066 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 3.75e-01 0.153 0.173 0.066 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0732 0.0853 0.066 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 5.90e-01 0.0913 0.169 0.066 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -138981 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0861 0.135 0.066 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.33e-02 -0.298 0.153 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0756 0.117 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 6.71e-01 0.0706 0.166 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 5.73e-02 0.317 0.166 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.00e-01 0.0902 0.134 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 5.28e-01 0.0469 0.0742 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00439 0.143 0.064 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.47e-01 -0.134 0.176 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0357 0.127 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 5.48e-01 0.0953 0.159 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 5.55e-02 0.329 0.171 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0142 0.113 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.10e-01 0.0825 0.0811 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 4.76e-01 0.107 0.15 0.064 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.48e-01 -0.131 0.217 0.073 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 8.39e-01 0.0381 0.187 0.073 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 5.24e-01 -0.132 0.207 0.073 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 2.54e-01 -0.0898 0.0785 0.073 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0388 0.204 0.073 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.84e-01 0.0486 0.177 0.064 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 2.09e-01 -0.213 0.169 0.064 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 7.75e-01 -0.049 0.171 0.064 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 5.25e-01 0.108 0.169 0.064 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 7.66e-02 0.303 0.17 0.064 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 7.39e-01 0.0249 0.0747 0.064 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 3.54e-01 0.169 0.182 0.064 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 8.18e-01 0.042 0.182 0.068 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.53e-01 0.0388 0.123 0.068 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 1.63e-01 0.242 0.173 0.068 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 1.20e-01 0.267 0.171 0.068 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.22e-02 0.335 0.164 0.068 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0371 0.0831 0.068 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.58e-01 -0.166 0.146 0.068 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 9.58e-01 0.0109 0.205 0.068 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.51e-02 -0.261 0.135 0.068 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 5.15e-01 0.0896 0.137 0.068 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 9.04e-01 0.0168 0.14 0.068 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0821 0.166 0.068 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 8.04e-01 0.0285 0.115 0.068 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 5.78e-01 0.0946 0.17 0.068 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -138981 sc-eQTL 5.69e-01 0.0926 0.162 0.068 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0496 0.184 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 4.03e-01 0.15 0.178 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0603 0.101 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0355 0.16 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 9.88e-02 -0.15 0.0907 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 2.88e-02 0.365 0.166 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 5.28e-01 0.102 0.161 0.064 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 1.93e-01 0.223 0.171 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 562672 sc-eQTL 3.22e-01 -0.187 0.188 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0756 0.0772 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 6.01e-02 -0.281 0.149 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0852 0.0907 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 3.60e-01 0.157 0.171 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 832259 sc-eQTL 9.68e-01 0.00437 0.109 0.064 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 4.19e-02 -0.283 0.138 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0334 0.0972 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 4.60e-01 0.117 0.158 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 2.69e-02 0.364 0.163 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 4.96e-01 0.0745 0.109 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 4.17e-01 0.0609 0.0748 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 5.58e-01 0.0782 0.133 0.064 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 7.68e-01 0.053 0.179 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0793 0.118 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 229382 sc-eQTL 7.08e-01 0.0653 0.174 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 250092 sc-eQTL 2.26e-01 0.209 0.172 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 3.97e-02 0.333 0.161 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 9.91e-01 0.000756 0.069 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 150808 sc-eQTL 4.82e-01 0.118 0.167 0.065 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -988023 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0903 0.145 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 450949 sc-eQTL 5.41e-01 0.0835 0.136 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 200688 sc-eQTL 9.82e-01 0.00392 0.173 0.065 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 149578 sc-eQTL 1.43e-01 -0.103 0.0701 0.065 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079931 MOXD1 562672 eQTL 0.00197 0.195 0.063 0.00576 0.00152 0.0604
ENSG00000093134 VNN3 229382 eQTL 0.00341 0.0897 0.0306 0.0 0.0 0.0604
ENSG00000112303 VNN2 200688 pQTL 0.000705 0.189 0.0557 0.0 0.0 0.0546
ENSG00000234484 AL032821.1 211472 eQTL 2.2e-07 -0.337 0.0645 0.0 0.0 0.0604


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000079931 MOXD1 562672 3.1e-07 1.59e-07 1.31e-07 2.26e-07 9.16e-08 9.05e-08 1.9e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.59e-07 1.08e-07 1.79e-07 7.95e-08 6.25e-08 7.5e-08 4.25e-08 1.8e-07 7.18e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 3.22e-08 1.72e-07 1.26e-07 1.1e-07 1.01e-07 1.26e-07 9.88e-08 1.02e-07 2.93e-08 4.27e-08 8.23e-08 3.57e-08 2.74e-08 4.28e-08 6.66e-08 6.76e-08 6.07e-08 4.84e-08 1.6e-07 3.2e-08 1.14e-08 3.66e-08 1.8e-08 1.15e-07 0.0 5.02e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 211472 2.63e-06 2.75e-06 6.66e-07 1.98e-06 3.81e-07 7.82e-07 1.85e-06 4.08e-07 1.7e-06 7.2e-07 2.43e-06 1.29e-06 3.58e-06 9.33e-07 4.61e-07 1.23e-06 1.55e-06 2.24e-06 6.58e-07 7.62e-07 1.1e-06 2.82e-06 1.77e-06 1.01e-06 3.3e-06 1.07e-06 1.01e-06 1.17e-06 1.76e-06 1.64e-06 9.07e-07 3.41e-07 6.45e-07 7.25e-07 1.03e-06 8.7e-07 7.59e-07 4.21e-07 6.93e-07 3.46e-07 2.4e-07 3.4e-06 4.01e-07 1.99e-07 2.91e-07 3.22e-07 6.08e-07 2.32e-07 2.8e-07