Genes within 1Mb (chr6:132862155:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 5.57e-02 0.209 0.109 0.259 B L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0394 0.0412 0.259 B L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.60e-01 -0.0874 0.0774 0.259 B L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 6.83e-04 0.157 0.0457 0.259 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 8.65e-03 0.258 0.0972 0.259 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 5.46e-01 0.0392 0.0648 0.259 B L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.47e-01 0.0153 0.0797 0.259 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 3.30e-02 -0.147 0.0683 0.259 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.08e-03 0.152 0.0458 0.259 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 3.01e-01 0.0981 0.0947 0.259 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.64e-01 0.0236 0.0785 0.259 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0253 0.0916 0.259 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 6.16e-01 0.0157 0.0313 0.259 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 5.53e-01 0.0561 0.0946 0.259 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 5.85e-01 0.0389 0.0713 0.261 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 4.60e-01 0.0654 0.0883 0.261 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 1.15e-01 -0.15 0.0949 0.261 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 8.51e-02 -0.175 0.101 0.261 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 6.04e-02 0.107 0.0568 0.261 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 2.94e-01 0.0951 0.0904 0.261 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -240973 sc-eQTL 8.54e-01 0.0152 0.0825 0.261 DC L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 6.29e-01 0.0263 0.0545 0.259 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0199 0.0935 0.259 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 5.96e-01 0.0535 0.101 0.259 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 1.74e-02 -0.168 0.0701 0.259 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.37e-02 0.09 0.0421 0.259 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0194 0.0842 0.259 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0185 0.0816 0.258 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00236 0.102 0.258 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0334 0.042 0.258 NK L1
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0208 0.0817 0.259 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.98e-03 -0.291 0.0968 0.259 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0215 0.0392 0.259 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.76e-01 0.0449 0.107 0.259 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 3.09e-01 0.118 0.116 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 5.84e-01 0.0598 0.109 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 5.61e-02 -0.221 0.115 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 6.21e-02 0.115 0.0615 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0831 0.109 0.247 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 3.87e-02 0.213 0.102 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 5.09e-01 0.0677 0.102 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0531 0.0669 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.00e-01 0.129 0.101 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 4.68e-04 0.213 0.06 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 5.31e-01 0.0698 0.111 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 1.08e-01 -0.152 0.094 0.258 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 4.39e-02 0.209 0.103 0.254 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0757 0.0816 0.254 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.36e-01 0.0361 0.107 0.254 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 4.24e-03 0.146 0.0505 0.254 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 2.38e-02 0.242 0.106 0.254 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 1.29e-01 -0.152 0.0997 0.254 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 5.02e-01 0.0777 0.116 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0597 0.0504 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.26e-02 -0.182 0.0974 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 4.54e-03 0.157 0.0548 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 1.36e-01 0.161 0.107 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 3.20e-01 0.071 0.0713 0.259 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 4.92e-01 0.0742 0.108 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00667 0.0588 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.18e-01 -0.133 0.108 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.57e-02 0.137 0.0564 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 9.76e-02 0.18 0.108 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 3.33e-01 0.0731 0.0754 0.255 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0152 0.108 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0501 0.109 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.66e-01 0.0455 0.0503 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 4.54e-01 -0.076 0.101 0.259 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.44e-01 0.0279 0.0853 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0925 0.0787 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.53e-04 0.191 0.0495 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.08e-01 0.0507 0.0986 0.259 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.31e-01 0.00822 0.0948 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 5.55e-02 -0.178 0.0926 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.92e-03 0.149 0.0473 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 4.85e-01 0.0783 0.112 0.259 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0994 0.109 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 9.22e-01 0.0103 0.105 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 8.74e-03 0.112 0.0423 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0435 0.107 0.259 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 5.25e-01 0.0574 0.0903 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 5.64e-01 0.0593 0.103 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 6.91e-02 -0.0996 0.0545 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 5.53e-01 0.0632 0.106 0.259 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 4.62e-01 0.0809 0.11 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 1.17e-01 0.148 0.0943 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 7.76e-03 0.144 0.0534 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.41e-01 0.0508 0.109 0.259 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 1.04e-01 -0.179 0.109 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0548 0.109 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 2.01e-01 0.0681 0.053 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.16e-01 0.0586 0.117 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00941 0.115 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 3.37e-01 -0.11 0.114 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0117 0.0615 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 2.31e-01 0.139 0.116 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.44e-02 0.177 0.102 0.258 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.29e-03 -0.317 0.103 0.258 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.91e-01 0.0442 0.0515 0.258 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 7.36e-01 0.0365 0.108 0.258 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0323 0.107 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.61e-01 0.0476 0.108 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 7.60e-01 0.0185 0.0604 0.26 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.39e-01 0.0176 0.0862 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.21e-01 0.0386 0.108 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 2.74e-01 -0.0468 0.0427 0.259 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.68e-02 0.191 0.107 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0524 0.109 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0107 0.051 0.263 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0815 0.0936 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.19e-01 0.0379 0.105 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0174 0.0572 0.259 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 2.55e-01 0.136 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.78e-01 0.0283 0.1 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0331 0.122 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.26e-01 0.106 0.0688 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 3.28e-01 0.127 0.13 0.248 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00903 0.0857 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.42e-02 -0.175 0.0973 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 3.14e-01 0.106 0.105 0.257 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 5.60e-01 0.0232 0.0398 0.257 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 7.97e-02 0.18 0.102 0.257 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.38e-02 -0.178 0.106 0.259 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 1.30e-01 -0.136 0.0892 0.259 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 9.39e-05 0.152 0.0383 0.259 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 2.74e-01 0.123 0.112 0.259 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0694 0.0916 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0193 0.0911 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 1.51e-01 -0.154 0.107 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.39e-02 -0.193 0.103 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.05e-01 0.0529 0.0514 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 8.58e-01 0.0183 0.102 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -240973 sc-eQTL 6.12e-01 0.0414 0.0816 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.40e-01 0.0142 0.0701 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0237 0.099 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 9.72e-01 0.00356 0.0999 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.43e-02 -0.179 0.0789 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.67e-01 0.04 0.0443 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 8.30e-01 0.0184 0.0856 0.259 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 3.43e-01 0.0715 0.0753 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 2.28e-01 -0.114 0.0939 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 7.26e-01 0.0358 0.102 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 4.58e-03 -0.188 0.0658 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.23e-01 0.0743 0.048 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 7.82e-02 -0.157 0.0887 0.259 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00506 0.127 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 3.00e-01 -0.146 0.14 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 7.01e-01 0.0206 0.0536 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0685 0.139 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.26e-01 0.036 0.102 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00428 0.103 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 6.50e-02 0.188 0.101 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 7.65e-01 -0.031 0.104 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.11e-02 0.114 0.0445 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0612 0.11 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 8.98e-01 0.00969 0.0756 0.256 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 7.92e-01 0.0282 0.107 0.256 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 1.35e-01 0.158 0.105 0.256 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.83e-01 -0.109 0.102 0.256 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.20e-01 0.0792 0.0508 0.256 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 5.46e-01 0.0545 0.0901 0.256 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 4.66e-01 0.0653 0.0893 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 5.19e-01 0.0582 0.09 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 9.22e-01 0.00902 0.0917 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 2.31e-02 -0.246 0.107 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 9.68e-03 0.193 0.0735 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 4.02e-01 0.0933 0.111 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -240973 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0467 0.106 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 1.66e-01 0.149 0.107 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0438 0.061 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 4.90e-01 0.0668 0.0966 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.10e-03 0.178 0.0537 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 1.69e-02 0.24 0.0997 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 8.14e-01 -0.023 0.0975 0.259 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 460680 sc-eQTL 3.33e-01 0.112 0.115 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0299 0.0473 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 4.23e-02 -0.186 0.0911 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 5.70e-03 0.153 0.0547 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 1.80e-02 0.247 0.104 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 730267 sc-eQTL 2.37e-01 0.0789 0.0665 0.259 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 5.60e-01 0.0341 0.0585 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0435 0.0953 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 9.08e-01 0.0115 0.0995 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 1.75e-02 -0.155 0.0649 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 2.30e-01 0.0541 0.0449 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0325 0.0802 0.259 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 9.00e-01 0.00907 0.0723 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 127390 sc-eQTL 9.10e-01 0.012 0.106 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 148100 sc-eQTL 1.65e-01 0.146 0.105 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0487 0.0993 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 1.20e-02 0.105 0.0415 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 sc-eQTL 7.68e-01 0.0302 0.102 0.259 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 348957 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0217 0.0816 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 98696 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00167 0.103 0.259 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 47586 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0377 0.0421 0.259 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 127390 eQTL 0.156 -0.0241 0.0169 0.0163 0.0092 0.244
ENSG00000112299 VNN1 148100 eQTL 2.22e-08 0.14 0.0248 0.0 0.0 0.244
ENSG00000112303 VNN2 98696 pQTL 9.36e-22 -0.28 0.0288 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112303 VNN2 98696 eQTL 9.59e-12 -0.101 0.0147 0.0 0.0 0.244
ENSG00000112306 RPS12 47586 eQTL 0.00613 -0.0192 0.00698 0.00234 0.0 0.244
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 eQTL 0.000541 0.0894 0.0258 0.0 0.0 0.244
ENSG00000234484 AL032821.1 109480 eQTL 9.07e-08 0.192 0.0356 0.0 0.0 0.244


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 148100 2.14e-06 2.66e-06 2.51e-07 1.67e-06 4.65e-07 8.14e-07 1.53e-06 6.01e-07 1.74e-06 8.34e-07 2.02e-06 1.3e-06 3.42e-06 1.15e-06 5.48e-07 1.15e-06 9.71e-07 1.73e-06 7.66e-07 1.15e-06 9.06e-07 2.34e-06 2.04e-06 9.95e-07 3.08e-06 1.2e-06 1.17e-06 1.39e-06 1.8e-06 1.8e-06 1.21e-06 2.5e-07 6.43e-07 1.22e-06 1.05e-06 8.86e-07 7.69e-07 4.1e-07 9.27e-07 3.35e-07 1.67e-07 2.83e-06 4.14e-07 1.99e-07 3.45e-07 3.09e-07 6.26e-07 2.25e-07 2.1e-07
ENSG00000112303 VNN2 98696 4.27e-06 4.63e-06 7.38e-07 2.32e-06 1.2e-06 1.27e-06 3.23e-06 9.52e-07 3.5e-06 1.97e-06 4.2e-06 3.04e-06 6.55e-06 2.01e-06 1.3e-06 2.43e-06 2.04e-06 2.89e-06 1.31e-06 9.7e-07 2.49e-06 4.1e-06 3.42e-06 1.65e-06 5.08e-06 1.36e-06 2.2e-06 1.45e-06 4.32e-06 3.94e-06 1.95e-06 5.93e-07 7.91e-07 1.86e-06 2.08e-06 9.97e-07 9.14e-07 5.11e-07 1.05e-06 3.98e-07 4.48e-07 4.67e-06 3.96e-07 1.79e-07 3.74e-07 3.94e-07 7.76e-07 3.35e-07 3.24e-07
ENSG00000112306 RPS12 47586 7.14e-06 9.5e-06 1.37e-06 4.2e-06 2.18e-06 3.93e-06 9.53e-06 1.49e-06 6.16e-06 4.35e-06 1.02e-05 4.46e-06 1.15e-05 3.8e-06 1.86e-06 5.69e-06 3.86e-06 5.13e-06 2.68e-06 2.58e-06 4.51e-06 7.57e-06 6.79e-06 2.9e-06 1.21e-05 2.92e-06 4.19e-06 2.96e-06 8.17e-06 7.87e-06 4.32e-06 7.91e-07 1.14e-06 2.96e-06 3.31e-06 2.14e-06 1.63e-06 1.86e-06 1.63e-06 1.04e-06 1.02e-06 9.16e-06 1.13e-06 1.61e-07 6.99e-07 1.32e-06 1.24e-06 6.93e-07 4.78e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 48816 7.03e-06 9.1e-06 1.32e-06 4.07e-06 2.22e-06 3.83e-06 9.63e-06 1.52e-06 6.17e-06 4.42e-06 9.71e-06 4.5e-06 1.12e-05 3.9e-06 1.76e-06 5.43e-06 3.8e-06 4.84e-06 2.66e-06 2.53e-06 4.51e-06 7.66e-06 6.69e-06 2.83e-06 1.19e-05 2.89e-06 4.15e-06 2.81e-06 7.82e-06 7.8e-06 4.16e-06 7.64e-07 1.1e-06 2.93e-06 3.13e-06 2.09e-06 1.55e-06 1.85e-06 1.6e-06 1.01e-06 9.79e-07 8.83e-06 1.03e-06 1.59e-07 7.07e-07 1.3e-06 1.12e-06 6.83e-07 5.09e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 109480 4e-06 3.85e-06 6.03e-07 1.93e-06 8.67e-07 9.33e-07 2.42e-06 1.03e-06 2.74e-06 1.61e-06 3.6e-06 2.28e-06 5.73e-06 1.35e-06 1.03e-06 2.01e-06 1.77e-06 2.07e-06 1.43e-06 1.05e-06 1.95e-06 3.46e-06 3.24e-06 1.9e-06 4.66e-06 1.16e-06 1.8e-06 1.46e-06 3.88e-06 3.29e-06 2.01e-06 4.72e-07 7.35e-07 1.8e-06 1.88e-06 8.85e-07 9.08e-07 4.72e-07 1.34e-06 3.64e-07 3.75e-07 4.1e-06 4.77e-07 1.86e-07 4.14e-07 3.54e-07 6.79e-07 2.4e-07 2.56e-07