Genes within 1Mb (chr6:132850693:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 6.16e-02 0.204 0.108 0.254 B L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 4.67e-01 -0.0301 0.0412 0.254 B L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.60e-01 -0.109 0.0772 0.254 B L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.07e-03 0.152 0.0457 0.254 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.09e-02 0.25 0.0972 0.254 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 6.23e-01 0.0319 0.0647 0.254 B L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.45e-01 0.0156 0.0797 0.254 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 4.03e-02 -0.141 0.0684 0.254 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.16e-03 0.151 0.0458 0.254 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0947 0.254 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.79e-01 0.0119 0.0783 0.254 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0476 0.0913 0.254 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 7.22e-01 0.0111 0.0312 0.254 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 6.15e-01 0.0475 0.0943 0.254 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 5.36e-01 0.0442 0.0712 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 6.18e-01 0.0441 0.0884 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 1.55e-01 -0.135 0.095 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.09e-01 -0.163 0.101 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.18e-01 0.0893 0.0569 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 3.51e-01 0.0846 0.0904 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -252435 sc-eQTL 6.85e-01 0.0335 0.0824 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.68e-01 0.0235 0.0547 0.254 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0146 0.0939 0.254 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 7.27e-01 0.0353 0.101 0.254 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.46e-02 -0.173 0.0703 0.254 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 4.82e-02 0.0841 0.0423 0.254 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 9.79e-01 -0.0022 0.0845 0.254 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.92e-01 -0.011 0.0815 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 9.91e-01 0.00118 0.101 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0246 0.0419 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00933 0.0816 0.254 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.98e-03 -0.26 0.0971 0.254 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 6.83e-01 -0.016 0.0391 0.254 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 8.06e-01 0.0264 0.107 0.254 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 2.14e-01 0.143 0.115 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.62e-01 0.0473 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.08e-02 -0.215 0.114 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 7.78e-02 0.108 0.0611 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0795 0.108 0.242 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 5.66e-02 0.196 0.102 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 6.82e-01 0.0419 0.102 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0356 0.0669 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 3.34e-01 0.0974 0.101 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.79e-03 0.191 0.0603 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 5.32e-01 0.0696 0.111 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 7.75e-02 -0.166 0.0938 0.253 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 3.35e-02 0.219 0.103 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0496 0.0813 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 8.67e-01 0.0178 0.106 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.85e-02 0.12 0.0506 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 2.47e-02 0.239 0.106 0.25 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 1.19e-01 -0.155 0.0991 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 5.87e-01 0.0627 0.115 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 2.70e-01 -0.0555 0.0502 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 8.45e-02 -0.168 0.097 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 6.76e-03 0.15 0.0547 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.41e-01 0.158 0.107 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 4.09e-01 0.0588 0.071 0.254 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 5.35e-01 0.0669 0.108 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.31e-01 0.00513 0.0588 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.70e-01 -0.148 0.107 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 2.61e-02 0.127 0.0565 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.19e-01 0.17 0.108 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 4.23e-01 0.0606 0.0755 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00622 0.107 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0722 0.108 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 3.57e-01 0.0461 0.05 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0933 0.101 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.91e-01 0.0339 0.0852 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0847 0.0787 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.68e-04 0.19 0.0495 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 6.48e-01 0.0451 0.0985 0.254 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0106 0.0948 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 5.21e-02 -0.181 0.0926 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.73e-03 0.15 0.0473 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 4.65e-01 0.082 0.112 0.254 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0808 0.109 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 9.66e-01 0.00442 0.105 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.20e-02 0.107 0.0423 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0401 0.107 0.254 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.93e-01 0.0356 0.0901 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.05e-01 0.0531 0.102 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 7.75e-02 -0.0965 0.0544 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 5.21e-01 0.0682 0.106 0.254 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 4.64e-01 0.0805 0.11 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.66e-01 0.131 0.0944 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.24e-02 0.135 0.0535 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 7.33e-01 0.0372 0.109 0.254 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.09e-02 -0.186 0.11 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.74e-01 -0.0315 0.11 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 3.24e-01 0.0527 0.0533 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 7.63e-01 0.0354 0.117 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.50e-01 0.0217 0.114 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 2.80e-01 -0.123 0.113 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0114 0.0612 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 3.83e-01 0.101 0.115 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.24e-02 0.173 0.102 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 4.96e-03 -0.291 0.103 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 5.44e-01 0.0312 0.0514 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 6.96e-01 0.0422 0.108 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0233 0.107 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.36e-01 0.0514 0.108 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 6.55e-01 0.0271 0.0604 0.256 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 7.49e-01 0.0276 0.086 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.89e-01 0.0431 0.108 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0428 0.0426 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 7.46e-02 0.192 0.107 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0374 0.109 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00442 0.0509 0.258 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0793 0.0935 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.35e-01 0.0357 0.105 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0134 0.0571 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 2.55e-01 0.136 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 7.78e-01 0.0283 0.1 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0331 0.122 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.26e-01 0.106 0.0688 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 3.28e-01 0.127 0.13 0.248 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00903 0.0857 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.85e-02 -0.161 0.097 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 2.31e-01 0.125 0.104 0.252 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 4.05e-01 0.033 0.0396 0.252 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.34e-01 0.153 0.102 0.252 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 1.11e-01 -0.169 0.106 0.254 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 8.90e-02 -0.152 0.0889 0.254 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.13e-04 0.15 0.0382 0.254 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 2.64e-01 0.125 0.112 0.254 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0928 0.0918 0.263 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0353 0.0914 0.263 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 1.75e-01 -0.146 0.107 0.263 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.26e-02 -0.194 0.104 0.263 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 4.23e-01 0.0414 0.0516 0.263 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00398 0.102 0.263 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -252435 sc-eQTL 4.52e-01 0.0616 0.0817 0.263 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.92e-01 0.00954 0.07 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0248 0.0989 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0214 0.0998 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.74e-02 -0.189 0.0787 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 5.36e-01 0.0274 0.0443 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 6.79e-01 0.0354 0.0855 0.254 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 3.81e-01 0.0663 0.0755 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 2.47e-01 -0.109 0.0941 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 8.82e-01 0.0153 0.103 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 4.40e-03 -0.19 0.0659 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.62e-01 0.0675 0.0481 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.09e-01 -0.143 0.089 0.254 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 9.32e-01 0.011 0.128 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 3.51e-01 -0.132 0.141 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 6.27e-01 0.0263 0.054 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0349 0.14 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.83e-01 0.042 0.103 0.251 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 9.09e-01 0.0119 0.104 0.251 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 2.79e-02 0.225 0.101 0.251 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0469 0.104 0.251 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.85e-02 0.106 0.0448 0.251 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0699 0.11 0.251 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.48e-01 0.0145 0.0755 0.251 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 9.64e-01 0.00477 0.107 0.251 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 1.64e-01 0.147 0.105 0.251 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 2.18e-01 -0.125 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.58e-01 0.072 0.0508 0.251 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 5.92e-01 0.0484 0.09 0.251 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 5.06e-01 0.0594 0.0891 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 7.00e-01 0.0346 0.0897 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 9.36e-01 0.00738 0.0914 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 2.71e-02 -0.239 0.107 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 1.04e-02 0.19 0.0733 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 3.75e-01 0.0985 0.111 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -252435 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0298 0.106 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 1.47e-01 0.156 0.107 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0301 0.061 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 7.26e-01 0.034 0.0966 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 2.17e-03 0.167 0.0538 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 1.17e-02 0.253 0.0995 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0338 0.0974 0.254 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 449218 sc-eQTL 3.88e-01 0.0994 0.115 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0208 0.0472 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 3.79e-02 -0.19 0.0907 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 9.67e-03 0.143 0.0546 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 2.84e-02 0.228 0.103 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 718805 sc-eQTL 3.11e-01 0.0673 0.0663 0.254 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 6.23e-01 0.0288 0.0585 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0452 0.0954 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0106 0.0995 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 1.45e-02 -0.16 0.0649 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 3.27e-01 0.0443 0.045 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0159 0.0803 0.254 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.01e-01 0.0183 0.0724 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 115928 sc-eQTL 9.51e-01 0.00658 0.107 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 136638 sc-eQTL 1.75e-01 0.143 0.105 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0639 0.0994 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 2.01e-02 0.0977 0.0417 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 sc-eQTL 7.92e-01 0.0271 0.103 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 337495 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0149 0.0814 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 87234 sc-eQTL 9.57e-01 0.00562 0.103 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 36124 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0273 0.042 0.254 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 115928 eQTL 0.129 -0.0258 0.017 0.0106 0.00628 0.244
ENSG00000112299 VNN1 136638 eQTL 2.06e-08 0.141 0.0249 0.0 0.0 0.244
ENSG00000112303 VNN2 87234 pQTL 3.96e-22 -0.284 0.0288 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112303 VNN2 87234 eQTL 8.37e-12 -0.102 0.0147 0.0 0.0 0.244
ENSG00000112306 RPS12 36124 eQTL 0.00691 -0.0189 0.007 0.00216 0.0 0.244
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 eQTL 0.000417 0.0914 0.0258 0.0 0.0 0.244
ENSG00000234484 AL032821.1 98018 eQTL 1.1e-07 0.191 0.0357 0.0 0.0 0.244


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 136638 1.45e-05 1.76e-05 2.65e-06 1.22e-05 2.57e-06 6.77e-06 2.14e-05 2.25e-06 1.62e-05 7.65e-06 2.04e-05 6.53e-06 3.39e-05 7.58e-06 5.06e-06 8.95e-06 8.19e-06 1.29e-05 4.15e-06 4.2e-06 7.14e-06 1.4e-05 1.47e-05 4.71e-06 2.4e-05 5e-06 7.6e-06 5.65e-06 1.57e-05 1.12e-05 1.08e-05 1.63e-06 1.23e-06 4.56e-06 7.96e-06 3.83e-06 1.91e-06 2.4e-06 3.71e-06 1.73e-06 1.11e-06 1.79e-05 2.68e-06 2.1e-07 1.59e-06 3e-06 2.12e-06 1.49e-06 1.32e-06
ENSG00000112303 VNN2 87234 2.1e-05 2.61e-05 3.55e-06 1.39e-05 3.33e-06 1.02e-05 3.09e-05 3.47e-06 2.13e-05 1.01e-05 2.88e-05 9.22e-06 4.07e-05 1.05e-05 5.37e-06 1.13e-05 1.2e-05 1.78e-05 4.98e-06 5.18e-06 9.16e-06 2.09e-05 2.05e-05 5.67e-06 3.01e-05 5.39e-06 8.84e-06 8.17e-06 2.1e-05 1.57e-05 1.31e-05 1.62e-06 1.65e-06 5.45e-06 9.6e-06 4.4e-06 2.37e-06 2.73e-06 4.48e-06 2.67e-06 1.48e-06 2.6e-05 3.07e-06 2.64e-07 1.91e-06 3.2e-06 2.94e-06 1.41e-06 1.32e-06
ENSG00000112306 RPS12 36124 3.69e-05 3.37e-05 5.66e-06 1.55e-05 5.05e-06 1.44e-05 4.44e-05 4.24e-06 3.01e-05 1.39e-05 3.78e-05 1.63e-05 4.85e-05 1.38e-05 6.33e-06 1.72e-05 1.73e-05 2.39e-05 7.14e-06 6.05e-06 1.39e-05 3.03e-05 3.06e-05 7.95e-06 4.05e-05 7.46e-06 1.32e-05 1.16e-05 3.05e-05 2.35e-05 1.83e-05 1.63e-06 2.38e-06 6.6e-06 1.14e-05 5.16e-06 2.82e-06 2.96e-06 4.58e-06 3.15e-06 1.7e-06 3.89e-05 3.74e-06 2.86e-07 2.13e-06 3.47e-06 3.77e-06 1.47e-06 1.52e-06
ENSG00000146409 SLC18B1 37354 3.59e-05 3.37e-05 5.6e-06 1.55e-05 4.91e-06 1.42e-05 4.4e-05 4.24e-06 2.98e-05 1.38e-05 3.76e-05 1.61e-05 4.8e-05 1.36e-05 6.27e-06 1.7e-05 1.73e-05 2.39e-05 7.02e-06 6.05e-06 1.38e-05 2.99e-05 3.03e-05 7.92e-06 4.01e-05 7.42e-06 1.31e-05 1.15e-05 3.01e-05 2.32e-05 1.83e-05 1.61e-06 2.39e-06 6.6e-06 1.12e-05 5.11e-06 2.82e-06 2.96e-06 4.54e-06 3.15e-06 1.67e-06 3.84e-05 3.68e-06 2.85e-07 2.1e-06 3.41e-06 3.8e-06 1.48e-06 1.46e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 98018 1.83e-05 2.37e-05 3.2e-06 1.35e-05 3.17e-06 9.14e-06 2.77e-05 3.39e-06 1.97e-05 9.47e-06 2.63e-05 8.28e-06 3.92e-05 9.56e-06 5.22e-06 1.04e-05 1.07e-05 1.68e-05 4.64e-06 4.89e-06 8.59e-06 1.91e-05 1.87e-05 5.19e-06 2.84e-05 5.42e-06 8.28e-06 7.8e-06 1.91e-05 1.46e-05 1.29e-05 1.6e-06 1.51e-06 5.42e-06 9.3e-06 4.2e-06 2.31e-06 2.68e-06 4.46e-06 2.44e-06 1.3e-06 2.34e-05 2.95e-06 2.62e-07 1.9e-06 3.23e-06 2.84e-06 1.4e-06 1.33e-06