Genes within 1Mb (chr6:132843303:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 1.51e-01 0.154 0.107 0.271 B L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0382 0.0406 0.271 B L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 4.32e-01 -0.06 0.0763 0.271 B L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.08e-03 0.149 0.045 0.271 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 5.82e-03 0.266 0.0955 0.271 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 7.12e-01 0.0235 0.0638 0.271 B L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.71e-01 0.00284 0.0786 0.271 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.42e-01 -0.0997 0.0677 0.271 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 2.09e-03 0.141 0.0453 0.271 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 2.20e-01 0.115 0.0933 0.271 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.45e-01 0.00537 0.0773 0.271 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0367 0.0902 0.271 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 7.30e-01 0.0107 0.0308 0.271 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 7.07e-01 0.0351 0.0932 0.271 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 7.43e-01 0.0232 0.0705 0.275 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 5.12e-01 0.0574 0.0874 0.275 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 2.30e-01 -0.113 0.0941 0.275 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 2.78e-01 -0.11 0.101 0.275 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.73e-02 0.0937 0.0563 0.275 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 7.96e-02 0.157 0.089 0.275 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -259825 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0275 0.0816 0.275 DC L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 7.90e-01 0.0144 0.0538 0.271 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0432 0.0924 0.271 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 4.20e-01 0.0803 0.0993 0.271 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.05e-01 -0.114 0.0698 0.271 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.89e-02 0.0866 0.0416 0.271 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 9.53e-01 0.00488 0.0832 0.271 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0552 0.0804 0.27 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 8.35e-01 0.0208 0.1 0.27 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0219 0.0414 0.27 NK L1
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0407 0.0804 0.271 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 2.08e-02 -0.224 0.0961 0.271 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0179 0.0386 0.271 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0289 0.106 0.271 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 5.51e-01 0.0681 0.114 0.263 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.84e-01 0.00211 0.107 0.263 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.39e-01 -0.168 0.113 0.263 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 7.04e-02 0.11 0.0604 0.263 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 7.50e-01 -0.034 0.107 0.263 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 5.90e-02 0.192 0.101 0.263 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 7.49e-01 0.0322 0.1 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0622 0.0656 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.21e-01 0.0984 0.0988 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 8.03e-04 0.201 0.059 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 5.71e-01 0.0619 0.109 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 8.51e-02 -0.159 0.0922 0.27 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 4.36e-02 0.204 0.101 0.267 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0511 0.0797 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 9.18e-01 0.0107 0.104 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 8.02e-03 0.132 0.0494 0.267 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 2.77e-02 0.23 0.104 0.267 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 9.03e-02 -0.165 0.0971 0.267 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 6.44e-01 0.0524 0.113 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 2.27e-01 -0.0597 0.0494 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.22e-01 -0.149 0.0956 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.56e-02 0.132 0.054 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 6.99e-02 0.191 0.105 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 3.94e-01 0.0596 0.0699 0.271 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 5.77e-01 0.0592 0.106 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0294 0.0578 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0858 0.106 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.69e-03 0.154 0.0552 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 3.52e-02 0.225 0.106 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 7.03e-01 0.0284 0.0743 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00233 0.106 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.31e-01 -0.104 0.107 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 2.72e-01 0.0542 0.0492 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 4.08e-01 -0.0823 0.0993 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 7.12e-01 0.0311 0.084 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0272 0.0778 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.73e-04 0.177 0.049 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 6.70e-01 0.0414 0.0971 0.271 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0303 0.0935 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.38e-02 -0.164 0.0915 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 2.62e-03 0.142 0.0468 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 2.42e-01 0.129 0.11 0.271 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0949 0.108 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0663 0.104 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.56e-02 0.102 0.0419 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0244 0.106 0.271 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.81e-01 0.00212 0.0891 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 5.43e-01 0.0616 0.101 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.76e-02 -0.0896 0.0538 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 5.48e-01 0.0631 0.105 0.271 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 4.77e-01 0.0772 0.108 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.67e-01 0.129 0.0931 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.59e-02 0.128 0.0528 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 9.28e-01 0.00976 0.107 0.271 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 5.93e-02 -0.205 0.108 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 8.39e-01 0.022 0.108 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 2.71e-01 0.0579 0.0525 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 8.45e-01 0.0226 0.115 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00111 0.115 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.69e-01 -0.102 0.114 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00442 0.0612 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 5.56e-01 0.0682 0.116 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 2.03e-01 0.129 0.101 0.271 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.13e-02 -0.26 0.102 0.271 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.54e-01 0.0472 0.0508 0.271 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00252 0.107 0.271 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0489 0.105 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.26e-01 0.0375 0.107 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 7.22e-01 0.0212 0.0597 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0395 0.085 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 6.04e-01 0.0552 0.106 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.20e-01 -0.042 0.0421 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 1.28e-01 0.165 0.108 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00219 0.11 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.66e-01 0.00219 0.051 0.276 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 2.47e-01 -0.107 0.0923 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 4.55e-01 0.0778 0.104 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.13e-01 0.0062 0.0565 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 5.54e-01 0.0687 0.116 0.263 PB L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0322 0.0968 0.263 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 8.89e-01 -0.0166 0.118 0.263 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 7.79e-02 0.118 0.0663 0.263 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 6.14e-01 0.0637 0.126 0.263 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0308 0.0828 0.263 PB L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 1.75e-01 -0.13 0.0959 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.99e-01 0.132 0.103 0.27 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.09e-01 0.0258 0.039 0.27 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 9.93e-02 0.166 0.1 0.27 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 1.13e-01 -0.167 0.105 0.271 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.04e-01 -0.144 0.0881 0.271 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 6.29e-05 0.154 0.0377 0.271 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 2.45e-01 0.129 0.11 0.271 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0744 0.0909 0.283 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0212 0.0904 0.283 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 2.01e-01 -0.136 0.106 0.283 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 2.05e-01 -0.131 0.103 0.283 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.64e-01 0.0464 0.051 0.283 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 3.74e-01 0.09 0.101 0.283 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -259825 sc-eQTL 8.74e-01 0.0128 0.0809 0.283 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.99e-01 -7.34e-05 0.0693 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 5.47e-01 -0.059 0.0979 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 8.70e-01 0.0162 0.0988 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.95e-01 -0.102 0.0787 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.60e-01 0.0256 0.0438 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 5.54e-01 0.0501 0.0846 0.271 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 5.02e-01 0.0501 0.0746 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 2.75e-01 -0.102 0.0929 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 3.87e-01 0.0875 0.101 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.43e-02 -0.14 0.0656 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.03e-01 0.0776 0.0474 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 8.68e-02 -0.151 0.0877 0.271 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0663 0.125 0.276 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.94e-01 -0.118 0.138 0.276 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.15e-01 0.0342 0.0525 0.276 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 4.56e-01 -0.101 0.136 0.276 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 5.39e-01 0.0619 0.101 0.269 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0165 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 1.91e-02 0.234 0.0991 0.269 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.95e-01 0.0266 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.97e-02 0.091 0.044 0.269 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0562 0.108 0.269 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00477 0.0741 0.267 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 7.38e-01 0.035 0.105 0.267 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 4.83e-02 0.204 0.103 0.267 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 2.56e-01 -0.113 0.0995 0.267 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 7.53e-02 0.0888 0.0497 0.267 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 4.14e-01 0.0722 0.0883 0.267 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 9.25e-01 0.00829 0.0875 0.271 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 7.41e-01 0.0292 0.0881 0.271 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 8.90e-01 0.0125 0.0897 0.271 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 3.20e-02 -0.228 0.105 0.271 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.46e-02 0.178 0.0721 0.271 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 2.70e-01 0.12 0.108 0.271 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -259825 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0877 0.104 0.271 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 2.26e-01 0.128 0.105 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0488 0.0596 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 5.62e-01 0.0549 0.0944 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.39e-03 0.17 0.0526 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 1.49e-02 0.239 0.0974 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0281 0.0953 0.271 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 441828 sc-eQTL 3.85e-01 0.0986 0.113 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0397 0.0465 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.79e-01 -0.121 0.09 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 1.22e-02 0.136 0.0539 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 9.27e-03 0.267 0.101 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 711415 sc-eQTL 4.29e-01 0.0518 0.0654 0.271 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 8.31e-01 0.0123 0.0578 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0706 0.094 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 7.12e-01 0.0363 0.0982 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 1.12e-01 -0.103 0.0645 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 3.22e-01 0.0441 0.0444 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0132 0.0792 0.271 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 8.39e-01 0.0144 0.0711 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 108538 sc-eQTL 8.64e-01 0.018 0.105 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 129248 sc-eQTL 5.14e-02 0.201 0.103 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0345 0.0977 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 9.43e-03 0.107 0.0408 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 sc-eQTL 7.66e-01 0.03 0.101 0.272 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 330105 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0578 0.0804 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 79844 sc-eQTL 7.44e-01 0.0333 0.102 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 28734 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0265 0.0416 0.272 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 108538 eQTL 0.338 -0.0159 0.0166 0.00384 0.00304 0.262
ENSG00000112299 VNN1 129248 eQTL 3.26e-07 0.125 0.0243 0.0 0.0 0.262
ENSG00000112303 VNN2 79844 pQTL 5.83e-16 -0.232 0.0283 0.0 0.0 0.264
ENSG00000112303 VNN2 79844 eQTL 8.13e-09 -0.0842 0.0145 0.0 0.0 0.262
ENSG00000112306 RPS12 28734 eQTL 0.00732 -0.0183 0.00683 0.00217 0.0 0.262
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 eQTL 4.49e-05 0.103 0.0251 0.0 0.0 0.262
ENSG00000234484 AL032821.1 90628 eQTL 4.23e-05 0.144 0.035 0.0 0.0 0.262


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 129248 4.19e-06 4.33e-06 5.82e-07 1.86e-06 8.3e-07 8.89e-07 2.79e-06 8.79e-07 2.7e-06 1.45e-06 3.74e-06 2.05e-06 6.48e-06 1.37e-06 9.89e-07 2e-06 1.77e-06 2.36e-06 1.47e-06 1.2e-06 1.68e-06 3.65e-06 3.45e-06 1.82e-06 4.66e-06 1.21e-06 1.57e-06 1.69e-06 3.8e-06 3.42e-06 2.02e-06 3.79e-07 5.69e-07 1.83e-06 1.87e-06 9.53e-07 8.92e-07 4.09e-07 1.34e-06 3.46e-07 2.08e-07 4.67e-06 6.38e-07 1.99e-07 3.13e-07 3.33e-07 8.96e-07 2.15e-07 1.53e-07
ENSG00000112303 VNN2 79844 5.49e-06 6.63e-06 6.38e-07 3.37e-06 1.73e-06 1.56e-06 8.05e-06 1.18e-06 4.83e-06 2.76e-06 7.6e-06 3.18e-06 9.9e-06 2.15e-06 9.37e-07 3.97e-06 2.76e-06 3.84e-06 1.51e-06 1.5e-06 2.71e-06 5.63e-06 4.76e-06 1.89e-06 9.06e-06 2.1e-06 2.24e-06 1.78e-06 5.92e-06 6.7e-06 2.89e-06 3.85e-07 7.27e-07 2.24e-06 2.09e-06 1.29e-06 1.08e-06 4.18e-07 9.23e-07 6.22e-07 7.52e-07 8.34e-06 4.9e-07 1.82e-07 7.43e-07 1.12e-06 1.13e-06 7.35e-07 4.23e-07
ENSG00000146409 SLC18B1 29964 1.21e-05 1.31e-05 2.54e-06 7.87e-06 2.32e-06 5.91e-06 1.65e-05 2.2e-06 1.15e-05 6.01e-06 1.64e-05 6.55e-06 2.28e-05 4.51e-06 4.15e-06 7.69e-06 6.9e-06 1.07e-05 3.64e-06 3.39e-06 6.51e-06 1.21e-05 1.23e-05 4.56e-06 2.11e-05 4.65e-06 6.74e-06 5.26e-06 1.44e-05 1.46e-05 8.17e-06 1.05e-06 1.44e-06 4.01e-06 5.44e-06 3.35e-06 1.76e-06 2.25e-06 2.61e-06 1.69e-06 1.14e-06 1.69e-05 1.61e-06 2.03e-07 1.04e-06 2.02e-06 1.98e-06 7.67e-07 5.4e-07
ENSG00000234484 AL032821.1 90628 4.85e-06 5.58e-06 7.29e-07 3.21e-06 1.62e-06 1.56e-06 6.29e-06 9.99e-07 5.07e-06 2.5e-06 6.19e-06 3.18e-06 8.21e-06 1.8e-06 1.21e-06 3.85e-06 1.92e-06 3.85e-06 1.54e-06 1.17e-06 2.96e-06 4.88e-06 4.6e-06 1.71e-06 7.95e-06 1.98e-06 2.45e-06 1.77e-06 4.66e-06 5.45e-06 2.8e-06 4.91e-07 5.21e-07 1.84e-06 2.04e-06 1.17e-06 9.76e-07 4.24e-07 8.54e-07 4.89e-07 5.82e-07 7.04e-06 4.2e-07 1.63e-07 5.64e-07 1.1e-06 1.01e-06 5.06e-07 3.73e-07