Genes within 1Mb (chr6:132815972:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 2.18e-01 0.127 0.103 0.282 B L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 5.90e-01 -0.021 0.0389 0.282 B L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.51e-01 -0.084 0.073 0.282 B L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.58e-03 0.138 0.0433 0.282 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 4.83e-02 0.183 0.0924 0.282 B L1
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 6.42e-01 0.0284 0.0611 0.282 B L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.15e-01 0.0384 0.0761 0.282 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.36e-01 -0.0983 0.0656 0.282 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.66e-03 0.133 0.0439 0.282 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 3.92e-01 0.0777 0.0906 0.282 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 7.25e-01 0.0264 0.0751 0.282 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 4.80e-01 -0.062 0.0876 0.282 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0051 0.03 0.282 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00775 0.0906 0.282 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.91e-01 0.0269 0.0675 0.284 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 8.62e-01 0.0146 0.0837 0.284 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0538 0.0903 0.284 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.71e-01 -0.106 0.0964 0.284 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 8.29e-02 0.0938 0.0538 0.284 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 1.99e-01 0.11 0.0854 0.284 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 -287156 sc-eQTL 3.62e-01 0.0712 0.0779 0.284 DC L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 7.10e-01 0.0194 0.0522 0.282 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0121 0.0896 0.282 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 3.89e-01 0.083 0.0962 0.282 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 3.71e-02 -0.141 0.0673 0.282 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.97e-02 0.0882 0.0403 0.282 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0121 0.0807 0.282 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0576 0.0777 0.281 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0104 0.0969 0.281 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 4.51e-02 -0.08 0.0397 0.281 NK L1
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.42e-01 -0.036 0.0774 0.282 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 5.20e-02 -0.181 0.0928 0.282 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0409 0.037 0.282 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0296 0.102 0.282 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 6.55e-01 0.0477 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.95e-01 0.0393 0.0998 0.273 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.44e-01 -0.155 0.106 0.273 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.15e-02 0.106 0.0564 0.273 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00561 0.0998 0.273 B_Activated L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 1.60e-01 0.134 0.0946 0.273 B_Activated L2
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 8.08e-01 0.0233 0.0961 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0439 0.0628 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 4.05e-01 0.079 0.0945 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.37e-03 0.184 0.0566 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 7.32e-01 0.0359 0.104 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 8.03e-03 -0.234 0.0873 0.281 B_Intermediate L2
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 3.56e-02 0.202 0.0956 0.278 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0305 0.0758 0.278 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0137 0.0992 0.278 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 3.61e-02 0.0997 0.0473 0.278 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 1.62e-01 0.139 0.0992 0.278 B_Memory L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 3.22e-02 -0.198 0.0919 0.278 B_Memory L2
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00323 0.108 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0264 0.0471 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.38e-02 -0.224 0.0903 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.55e-02 0.126 0.0515 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 3.48e-01 0.0944 0.1 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 3.97e-01 0.0565 0.0666 0.282 B_Naive1 L2
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 9.11e-01 0.0113 0.101 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 7.59e-01 -0.017 0.0551 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0551 0.101 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 3.45e-02 0.113 0.053 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 1.50e-01 0.147 0.102 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 5.97e-01 0.0375 0.0708 0.279 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0107 0.102 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 3.53e-01 -0.096 0.103 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.25e-01 0.0234 0.0477 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0539 0.0962 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 5.25e-01 0.0518 0.0813 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0385 0.0754 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.65e-05 0.207 0.0468 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 8.76e-01 0.0147 0.0942 0.282 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 7.52e-01 0.0287 0.0909 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.01e-01 -0.114 0.0893 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.59e-02 0.111 0.0458 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 8.99e-01 0.0136 0.108 0.282 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.95e-01 -0.108 0.103 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 9.56e-01 0.00547 0.099 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 8.99e-02 0.0687 0.0403 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0299 0.101 0.282 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 8.70e-01 0.014 0.0851 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.22e-01 0.0218 0.0967 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 3.15e-02 -0.111 0.0512 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 8.80e-01 0.0151 0.1 0.282 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 5.30e-01 0.0661 0.105 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.75e-01 0.123 0.0903 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.58e-03 0.14 0.051 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0487 0.104 0.282 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 1.80e-01 -0.142 0.105 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.27e-01 -0.023 0.105 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.99e-01 0.0199 0.0512 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.98e-01 0.0592 0.112 0.28 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 9.28e-01 0.00975 0.108 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0562 0.108 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0355 0.058 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 6.64e-01 0.0477 0.11 0.279 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.83e-01 0.105 0.0972 0.281 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.98e-02 -0.214 0.098 0.281 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 7.69e-01 0.0143 0.0488 0.281 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.76e-01 0.0572 0.102 0.281 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 8.81e-01 0.0152 0.101 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.06e-01 0.13 0.102 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0245 0.0571 0.284 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 9.73e-01 0.00281 0.0818 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 7.02e-01 0.0391 0.102 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 8.43e-02 -0.0699 0.0403 0.282 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.47e-01 0.118 0.102 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0777 0.103 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0639 0.048 0.288 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0922 0.0885 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 6.14e-01 0.0504 0.0996 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0579 0.054 0.282 NK_cytokine L2
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 6.80e-01 0.0469 0.114 0.278 PB L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.23e-01 0.115 0.0943 0.278 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0496 0.116 0.278 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.77e-01 0.0887 0.0653 0.278 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 4.36e-01 0.0962 0.123 0.278 PB L2
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00466 0.0811 0.278 PB L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 1.54e-01 -0.131 0.0918 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 4.44e-02 0.198 0.0979 0.28 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00185 0.0374 0.28 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 2.86e-01 0.103 0.0966 0.28 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.92e-02 -0.183 0.1 0.282 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.24e-01 -0.13 0.0844 0.282 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 9.15e-05 0.144 0.0362 0.282 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 2.55e-01 0.121 0.106 0.282 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0973 0.0872 0.293 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0367 0.0869 0.293 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0703 0.102 0.293 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.06e-02 -0.174 0.0988 0.293 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 6.98e-01 0.0191 0.0491 0.293 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 4.97e-01 0.0662 0.0973 0.293 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -287156 sc-eQTL 4.71e-01 0.0562 0.0777 0.293 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0247 0.0664 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0218 0.0939 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 4.93e-01 0.0649 0.0946 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.05e-01 -0.123 0.0753 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 4.95e-01 0.0287 0.042 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.86e-01 0.0443 0.0811 0.282 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 1.18e-01 0.111 0.071 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 1.53e-01 -0.127 0.0888 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 7.60e-01 0.0296 0.0969 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 2.02e-02 -0.147 0.0627 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.18e-01 0.0713 0.0454 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 7.84e-02 -0.148 0.084 0.282 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 9.99e-01 0.000224 0.125 0.273 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.19e-01 -0.214 0.137 0.273 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 7.03e-01 -0.02 0.0524 0.273 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0995 0.135 0.273 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.32e-01 0.047 0.0978 0.28 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00516 0.0988 0.28 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 1.99e-03 0.299 0.0954 0.28 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0157 0.0993 0.28 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 7.76e-03 0.114 0.0424 0.28 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0609 0.105 0.28 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0175 0.071 0.276 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 5.16e-01 0.0651 0.1 0.276 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 3.17e-02 0.213 0.0984 0.276 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 1.66e-01 -0.132 0.0952 0.276 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.09e-01 0.0602 0.0478 0.276 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 4.70e-01 0.0612 0.0846 0.276 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 3.93e-01 0.0735 0.0859 0.277 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 6.76e-01 0.0363 0.0866 0.277 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 3.97e-01 0.0747 0.088 0.277 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 9.11e-02 -0.177 0.104 0.277 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.24e-03 0.23 0.0699 0.277 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 3.87e-01 0.0926 0.107 0.277 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 -287156 sc-eQTL 6.53e-01 0.0462 0.102 0.277 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 1.12e-01 0.16 0.1 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0226 0.0572 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 7.56e-01 0.0282 0.0905 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 4.09e-03 0.147 0.0506 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.00e-02 0.185 0.0938 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 2.36e-01 -0.108 0.091 0.282 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079931 MOXD1 414497 sc-eQTL 8.17e-01 0.0251 0.108 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0105 0.0444 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 3.90e-02 -0.177 0.0854 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 1.52e-02 0.126 0.0515 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 5.65e-02 0.187 0.0976 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000228495 LINC01013 684084 sc-eQTL 2.60e-01 0.0704 0.0623 0.282 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 6.10e-01 0.0284 0.0555 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 5.29e-01 -0.057 0.0905 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 6.75e-01 0.0396 0.0944 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 5.80e-02 -0.118 0.0619 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 2.66e-01 0.0476 0.0427 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0132 0.0762 0.282 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00661 0.068 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 81207 sc-eQTL 6.66e-01 0.0432 0.1 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 101917 sc-eQTL 3.21e-02 0.212 0.0981 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0717 0.0934 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 4.89e-02 0.0779 0.0393 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 sc-eQTL 9.54e-01 0.00552 0.0963 0.282 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 302774 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0669 0.0776 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 52513 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0189 0.0984 0.282 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 1403 sc-eQTL 4.78e-02 -0.0792 0.0398 0.282 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 81207 eQTL 0.00934 -0.0419 0.0161 0.00116 0.0 0.272
ENSG00000112299 VNN1 101917 eQTL 4.53e-11 0.157 0.0235 0.0 0.0 0.272
ENSG00000112303 VNN2 52513 pQTL 1.7099999999999998e-23 -0.278 0.0273 0.0 0.0 0.274
ENSG00000112303 VNN2 52513 eQTL 3.04e-11 -0.0943 0.014 0.0 0.0 0.272
ENSG00000112306 RPS12 1403 eQTL 0.0409 -0.0136 0.00666 0.0 0.0 0.272
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 eQTL 4.32e-05 0.101 0.0245 0.0 0.0 0.272
ENSG00000234484 AL032821.1 63297 eQTL 2.08e-10 0.217 0.0337 0.0 0.0 0.272


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112299 VNN1 101917 2.59e-05 1.71e-05 5.06e-06 8.36e-06 2.46e-06 8.16e-06 2.17e-05 2.33e-06 1.39e-05 7.65e-06 1.58e-05 6.41e-06 2.49e-05 6.35e-06 4.72e-06 9e-06 7.11e-06 8.13e-06 4.02e-06 4.47e-06 7.68e-06 1.42e-05 1.62e-05 4.56e-06 2.35e-05 4.36e-06 8e-06 6.17e-06 1.77e-05 1.19e-05 8.34e-06 9.76e-07 1.9e-06 5.09e-06 7.28e-06 3.83e-06 1.78e-06 2.29e-06 2.01e-06 1.26e-06 1.21e-06 2.57e-05 2.81e-06 1.58e-07 1.99e-06 2.34e-06 1.93e-06 8.09e-07 1.06e-06
ENSG00000112303 VNN2 52513 4.04e-05 2.83e-05 6.26e-06 1.3e-05 4.07e-06 1.29e-05 3.66e-05 3.73e-06 2.29e-05 1.23e-05 2.63e-05 1.02e-05 3.78e-05 1.16e-05 5.88e-06 1.34e-05 1.14e-05 1.58e-05 6.45e-06 6.43e-06 1.19e-05 2.53e-05 2.59e-05 7.18e-06 3.59e-05 5.57e-06 1.15e-05 9.9e-06 2.73e-05 2.03e-05 1.36e-05 1.45e-06 2.68e-06 7.1e-06 1.08e-05 4.58e-06 2.29e-06 2.88e-06 3.4e-06 2.5e-06 1.72e-06 3.51e-05 3.68e-06 2.2e-07 2.39e-06 2.97e-06 3.36e-06 1.3e-06 1.38e-06
ENSG00000146409 SLC18B1 2633 4.47e-05 3.69e-05 7.01e-06 1.62e-05 6.91e-06 1.68e-05 5.04e-05 5.02e-06 3.72e-05 1.74e-05 4.51e-05 2.05e-05 5.42e-05 1.61e-05 8.05e-06 2.37e-05 2.1e-05 2.97e-05 9e-06 7.47e-06 1.9e-05 3.99e-05 3.62e-05 1.02e-05 4.97e-05 9.62e-06 1.65e-05 1.53e-05 3.69e-05 2.99e-05 2.34e-05 1.61e-06 2.95e-06 7.83e-06 1.27e-05 6.44e-06 3.52e-06 3.34e-06 5.29e-06 3.56e-06 1.79e-06 4.33e-05 4.51e-06 4.08e-07 2.73e-06 4.63e-06 4.54e-06 1.76e-06 1.53e-06
ENSG00000234484 AL032821.1 63297 3.86e-05 2.61e-05 6.07e-06 1.2e-05 3.55e-06 1.19e-05 3.29e-05 3.5e-06 2e-05 1.13e-05 2.23e-05 8.71e-06 3.48e-05 1.05e-05 5.5e-06 1.17e-05 1e-05 1.31e-05 5.89e-06 5.95e-06 1.04e-05 2.26e-05 2.34e-05 6.27e-06 3.26e-05 5.41e-06 1.04e-05 8.98e-06 2.5e-05 1.78e-05 1.28e-05 1.17e-06 2.62e-06 7.05e-06 1.01e-05 4.51e-06 2.05e-06 2.77e-06 3.01e-06 2.17e-06 1.66e-06 3.29e-05 3.63e-06 1.92e-07 2.3e-06 2.69e-06 3.18e-06 9.83e-07 1.32e-06